Сущность жизни

Вид материалаДокументы

Содержание


Строение ДНК
Правила Чаргаффа
Функции ДНК
РНК ( рибонуклеиновая кислота )
ДНК – зависимой фермента РНК
Особенности полинуклеотидов
Подобный материал:
1   2   3   4   5   6   7   8   9   ...   49

ДНК ( дезоксирибонуклеиновая кислота )
  • Полинуклеотид ( молекулярная масса достигает 100 000 000 ; 6 10 - 12 г .) , длина одной молекулы достигает 4 -5 см . ( гигантская макромолекула )
  • Локализована в хромосомах ядра и исчезающе малых количествах в митохондриях и хлоропластах ( особеннномного содержится в меристемах , регенерирующих тканях , железах секреции , клетках злокачественных опухолей )
  • Состоит из четырёх типов нуклеотидов А , Т , Г , Ц
  • В клетке имеет сложную пространственную структуру , позволяющую компактно складываться в малом объёме клетки и её органоидов ( имеет несколько уровней структурной организации подобно всем биополимерам с большой молекулярной массой )

Строение ДНК

Первичная структура
  • впервые установлена в 1950 году американским биохимиком Э . Чаргаффом
  • апериодичная линейная последовательность дезоксирибонуклеотидов ( их количество исчисляется сотнями тысяч и миллионами ) ; например : А - Г - Т - Ц - Т - Т - А - Ц - Г - и т . д .
  • последовательность нуклеотидов строго определена и постоянна для каждого вида ДНК данного организма ( основа генетического кода )
  • поддерживается фосфодиэфирными связями ( стабильна в организме )

Вторичная структура
  • впервые установлена в 1953 году ( Д . Уотсон -амер . и Ф . Крик - англ . ; Нобелевская премия 1962 года
  • представляет собой две полинуклеотидных цепочки, спирально закрученных одна относительно другой ( двойная спираль )
  • на переферии двойной спирали каждая цепь состоит из сахарофосфатного остова
  • цепи обращены друг к другу азотистыми основаниями , способными к образованию водородных связей между соответствующими парами оснований (принцип комплементарности )
  • Принцип комплементарности ( Э. Чаргафф ) - спаривание ( взаимодействие ) геометрически дополняющих друг друга азотистых оснований ( пуриновых с пиримидиновыми ) , завершающееся образованием водородных связеймежду ними
  • геометрически разрешёнными оказываются только взаимодействия А - Т и Г - Ц ( комплементарные пары азотистых оснований )
  • между А и Т образуется две водородных связи , а гуанином и цитозином - три ( водородные связи обеспечивают вторичной структуре ДНК ( двойной спирали ) стабильность
  • благодаря комплементарности оснований ДНК ( А - Т и Г - Ц ) порядок чередования их в обеих нитях взаимно обусловлен ( последовательность нуклеотидов одной цепочки определяет последовательность нуклеотидов во второй )

А - Т – Г- Ц - Г - Ц - Т - А - Ц - А - А - Г - Т - . .. водородные связи . в Т - А - Ц - Г - Ц - Г - А - Т - Г- Т - Т - Ц - А - и т. д.

Фосфодиэфирные связи






А Т



водородные связи фосфодиэфирная связь



Г Ц



Схематическое изображение вторичной структуры ДНК


  • расстояние между цепями равно расстоянию , занимаемому парой оснований (т.е. одним пурином и одним пиримидином )
  • каждый виток двойной спирали образуют по 10 пар комплементарных оснований
  • направление цепей в двойной спирали ДНК антипараллельно ( её диаметр 20 Ао , шаг спирали 34 Ао ; 1 Ао - ангстрем равен 10 -12 м )
  • нуклеотидный состав ДНК впервые количественно проанализировал Э . Чаргафф , который сформулировал выводы , известные как « Правила Чаргаффа »

Правила Чаргаффа - сумма пуриновых оснований равно сумме пиримидиновых оснований , т . е . их отношение равно 1 : 1 или А + Г \ Ц + Т = 1
  • число остатков аденина равно числу остатков тимина , т.е . А = Т или А \ Т =1
  • число остатков цитозина равно числу остатков гуанина , т.е. Ц = Г или Ц \ Г =1
  • количество аденина и цитозина равно количеству гуанина и тимина , т. е. А + Ц = Г + Т

Третичная структураъ
  • у эукариот III структура ДНК представляет собой комплекс ДНК с белком гистоном ( нуклеопротеид ) , в результате чего образуется нуклеосом , имеющая сложную пространственную конфигурацию (нуклеосомная нить)

Нуклеосома - компактное тельце , состоящее из 8 гистоновых белков
  • каждая нуклеосома обёрнута двумя витками двойной спирали ( при этом длина ДНК уменьшается в 7 раз , что обеспечивает компактное расположение длинной молекулы ДНК в малом объёме ядра )
  • гистоновые белки выполняют структурную и регуляторную функции
  • нуклеосомы образуют нуклеосомную нить ( элементарная структурная единица хромосомы ) , которая в электронный микроскоп выглядит как нитка , на которую нанизаны бусинки )

Четвертичная структура
  • образуется в результате дальнейшего скручивания нуклеосомной нити , приводящего к формированию фибрилл
  • дальнейшая пространственная укладка фибрилл связана с формированием петель и хроматиновой фибриллы ( в результате такой упаковки длина молекулы ДНК уменьшается в 200 раз ) - V структура
  • IV и V структуры , образующиеся в результате реорганизации нуклеосомной нити называется спирализацией в результате спирализации молекулы длина ДНК с 5 см . уменьшается до 5 мкм , т.е. примерно в 5000 раз )
  • спирализация приводит к образованию хромосом ( в min объёме хромосомы заключается огромное количество генетической информации ) ; хорошо видны в световой микроскоп
  • подобно белкам , при резком изменений нормальных условий ДНК подвергается денатурации ( называется плавлением ) , а при восстановлении условий - ренатурирует



Функции ДНК

1. Хранение, воспроизведение ( репликация ) и передача ряду поколений наследственной генетической информации о первичной структуре всех белков и РНК - носитель генетической (наследственной ) информации ( единственное исключение - вирусы , у которых отсутствует ДНК ) ; установлено в 1944 году
  • функциональной единицей ДНК ( и хромосом ) является ген ( гены располагаются в ДНК и хромосомах линейно , каждый ген занимает определённое место – локус )

Ген - участок ( фрагмент ) молекулы ДНК содержащий информацию о первичной структуре одного белка ( фермента ) или одной молеклы РНК
  • в организме ДНК определяет , какие белки ( ферменты ) и РНК и в каких количествах необходимо синтезировать
  • ДНК является основой уникальности индивидуального организма
  • ДНК обуславливает явление наследственности



Репликация ( редупликация ) ДНК
  • ферментативный процесс самовоспроизведения ( самоудвоения ) молекул ДНК , происходящий накануне деления клетки и обеспечивающий дочерние клетки количеством ДНК , равным материнскому ( передачу наследственной информации от одной клетки к другой )
  • редупликация - уникальное свойство молекулы ДНК незвестное ни для одной другой известной молекулы
  • осуществляется во всех клетках про- и эукариот накануне их деления
  • связана с большими энергетическими затратами и огромным количеством превращений , поэтому репликация начинается локально на небольших участках ДНК , которые называются репликативными вилками – репликны ; в этом месте образуется вздутие - (« вилка » ) , которая перемещается вдоль « материнской » молекулы
  • начинается с ферментативного разрыва Н - связей , соединяющих комплементарные азотистые основания в двойной спирали ( двойная спираль разделяется на две полинуклеотидные нити - в районе репликона )
  • свободные нуклеотиды кариоплазмы ( ядерного сока ) или цитоплазмы присоединяются к обеим нитям по принципу комплементарности под действием фермента ДНК - завимсммой ДНК - полимеразы
  • каждая из двух цепей « материнской » молекулы ДНК служит матрицей для постройки на ней новой нити ДНК , в результате чего образуются две новых ( дочерних ) спирали ; новые цепи синтезируются вначале в виде коротких фрагментов , которые затем сшиваются в длинные цепи специальным ферментом
  • в результате репликации образуются две совершенно одинаковые молекулы ДНК , каждая из которых содержит одну « старую » и одну вновь синтезированную цепь ( принцип полуконсервативности )
  • число ошибок при репликации составляет ничтожную величину : менее 1 на 10 нуклеотидов ( каждое случайное изменение последовательности нуклеотидов при репликации ДНК - генетическая ошибка , называется мутацией )



РНК ( рибонуклеиновая кислота )
  • линейный природный биополимер , состоящий из одной полинуклеотидной цепочки , последовательность нуклеотидов в которой обязательно комплементарна к определённому участку одной из спиралей ДНК
  • все молекулы РНК синтезируются на матрице ( генах ) ДНК с помощью фермента ДНК – зависимой фермента РНК - полимеразы ; этот процесс называется транскрипцией

Транскрипция – ферментативный синтез молекул РНК на матрице ( генах ) ДНК
  • мономеры - рибонуклеотиды : аденозин , уридин , гуанозин , цитидин
  • в состав нуклеотида РНК входят :
  • один из 4 видов азотистых оснований - аденин , гуанин , цитозин или урацил (вместо тимина у ДНК )
  • сахар - пентоза - рибоза
  • остаток фосфорной кислоты ( фосфат )
  • соединение нуклеотидов осуществляется фосфодиэфирными связями
  • в результате транскрипции могут быть образованы три основных вида РНК : информационные ( матричные ) , транспортные , рибосомальные ; в процессе постсинтетической химической модификации информационной РНК образуются т. н. малые ядерные РНК

Информационная РНК ( и - РНК ) или матричная ( м - РНК )
  • содержится в ядре и цитоплазме (от 0,5 до 5% от общего содержания РНК в клетке )
  • наиболее разнородная по размерам , структуре и стабильности группа молекул РНК
  • все и - РНК объединяет их функция - перенос информации о I структуре белка от гена ДНК к месту синтеза белка в рибосомах ( служат в качестве матриц для синтеза полинуклеотидной цепи белка в ходе реализация генетической информации – экспресси генов )
  • каждому гену или группе генов соответствует своя собственная и-РНК
  • синтезировавшиеся в ядре и - РНК выходят в цитоплазму через ядерные поры и объединяются с рибосомами , образуя с ними комплекс для синтеза белка
  • имеет вторичную и третичную компактизирующие структуры

Транспортная ( акцепторная ) РНК ( т - РНК )
  • имеет самые короткие молекулы ( 70 - 100 нуклеотидов ) ; молекулярная масса - 25 - 30 тыс.
  • содержится в основном в цитоплазме клетки ( составляет около 10 % от общего содержания РНК в клетке)
  • синтезируется в ядре на матрице ( генах ) ДНК в результате транскрипции и переходит в цитоплазму через поры в ядре
  • функция т-РНК - перенос активированных аминокислот к месту синтеза белка в рибосомы и участие в «считывании» информации с и-РНК в процессе синтеза белка ( трансляции )
  • выполнению функций соответствует определённая пространственная структура т-РНК - вторичная и третичная
  • вторичная структура т - РНК имеет вид плоского клеверного листа , в которой выделяют четыре петли ( или плеча )
  • акцепторная петля ( служит местом присоединения переносимой аминокислоты )
  • антикодоновая петля ( находится на противоположном конце молекулы и содержит триплет - варьирующую последовательность трёх нуклеотидов , называемый антикодоном ; служит для узнавания триплетов и-РНК (кодонов ) в процессе трансляции ( см . « Синтез белка » )
  • две боковые петли
  • третичная структура обладает большей компактностью , благодаря складыванию молекулы в виде буквы Г
  • каждая аминокислота имеет свои т - РНК ( со спецефическими антикодонами ) и не способна взаимодействовать с т -РНК для других аминокислот



акцепторная петля





боковые петли

. антикодоновая петля

А У Ц


Рибосомальные РНК ( р - РНК )
  • самые распространённые и крупные РНК ( состоят из 3 - 5 тыс . нуклеотидов ; молекулярная масса 1 - 1.5 млн около 90 % от общего содержания РНК в клетке )
  • образуется на генах ДНК ( матрицах ) в ядрышках ядра в процессе транскрипции
  • выполняют в клетке структурную функцию ( входят в состав рибосом , образуя их остов , включающий три молекулы р - РНК , прочно связанных с белками рибосомы ) и участвуют в формировании активного центра рибосомы
  • Иногда РНК выделяют по месту их локализации : ядерные , цитоплазматические , митохондральные , РНК пластид
  • Все типы РНК представляют собой функционально объединённую систему , направленную на осуществление синтеза спецефических клеточных белков в процессе экспрессии генов ( транскрипции и трансляции )

Особенности полинуклеотидов



Признаки

ДНК

РНК

1 . Локализация


2 . Размеры молекулы

3. Вторичная структура

( число цепей ) 4. Третичная структура


5. Азотистые основания


6 . Комплементарные пары оснований

7 . Углевод ( пентоза )

8. Механизм образования

9 . Время образования

10 . Стабильность молекулы

11 . Длина полипептидных цепей - количество нуклеотидов

12 . Постоянство содержания в клетке

14. Изменение структуры

15 . Уровни пространственной структуры

16. Виды в клетке


17 . Функции



в ядре - 99 , 999 % , митохондрии , хлоропласты, центриоли

1 молекула - 2 - 5 см .

двойная спираль ( две цепи )

связана с гистоновыми белками (нуклеопротеид ) .

А , тимин , Г , Ц


А - Т ; Г - Ц

дезоксирибоза

репликация

накануне деления клети Стабильна

очень длинные ( 105 - 106 )

количество относительно постоянно в клетках одного вида

вызывает мутации

имеет много уровней - I , II III , IV , V и т. д. ( спирализация )

линейная ( ядерная ) , кольцевая ( митохондральная , плазмиды прокариот )

1. хранение , воспроизводство и передача наследственной информации 2. информационная матрица для синтеза РНК

3. химический субстрат наследственной изменчивости мутационной и др )



ядро , цитоплазма , рибосомы , митохондрии , хлоропласты

небольшие ( мкм )

зависит от типа РНК (одна цеп

не образует устойчивых комплексов с другими молекулами

А , урацил , Г , Ц


А - У ; Г – Ц

рибоза

транскрипция

постоянно

нестабильна относительно короткие ( до 103 )

сильно колеблется

не вызывает

I , II, III (не спирализуется )


и - РНК , т – РНК , р - РНК


см . функции и - РНК

т - РНК

р - РНК





Общие признаки нуклеиновых кислот
  1. Элементарный состав включает азот и фосфор
  2. Являются линейными , информационными полинуклеотидами
  3. Мономером является нуклеотид , включающий :
  • Азотистые основания – аденин , гуанин , цитозин
  • Углевод ( пентоза )
  • Остаток фосфорной кислоты
  1. Мономеры соединяются в полинуклеотиде с помощью фосфодиэфирной связи
  2. В основу структуры , синтеза в клетке и выполнения функций положен принцип комплементарности
  • Комплементарные пары азотистых оснований : гуанин --- цитозин
  1. Для поддержания структуры и выполнения функций необходимы водородные связи
  2. В клетке структурированы ( имеют I , II, и III структуры )
  3. Содержат информацию о первичной структуре белка в виде генетического кода
  4. Участвуют в биосинтезе белка и реализации наследственной генетической информации
  5. Синтезируются в процессе ферментативных реакций матричного синтеза
  6. Содержаться в ядре , митохондриях и хлоропластах
  7. Гидролизуются до нуклеозидов и фосфорной кислоты