Учебно-методический комплекс по дисциплине специальность 050102 Биология, со специализацией Фитодизайн

Вид материалаУчебно-методический комплекс

Содержание


7. Методические указания по выполнению
Таблица соответствия между кодонами РНК и аминокислотами
Подобный материал:
1   2   3   4   5   6   7   8   9   10


Вариант 2.
  1. Изобразить структурную формулу тетрапептида Про-Глу-Три-Тре.
  2. Цветная реакция на выявление аргинина.
  3. Цветная реакция на выявление гистидина.
  4. Участок правой цепи ДНК имеет такую последовательность нуклеотидов:

5/-ГТААЦАЦТАГТТАААТАЦ-3/. Какова структура этого участка и-РНК. Пользуясь таблицей генетического кода, укажите, какова возможная последовательность аминокислот белка, синтезируемого при участии и-РНК, транскрибируемой данным фрагментом цепи ДНК?
  1. Изобразите схему синтез пантотеновой кислоты из -кетоизовалериата, формиата и β-аланина.
  2. Предложите последовательность реакций для объяснения превращения углеродных атомов глюкозы в -аминомасляную кислоту.
  3. Напишите уравнения реакций:

Глутаминовая кислота -аминомасляная кислота + СО2;

Глицерин + гидроокись меди

Триацилглицерил H2O глицерин + жирная кислота.
  1. Перечислите аминокислоты, радикалы которых участвуют в образовании водородных связей при формировании третичной структуры белка.
  2. Определите максимальное количество дисахаридов, которые могут существовать, если они состоят только из D-глюкозы.
  3. Привести доказательства полипептидного строения белковой молекулы.



Вариант 3.
  1. Изобразить структурную формулу тетрапептида Тре-Гли-Фен-Вал.
  2. Цветная реакция на выявление тирозина.
  3. Цветные реакции на выявление метионина и серусодержащих аминокислот.
  4. Участок правой цепи ДНК имеет такую последовательность нуклеотидов:

5/-ГТААЦАЦТАГТТАААТАЦ-3/. Какова структура этого участка и-РНК. Пользуясь таблицей генетического кода, укажите, какова возможная последовательность аминокислот белка, синтезируемого при участии и-РНК, транскрибируемой данным фрагментом цепи ДНК?
  1. Изобразите структурные формулы следующих соединений: а) гуанозин-3`-монофосфат, б) дезоксиаденозин-5`-дифосфат, в) 5`-dADP, г) 5`-dTMP.
  2. Напишите формулу динуклеотида следующего строения:

5`-У-А

5`-дГ-дТ
  1. Напишите уравнения реакций:

Фруктоза-1,6-дифосфат диоксиацетонфосфат + глицеральдегидфосфат

Глюкоза + H3PO4 глюкозо-1-фосфат

Этанол + НАД+ ацетальдегид + НАДН+ + Н+.
  1. Объясните основные свойства лизина.
  2. Очищенный препарат ДНК содержит 30,4% аденина и 19,6% цитозина. Отношение аденин/тимин равно 0,98, а гуанин/цитозин 0,97. Вычислите количество гуанина и тимина в этой ДНК, а также соотношение пуриновых и пиримидиновых оснований.
  3. Привести доказательства полипептидного строения белковой молекулы.


Вариант 4.
  1. Изобразить структурную формулу тетрапептида Три-Ала-Мет-Цис.
  2. Цветные реакции на выявление триптофана.
  3. Нингидриновая реакция
  4. Участок правой цепи ДНК имеет такую последовательность нуклеотидов:

5/-ГТААЦАЦТАГТТАААТАЦ-3/. Какова структура этого участка и-РНК. Пользуясь таблицей генетического кода, укажите, какова возможная последовательность аминокислот белка, синтезируемого при участии и-РНК, транскрибируемой данным фрагментом цепи ДНК?
  1. Изобразите структурные формулы следующих соединений: а) тимидин, б) цитозин-5`-трифосфат, в) …pUpGp, г) гуаниловая кислота.
  2. Напишите формулы дисахаридов следующего строения:

Глюкоза ( 1-6)–глюкоза

Глюкоза ( 1-2)–фруктоза

Глюкоза ( 1-4)– глюкоза
  1. Напишите уравнения реакций:

Сукцинат + ФАД фумарат + ФАД+ + Н-

L-лактат + НАД+ пируват + НАДН+ + Н+

Пируват + СО- + АТФ щавелеуксусная кислота + АДФ + H3PO4.
  1. Объясните кислые свойства глутамина.
  2. Полипептидная цепь миоглобина содержит 153 аминокислотных остатка. Теоретически, сколько нуклеотидов в гене должны определять последовательность этого полипептида?
  3. После инкубации с п-хлормеркурийбензоатом связывание фермента с субстратом не изменилось по сравнению с необработанным ферментом, но каталитическая активность уменьшилась на 40%. Какой вывод можно сделать из этого наблюдения?


^ 7. МЕТОДИЧЕСКИЕ УКАЗАНИЯ ПО ВЫПОЛНЕНИЮ

КОНТРОЛЬНЫХ РАБОТ


Прежде, чем решать задачу, следует внимательно ее прочитать, понять, наметить план, а затем приступить к ее решению. При решении задачи необходимо приводить весь ход решения, математические формулы и преобразования с указанием единиц измерения. Нет необходимости выполнять задания в указанной последовательности. Поэтому сначала выполните наиболее легкие для Вас задания, а затем – более сложные.
  1. Задачи нахождения количества пары нуклеотидов в ДНК по известному количеству другой пары основаны на правилах Чаргаффа, согласно которым А=Т, Ц=Г и А+Ц=Т+Г. Следовательно, если в ДНК содержится 30,4% аденина и 19,6% цитозина, то тимина содержится 30,4%, а гуанина – 19,6%. Остальное – элементарно.
  1. При выполнении заданий на комплементарность НК и аминокислот пользуйтесь таблицей соответствия:


^ Таблица соответствия между кодонами РНК и аминокислотами


Первый

нуклеотид

Второй нуклеотид

У

Ц

А

Г

У

УУЦ

УУУ

Фенилаланин

УЦЦ

УЦГ

УЦУ

УЦА

Серин

УАЦ

УАУ

Тирозин


УГЦ

УГУ

Серин

УУА

УУГ

Лейцин

УАГ

УАА

Границы

белка

УГГ

Триптофан

УГА

Границы

белка

Ц

ЦУЦ

ЦУГ

ЦУУ

ЦУА

Лейцин

ЦЦЦ

ЦЦГ

ЦЦУ

ЦЦА

Пролин

ЦАЦ

ЦАУ

Гистидин


ЦГЦ

ЦГГ

ЦГУ

ЦГА

Аргинин

ЦАГ

ЦАА

Глутамин


А

АУЦ

АУУ

Изолейцин

АЦЦ

АЦГ

АЦУ

АЦА

Треонин

ААЦ

ААУ

Аспарагин

АГЦ

АГУ

Серин

АУА

АУГ

Метионин

ААГ

ААА

Лизин

АГГ

АГА

Аргинин

Г

ГУЦ

ГУГ

ГУУ

ГУА

Валин

ГЦЦ

ГЦГ

ГЦУ

ГЦА

Аланин

ГАЦ

ГАУ

Аспарагиновая кислота

ГГЦ

ГГГ

ГГУ

ГГА

Глицин

ГАГ

ГАА

Глутаминовая

Кислота

По первому нуклеотиду кодона РНК определяем в таблице горизонтальный ряд, а по второму – вертикальный столбец. На их пересечении находим нужную тройку нуклеотидов и читаем название соответствующей ей аминокислоты.


  1. Чтобы написать последовательность нуклеотидов второй цепочки молекулы ДНК, когда известна последовательность их в первой цепочке, достаточно, пользуясь правилом Чаргаффа, заменить тимин на аденин, аденин на тимин, гуанин на цитозин и цитозин на гуанин.
  2. Чтобы закодировать тройками нуклеотидов последовательность аминокислот белка, обращаемся к биохимическому коду наследственности (см. табл. комплементарности на стр. 43). Для каждой аминокислоты находим ее кодовое «обозначение» в виде соответствующей тройки нуклеотидов и выписываем его. Располагаем эти тройки друг за другом в таком же порядке, в каком идут изображаемые нами аминокислоты, получаем формулу строения искомого участка молекулы информационной РНК. Поскольку в генетическом коде имеются «синонимы1» для каждой аминокислоты найдется не одна, а несколько изображающих ее нуклеотидных троек. Выбор между ними делается по произволу решающего задачу. Таким образом, данная задача допускает множество правильных решений.
  3. Обратная задача, воспроизвести последовательность аминокислот в белке или его фрагменте решается аналогично. От 5’ конца отсчитываем тройки нуклеотидов и пользуясь таблицей комплементарности выписываем соответствующую аминокислоту.



Учебное издание


Биологическая химия

Учебно-методический комплекс по дисциплине

Специальность 032400.00 – Биология,

со специализацией 032418 – Фитодизайн

заочное отделение


Составитель :

Козлов Вадим Авенирович


Подписано в печать . Формат 60×84/16.

Бумага писчая. Печать оперативная.

Усл. печ. л. 2,44. Тираж 25 экз. Заказ №.


ГОУ ВПО «Чувашский государственный педагогический

университет им. И. Я. Яковлева»

428000, Чебоксары, ул. К. Маркса, 38


Отпечатано на участке оперативной полиграфии

ГОУ ВПО «Чувашский государственный педагогический

университет им. И. Я. Яковлева»

428000, Чебоксары, ул. К. Маркса, 38




1 В языкознании синонимами называются различно звучащие слова с одинаковым смыслом, например: гиппопотам и бегемот.

41