Цели и задачи программы главная цель Разработка и применение научных методов для существенного продления периода здоровой жизни человека Приоритетные задачи

Вид материалаИсследование

Содержание


17.1. Развитие методов анализа данных
17.2. Развитие методов анализа геномной информации.
17.3. Поиск новых возможных механизмов функционирования генома
17.4. Комплексный анализ молекулярных систем регуляции.
17.5. Исследование взаимодействия организма человека с внутренней и внешней средой.
17.6. Разработка баз данных и веб-сервисов.
Научный руководитель
Сергей Анисимов
Александр Вайсерман
Дэвид Гемс
Лариса Дзеранова
Сергей Киселев
Василий Манских
Стивен Мингер
Андрей Миронов
Алексей Москалёв
Екатерина Пигарова
Евгения Селькова
Елена Терёшина
Подобный материал:
1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11



17.1. РАЗВИТИЕ МЕТОДОВ АНАЛИЗА ДАННЫХ:

17.1.1. Развитие методов сравнительного анализа зашумленных данных.

17.1.2. Развитие методов поиска ассоциаций полиморфизмов и продолжительности жизни.

17.1.3. Развитие алгоритмов анализа первичных данных, в частности методов получения информации о модификации белков по масс-спектрам и геномам.

17.1.4. Развитие алгоритмов поиска регуляторных сигналов по результатам SELEX.


17.2. РАЗВИТИЕ МЕТОДОВ АНАЛИЗА ГЕНОМНОЙ ИНФОРМАЦИИ.

Предполагается развитие и создание новых методов анализа генома для того, чтобы иметь возможность искать новые биологические явления и механизмы.

17.2.1. Методы поиска регуляторных элементов – энхансеров, промоторов.

17.2.2. Методы сравнительного анализа регуляторных элементов.

17.2.3. Методы поиска мишеней микро-РНК.

17.2.4. Методы поиска возможных новых механизмов РНК-регуляции, в частности регуляции сплайсинга, модификации структуры хроматина.

17.2.5. Методы сравнительного анализа белковых последовательностей с целью выявления возможных сайтов пост-трансляционной модификации и белок-белковых взаимодействий.

17.2.6. Методы анализа сетей белок-белковых взаимодействий.

17.2.7. Методы поиска и предсказания сайтов связывания нуклеосом.

17.2.8. Методы комплексного анализа функционирования генома, учитывающие комплекс информации о сайтах связывания нуклеосом, сайтах связывания факторов транскрипции, сайтов связывания микро-РНК, метилировании ДНК и пр.


17.3. ПОИСК НОВЫХ ВОЗМОЖНЫХ МЕХАНИЗМОВ ФУНКЦИОНИРОВАНИЯ ГЕНОМА

Расстройство механизмов регуляции генома с возрастом у не возобновляемых клеток (например, клеток мозга) может быть связано со старением. Поэтому поиск новых механизмов регуляции представляется важным. Поиск такого рода возможных механизмов производится с помощью сравнительного анализа геномов с привлечением всех доступных данных. В дальнейшем необходима экспериментальная проверка предсказанных механизмов.

17.3.1. Поиск возможных систем регуляции сплайсинга с помощью известных или новых классов малых РНК. На данный момент есть косвенные указания на возможность такой регуляции.

17.3.2. Поиск возможного участия малых РНК в метилировании генома и в ремоделировании хроматина. На данный момент известно несколько примеров участия РНК в импринтинге генов у позвоночных и в метилировании ДНК у растений. Не исключено, что подобные механизмы существуют у человека.


17.4. КОМПЛЕКСНЫЙ АНАЛИЗ МОЛЕКУЛЯРНЫХ СИСТЕМ РЕГУЛЯЦИИ.

Сведения о тех или иных регуляторных взаимодействиях необходимо объединять в регуляторные сети и каскады, включающие в себя все известные уровни:

– эпигенетический (метилирование ДНК, ремоделирование хроматина),

– транскрипционный (промоторы, энхансеры, сайта полиаденилирования, взаимодействие со структурой хроматина), в том числе транскрипция регуляторных РНК,

– сплайсинговый (регуляция альтернативного сплайсинга),

– трансляционный (регуляция на уровне микроРНК),

– пост-трансляционный (пост-трансляционная модификация белков),

– компартментализация (транспорт белков и РНК в различные клеточные компартменты)

– стабильность макромолекул (белков и РНК).

В связи с этим возникают следующие задачи:

17.4.1. Восстановление регуляторных сетей на основе всей доступной информации.

17.4.2. Построение адекватного языка описания регуляторных сетей.

17.4.3. Предсказание реакции сетей на внешние воздействия. Сопоставление результатов предсказаний с наблюдениями, в тех случаях, когда наблюдения доступны.

17.4.4. Поиск узких мест в регуляторных сетях для указания наиболее чувствительных мест воздействия, как позитивного (мишень для коррекции), так и негативного.


17.5. ИССЛЕДОВАНИЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ ОРГАНИЗМА ЧЕЛОВЕКА С ВНУТРЕННЕЙ И ВНЕШНЕЙ СРЕДОЙ.

17.5.1. Исследование разнообразия микроорганизмов-симбионтов, обитающих в желудочно-кишечной системе человека.

17.5.2. Метаболическая реконструкция метагеномов.

17.5.3. Исследование разнообразия метагеномов в пределах популяций и между популяциями.

17.5.4. Исследование возможного взаимодействия метагеномов и генома человека.

17.5.5. Исследование внутриклеточных симбионтов и паразитов и их взаимодействия с геномом.


17.6. РАЗРАБОТКА БАЗ ДАННЫХ И ВЕБ-СЕРВИСОВ.

Накопление информации по разным направлениям Проекта должно быть интегрировано в единую базу данных, доступ к которой должен быть обеспечен с помощью удобного интерфейса.



ОРГАНИЗАТОР

Михаил Батин
председатель попечительского совета Благотворительного Фонда поддержки научных исследований «Наука за продление жизни»

mi20022@yandex.ru


НАУЧНЫЙ РУКОВОДИТЕЛЬ

Владимир Анисимов
профессор, доктор медицинских наук, президент Геронтологического общества при РАН, НИИ онкологии им. Н.Н.Петpова Минздравсоцразвития РФ (Санкт-Петеpбуpг)

aging@mail.ru



РАЗРАБОТЧИКИ:

Наталья Анисимова
кандидат биологических наук, Российский онкологический научный центр им. Н.Н. Блохина РАМН (Москва)

Сергей Анисимов
кандидат медицинских наук, ФГУ Федеральный центр сердца, крови и эндокринологии им. В.А. Алмазова (Санкт-Петербург)

Владислав Баранов
доктор медицинских наук, член-корреспондент РАМН, ГУ НИИ акушерства и гинекологии им. Д.О. Отта РАМН (Санкт-Петербург)

Александр Вайсерман
доктор медицинских наук, Институт геронтологии АМН Украины (Киев)

Алексей Волчецкий
кандидат медицинских наук, доцент, фонд «Наука за продление жизни» (Москва)

Дэвид Гемс

руководитель лаборатории C.elegans Aging Института здорового старения, Лондонский Университетский Колледж (Великобритания)

Надежда Гончарова

доктор биологических наук, Научно-исследовательский институт медицинской приматологии РАМН

Лариса Дзеранова
доктор медицинских наук, Эндокринологический научный центр РАМН (Москва)

Роман Зиновкин
кандидат биологических наук, Центр Митоинженерии МГУ (Москва)

Сергей Киселев
доктор биологических наук, профессор, Институт общей генетики РАН (Москва)

Михаил Киселевский
доктор медицинских наук, профессор, Российский онкологический научный центр им. Н.Н. Блохина РАМН (Москва)

Василий Манских
НИИ физико-химической биологии им. А.Н. Белозёрского МГУ им. М.В. Ломоносова (Москва)

Галина Мельниченко
член-корр. РАМН, Эндокринологический научный центр РАМН (Москва)

Стивен Мингер

Директор лаборатории биологии стволовых клеток Центра возраст зависимых заболеваний Вольфсона Лондонского Королевского Коледжа (Великобритания)

Андрей Миронов
доктор биологических наук, МГУ (Москва)


Анатолий Михальский
кандидат технических наук, Институт проблем управления им. В.А. Трапезникова РАН (Москва)

Алексей Москалёв
доктор биологических наук, Институт биологии Коми Научного Центра Уральского отделения РАН (Сыктывкар)

Василий Новосельцев
доктор технических наук, профессор, Институт проблем управления им. В.А. Трапезникова РАН (Москва)

Екатерина Пигарова
кандидат медицинских наук, Эндокринологический научный центр РАМН (Москва)

Игорь Попов
кандидат биологических наук, СПбГУ (Санкт-Петербург)

Евгения Селькова
доктор медицинских наук, Московский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского (Москва)

Ирина Спивак

кандидат биологических наук, Институт цитологии РАН (Санкт-Петербург)

Елена Терёшина
доктор биологических наук, Российский геронтологический научно-клинический центр Росздрава РФ (Москва)

Александр Штиль
доктор медицинских наук, Российский онкологический научный центр им. Н.Н. Блохина РАМН (Москва)


КООРДИНАТОРЫ:

Ольга Мартынюк

+7 911 756 0745

anti.starenie@gmail.com


Елена Кокурина

+7 985 139 5088

Longevity.foundation@gmail.com


Мария Коноваленко

+7 926 521 5377

Maria.konovalenko@gmail.com

info@scienceagainstaging.com