Рабочая программа дисциплины «физико-химические методы в экологии» Код дисциплины по учебному плану ен. Р. 2

Вид материала

Рабочая программа

Содержание Рабочая программа 1. Организационно-методический раздел 2. Распределение часов по темам и видам работ 3. Содержание программы Тема 2. Физико-химическая характеристика макромолекул. Тема 3. Методы непосредственного наблюдения Тема 4. Хроматография Тема 5. Электрофорез Тема 6. Спектроскопические методы Тема 7. Центрифугирование Тема 8. Прочие физико-химические методы анализа 4. Формы промежуточного и итогового контроля Итоговый контроль 5. Учебно-методическое обеспечение курса Лист обновления

Подобный материал:

• Рабочая программа дисциплины «математические методы и модели в экологии» Код дисциплины, 129.07kb.
• Рабочая программа дисциплины «методика преподавания экологии» Код дисциплины по учебному, 283.89kb.
• Рабочая программа дисциплины «радиационная экология» Код дисциплины по учебному плану, 137.34kb.
• Рабочая программа дисциплины «экология гидробионтов» Код дисциплины по учебному плану, 130.55kb.
• Рабочая программа дисциплины «методы асептики в микробиологической практике» Код дисциплины, 88.27kb.
• Рабочая программа дисциплины «жизнь микроорганизмов в экстремальных условиях» Код дисциплины, 123.41kb.
• Рабочая программа дисциплины «Зоология» Код дисциплины по учебному плану опд, 751.31kb.
• Рабочая программа дисциплины «экологический мониторинг» Код дисциплины по учебному, 254.39kb.
• Рабочая программа дисциплины «Цитология и гистология» Код дисциплины по учебному плану, 271.37kb.
• Рабочая программа дисциплины «методика преподавания биологии» Код дисциплины по учебному, 350.54kb.

МИНОБРНАУКИ РОССИИ

Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования

«Иркутский государственный университет»

(ФГБОУ ВПО «ИГУ»)


«Утверждаю»

_____________________

Первый проректор,

Проректор по учебной работе,

проф. И. Н. Гутник

«____»_____________20____г.


Биолого-почвенный факультет

Кафедра физико-химической биологии


РАБОЧАЯ ПРОГРАММА


дисциплины «ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ В ЭКОЛОГИИ»


Код дисциплины по учебному плану ЕН.Р.2

Для студентов специальности 020801.65 - Экология




г. Иркутск


1. ОРГАНИЗАЦИОННО-МЕТОДИЧЕСКИЙ РАЗДЕЛ


Цель курса

Ознакомить студентов с современными физико-химическими методами исследований и анализа объектов окружающей среды - воздуха, вод, почв, живых организмов.


Задачи курса

• рассмотреть теоретические основы современных физико-химических методов, используемых в экологических исследованиях;
  
• изучить общие лабораторные и специальные методы исследования объектов окружающей среды;
  
• рассмотреть принципы работы современной аналитической аппаратуры;
  
• обучить основам постановки эксперимента и обработки материалов исследования;
  
• ознакомить с особенностями анализа реальных объектов окружающей среды.
  

Место курса в процессе подготовки специалиста

Настоящий курс является обязательным для подготовки студентов II курса биолого-почвенного факультета по специальности 020801 - «Экология». В качестве основы для данной дисциплины используются такие базовые курсы, как общая и неорганическая химия, аналитическая химия, общая экология, а также курс высшей математики и общей физики. Эти дисциплины создают необходимую теоретическую базу и формируют достаточные практические навыки для понимания и осмысления информации, излагаемой в данном курсе.

Данная дисциплина является необходимой основой при изучении курсов, рассматривающих особенности анализа объектов окружающей среды (Экологический мониторинг)

2. РАСПРЕДЕЛЕНИЕ ЧАСОВ ПО ТЕМАМ И ВИДАМ РАБОТ

для студентов очного отделения

№	Темы, разделы	Всего часов	Виды подготовки		Самостоятельная работа
			Лекции	Практические, семинарские, лабораторные занятия	Самост. работа студентов	КСР
1	Тема 1. Введение. Общая характеристика физико-химических методов анализа.	4	2	2	-	-
2	Тема 2. Физико-химическая характеристика макромолекул	6	2	2	2	-
3	Тема 3. Методы непосредственного наблюдения	7	2	2	2	1
4	Тема 4. Хроматография	11	4	4	3	-
5	Тема 5. Электрофорез	8	2	2	3	1
6	Тема 6. Спектроскопические методы	7	2	2	3	-
7	Тема 7. Центрифугирование	4	2	2	-	-
8	Тема 8. Прочие физико-химические методы анализа	8	2	2	3	1
ВСЕГО часов		55	18	18	16	3

3. СОДЕРЖАНИЕ ПРОГРАММЫ


3.1 Общее (по всем темам)

Тема 1. Введение. Общая характеристика физико-химических методов анализа.

Предмет и задачи курса. Место и роль современных физико-химических методов исследования в современной биологии, экологии и медицине. Связь дисциплины с химией, физикой, математикой и смежными дисциплинами. Принципы классификации физико-химических методов анализа. Методы непосредственного наблюдения. Методы разделения и идентификации веществ. Гидродинамические методы. Спектроскопические методы. Общие лабораторные методы. Иные методы анализа. Чувствительность методов. Виды, источники и характеристики погрешностей. Математическая обработка результатов измерений и экспериментов.

Тема 2. Физико-химическая характеристика макромолекул.

Размеры молекул. Органические кислоты. Классификация кислот: окси- и кетоислоты, моно-, ди- и трикарбоновые кислоты. Особенности выделения и идентификации органических кислот. Общая характеристика аминокислот. Заряд молекулы. Полярные и неполярные аминокислоты. Полипептидные и полинуклеотидные цепи. Связи, обусловливающие взаимодействие аминокислот в белках. Пептидная связь.

Липиды. Общая характеристика. Классификация липидов. Экстракция и методы определения качественного и количественного состава липидов. Углеводы. Общая характеристика. Классификация углеводов. Выделение растворимых и нерастворимых углеводов из проб. Фракционировние углеводов. Методы определения содержания свободных моносахаридов, олигосахаридов, запасных и структурных полисахаридов.

Нуклеиновые кислоты. Компоненты нуклеиновых кислот. Азотистые основания, нуклеозиды, нуклеотиды. Связи, возникающие в полинуклеотидной цепи. Первичная, вторичная, третичные структуры белков и нуклеиновых кислот. Нативная и денатурированная структура биополимера. Переход спираль-клубок. Детергенты. Ренатурация, диссоциация и реассоциация. Гибридные молекулы. Линейные и циклические полинуклеотидные молекулы.

Низкомолекулярные органические вещества: флавоноиды, алкалоиды, терпеноиды. Минеральные вещества. Методы извлечения и определения отдельных компонентов.

Тема 3. Методы непосредственного наблюдения

Оптическая микроскопия. Основы теории микроскопии. Темнопольная, фазово-контрастная, интерференционная, поляризационная микроскопия. Люминесцентная и флуоресцентная микроскопия. Конфокальная микроскопия.

Электронная микроскопия. Принцип действия электронного микроскопа. Подготовка образцов. Контрастирование. Трансмиссионная и сканирующая микроскопия. Зондовая микроскопия. Возможности разных видов микроскопии и сферы их применения. Цито- и гистохимические микроскопические исследования. Исследование локализации веществ в клетке. Микроскопические подходы в изучении структурной организации клеток и тканей.

Тема 4. Хроматография

История развития хроматографии. Классификация хроматографических методов по агрегатному состоянию фаз, по технике выполнения, по механизму взаимодействия сорбента и сорбата, по цели хроматографического процесса, в зависимости от способа проведения хроматографического процесса.

Физико-химические основы хроматографического процесса. Теория теоретических тарелок и кинетическая теория хроматографии. Факторы, влияющие на селективность и эффективность разделения. Хроматографический пик и его характеристики. Основные хроматографические параметры: время и объем удерживания. Коэффициент удерживания. Коэффициент емкости. Коэффициент селективности. Анализ и методы расчета хроматограмм. Качественный и количественный анализ. Метод нормировки, метод внешнего стандарта и метод внутреннего стандарта.

Газовая хроматография. Классификация методов газовой хроматографии. Неподвижные фазы, способы их получения и подготовки. Классификация носителей в газожидкостной хроматографии. Характеристики неподвижных жидких фаз. Особенности газовых хроматографов. Способы введения жидких и газовых проб. Детекторы, общие требования и основные характеристики. Неионизационные и ионизационные детекторы: принцип работы, детектируемые вещества, пределы обнаружения. Способы концентрирования микропримесей из воздуха, вод и почв.

Жидкостная хроматография. Особенности и классификация разновидностей метода. Принципиальная схема жидкостного хроматографа. Принципы детектирования в жидкостной хроматографии. Фотометрический, флуоресцентный, рефрактометрический и электрохимические детекторы. Распределительная (жидкость-жидкостная) хроматография. Сущность метода. Неподвижные фазы: иммобилизованные жидкости и химически закрепленные обращенные и нормальные фазы. Подвижные фазы, элюирующая сила подвижной фазы. Применение распределительной жидкостной хроматографии при анализе объектов окружающей среды. Адсорбционная жидкостная хроматография. Нормально-фазовая (НФХ) и обращенно-фазовая (ОФХ) хроматографии. Неподвижные и подвижные фазы. Классификация растворителей. Ионная хроматография. Классические и высокоэффективные методы. Неподвижные фазы, требования, предъявляемые к ним. Классификация ионообменников. Селективность ионного обмена. Гель-хроматография. Молекулярная эксклюзия. Неподвижные фазы. Подвижные фазы. Применение гель-хроматографии. Бумажная и тонкослойная распределительная хроматография. Возможности, преимущества, недостатки. Неподвижные и подвижные фазы. Нанесение пробы и получение хроматограмм. Детектирование. Коэффициент удерживания и коэффициент емкости. Применение тонкослойной хроматографии.

Тема 5. Электрофорез

Теория электрофореза. Виды электрофореза: с подвижной границей, зональный, непрерывный. Низковольтный и высоковольтный электрофорез. Оборудование для электрофореза. Электрофорез на бумаге, гель-электрофорез. Типы используемых гелей: полиакриламидный, агарозный, крахмальный. Область применения разных гелей. Денатурирующий электрофорез – SDS-электрофорез. Электрофорез в градиенте пористости геля. Диск-электрофорез. Изоэлектрофокусирование. Иммуноэлектрофорез. Иммуноблоттинг. Нозерн-, саузерн-гибридизация. Использование электрофореза для разделения и идентификации белков и нуклеиновых кислот. Определение молекулярной массы биополимеров. Применение электрофореза для анализа множественных форм ферментов. Аналитический и препаративный электрофорез. Непрерывный электрофорез. Капиллярный электрофорез. Сущность метода. Электроосмотический поток и его использование для разделения веществ. Приборы для капиллярного электрофореза. Возможности метода.

Тема 6. Спектроскопические методы

Общая теория поглощения света молекулами. Абсорбционная спектроскопия. Энергетические уровни молекул и атомов. Хромофоры. Спектры поглощения молекул. Молярный коэффициент экстинкции. Закон Ламберта-Бэра. Оптическая плотность. UV-VIS спектроскопия. Инфракрасная спектроскопия. Использование спектроскопии в экологических и биологических исследованиях: определение концентрации веществ, изучение биохимических реакций, идентификация веществ путем спектральных измерений, исследование денатурации-ренатурации ДНК, исследование динамических свойств белков и т.д. Спектрофотометрические приборы. Фотоэлектрокалориметры. Спектрофотометры. Атомно-адсорбционные спектрометры. Флуоресцентная спектроскопия. Общая теория флуоресценции. Квантовый выход флуоресценции. Тушение флуоресценции. Резонансный перенос энергии. Приборы для измерения флуоресценции. Спектрофлуориметры. Флуоресцентные метки и зонды. Флуоресцентная микроскопия. Метод флуоресцирующих антител. Ядерный магнитный резонанс и электронный парамагнитный резонанс (ЯМР и ЭПР). Основы ЯМР и ЭПР. Фурье-спектроскопия ЯМР. Аппаратура для измерения ЯМР и ЭПР. ЯМР-спектрометры. Использование методов для получения информации о структуре биополимеров, о взаимодействии между молекулами и о молекулярном движении.

Тема 7. Центрифугирование

Теоретические основы метода. Центробежная и центростремительная силы. Седиментация. Основы теории седиментации. Скорость седиментации. Коэффициент седиментации. Масса и форма молекул и седиментационные свойства. Седиментационное равновесие. Факторы, влияющие на седиментацию – концентрация, скорость и заряд молекулы. Центрифуги: аналитические и препаративные. Типы роторов. Методы центрифугирования: дифференциальное и в градиенте плотности. Зональное центрифугирование. Применение методов центрифугирования для выделения клеточных структур, фракционирования органических веществ, определения молекулярной массы макромолекул. Ультрацентрифугирование. Оптические системы для измерения концентрации компонентов при центрифугировании: шлиреновская, интерференционная и абсорбционная. Примеры использования зональное и скоростной седиментации.

Тема 8. Прочие физико-химические методы анализа

Пробоподготовка. Правила отбора проб. Подготовка образцов для биохимического и физиологического исследования. Фиксация, основные типы фиксаторов. Криосохранение. Высушивание образцов.

Способы гомогенизации свежего и фиксированного материала. Гомогенизаторы. Концентрирование растворов. Центрифугирование. Высаливание. Упаривание. Вакуумный ротационный испаритель. Лиофилизация. Диализ.

Электрометрия. рН-метрия. Принципы измерения рН. Устройство рН-метра. Типы электродов. Потенциометрические методы исследования химического состава и функций. Определение содержания минеральных веществ. Определение активности ферментов. Полярографические методы.

Газоаналитические методы. Оптико-акустические и инфракрасные газоанализаторы. Принципы измерения концентрации газов. Использование газометрии в решении биологических и экологических задач.

Метод «меченых» атомов. Изотопы, используемые в биологических исследованиях. Типы ядерных распадов: α- β- γ-распад. Период полураспада. Характеристика ³H, ¹⁴С, ³²P, ³⁵S, ⁴⁰K, ⁴⁵Ca. Измерение радиоактивности в биологических объектах. Подготовка образцов для радиометрии. Явление самопоглощения. Использование метода меченых атомов в исследовании структуры и свойств молекул, метаболизма, функций клеток и организмов: анализ структуры нуклеиновых кислот и белков, выявление локализации веществ в клетках и клеточных структурах, определение активности ферментов, изучение путей обмена веществ. Авторадиография.


3.2 Темы семинарских занятий

К теме 1:

• Роль физико-химических методов в современной экологии и биологии;
  
• Наиболее существенные открытия в развитии физико-химических методов;
  
• Роль математических методов в физико-химическом анализе
  

К теме 2:

• Физико-химические свойства аминокислот, белков, углеводов, липидов и нуклеиновых кислот;
  
• Роль физико-химических методов в понимании структуры и функции биомолекул;
  
• Вычислительная техника в физико-химическом анализе
  

К теме 3:

• Основные этапы развития метода микроскопии;
  
• Оптическая микроскопия: разновидности метода;
  
• Электронная микроскопия: принцип метода и возможности применения в биологии и экологии
  

К теме 4:

• Необходимость фракционирования веществ. Основные методы разделения;
  
• Теоретические основы хроматографии;
  
• Виды хроматографии, их отличительные характеристики;
  
• Качественный и количественный анализ результатов хроматографического разделения;
  
• Область применения хроматографии в экологических и биологических исследованиях.
  

К теме 5:

• Теоретические основы электрофореза;
  
• Двумерный электрофорез, изоэлектрофокусирование и капиллярный электрофорез;
  
• Особенности электрофореза белков и нуклеиновых кислот;
  
• Оборудование для электрофореза.
  

К теме 6:

• Квантовые основы абсорбции излучения;
  
• Спектроскопия в видимой, ультрафиолетовой и инфракрасной области излучения – отличительные особенности;
  
• Флуоресцентная спектроскопия;
  
• Электронный парамагнитный резонанс – принцип метода.
  

К теме 7:

• Теории скорости седиментации;
  
• Разновидности метода центрифугирования, область их применения;
  
• Оптические методы в центрифугировании.
  

К теме 8:

• Методы подготовки образцов для физико-химического анализа
  
• Методы концентрирования растворов
  
• Потенциометрические и полярографические методы.
  
• Методы с применением «меченых» элементов.
  

3.3 Тематика заданий для самостоятельной работы

Углубление знаний по курсу осуществляется за счет организации самостоятельной работы студентов по разделам, установленных программой дисциплины.

1. Открытия, определившие развития физико-химических методов. Исторические аспекты.
   
2. Математические методы в физико-химических исследованиях биологических и экологических систем.
   
3. Физико-химические свойства аминокислот, и белков
   
4. Физико-химические свойства липидов и углеводов
   
5. Физико-химические свойства нуклеиновых кислот
   
6. Оптическая микроскопия
   
7. Электронная и зондовая микроскопия
   
8. Детекторы, используемые в хроматографическом анализе
   
9. Газожидкостная хроматография
   
10. Аффинная хроматография.
    
11. Двумерный электрофорез.
    
12. Изоэлектрофокусирование.
    
13. Капиллярный электрофорез.
    
14. Флуоресцентная спектроскопия.
    
15. Электронный парамагнитный резонанс
    
16. Оптические системы для измерения концентрации компонентов при центрифугировании
    
17. Методы подготовки образцов для физико-химического анализа
    
18. Методы концентрирования растворов
    
19. Потенциометрические методы.
    
20. Полярографические методы.
    
21. Газоаналитические методы.
    
22. Методы с применением «меченых» элементов.
    
23. Компьютеры в физико-химических исследованиях.
    
24. Иммунологические методы
    

3.4 Примерный список вопросов к зачету

1. Физико-химические методы, используемые для изучения тонкой структуры клетки. Наиболее существенные открытия в развитии методов микроскопии.
   
2. Физико-химические методы, используемые для изучения функционирования клетки. Наиболее существенные открытия в развитии культуры тканей.
   
3. Физико-химические методы, используемые для изучения свойств отдельных макромолекул. Наиболее существенные открытия в развитии методов рентгеноструктурного анализа.
   
4. Физико-химические методы, используемые для изучения структуры и активных центров макромолекул. Наиболее существенные открытия в развитии методов фракционирования клеточного содержимого.
   
5. Физико-химические методы, используемые для изучения взаимодействий макромолекул в клетке. Наиболее существенные открытия в развитии методов рентгеноструктурного анализа.
   
6. Физико-химические методы, используемые для изучения взаимодействий между клетками. Наиболее существенные открытия в развитии методов микроскопии.
   
7. Физико-химические методы, используемые для изучения физико-химических параметров макромолекул. Наиболее существенные открытия в развитии методов фракционирования клеточного содержимого.
   
8. Характеристика макромолекул: полипептидные и полинуклеотидные цепи. Связи, обусловливающие взаимодействие аминокислот в белках.
   
9. Компоненты нуклеиновых кислот. Связи, возникающие в полинуклеотидной цепи. Линейные и циклические полинуклеотидные цепи. Циклы Херши.
   
10. Понятия нативной и денатурированной структуры биополимера. Детергенты. Ренатурация, диссоциация и реассоциация. Гибридные молекулы.
    
11. Электрофорез. Скорость движения частицы в электрическом поле. Электрофоретическая подвижность.
    
12. Три типа электрофореза: с подвижной границей, зональный и непрерывный.
    
13. Электрофорез с носителем и без него.
    
14. Гель-электрофорез. Характеристика агарозного геля. Явление эндосмоса в агарозном геле.
    
15. Характеристика полиакриламидного геля (ПААГ). Факторы, улучшающие разрешение электрофореза. Факторы, влияющие на полимеризацию ПААГ.
    
16. Электрофорез нуклеиновых кислот. Характеристики нуклеиновых кислот, обусловливающие особенности их электрофореза.
    
17. Низковольтный и высоковольтный гель-электрофорез нуклеиновых кислот. Электрофорез в денатурирующих гелях. Маркерные молекулы. Лидирующие красители.
    
18. Электрофорез кольцевой ДНК и РНК. Секвенирование ДНК. Маркерные молекулы. Лидирующие красители.
    
19. Электрофорез белков. ДСН-гель-электрофорез. Диск-электрофорез в ПААГ.
    
20. Двумерный гель-электрофорез. Изоэлектрическая фокусировка.
    
21. Центрифугирование. Основы теории скорости седиментации. Седиментационное равновесие.
    
22. Аналитические и препаративные центрифуги. Основные правила седиментации. Коэффициент седиментации.
    
23. Скоростное центрифугирование. Факторы, влияющие на скорость седиментации.
    
24. Зональное центрифугирование. Зависимость седиментации от концентрации. Стандартные коэффициенты седиментации.
    
25. Оптические системы, используемые для определения концентрации компонентов в центрифугах.
    
26. Седиментация ДНК в щелочном градиенте сахарозы. Измерение молекулярной массы методом седиментационного равновесия. Примеры использования скоростной и зональной седиментации.
    
27. Хроматография. Теория хроматографического процесса. Классификация хроматографических методов по принципу фракционирования, по месту расположения неподвижной фазы.
    
28. Распределительная хроматография: принцип метода и коэффициент распределения.
    
29. Адсорбционная хроматография: изотермы адсорбции.
    
30. Ионообменная хроматография.
    
31. Аффинная хроматография.
    
32. Гель-фильтрация.
    
33. Оптимизация условий фракционирования в хроматографическом эксперименте. Хроматография макромолекул. Определение молекулярной массы белка.
    
34. Принципы, возможности и разрешающая способность микроскопии.
    
35. Оптическая: световая и эпифлуоресцентная микроскопия.
    
36. Электронная: сканирующая и просвечивающая (трансмиссинная) микроскопия. Визуализация клеток и возможности методов сопряженного анализа.
    
37. Техника подготовки препаратов для микроскопии.
    
38. Общие лабораторные методы. Измерение рН. Введение радиоактивных меток и измерение радиоактивности. Мембранная фильтрация и диализ.
    
39. Спектроскопические методы. Электромагнитный спектр. Поглощение и испускание излучения. Ультрафиолетовые спектры поглощения белков и нуклеиновых кислот.
    
40. Колебательные спектры: инфракрасное поглощение. Ядерный магнитный резонанс.
    

4. ФОРМЫ ПРОМЕЖУТОЧНОГО И ИТОГОВОГО КОНТРОЛЯ:

Цель контроля: определение уровня подготовки студентов по дисциплине.

Текущий контроль проводится для оценки степени усвоения студентами учебных материалов, обозначенных в учебной рабочей программе, и осуществляется в виде непрерывного и рубежного контроля. К непрерывному контролю относятся систематические проверки знаний и навыков студентов в форме устного опроса, решения расчетных и ситуационных задач, рефератов. Текущий контроль осуществляется на семинарских занятиях. Рубежный контроль (тестирование) охватывает содержание части курса и осуществляется в ходе аттестации в середине семестра.


Итоговый контроль - зачет (4 семестр). К зачету допускаются студенты, выполнившие в полном объеме самостоятельную работу и успешно сдавшие две промежуточные аттестации.

Студенты, вовремя выполнившие все обязательные виды деятельности и набравшие в ходе тестирования не менее 60 % баллов, получают зачет автоматически. Студенты, имеющие задолженность, должны выполнить все обязательные виды деятельности, а затем сдают зачет по вопросам в виде собеседования.

Критерии оценки: ответ полный, раскрывающий историю рассматриваемой проблемы, основных акторов проблемы, теоретические положения проблемы, пути их решения.

Формально: оценивается достижение целей образовательного стандарта высшего профессионального образования и соответствия фактического уровня развития личности профессионала проектируемому.


5. УЧЕБНО-МЕТОДИЧЕСКОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ КУРСА

Интернет-источники

1. ссылка скрыта - Интернет версия международного журнала по биохимии и биохимическим аспектам молекулярной биологии, биоорганичемской химии, микробиологии, иммунологии, физиологии и биомедицинских иссследований. Статьи в pdf-формате.
   
2. ссылка скрыта - Поиск электронных книг, публикаций, законов, ГОСТов на сайтах научных электронных библиотек. В поисковике отобраны лучшие библиотеки, в большинстве которых можно скачать материалы в полном объеме без регистрации. В список включены библиотеки иностранных университетов и научных организаций.
   
3. ссылка скрыта - Научная электронная библиотека, крупнейший российский информационный портал в области науки, технологии, медицины и образования, содержащий рефераты и полные тексты более 12 млн научных статей и публикаций.
   
4. ссылка скрыта - портал бесплатной медицинской информации, содержит большое количество книг, учебных пособий биохимической направленности.
   
5. ссылка скрыта - описание большого количества физико-химических и молекулярно-генетических методов.
   
6. ссылка скрыта - просмотр патентов на United States Patents and Trademark office.
   
7. ссылка скрыта - протоколы методов A Laboratory Manual. Joseph Sambrook and David W. Russell.
   
8. ссылка скрыта - Сайт содержит хорошо структурированную коллекцию ссылок на протоколы методов (в основном, различных лабораторий). Имеется тематический форум.
   
9. ссылка скрыта - книга А.Н. Шендрика «Инструментальные методы исследования в биохимии»
   

Оборудование

1. Для лекционных занятий используется мультимедийный проектор и ноутбук;
   
2. при выполнении заданий самостоятельной работы студенты могут пользоваться компьютерами компьютерного класса биолого-почвенного факультета.
   

Материалы

а) Видеоклипы для лекций: «Тонкослойная хроматография красителя»; «Колоночная хроматография»; «Электрофорез»; «Гель-электрофорез»; «ВЭЖХ»; «ИК-спектроскопия»; «ЯМР»; «SDS-электрофорез»; «Тонкослойная хроматография»; «Тонкослойная и колоночная хроматография»; «УФ- и видимая спектроскопия».

б) Презентации к лекциям: «Методы молекулярной биологии»; «Методы очистки белков. Ферменты»; «Общая характеристика физико-химических методов»; «Протеомные исследования»; «Спектроскопия»; «Хроматография»; «Хроматографы»


ЛИТЕРАТУРА

Основная

1. Аналитическая химия и физико-химические методы анализа: в 2 т. / ред. А.А. Ищенко. – М.: Академия, Т.1. – 2010. – 352 с.; Т.2. – 2010. – 412 с.
   
2. Биофизика: Учебник для вузов/ Под ред. В.Г. Артюкова. – Екатеринбург: Деловая книга, 2010. – 293 с.
   

Дополнительная

1. Белькова Н.Л. Введение в молекулярную экологию организмов / Н.Л. Белькова, А.М. Андреева.- Ярославль.: ООО Пентхаус, 2009.
   
2. Березов Т. Т. Биологическая химия / Т.Т. Березов, Б.Ф. Коровкин. – М.: Медицина, 1998. – 704 с.
   
3. Глик Б. Молекулярная биотехнология. Принципы и применение / Б. Глик, Дж. Пастернак Пер. с англ. - М.: Мир, 2002. - 589 с.
   
4. Горшков В.И. Физическая химия / В.И. Горшков, И.А. Кузнецов. – М.: Изд-во Моск. Ун-та, 1986
   
5. Дорохова Е.Н. Аналитическая химия / Е.Н. Дорохова, Г.В. Прохорова. – М.: Высш. шк., 1991
   
6. Другов Ю.С. Анализ загрязненных биосред и пищевых продуктов / Ю.С. Другов, А.А. Родин - М.: Бином, 2007.
   
7. Комов В.П. Биохимия: учебник для вузов / В.П. Комов, В.И. Шведова.-М.: Дрофа, 2008. – 640 с.
   
8. Маниатис Т. Молекулярное клонирование / Т. Маниатис, Э. Фрич, Дж. Сэмбрук. - М.: Мир, 1984. - 480 с..
   
9. Николаев Н.Я. Биологическая химия / Н.Я. Николаев. – М.: Дрофа, 2004. – 544 с.
   
10. Остерман Л.А. Исследование биологических макромолекул электрофокусированием, иммуноэлектрофорезом и радиоизотопными методами / Л.А. Остерман. - М.: Наука, 1983. - 304 с.
    
11. Остерман Л.А. Методы исследования белков и нуклеиновых кислот: Электрофорез и ультрацентрифугирование / Л.А. Остерман. - М.: Наука, 1981. - 288 с.
    
12. Рис Э. Введение в молекулярную биологию клетки / Э. Рис, М. Стернберг. - М.: Мир, 2002. - 142 с
    
13. Рубин А.Б. Лекции по биофизики. Учебное пособие / А.Б. Рубин. - М.: Изд-во МГУ, 2004. – 302 с.
    
14. Физическая химия. Принципы и применение в биологических науках / И. Тиноко, К. Зауэр, Дж. Вэнг, Дж. Паглиси - М.: Техносфера, 2005.
    
15. Фрайфелдер Д. Физическая биохимия / Д. Фрайфелдер. - М.: Мир, 1980. – 582 с.
    
16. Эллиот В. Биохимия и молекулярная биология / В. Эллиот, Д. Эллиот.- М.: Изд-во НИИ биомедицинской химии, 2000.- 366 с.
    

Кроме этого, студентам рекомендуется изучение периодических научных изданий: «Биологические мембраны», «Биохимия», «Биофизика», «Биотехнология», «Вопросы биологической, медицинской и фармацевтической химии», «Известия РАН. Серия биологическая », «Микробиология», «Молекулярная биология», «Прикладная биохимия и микробиология».

ЛИСТ ОБНОВЛЕНИЯ

Дата	Внесенные обновления	Подпись автора	Подпись зав. кафедрой

Программу составил Приставка А.А., к.б.н., доцент кафедры физико-химической биологии биолого-почвенного факультета ИГУ __________

Программа рассмотрена и утверждена на заседании кафедры физико-химической биологии ____________

дата


Зав. кафедрой физико-химической биологии профессор В.П. Саловарова __________

Согласовано: председатель УМК биолого-почвенного факультета профессор А. Н. Матвеев __________