План научно-исследовательской работы на 2012 г. Учреждения Российской Академии наук Институт биоорганической химии им академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова ран
| Вид материала | Документы |
- Vi московский международный конгресс, 625.54kb.
- М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова ран институт молекулярной генетики ран нейрохимическое, 386.57kb.
- Институт биоорганической химии имени академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова, 871.3kb.
- В. Т. Иванов, директор Института биоорганической химии им. М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова, 719.75kb.
- Международная научно-практическая конференция, 301.89kb.
- Международная научно-практическая конференция, 148.88kb.
- Международная научно-практическая конференция, 130.29kb.
- Синтетические пептиды, взаимодействующие с различными типами холинорецепторов, 487.49kb.
- Программа отчетной конференции по программе фундаментальных исследований Президиума, 123.52kb.
- Здание Правительства Москвы Мероприятие проводится в рамках Московского международного, 505.89kb.
(1)
Исследование механизма взаимодействия кальций связывающего белка акворина с его функциональным партнером – зеленым флуоресцентным белком (GFP).
Номер государственной
регистрации 01201154253
С.н.с., к.х.н.
Винокуров Л.М.
Базовое
бюджетное финансирование
Изучение ингибирования белками переноса энергии биолюминесценции химически модифицированных мутантных форм гибридного белка eGFP-Aeq.
Группа биоинженерии репортерных белков ФИБХ
2010-2012
46
51
(2)
Исследование особенностей генетической вариабельности при аутоиммунных и онкологических заболеваниях человека.
Номер государственной
регистрации 01201053940
Лебедев Ю.Б.
Базовое
бюджетное финансирование
Определение характеристических особенностей репертуара периферических Т-лимфоцитов при аутоиммунных заболеваниях.
Определение аллельных сочетаний как фактора риска анкилозирующего спондилита.
Определение функциональных особенностей продуктов рисковых аллелей.
Лаборатория сравнительной и функциональной геномики
10.01.2010 – 31.12.2012
47
52
(2)
Структурный, функциональный и эволюционный анализ геномов и его применение в биотехнологии.
Номер государственной
регистрации 01200957163
Свердлов Е.Д.
Базовое
бюджетное финансирование,
ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2012 годы»,
Государственный контракт №16.512.12.2002 2011-2012 Мин. науки,
Государственный контракт № 11411.1008700.13.082011-2013 Мин.промышлен., Программа фундаментальных исследований Президиума РАН
Разработка эффективных
промоторных модулей для
универсального использования в
генно-терапевтических
противоопухолевых средствах.
Молекулярно-функциональный
анализ процессов клеточной
трансдифференцировки в ходе
формирования клеточного
микроокружения в опухолях
легкого и поджелудочной железы
человека.
Проведение негативно-
позитивной селекции инсуляторов
в ретровирусной системе.
Исследование эволюционно
консервативной эпигенетической
регуляции процессов раннего
развития и герминогенного
опухолеобразования – путь к
терапии герминогенного рака.
Сравнительный анализ
транскриптома Mycobacterium
tuberculosis при развитии
инфекционного процесса in vivo.
Лаборатории структуры и функции генов человека
2009-2012
47
53
(2)
Регуляция синтеза рибосомных белков.
Номер государственной
регистрации 01200957170
Бони И.В.
Базовое
бюджетное финансирование
Грант РФФИ
09-04-01014
Выяснение механизмов,
вызывающих клеточную
смерть, под действием
ингибиторов аминоацил-
т-РНК-синтетаз в
штаммах E.coli, не
способных к синтезу
алармона ppGpp.
Лаборатории структуры и функции генов человека
2009-2012
47.
54
(1,4,6,7)
Структурная и функциональная геномика вирусов бактерий.
Номер государственной
регистрации 01201054516
Месянжинов В.В
Мирошников К.А.
А. Базовое
бюджетное финансирование
Грант РФФИ № 09-04-00335-а
Б.
Договор с НПО «Биопрепарат»
400
380
Определение структурно-
функциональных геномов и
протеомов фагов Pseudomonas
aeruginosa.
Трехмерная реконструкция фагов
P. aeruginosa на основе крио-
Микроскопии.
Определение пространственных
структур белков, в том числе
кристаллизация белков в
условиях микрогравитации.
Лаборатория молекулярной биоинженерии
01.01.2010-31.12.2012
01.05.2009-
01.05.2012
47
55
(7)
Функциональный анализ регуляторных и кодирующих областей генома человека.
Номер государственной
регистрации 03200950980
Буздин А.А.
Базовое
бюджетное финансирование
Программа Президиума РАН «Молекулярная и клеточная биология»
1700
Полнотранскриптомный
мониторинг микроРНК,
маркирующих прогрессию рака
мочевого пузыря человека
Группа геномного анализа
сигнальных систем клетки
01.01.2012-31.12.2012
47.
56
(2)
Полногеномный поиск функциональных последовательностей ДНК человека, созданных эволюционно недавними вставками ретротранспозонов SVA.
Номер государственной
регистрации 01201067914
Буздин А.А.
Базовое
бюджетное финансирование
Грант РФФИ
400
Анализ экспрессии открытой
рамки считывания, кодируемой
ретротранспозоном SVA в
антисмысловой ориентации
Группа геномного анализа
сигнальных систем клетки
01.01.2012-31.12.2012
47.
57
(7)
Исследование мутагенеза у эукариот.
Номер государственной
регистрации 01201054515
Л.И. Патрушев
Базовое
бюджетное финансирование
Грант РФФИ 11-08-00550
410
Разработка твердофазной ПЦР
для анализа индивидуальных
молекул ДНК.
Секвенирование полноразмерного гена CYP21A2 у 15 индивидуумов контрольной группы.
Выявление мутаций в генах
системы гемостаза
разработанными в группе
методами.
Лаборатория биотехнологии
2010-2012
47
58
(А) ( 2)
Выявление и изучение новых компонентов протеома человека, участвующих в формировании и экспорте мРНК из ядра.
Номер государственной
регистрации 01201157088
Научный руководитель темы Шпаковский Г.В.
Базовое бюджетное финансирование; программа
фундаментальных исследований Президиума РАН «Молекулярная и клеточная биология».
Анализ белков-партнёров новых изоформ субъединицы
РНК-полимеразы II человека hRPB11 в лимфоидной ткани (клеточная линия Jurkat).
Лаборатория механизмов
генной экспрессии
2010-2012 гг.
47.
59
(2)
Реконструкция in vitro мультиферментного комплекса биосинтеза экзополисахаридов у симбиотических бактерий Rhizobium leguminosarum.
Номер государственной
регистрации 01200957176
н.с. Шалойко Л.А.
Базовое
бюджетное финансирование
Синтез гликозилтрансфераз
PssF и PssI в бесклеточной
системе трансляции из зародышей
пшеницы и определить их
функции.
Проведение экспериментов по
определению функций
гликозилтрансфераз при
инкубировании смеси
протеолипосом с PssA,E,D,
катализирующими первые две
стадии синтеза ЭПС, и PssC,F,G
(в разных сочетаниях) с
предшественниками синтеза ЭПС
(UDP-[14С]Glc, UDP-Glc, UDP-
Gal, UDP-GlcA).
Группа молекулярной экологии ФИБХ
2009-2012
47
60
(2)
Структурно-функциональный анализ энзиматического метилирования ДНК эукариот в эпигенетических процессах.
Номер государственной
регистрации 01201154250
д.б.н., с.н.с. Шевчук Т.В.
Базовое
бюджетное финансирование
Грант РФФИ
10-04-00037
Поиск и выявление в геноме
среди ключевых генов белков,
ответственных за метилирование
ДНК и модификацию гистонов
новых маркерных
последовательностей,
характеризующихся
наиболее выраженными
изменениями метилирования в
ходе развития лейкозов различной
этиологии и при формировании
фенотипа множественной
лекарственной устойчивости.
Конструирование на базе
бактериальной метилтрансферазы
M.HhaI слитого белка с
присоединением специфических
пептидов, обеспечивающих
направленный транспорт всей
молекулы в ядро эукариотической
клетки для реализации нового
подхода к структурно-
функциональному анализу
особенностей CpG-сайт
специфического метилирования в
эукариотических системах.
Получение специализированного
вектора, содержащего ген
CpNpG-специфической
ДНК-метилтрансферазы cmt3 и ее
перенос в клетки модельных
растений табака.
Лаборатория
биотехнологии растений ФИБХ
2010-2012
47
61
(5)
Исследование молекулярных механизмов аутоиммунных заболеваний на примере болезни Бехтерева.
Номер государственной
регистрации 01200955697
Чудаков Д.М.
Базовое бюджетное финансирование
Программа по молекулярной и клеточной биологии отделения физико-химической биологии
Исследование закономерностей старения адаптивного иммунитета методом массированного секвенирования ограниченного пула Т клеточных рецепторов.
Программное обеспечение для системного анализа массивов данных индивидуальных репертуаров Т клеточных рецепторов и антител человека.
Новые инструменты на основе флуоресцентных белков.
Группа флуоресцентных инструментов
2012
48
62
(5)
Новые подходы к коррекции иммунного ответа: исследование иммуномодулирующих эффектов белков теплового шока, ганглиозидов и пептидов – аналогов иммунодоминантных эпитопов антигенов.
Номер государственной
регистрации – 01201053942.
Руководитель: рук. отдела иммунологии ИБХ РАН, академик Р.В. Петров
Базовое
бюджетное финансирование,
РФФИ: грант 10-04-01095-а
РФФИ: грант 11-04-01954-a
ГК №16.740.11.0200
ГК №16.512.11.2069
А. Базовое
бюджетное финансирование,
Грант по Программе Президиума РАН МКБ
Грант по Программе Президиума РАН
Б.
ГК по ФЦП "Научные и научно-педагогические кадры инновационной России"
400
400
750
4320
200 000
300 000
Исследование механизмов модулирующего действия БТШ70 на уровень экспрессии MICA опухолевыми клетками.
Исследование вовлеченности БТШ70 в аллергическое воспаление дыхательных путей. Оптимизация состава миниантигенов для разрабатотки противоаллергенных вакцин.
Получение наночастиц модифицированного хитозана для внутривенного применения.
Разработка частиц на основе хитозана для доставки вакцин мукозальным путем.
Исследование мембранных структур, ответственных за связывание с онко-ассоциированными ганглиозидами и запуск апоптоза Т-лимфоцитов, методом AFM.
Изучение механизмов индукции апоптоза опухолевых лимфоидных клеток антителами к онкоассоциированному ганглиозиду GD2.
Лаборатория клеточных взаимодействий и Группа липидных модуляторов иммунитета
Январь 2010 – декабрь 2012
48
63
(5)
Изучение биологической активности и механизма действия миелопептидов. Разработка новых лекарственных средств на основе миелопептидов.
Номер государственной
регистрации - 01201053943
Руководитель: рук. отдела иммунологии ИБХ РАН, академик Р.В. Петров
Базовое
бюджетное финансирование
Изучение влияния МП-1 в условиях индуцированного стресса: (1) на прививаемость опухолей Р-388 у мышей в условиях радиационной иммунодепрессии, (2) на возникновение рецидивов опухолей Са-755 у мышей при операционном стрессе).
Лаборатория клеточных взаимодействий
Январь 2010 – декабрь 2012
48
64
(2,7,9)
Функции нового опухолевого супрессора PDLIM4 (RIL) в нормальных клетках и при опухолевой трансформации
Номер государственной
регистрации
кбн Фролова Е.И.
Базовое
бюджетное финансирование
Грант РФФИ,
400
Анализ структурных изменений гена Src в различных опухолях молочной железы с измененным уровнем экспрессии RIL. Структурные изменения кодирующей области гена RIL в клетках рака молочной железы, в которых активация Src не сопровождается угнетением экспрессии RIL – .
Группа экспрессии белковых факторов роста и дифференцировки
2010-2012
48
65
(4, 5)
Изучение роли GMDP-связывающего белка YB-1 в передаче сигнала мурамилпептидов.
Номер государственной
регистрации И11012617272501201154254
cт.н.c. Ламан А.Г.
Базовое бюджетное финансирование
Получение поликлональных антител к белкам семейства NLR.
Проверка участия YB-1 в NOD-зависимой или NLR-зависимой передаче сигнала.
Исследование внутриклеточной локализации YB-1 и его комплекса с RN-пептидом.
Группа иммунохимии ФИБХ
2012
48
66
(10).
Моноклональные антитела для диагностики энтеротоксинов стафилококков: получение и применение.
Номер государственной
регистрации
И110127125013 01201154255
С.н.с Бровко Ф.А.
Базовое бюджетное финансирование
Получение моноклональных антител к токсинам стафилококков – альфа-гемолизину и лейкосидину.
Группа иммунохимии ФИБХ
2012
48
67
(1, 4, 8)
«Структура, динамика, механизмы действия и биологическая функция мембранных и мембрано-активных белков и пептидов»
Номер государственной
регистрации 01200957167
Рук. д.ф.-м.н. Ефремов Р.Г.
Базовое
бюджетное финансирование,
Грант РФФИ ,
ГК № 16.512.11.2172 от 16.03.2011
ГК № 16.512.11.2079 от 16.02.2011 ,
Грант РФФИ 11-04-01606 ,
Грант РФФИ ,
Грант президента РФ для государственной поддержки молодых российских ученых. МК-8439.2010.4
ГК № П818 от 24.05.2010
260
2 400
1 200
300
100
600
1 100
1. Моделирование мембранных белков и пептидов:
- Изучение роли мембранного окружения в процессе димеризации трансмембранных спиралей (ТМС) белков.
- Дальнейшая разработка и совершенствование созданного в 2009-2011 гг. вычислительного метода оценки свободной энергии димеризации ТМС: определение вкладов отдельных остатков в энергию димеризации ТМС в явно заданных бислоях.
- Систематическое изучение факторов, определяющих эффективность ассоциации ТМС (димеры битопных белков, тримеры гемагглютинина) в различном мембранном микроокружении.
2. Исследование структурно- динамических свойств липидных бислоев, имитирующих мембраны эукариот и бактерий.
- Анализ взаимодействия ионов различного типа с липидными бислоями;
- Изучение коллективных движений компонентов липидного бислоя и оценка их роли в структурно-динамической организации биомембран.
3. Дизайн аналогов низина и других лантибиотиков, «захватывающих» липид-II в липидной мембране
- Выявление молекулярных механизмов взаимодействия лантибиотиков с липидом-II в явно заданных мембранах;
- Рациональное конструирование молекул-«ловушек», способных эффективно связывать липид-II в мембране.
4. Установление механизмов действия пептидных токсинов на потенциал-чувствительные натриевые каналы
- Выявление функциональных особенностей β-токсинов скорпионов, обусловливающих их селективность к тем или иным потенциал-чувствительным Na+-каналам.
- Рациональное внесение в нейротоксины мутаций, позволяющих менять селективность действия «млекопитающие–насекомые».