План научно-исследовательской работы на 2012 г. Учреждения Российской Академии наук Институт биоорганической химии им академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова ран
| Вид материала | Документы |
- Vi московский международный конгресс, 625.54kb.
- М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова ран институт молекулярной генетики ран нейрохимическое, 386.57kb.
- Институт биоорганической химии имени академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова, 871.3kb.
- В. Т. Иванов, директор Института биоорганической химии им. М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова, 719.75kb.
- Международная научно-практическая конференция, 301.89kb.
- Международная научно-практическая конференция, 148.88kb.
- Международная научно-практическая конференция, 130.29kb.
- Синтетические пептиды, взаимодействующие с различными типами холинорецепторов, 487.49kb.
- Программа отчетной конференции по программе фундаментальных исследований Президиума, 123.52kb.
- Здание Правительства Москвы Мероприятие проводится в рамках Московского международного, 505.89kb.
План научно-исследовательской работы на 2012 г.
Учреждения Российской Академии наук Институт биоорганической химии им. академиков М.М.Шемякина и Ю.А.Овчинникова РАН
| № п/п | Индекс научного направления ИБХ. Наименование тем. Номер государственной регистрации переходящих тем. Научный руководитель темы | Источники финансирования | Объем финансирования (тыс. руб.) | Наименование этапов исследований в 2012 г. Подразделение научной организации РАН | Сроки начала и окончания темы | Пункт Программы фундаментальных научных исследований государственных академий наук на 2008 -2012 гг. |
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 |
| 1. | А. (9) Новые белки - регуляторы раннего развития центральной нервной системы позвоночных. Номер государственной регистрации: 01201053941 д.б.н. А.Г.Зарайский | Базовое бюджетное финансирование Программа фундаментальных исследований президиума РАН «Молекулярная и клеточная биология» Гранты РФФИ | 3000 650 | (1) Роль секретируемого фактора Noggin4 в регуляции сигнальных каскадов Wnt и Activin/Nodal; (2). Малая ГТФ-аза Ras-dva – регулятор обмена морфогенетическими сигналами в раннем эмбриогенезе. (3). Белки сигнального каскада Shh, взаимодействующие с цитоскелетным белком Zyxin в раннем развитии нервной системы Лаб. молекулярных основ эмбриогенеза | 2010-2012 гг | 42. Биология развития и эволюция живых систем |
| 2. | А. ( 8) Молекулярный дизайн и синтез низкомолекулярных биологически активных соединений и их аналогов. Номер государственной регистрации 01201053939 д.х.н. Формановский А.А. | Программа фундаментальных исследований Президиума РАН №25 | 400 | Поиск условий абиогенного синтеза аденозина и аденозинмонофосфата. Лаборатория органического синтеза | 2012 | 42. |
| 3. | А. (8) Разработка технологий получения трансгенных и нокаутных животных -биомоделей в соответствии с международными требованиями. Номер государственной регистрации 01201154251 к.б.н. Телегин Г.Б. | Базовое бюджетное финансирование | | - Получение новой устойчивой линии генномодифицированных мышей с использованием стволовых мышиных клеток PRX-BALB/cJ #9(The Jackson Laboratory); - сохранение уникальных генетических ресурсов НПП ПЛЖ путем криоконсервации. НПП Питомник лабораторных животных ФИБХ | Январь 2009-декабрь 2012 | 42 |
| 4. | (6) Исследование гомеотических генов, влияющих на морфологию соцветия сложноцветных на примере хризантем. Номер государственной регистрации 01201154258 к.б.н. Т.Ю.Митюшкина | Базовое бюджетное финансирование | | Анализ уровня экспрессии генов MADS семейства в трансгенных линиях хризантем. Оценка морфогенетических изменений в развитии цветка, бутона соцветия и растения в целом. Станция искусственного климата «БИОТРОН» ФИБХ | 2011-2012 | 42 |
| 5 | А (10) Структура низкомолекулярных компонентов природного гуминового комплекса, отвечающих за фотохимическую деградацию поллютантов в окружающей среде и фитогормональную активность. Номер государственной регистрации 01201154252 Научный рук. темы: Трубецкая О.Е. | Базовое бюджетное финансирование Грант РФФИ 10-05-00243-a; Международный проект № 23962 по программе безвалютного обмена между CNRS (Франция) и РАН | | Продолжение cтруктурного анализа желтого и голубого флюорофоров с помощью ЭПР и электрораспыли-тельной ионизационной масс-спектрометрии (ESI-MS). Определение скорости деградации триметилфенола и фурфурола в присутствии голубого и желтого флуорофоров при освещении растворов полихромати-ческим (300-500нм) светом. Группа молекулярной экологии ФИБХ | 2010-2012 | 43 |
| 6 | (1, 5) Иммуноактивные синтетические фрагменты эндогенных и экзогенных белков для иммунопрофилактики, лечения и диагностики. Номер государственной регистрации 01200957161 Научный руководитель темы Вольпина О.М. | Базовое бюджетное финансирование Программа фундаментальных исследований Президиума РАН Гранты РФФИ | 1582,8 120 600 | Иммунопротективное действие фрагментов прионного белка в животной модели болезни Альцгеймера. Изучение активности противопептидных антител на культурах клеток, зараженных бета-амилоидом. Изучение применения антител против нуклеофозмина и сурвивина для дифференциальной и уточняющей диагностики опухолевых заболеваний Лаборатория синтетических вакцин | 2009-2012 | 41,46 |
| 7 | (1), (8) Структура, динамика, механизмы действия и биологическая функция мембранных и мембрано-активных белков и пептидов. Номер государственной регистрации 01200957167 Научный руководитель темы Д.х.н. Арсеньев А.С. Ответственный исполнитель д.б.н. Феофанов А.В. | А Базовое бюджетное финансирование | 1242,7 | Сравнительное исследование механизмов антимикробного действия латарцинов Ltc1 и Ltc5. Изучение путей интернализации латарцинов Ltc1, Ltc3a и Ltc5 и идентификация клеточных структур, в которых происходит преимущественное накопление латарцинов в лейкоцитах и клетках HL60 - острого промиелоцитарного лейкоза человека. Используя разработанную бактериальную клеточную тест-систему продолжить поиск и изучение новых пептидов-лигандов поровой части канала Kv1.3 в ядах скорпионов. Изучить особенности воздействия блокаторов Kv1.3 на клетки эукариот in vitro. Разработка методик оптической микроскопии для детекции и изучения единичных молекул и единичных супрамолекулярных комплексов. Отдел структурной биологии, Лаб. оптической микроскопии и спектроскопии биомолекул | 2008-2012 | 46 |
| 8 | (7) Исследование функциональных свойств и оптимизация структуры конъюгатов хлорина е6 с наночастицами бора Научный руководитель темы д.б.н. Феофанов А.В. | А Базовое бюджетное финансирование Б. Научные и научно-технические исследования и разработки, финансируемые за счет внебюджетных источников. РФФИ № 10-04-01436. | 563,8 350 | Изучение цитотоксичности в отсутствии активирующего воздействия и фотоиндуцированная цитотоксичность конъюгатов в отношении раковых клеток различного происхождения. Анализ накопления и распределения конъюгатов в живых раковых клетках различного происхождения. Агрегация/диссоциация и взаимодействие конъюгатов с биологическими молекулами в растворах. Измерение квантового выхода генерации синглетного кислорода и относительной эффективности фотоиндуцированной генерации OH радикалов конъюгатами. Анализ данных о клеточных структурах, преимущественно накапливающих исследуемые конъюгаты и данных о скорости накопления и времени удержания конъюгатов в раковых клетках различного происхождения. Отдел структурной биологии, Лаб. оптической микроскопии и спектроскопии биомолекул | Январь-декабрь 2012 | 46 |
| 9 | (1) Структура, динамика, механизмы действия и биологическая функция мембранных и мембрано-активных белков и пептидов. Номер государственной регистрации темы 01200957167 проф., дхн Арсеньев А.С. | А Базовое бюджетное финансирование. Программа РАН: «Молекулярная и клеточная биология» РФФИ: 09-04-00551а (рук. Бочаров Э.В.) РФФИ: 12-04-01816-а заявка (рук. Бочаров Э.В.) ГК_16.512.11.2172 (рук. Арсеньев А.С.) РФФИ: 11-04-01795-а (рук. Бочарова О.В.) РФФИ: 11-04-01822-а РФФИ10-04-01752-a (рук. Шенкарев З.О.) РФФИ:11-03-00950- (рук. Лесовой Д.М.) | Данные за 2011 3 400 390 2 400 300 350 | Исследование пространственной структуры и внутримолекулярной динамики мембранных и мембрано-активных белков и пептидов в средах, имитирующих биологическую мембрану (мицеллах, бицеллах, нанодисках): - гомо- и гетеродимеры трансмембранных доменов рецепторных протеинкиназ: ErbB-, EphA- и FGFR- семейств тирозинкиназ и их патогенных мутантов. Исследования зависимости пространственной структуры и энергетики спираль-спирального взаимодействия в мембранных доменах рецепторов ErbB от наличия биологически-активных внутриклеточных примембранных регионов на примере трансмембранных доменов рецепторов EGFR, ErbB2. Исследования энергетики взаимодействия между трансмембранными α-спиралями в мембранных доменах различных рецепторов семейства ErbB. Получение структуры и определение динамических характеристик мутантных форм димера трансмембранного сегмента рецептора фактора роста фибробластов 3. Будет охарактеризован структурный механизм влияния патогенных мутаций в трансмембранном сегменте FGFR3tm на функционирование рецептора. - трансмембранный домен белка амилоидного предшественника APP, ассоциированного с развитием болезни Альцгеймера; - искусственные «пептиды-перехватчики», специфически взаимодействующие с α-спиральными ТМ доменами белков. Изучение пространственной структуры G-белок-сопряженных рецепторов методом спектроскопии ЯМР. -подбор условий рефолдинга бета-2-адренергического рецептора в мицеллах и нанодисках. Тестирование функциональнеой активности рецептора с помощью аффинной хроматографии. Ожидается получение функционально-активного рецептора. Получение изотопно-меченого бета-2-адренергического рецептора, встраивание его в нанодиски. Сравнение спектров ЯМР рецептора и бактериородопсина ESR в составе нанодисков. - полноразмерные бактериородопсины (БР) из Halobacterium salinarium (завершить отнесение сигналов полноразмерного бактериородопсина Halobacterim salinarium), и Exiguobacterium sibiricum( получение 2H-13C-15N-меченого бактериородопсина психротолерантных бактерий E. sibiricum (ESR). Провести подбор условий для съемки ЯМР спектров ESR. Получение спектров ЯМР ESR в составе нанодисков и мицелл. Проведение структурных исследований ESR методами ЯМР и рентгеновской кристаллографии. Охарактеризовать <<предсвернутое/ расплавленное>> состояние мембранного белка на примере вольт-сенсорного домена канала KvAP в составе мицелл анионных детергентов. Исследование механизмов формирования и поддержания пространственной структуры интегральных мембранных белков на примере бета2-адренорецептора из семейства рецепторов, сопряженных с G-белками. Определение роли парных взаимодействий трансмембранных спиралей в механизмах формирования пространственной структуры мембранных белков, получение новых знаний о влиянии мембраномоделирующего окружения на механизмы <<спираль-спирального>> узнавания. Получение изотопномеченых (13С) GPCR-белков. Разработка упрощённых процедур отнесения сигналов с использованием априорных данных о структуре пептида и экспериментальных 13С-химических сдвигах. Исследование пространственной структуры, динамики и механизма действия антимикробных пептидов растительного и животного происхождения. Продолжить проект построения структурно-динамических моделей белков высокой точности, используя белки, имеющие различные типы вторичной структуры, например, альфа-структурный белок - трансмембранный домен рецептора фактора роста фибробластов 3 человека (FGFR3tm), и природно неструктурированный белок ̶ - цитоплазматический домен альфа-цепи В-клеточного рецептора человека. Отдел структурной биологии ИБХ РАН, лаборатория биомолекулярной ЯМР спектроскопии | 2008-2012 | 46 |
| 10 | (1) Антимикробные пептиды природного происхождения (из бактерий, грибов, растений и животных): поиск, выделение, структурно-функциональное исследование и изучение взаимодействия с мембранами. Номер государственной регистрации: 01201053937 Научный руководитель Т.В.Овчинникова. | Базовое бюджетное финансирование ФЦП «Научные и научно-педагогичес-кие кадры иннова-ционной России на 2009-2013 годы» Госконтракт П1159 от 03.06.2010 г. Грант РФФИ № 12-04-01224-а «Исследование моле-кулярных факторов системы врожденного иммунитета растений» | | Исследование антимикробных пептидов животного происхождения. Получение штамм-продуцента рекомбинантного антимикробного пептида из лейкоцитов осетра Acipencer guldenstadti. Изучение влияние ареницинов из морских полихет Arenicola marina на потенциал-зависимый транспорт протонов в реконструированных протеолипосомах. Исследование антимикробных пептидов растительного происхождения. Получение штамм-продуцента новой рекомбинантной изоформы LTP из чечевицы Lens culinaris, принадлежащего к классу PRP-14 растительных защитных белков. Исследование антимикробных пептидов бактериального происхождния. Получение штамм-продуцента рекомбинантного белка, включающего аминокислотную последовательность лантибиотика из термофильных бактерий Bасillus licheniformis. Разработка эксперментальной тест-системы для характеристики мембранной активности анти-микробных пептидов на основе бислойных липидных мембран, моделирующих мембраны грамположительных и грамотрицательных бактерий, а также клеток млекопитающих. Научно-образовательный центр ИБХ РАН | 2010-2012 гг. | 46 |
| 11 | (1, 7). Исследование терапевтического потенциала аналогов пептида дельта-сна в онкологии. Номер государственной регистрации: 01201054505 Научный руководитель: Иванов В.Т. | А Базовое бюджетное финансирование | | Продолжение изучения физиологической активности аналогов пептида дельта-сна Продолжение работы по изучению структуры и биологической активности компонентов пептидных библиотек растений, Лаборатория химии пептидов | 2010-2012 | 46 |
| 12 | (1) Синтез и структурно-функциональные исследования иммуномодуляторов класса мурамилпептидов для разработки новых иммунобиологических препаратов для профилактики и иммунотерапии. Номер государственной регистрации 01201053931 Андронова Т.М. Демушкин В.П. | Базовое бюджетное финансирование | | Изучение механизма действия ГМДП. Изучение механизмов мукоадъювантного действия низкомолекулярных хитозанов. Продолжить работы по изучению структуры и биологической активности компонентов пептидных библиотек растений, Лаборатория химии пептидов | 2010-2012 | 46 |
| 13 | (1) Структурно-функциональное изучение флуоресцентных белков для разработки новых технологий флуоресцентного мечения в живых системах Номер государственной регистрации 01201053936 Лукьянов С.А. | Базовое бюджетное финансирование Программа Президиума РАН «Молекулярная и клеточная биология» РФФИ 10-04-01042а РФФИ 10-04-01561а РФФИ 11-04-01427а РФФИ 11-04-01293а РФФИ 11-04-01861а ФЦП "Кадры" П 256 ФЦП "Кадры" 16.740.11.0367 | | 1 Структурно-функциональные исследования флуоресцентных белков. 2 Разработка и применение новых генетически кодируемых сенсоров. 3 Разработка технологий флуоресцентного мечения живых систем. Лаборатория молекулярных технологий и Технопарк Лаборатория биофотоники | Январь 2010 – декабрь 2012 | 46 |
| 14 | (1) Посттрансляционные модификации белков семейства GFP. Номер государственной регистрации: 01201053933 Мартынов В.И. | Базовое бюджетное финансирование | | Определение пространственной структуры желтого флуоресцентного белка phyYFP с помощью рентгеноструктурного анализа. Группа химии хромопротеинов совместно с лабораторией рентгеноструктурного анализа | 01.01.2010 - 31.12.2012 | 46 |