Geum.ru

Список литературы по курсу лекций «Моделирование биологических процессов и систем» Предмет, задачи и методы моделирования биологических объектов

Вид материалаЛитература

Содержание


4. Применение методов качественной теории динамических систем
5. Системы с сосредоточенными параметрами. Точечные модели биологических процессов.
7. Стохастические модели биологических объектов
8. Обработка медико-биологических экспериментальных данных.
10. Применение численных методов для решения задач моделирования
Подобный материал:




СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

по курсу лекций «Моделирование биологических процессов и систем»

1. Предмет, задачи и методы моделирования биологических объектов.

Основная литература

  1. Феликс Л. Элементарная математика в современном изложении. М.: Просвещение, 1967.
  2. Малинецкий Г.Г. Хаос. Структуры. Вычислительный эксперимент: Введение в нелинейную динамику. М.: Наука, 1997.
  3. Лайтфут Э. Явления переноса в живых системах. М.:Мир, 1977.
  4. Балантер Б.И., Ханин М.А., Чернавский Д.С. Введение в математическое моделирование патологических процессов. – М., Медицина, 1980.
  5. Рубин А.Б. Биофизика: В 2 т. Т.1: Теоретическая биофизика.-М.: Книжный дом «Университет», 1999.
  6. Щукин С.И. Основы биофизики.Ч.1: Учебное пособие. М.: МГТУ, 2001. 36 с.
  7. Амосов А.А., Дубинский Ю.А., Копченова Н.В. Вычислительные методы для инженеров. М., Высшая школа, 1994.
  8. Котин В.В. Методическая разработка к курсовой работе по дисциплине «Математические модели макроуровня». МГТА, М.,1998.



Дополнительная литература

  1. Н.Бейли. Математика в биологии и медицине. М., Мир, 1970.
  2. Беллман Р. Математические методы в медицине. - М.: Мир,1987.
  3. Вольтерра В. Математическая теория борьбы за существование. М., Наука, 1976.
  4. Свирежев Ю.М. Нелинейные волны, диссипативные структуры и катастрофы в экологии. М.:Наука, 1987.
  5. Романовский Ю.М., Степанова Н.В., Чернавский Д.С. Математическое моделирование в биофизике.- М.: Наука,1975.
  6. Рубин А.Б. Биофизика: В 2 т. Т.2: Биофизика клеточных процессов.-М.: Книжный дом «Университет», 2000.
  7. Моисеев Н.Н. Математические задачи системного анализа. М. Наука, 1981.
  8. Хомяков Д.М., Хомяков П.М. Основы системного анализа. Изд. механико-математического факультета МГУ им. М.В. Ломоносова, М., 1996.
  9. Новосельцев В.Н. Теория управления и биосистемы. Анализ сохранительных свойств. М.: Наука, 1978.
  10. Марри Дж. Нелинейные дифференциальные уравнения в биологии. Лекции о моделях. -М.: Мир, 1983.-397 с.
  11. Копченова Н.В., Марон И.А. Вычислительная математика в примерах и задачах. М.,Наука, 1972.
  12. Волков Е.А. Численные методы , М., Наука, 1987.
  13. Косарев В.И. 12 лекций по вычислительной математике (вводный курс), М., МФТИ, 1995.
  14. Турчак Л.И. Основы численных методов. М.,Наука,1987.
  15. Вентцель Е.С. Овчаров Л.А. Теория вероятностей и её инженерные приложения. М.: Наука, 1988.
  16. Гмурман В.Е. Руководство к решению задач по теории вероятностей и математической статистике. М., Высшая школа, 1997.
  17. Ханин М.А., Дорфман Н.Л., Бухаров И.Б., Левадный В. Г. Экстремальные принципы в биологии и физиологии. М.,Наука, 1977.
  18. Гродинз Ф. Теория регулирования и биологические системы. – М. Мир, 1966.


2. Вычислительные задачи математического моделирования.

Основная литература

  1. Амосов А.А., Дубинский Ю.А., Копченова Н.В. Вычислительные методы для инженеров. М., Высшая школа, 1994.
  2. Ершов Ю.А. Теория цепного роста и ингибирования биологических популяций химическими агентами. - Доклады Академии Наук,1997, т.352, №5, с.627-629. mstu.ru/~ersh+
  3. Ершов Ю.А. Квазихимические модели роста биологических популяций под действием ингибиторов и промоторов. Журнал физической химии, 1998, т.72, №3, с.553-559.
  4. Ершов Ю.А., Котин В.В. Детерминированные и стохастические экотоксикологические модели популяционной динамики -Журнал физической химии, 2000, т.74, №9, с. 1682-1691.
  5. Котин В.В., Ершов Ю.А. Моделирование химического управления ростом клеточных популяций. Учебное пособие. Изд-во МГТУ им. Н.Э.Баумана, М., 2002.
  6. Косарев В.И. 12 лекций по вычислительной математике (вводный курс), М., МФТИ, 1995.
  7. Рубин А.Б. Биофизика: В 2 т. Т.1: Теоретическая биофизика.-М.: Книжный дом «Университет», 1999.

Дополнительная литература

  1. Турчак Л.И. Основы численных методов. М.,Наука,1987.
  2. Мудров А.Е. Численные методы для ПЭВМ на языках Бейсик, Фортран и Паскаль. Томск, РАСКО, 1991.
  3. Котин В.В. Методическая разработка к курсовой работе по дисциплине «Математические модели макроуровня». МГТА, М.,1998.

  4. Диментберг М.Ф. Нелинейные стохастические задачи механических колебаний. М.: Наука, 1980.




3. Динамика популяций. Базовые модели.

Основная литература

  1. Вольтерра В. Математическая теория борьбы за существование. М., Наука, 1976.
  2. Свирежев Ю.М. Логофет Д.О. Устойчивость биологических сообществ. М.:Наука, 1978.
  3. Варфоломеев С.Д., Гуревич К.Г. Биокинетика: Практический курс. М.:ФАИР-ПРЕСС, 1999.
  4. Петрова Т.А., Галактионова Н.А. Компьютерный практикум по курсу «Математическое моделирование в экологии». М., МНЭПУ, 1997.

Дополнительная литература

  1. Рубин А.Б. Биофизика: В 2 т. Т.1: Теоретическая биофизика.-М.: Книжный дом «Университет», 1999.
  2. Свирежев Ю.М. Нелинейные волны, диссипативные структуры и катастрофы в экологии.
  3. Новосельцев В.Н. Теория управления и биосистемы. Анализ сохранительных свойств. М.: Наука, 1978.
  4. Варфоломеев С.Д., Калюжный С.В. Биотехнология: Кинетические основы микробиологических процессов. М.: Высшая школа, 1990.
  5. Дре Ф. Экология. М., Атомиздат, 1976.
  6. Ершов Ю.А. Журнал физической химии, 1998, т.72, №3, с.553-559.
  7. Зуев С.М. Статистическое оценивание параметров математических моделей заболеваний. М.: Наука, 1988.

4. Применение методов качественной теории динамических систем

для исследования биологических объектов

Основная литература

  1. Бутенин Н.В., Неймарк Ю.И., Фуфаев Н.А. Введение в теорию нелинейных колебаний. М., Наука, 1976.
  2. Рубин А.Б. Биофизика: В 2 т. Т.1: Теоретическая биофизика.-М.: Книжный дом «Университет», 1999.
  3. Новосельцев В.Н. Теория управления и биосистемы. Анализ сохранительных свойств. М.: Наука, 1978.

Дополнительная литература

  1. Романовский Ю.М., Степанова Н.В., Чернавский Д.С. Математическое моделирование в биофизике.- М.: Наука,1975.
  2. Варфоломеев С.Д., Гуревич К.Г. Биокинетика: Практический курс. М.:ФАИР-ПРЕСС, 1999.
  3. Варфоломеев С.Д., Калюжный С.В. Биотехнология: Кинетические основы микробиологических процессов. М.: Высшая школа, 1990.
  4. Свирежев Ю.М. Нелинейные волны, диссипативные структуры и катастрофы в экологии. М.:Наука, 1987.
  5. Андронов А.А., Леонтович Е.А., Гордон И.И., Майер А.Г. Теория бифуркаций динамических систем на плоскости. М., Наука, 1967.
  6. Арнольд В.И. Теория катастроф. М., Наука, 1990.
  7. Гилмор Р. Прикла дная теория катастроф. Кн.1,2. М., Мир, 1984.
  8. Математическая энциклопедия - М.:, Советская Энциклопедия. Т.2, 5. 1984.
  9. Андронов А.А., Витт А.А.,Хайкин С.Э. Теория колебаний. М., Наука, 1981.
  10. Ершов Ю.А., Котин В.В. Детерминированные и стохастические экотоксикологические модели популяционной динамики -Журнал физической химии, 2000, т.74, №9, с. 1682-1691.
  11. Котин В.В., Ершов Ю.А. Моделирование химического управления ростом клеточных популяций. (Учебное пособие). Изд-во МГТУ им. Н.Э.Баумана, М., 2002.
  12. Балантер Б.И., Ханин М.А., Чернавский Д.С. Введение в математическое моделирование патологических процессов. – М., Медицина, 1980.


5. Системы с сосредоточенными параметрами. Точечные модели биологических процессов.

Основная литература




  1. Хомяков Д.М., Хомяков П.М. Основы системного анализа. Изд. механико-математического факультета МГУ им. М.В. Ломоносова, М., 1996.
  2. Варфоломеев С.Д., Гуревич К.Г. Биокинетика: Практический курс. М.:ФАИР-ПРЕСС, 1999.

Дополнительная литература

  1. Беллман Р. Математические методы в медицине. - М.: Мир,1987.
  2. Лепахин В.К. Клиническая фармакология и фармакотерапия М.: Медицина,1997.
  3. Касти Дж. Большие системы. Связность, сложность и катастрофы. М.: Мир, 1982.


6. Модели биологических объектов с распределёнными параметрами.

Основная литература

  1. Лайтфут Э. Явления переноса в живых системах. М.:Мир, 1977.
  2. Рубин А.Б. Биофизика: В 2 т. Т.1: Теоретическая биофизика.-М.: Книжный дом «Университет», 1999.
  3. Рубин А.Б. Биофизика: В 2 т. Т.2: Биофизика клеточных процессов.-М.: Книжный дом «Университет», 2000.
  4. Свирежев Ю.М. Нелинейные волны, диссипативные структуры и катастрофы в экологии. М.:Наука, 1987.
  5. Балантер Б.И., Ханин М.А., Чернавский Д.С. Введение в математическое моделирование патологических процессов. – М., Медицина, 1980.



Дополнительная литература

  1. Романовский Ю.М., Степанова Н.В., Чернавский Д.С. Математическое моделирование в биофизике.- М.: Наука,1975.
  2. Новосельцев В.Н. Теория управления и биосистемы. Анализ сохранительных свойств. М.: Наука, 1978.
  3. Марри Дж. Нелинейные дифференциальные уравнения в биологии. Лекции о моделях. -М.: Мир, 1983.-397 с.
  4. Котин В.В., Ершов Ю.А. Математическая модель медикаментозного воздействия на инфицированную ткань. Биомедицинские технологии и радиоэлектроника. 2002, №9, с. 36-41.
  5. Малинецкий Г.Г. Хаос. Структуры. Вычислительный эксперимент: Введение в нелинейную динамику. М.: Наука, 1997.


7. Стохастические модели биологических объектов

Основная литература

  1. Гласс Л., Мэки М. От часов к хаосу: Ритмы жизни. М.: Мир, 1991.
  2. Свирежев Ю.М. Нелинейные волны, диссипативные структуры и катастрофы в экологии.
  3. Вентцель Е.С. Овчаров Л.А. Теория вероятностей и её инженерные приложения. М.: Наука, 1988.
  4. Диментберг М.Ф. Случайные процессы в динамических системах с переменными параметрами. -М.: Наука, 1989.
  5. Котин В.В., Ершов Ю.А. Моделирование химического управления ростом клеточных популяций. (Учебное пособие). Изд-во МГТУ им. Н.Э.Баумана, М., 2002.



Дополнительная литература

  1. Романовский Ю.М., Степанова Н.В., Чернавский Д.С. Математическое моделирование в биофизике.- М.: Наука,1975.
  2. Рубин А.Б. Биофизика: В 2 т. Т.1: Теоретическая биофизика.-М.: Книжный дом «Университет», 1999.
  3. Ершов Ю.А., Котин В.В. Детерминированные и стохастические экотоксикологические модели популяционной динамики -Журнал физической химии, 2000, т.74, №9, с. 1682-1691.
  4. Хорстхемке В., Лефевр Р. Индуцированные шумом переходы. Теория и применение в физике, химии и биологии. М.: Мир, 1987.
  5. Климонтович Ю.Л. Статистическая теория открытых систем .т.1, М., «Янус», 1995.
  6. Биндер К., Хеерман Д.В. Моделирование методом Монте-Карло в статистической физике: Введение. – М.:Наука. Физматлит, 1995.
  7. Гмурман В.Е. Руководство к решению задач по теории вероятностей и математической статистике. М., Высшая школа, 1997.
  8. Плис А.И., Сливина Н.А. Mathcad 2000. Математический практикум для экономистов и инженеров. -М.: Финансы и статистика, 2000.
  9. Дьяконов В.П. Математическая система MAPLE V R3/R4/R5 - М., Солон, 1998.
  10. Дьяконов В.П. Системы символьной математики Mathematica 2 и Mathematica 3. М., СК Пресс, 1998.
  11. Диментберг М.Ф. Нелинейные стохастические задачи механических колебаний. -М.: Наука, 1980.

8. Обработка медико-биологических экспериментальных данных.

Основная литература

  1. Косарев В.И. 12 лекций по вычислительной математике (вводный курс), М., МФТИ, 1995.
  2. Мудров А.Е. Численные методы для ПЭВМ на языках Бейсик, Фортран и Паскаль. Томск, РАСКО, 1991.
  3. Спиридонов И.Н. Основы статистической обработки медико-биологической информации. Учебное пособие. Изд-во МГТУ им. Н.Э.Баумана, М., 2002.
  4. Лужнов П.В., Морозов А.А. Разработка аппаратно-программных средств системы биоадекватного электромагнитного воздействия. Биомедицинская радиоэлектроника. №9, 2000, с.33-37.
  5. Зубенко В.Г., Морозов А.А., Морозов Д.Ю., Щукин С.И. Результаты проектирования аппаратно-программного комплекса для дистанционного мониторинга параметров центральной гемодинамики. Биомедицинские технологии и радиоэлектроника. №9, 2002, с.53-57.

Дополнительная литература

  1. Турчак Л.И. Основы численных методов. М.,Наука,1987.

  2. Амосов А.А., Дубинский Ю.А., Копченова Н.В. Вычислительные методы для инженеров. М., Высшая школа, 1994.
  3. Вентцель Е.С. Овчаров Л.А. Теория вероятностей и её инженерные приложения. М.: Наука, 1988.
  4. Статистическая обработка результатов экспериментов на микро-ЭВМ и программируемых калькуляторах. А.А. Костылёв, П.В. Миляев, Ю.Д. Дорский и др. Л., Энергоатомиздат, 1991.
  5. Mathcad User’s Guide. Mathcad 8 Professional Academic. MathSoft, Inc., Cambridge, MA, 1998.

  6. Плис А.И., Сливина Н.А. Mathcad 2000. Математический практикум для экономистов и инженеров. -М.: Финансы и статистика, 2000.

  7. Дьяконов В.П. Математическая система MAPLE V R3/R4/R5. М., Солон, 1998.

  8. Манзон Б.М. Maple V Power Edition. М., Филин, 1998.

  9. Дьяконов В.П. Системы символьной математики Mathematica 2 и Mathematica 3 - М., СК Пресс, 1998.

  10. soft.com
  11. oft.com
  12. ine.ru
  13. enta.ru

  14. Дьяконов В.П. Справочник по MathCAD PLUS 7.0 PRO. СКПресс, М.,1998.




9. Модели регуляции в биологических объектах.

Основная литература

  1. Ляпунов А.А. О кибернетических вопросах биологии. Сб. Проблемы кибернетики, вып. 25, М.: Наука, 1972.
  2. Новосельцев В.Н. Теория управления и биосистемы. Анализ сохранительных свойств. М.: Наука, 1978.
  3. Чернавский Д.С. Информация, самоорганизация, мышление. Синергетика. Труды семинара. Т.3, М., Изд-во МГУ, 2000.
  4. Математическая энциклопедия - М.:, Советская Энциклопедия. Т.2, 1979.
  5. Вентцель Е.С. Овчаров Л.А. Теория вероятностей и её инженерные приложения. М.: Наука, 1988.
  6. Фельдбаум А.А., Бутковский А.Г. Методы теории автоматического управления. М.: Наука, 1971.

Дополнительная литература

  1. Гродинз Ф. Теория регулирования и биологические системы. М. Мир, 1966.

  2. Винер Н. Кибернетика или управление и связь в животном и машине. М. Советское радио, 1968.
  3. Кадомцев Б.Б. Динамика и информация. Редакция журнала «Успехи физических наук», М., 1997.
  4. Яглом А.М., Яглом И.М. Вероятность и информация. М., Наука, 1973.
  5. Ханин М.А., Дорфман Н.Л., Бухаров И.Б., Левадный В. Г. Экстремальные принципы в биологии и физиологии. М.,Наука, 1977.


10. Применение численных методов для решения задач моделирования

биологических объектов и процессов

Основная литература




  1. Амосов А.А., Дубинский Ю.А., Копченова Н.В. Вычислительные методы для инженеров. М.: Высшая школа, 1994.
  2. Косарев В.И. 12 лекций по вычислительной математике (вводный курс), М., МФТИ, 1995.
  3. Мудров А.Е. Численные методы для ПЭВМ на языках Бейсик, Фортран и Паскаль. Томск: РАСКО, 1991.
  4. Ракитин В.И., Первушин В.Е. Практическое руководство по методам вычислений с приложением программ для персональных компьютеров. М., Высшая школа, 1998.
  5. Лобанов А.И., Петров И.Б. Вычислительные методы для анализа моделей сложных динамических систем. Ч.1. М., МФТИ, 2000.

Дополнительная литература




  1. Турчак Л.И. Основы численных методов. М.:Наука,1987
  2. Копченова Н.В., Марон И.А. Вычислительная математика в примерах и задачах. М.:Наука, 1972.
  3. Волков Е.А. Численные методы, М.: Наука, 1987
  4. Воробьева Г.Н., Данилова А.Н. Практикум по вычислительной математике. М.: Высшая школа, 1990.
  5. Сборник задач по методам вычислений, под ред. П.И. Монастырского, М.:Наука,1994
  6. Фуско В. СВЧ цепи. Анализ и автоматизированное проектирование. М., Радио и связь, 1990.
  7. Плис А.И., Сливина Н.А. Mathcad 2000. Математический практикум для экономистов и инженеров. -М.: Финансы и статистика, 2000.
  8. Дьяконов В.П. Математическая система MAPLE V R3/R4/R5. М., Солон, 1998.
  9. Манзон Б.М. Maple V Power Edition. М., Филин, 1998.
  10. Дьяконов В.П. Системы символьной математики Mathematica 2 и Mathematica 3 - М., СК Пресс, 1998.
  11. soft.com
  12. oft.com
  13. ine.ru
  14. enta.ru
  15. Дьяконов В.П. Справочник по MathCAD PLUS 7.0 PRO. СКПресс, М.,1998.
  16. Говорухин В., Цибулин В. Компьютер в математическом исследовании. Учебный курс. - Санкт-Петербург: Питер, 2001.