Пропедевтический курс для интернет-консультантов Под редакцией А. В. Мартынихина

Вид материала

Библиографические базы данных
Библиографическая база данных MEDLINE
Medical Subject Headings (MeSH).
Программа OVID
Search Fields
Уточнение запросов по тезаурусу MeSH
Permutted Index
Scope Note
Многоаспектный поиск
Search UnCover

Подобный материал:

1 2 3 4 5 6 7 8

Библиографические базы данных

Библиографические ресурсы Интернет представлены прежде всего базами данных (БД). Через Сеть можно получить доступ к огромному количеству БД.

Самой авторитетной базой данных в мире является медицинская БД MEDLINE. Она используется в различных автоматизированных ИПС – в частности, OVID и Grateful Med. Благодаря спонсорской поддержке бесплатный доступ к MEDLINE возможен сразу на нескольких Web-узлах.

Библиографическая база данных MEDLINE

База данных MEDLINE создается начиная с 1966 года в Национальной медицинской библиотеке США. Это основная реферативная база данных по мировой медицинской литературе, информирующая о научных исследованиях, клинической практике, управлении, политике в сфере здравоохранения. Она характеризуется широким тематическим охватом, включая клиническую и экспериментальную медицину, анатомию, физиологию, микробиологию, психиатрию и др.

База Данных MEDLINE рекомендована Всемирной организацией здравоохранения.

Массив MEDLINE содержит библиографическую информацию о статьях из более чем 3900 современных научных журналов на 70 языках мира. С 1975 года база данных является реферативной, т.е. содержит рефераты статей – краткое изложение их основного содержания. Рефераты, как правило, написаны специальными сотрудниками Национальной медицинской библиотеки США. Рефератами в MEDLINE сопровождается около 60-65% библиографических записей. Все рефераты – на английском языке.

В качестве информационно-поискового языка в БД MEDLINE использован тезаурус Medical Subject Headings (MeSH). Тезаурус разработан Национальной медицинской библиотекой США и применяется при составлении библиографического указателя Index medicus. Тезаурус содержит более 15000 предметных рубрик. В основной части тезауруса рубрики (дескрипторы) расположены в алфавитном порядке, а в приложении, носящем название «дерево», они сгруппированы в 15 обширных тематических областей: A – анатомические термины, B – организмы, C – заболевания и т.д. Кроме рубрик, тезаурус MeSH содержит также перечень типовых подрубрик (модификаторов), отражающих отдельные аспекты предметов. Например, для болезней применяются такие подрубрики, как диагностика, иммунология, терапия, хирургия и др. Тезаурус MeSH требует специального изучения. Ознакомиться с ним можно на сервере Национальной медицинской библиотеки США (ссылка скрыта) или через Medical Matrix (www.medmatrix.org).

Программа OVID

gateway.ovid.com

Поисковая программа OVID, разработанная фирмой CD Plus Technologies, предназначена для поиска информации как в сети Интернет, так и на лазерных компакт-дисках.

В библиотеке СПбГМУ им. акад. И.П. Павлова имеется база данных (БД) MEDLINE на CD-ROM дисках за период с 1992 по январь 1999 г.

Работа в программе начинается с ввода имени и пароля. Следующий шаг – выбор базы данных. Можно выбрать данные за различные хронологические периоды:

с 1996 г. по настоящее время;
с 1966 по 1995 гг.;
с 1991 по 1995 гг.;
с 1985 по 1990 гг.;
с 1976 по 1984 гг.;
с 1966 по 1975 гг.;
с 1966 г. по настоящее время.

Программа OVID позволяет осуществлять поиск информации по следующим элементам:

теме (предметным рубрикам, ключевым словам);
фамилии автора;
заглавию статьи;
названию источника (журнала);
персоналиям (фамилии лица, которому посвящена статья);
учреждению, в котором работает автор.

Тематический поиск по предметным рубрикам (дескрипторам MeSH) осуществляется следующим образом. Термин нужно ввести в поисковую строку (для выбора терминов удобно использовать двуязычный тезаурус Медицинские предметные рубрики, составленный ГЦНМБ). Нажать кнопку Perform Search. На экране высвечиваются все предметные рубрики, в которые входит данный термин; следует выбрать нужную рубрику. После этого можно выбрать один из четырех вариантов:

только одну данную рубрику, без включения нижестоящих понятий (сохранить уже имеющуюся пометку);
рубрику со всеми входящими в нее нижестоящими понятиями (Explode);
только те документы, в которых данная тема является главной (Focus);
ключевое слово, входящее в заглавие статьи, текст реферата или перечень предметных рубрик (mp).

Дальнейшее сужение поиска - выбор подрубрик, отражающих отдельные аспекты темы. Можно выбрать одну или несколько подрубрик. Если пользователя интересуют все аспекты темы, выбирается вариант "все подрубрики" (All Subheadings).

После этого на экране появляется строка, содержащая формулировку предметной рубрики, сокращенные обозначения подрубрик и количество документов по данной теме. Если был выбран вариант focus (главная тема), то перед предметной рубрикой стоит знак * (звездочка). Если был выбран вариант All Subheadings (все подрубрики), то после предметной рубрики стоит знак / (косая черта).

Можно не пользоваться тезаурусом, а проводить поиск непосредственно по ключевым словам, входящим в библиографическое описание и предметные рубрики. Для этого нужно убрать пометку Map terms to Subject Headings, а затем ввести нужное слово или словосочетание. В этом случае система не предлагает пользователю сузить поиск. Поисковое выражение (ключевое слово и количество документов) высвечивается сразу. После ключевого слова имеется пометка mp.

Для поиска статей определенного автора или статей, опубликованных в определенном журнале, необходимо ввести нужную фамилию и инициалы либо название журнала. Затем нажать кнопки: Author– для поиска по фамилии автора, Journal–для поиска по названию журнала. Из предложенного алфавитного списка, выбрать то, что необходимо.

Для поиска статьи по заглавию необходимо ввести заглавие статьи (или его часть) и нажать кнопку Title. Результаты поиска высвечиваются сразу, без промежуточных этапов.

Для проведения поиска по другим элементам нужно использовать поисковые поля ( Search Fields). В режиме Search Fields предусмотрены возможности поиска по любым элементам, в том числе и рассмотренным ранее (автору, заглавию статьи, названию журнала, предметным рубрикам, ключевым словам), а также по целому ряду других полей: языку, стране, году издания, номеру тома, заглавию статьи на языке оригинала, типу публикации и др. Нажав кнопку i (information), можно прочитать характеристику каждого поискового поля и определить год ввода данного поля в БД MEDLINE.

Уточнение запросов по тезаурусу MeSH

Нажав кнопку Tools, можно обратиться к тезаурусу MeSH. Вначале необходимо ввести предметную рубрику. Предусмотрены следующие возможности:

Просмотр «дерева» дескрипторов (Tree). Это определение того, какое место занимает выбранный Вами термин в иерархической классификации. Для просмотра «дерева» дескрипторов вводится предметная рубрика целиком, так, как она сформулирована в тезаурусе MeSH.
Просмотр «дерева» дескрипторов представляет собой процесс, аналогичный работе с алфавитно-предметным указателем к традиционному предметному каталогу.
Просмотр пермутационного указателя ( Permutted Index) дает возможность разыскать в тезаурусе MeSH все термины, содержащих нужную последовательность букв. Для просмотра пермутационного указателя вводится одно слово. При работе с традиционными карточными каталогами аналогов этому варианту нет, но некоторые библиографические пособия (например, указатель Медицина и здравоохранение) имеют вспомогательные пермутационные указатели.
Просмотр дескрипторной статьи ( Scope Note) дает возможность узнать определение термина и год его ввода в тезаурус MeSH.

При узких запросах рекомендуется просмотр пермутационного указателя, при широких - просмотр "дерева" (для того, чтобы в поисковое выражение был включен не только обобщающий термин, но и все нижестоящие).

Пример 1. АСПИРИН (ASPIRIN). Запрос узкий, конкретный; выбор термина производится по пермутационному указателю дескрипторов.

Пример 2. ПРОТИВОВОСПАЛИТЕЛЬНЫЕ СРЕДСТВА НЕСТЕРОИДНЫЕ (ANTI-INFLAMMATORY AGENTS, NON-STEROID). Запрос широкий. Выбор термина - по "дереву" дескрипторов; при этом в поисковое выражение будут включены все лекарственные препараты данной группы.

Многоаспектный поиск

Комбинирование поисковых выражений осуществляется нажатием кнопки Combine. Пользователь выбирает из имеющихся на экране поисковых выражений те строки, которые будут соединены логическими операторами. Затем выбирается сам оператор: AND (так по умолчанию) или OR.

Логический оператор AND означает, что могут присутствовать оба термина одновременно. Логический оператор OR означает, что должен присутствовать либо первый термин, либо второй, либо оба термина вместе.

Можно, не нажимая кнопки Combine, комбинировать термины непосредственно на поисковой строке, например: 1 AND 2; 5 OR 6: 7 NOT 8 и т.п. Логический оператор NOT, означающий, что данный термин не должен присутствовать в документах, может быть реализован только таким образом.

Пример 1. ЗАПРОС. Лечение ревматоидного артрита аспирином.

Строка 1. Arthritis, rheumatoid (Explode) / drug therapy.

Строка 2. Aspirin.

Строка 3. 1 and 2.

Пример 2. ЗАПРОС. Язвенные поражения желудочно-кишечного тракта у больных с трансплантированной почкой и их ассоциация с HLA-антигенами.

Строка 1. Peptic ulcer (Explode).

Строка 2. Kidney transplantation.

Строка 3. HLA antigens (Explode).

Строка 4. 1 AND 2 AND 3. Результат – 1.

На этом этапе поиска выясняется, что запрос необходимо расширить. Разбиваем его на два более широких запроса.

ЗАПРОС A. Язвенные поражения желудочно-кишечного тракта у больных с трансплантированной почкой.

Строка 5. 1 AND 2.

ЗАПРОС B. HLA-антигены у больных с трансплантированной почкой.

Строка 6. 2 AND 3.

Значение рассмотренного примера состоит в следующем. При формулировании запроса пользователь должен решить, что для него более важно: ПОЛНОТА информации или ее ТОЧНОСТЬ. Если Вы выбираете ПОЛНОТУ, как мы это сделали в рассмотренном примере, будьте готовы к тому, что в ответ на ваш запрос будет получено какое-то количество не нужных Вам документов ("информационный шум"). При выборе же ТОЧНОСТИ "шума" не будет, но Вы не застрахованы от потерь информации. Опытные пользователи автоматизированных информационных систем обычно делают выбор в пользу ПОЛНОТЫ информации, поскольку лучше выбрать из большого массива документов то, что нужно, чем рисковать потерять то, что может оказаться полезным. Точность обеспечивается самой поисковой программой. На это нацелены все варианты сужения поиска: возможность выбора главной темы, подрубрик, а также лимитирования.

Программа OVID предусматривает большое количество ограничений – лимитов для сужения поиска.

На главной поисковой странице можно установить следующие лимиты:

только клинические работы (human);
только реферированные статьи (abstracts);
только статьи на английском языке (English);
статьи, опубликованные в определенные годы;
статьи, полный текст которых доступен (full text available).

Нажав кнопку Limit, пользователь получает возможность наряду с перечисленными лимитами установить также ряд других, важнейшим из которых является ограничение по языку (языки перечислены в алфавитном порядке). Кнопку Limit необходимо нажимать также в том случае, если устанавливается ограничение не для последней строки поискового предписания, а для одной из предыдущих.

Закончив работу с запросом, переходим к просмотру результатов поиска. Можно просмотреть библиографические описания первых 10 документов. Для каждого документа предусмотрена возможность обращения через гиперссылки к полному библиографическому описанию (complete reference) или реферату (Abstract). Переход к следующим 10 документам - Next. Переход к предыдущим 10 документам - Previous.

Документы, выбранные для записи в файл, нужно пометить. Для записи результатов поиска в файл нужно произвести ряд действий, в нижней части страницы.

В столбце Citations пометить: Selected или All; либо ввести номера документов (не более 200, например, 1-200).
В столбце Fields выбрать: только библиографическое описание (Citation), библиографическое описание с рефератом (Citation + Abstract); полное библиографическое описание с приведением заглавия статьи на языке оригинала и с рефератом (Complete Reference), либо набор поисковых полей по вашему выбору (Select Fields). Предпочтительно выбирать полное библиографическое описание (Complete Reference): только в этом случае будут приведены заглавия статей на языке оригинала, если этот язык не английский.
По желанию можно сохранить стратегию поиска (Search History).
В столбце Citation Format по умолчанию выбирается формат Ovid.
В столбце Save Format по умолчанию выбирается DOS-Windows.
В столбце Action нажать кнопку Save. Задать имя файла.

На том же сервере ссылка скрыта представлены БД:

Journals@Ovid, содержащая большое количество полных текстов статей из нескольких сотен медицинских и естественнонаучных журналов (главным образом с 1996 г.);
реферативная БД HealthStar по социальной медицине и организации здравоохранения (ведется с 1975 г.) Подробную информацию о базах данных можно прочесть, нажав кнопку i.

Существуют различные интерфейсы БД MEDLINE и различные поисковые программы. Среди наиболее известных следует отметить программы Grateful Med (ссылка скрыта, доступ пользователей не ограничен) и PubMed (доступна через Medical Matrix (ссылка скрыта), а также через сервер Национальной медицинской библиотеки США ссылка скрыта).

Что касается других баз данных по медицине, в особенности предоставляющих полные тексты статей, то пользование ими, как правило, является платным.

Из бесплатных БД заслуживает внимания библиографическая база данных UnCover (ссылка скрыта) – единственная в своем роде англоязычная БД универсального содержания. Она содержит описания книг и статей из наиболее авторитетных журналов и сборников, в том числе по медицине.

При входе на сервер нужно выбрать иконку с надписью Search UnCover, а затем в появившемся меню – Search UnCover Now. Методика поиска очень проста благодаря максимально облегченному дружественному интерфейсу. Поиск можно проводить по фамилии автора, названию периодического издания или ключевым словам. В запросе возможно применение логических операторов AND, OR, NOT и использование части термина (усечение) с помощью значка * (звездочка).

Большинство библиографических записей в UnCover содержат сведения о плате за возможную пересылку полного текста источника по факсу, включая оплату авторского права.