План научно-исследовательской работы на 2012 г. Учреждения Российской Академии наук Институт биоорганической химии им академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова ран
| Вид материала | Документы |
- Vi московский международный конгресс, 625.54kb.
- М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова ран институт молекулярной генетики ран нейрохимическое, 386.57kb.
- Институт биоорганической химии имени академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова, 871.3kb.
- В. Т. Иванов, директор Института биоорганической химии им. М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова, 719.75kb.
- Международная научно-практическая конференция, 301.89kb.
- Международная научно-практическая конференция, 148.88kb.
- Международная научно-практическая конференция, 130.29kb.
- Синтетические пептиды, взаимодействующие с различными типами холинорецепторов, 487.49kb.
- Программа отчетной конференции по программе фундаментальных исследований Президиума, 123.52kb.
- Здание Правительства Москвы Мероприятие проводится в рамках Московского международного, 505.89kb.
15
А. ( 1)
Исследование пространственной организации и структурно-функциональной взаимосвязи белков методами рентгеноструктурного анализа, биоинформатики, молекулярной механики/ динамики.
Номер госрегистрации:
01201053938
Научный руководитель:
дхн Плетнев В.З.
Базовое
бюджетное финансирование
Методом рентгеноструктурного анализа установить на атомном уровне и провести кристаллографическое уточнение пространственных структур супер дальнекрасных генно-инженерных вариантов красного флуоресцентного белка– eqFP650 и eqFP670. Установление взаимосвязи между пространственной организацией и фотофизическими характеристиками исследуемых объектов.
Лаборатория рентгено-структурного анализа
01.01.2010
-
31.12.2012
46
16
(1. и 4).
Исследование генома и протеома яда паукообразных и растений с целью идентификации новых биологически-активных веществ, взаимодействующих с клеточной мембраной.
Номер государственной
регистрации 01201053928
Научный руководитель темы
Член-корр. РАН Гришин Е.В.
Базовое
бюджетное
финансирование
Программа Президиума РАН,
Грант РФФИ
ФЦП Минобрнаука
Моделирование функциональной активности компонентов природных ядов и защитных пептидов растений.
Лаборатория нейрорецепторов и нейрорегуляторов
2010-2012 гг
46
17
(1).
Новые полипептиды животных ядов, действующие на Cys-петельные рецепторы и гемостаз.
Номер государственной
регистрации 01201053935.
Д.х.н. Ю.Н.Уткин
Базовое
бюджетное финансирование
Гранты РФФИ
800
Определение фармакологических свойств выделенных белков in vivo (токсичность и т.п.) и in vitro (модуляция нейрорецепторов и ионных каналов и др.).
Отдел молекулярных основ нейросигнализации
Лаборатория молекулярной токсинологии
2010-2012
46.
18
(1).
Создание новых лигандов Cys-петельных рецепторов на основе пептидных токсинов: конструирование, синтез, активность
Номер государственной
регистрации 01201054510
Д.х.н. И.Е. Кашеверов
Базовое
бюджетное финансирование
Гранты РФФИ
600
Определение активности и специфичности полученных пептидных соединений в тестах in vitro на некоторых Cys-петельных рецепторах и/или их гомологах.
Отдел молекулярных основ нейросигнализации
Лаборатория лиганд-рецепторных взаимодействий.
2010-2012
46.
19
(1).
Механизмы взаимодействия Cys-петельных рецепторов с природными и синтетическими токсинами.
Номер государственной
регистрации 01201054509
Член-корр. РАН, д.х.н. В.И.Цетлин
Базовое
бюджетное финансирование
Гранты РФФИ
900
Получение новых структур комплексов Cys-петельных рецепторов с некоторыми пептидно-белковыми токсинами и низко-молекулярными соединениями и сделать предположения о механизмах их взаимодействия с целью дальнейшего поиска и дизайна более эффективных лигандов.
Отдел молекулярных основ нейросигнализации
2010-2012
46.
20
(1)
Тема – Исследование механизма действия биокатализаторов, ферментов, каталитических антител, компонент протеосомного комплекса.
Номер государственной
регистрации 01201054506
Руководитель темы
Габибов А.Г.
Базовое
бюджетное финансирование
Гранты
NATO SfP 982833 - PRF,
программа “Нацтехбаза»
07-04-92168-НЦНИ_а
ICGEB CRP/RUS09-01
Программа Президиума РАН - «Фундаментальные науки – медицине»
Программа фундаментальных исследований Президиума РАН № 27 «Основы фундаментальных исследований
нанотехнологий и наноматериалов»
2000 тыс.руб.
2000 тыс.руб.
500 тыс.руб.
450 тыс.руб.
800 тыс.руб.
1500 тыс.руб
Исследование механизма действия протеосомного комплекаса и специфического процессинга аутоантигенов иммунопротеасомой.
Исследование механизма действия протеаз патогенов и каталитических антител методом предстационарной кинетики
Исследование молекулярного механизма катализа деградации фосфорорганических молекул (пестицидов) рекомбинантными антителами.
Установление кроссреактивности антител в репертуаре больных РС нейроантигенов и вирусных белков.
Осуществление дизайна генно-инженерных цитотоксических агенов для специфической элиминации патологических В-клеток.
Лаборатория биокатализа
2010 - 2012
46.
21
(1)
Идентификация и структурно-функциональные исследования новых белков, участвующих в патогенезе ряда социально-значимых заболеваний. Разработка на их основе подходов для диагностики и лечения этих заболеваний.
Номер государственной
регистрации 01200957166
Научный руководитель темы:
Липкин В. М.
Член-корр. РАН
1. Базовое
- бюджетное финансирование
- 2. Программа фундаментальных исследований Президиума РАН “Молекулярная и клеточная биология”
- 3. Грант РФФИ №11-04-00761а
- 4. Государственный контракт ГК № 16.512.11.2044
- 5. Государственный контракт ГК № 16.512.11.2036
1730000 руб
400000 руб
2180000 руб
1450000 руб
Исследование взаимодействия NDP-киназы А с DYNLRB1 в препаратах сетчатки быка, а также в клетках нейробластомы методом конфокальной микроскопии. Определение уровня фосфорилирования NDP-киназы А и DYNLRB1 при светозависимой активации фоторецепторных клеток.
Сравнительный электрофоретический анализ белков склеры миопических и нормальных глаз с последующим иммуноблотингом с использованием поликлональных антител против PEDF и металлопротеаз 2 и 9. Изучение влияния индуцированной миопии на экспрессию мРНК PEDF и металлопротеаз 2 и 9.
Используя стабильные гетерогенные клеточные линии с изменёнными уровнями экспрессии гапонина, обладающие различной устойчивостью к воздействию окислительного и метаболического стрессов, определить механизм участия гапонина в регуляции клеточного ответа на различные виды стрессовых воздействий и место данного белка в иерархии сигнальных каскадов клетки.
Получение специфических антител к rYM-1olf и анализ экспрессии белка в тканях воздухоносных путей в зависимости от микроокружения (от уровня экспрессии белка rSec14р и основного антиоксиданта тканей, контактирующих с кислородов воздуха, пероксиредоксина 6).
Изучение фармакокинетики пептида HLDF-6
Лаборатория белков гормональной регуляции
01.01.2009-31.12.2012
46
22
(1, 7, 8, 9, 10.)
Структура и функции белков ядрышек клеток млекопитающих.
Номер государственной
регистрации 01201053930
Зацепина О.В., д.б.н., профессор
Подтема:
6.5. (1.7) Структура и свойства нуклеофозмина в нормальных и малигнизированных клетках человека.
Подтема:
6.5. (1) Функциональный анализ белка ядрышка SURF-6 в клетках млекопитающих.
Подтема:
6.8 (9) Ядрышко и ядрышковые белки в условиях стресса и митоза у млекопитающих.
Подтема:
6.7 (7) Лабораторная модель склеродермии человека: иммуногистохимический анализ органов при аутоиммунных патологиях у
мышей.
Базовое
бюджетное финансирование
Грант Президиума РАН «Фундаментальные науки-медицине»,
Программа «У.М.Н.И.К.»,
ГК Министерства образования и науки РФ№ 14.740.11.0116,
ГК Министерства образования и науки РФ№ 14.740.11.0925,
ГК Министерства образования и науки РФ
№ 14.740.11.0116 и
№ 14.740.11.0925
700
600
800
400
Продолжение анализа нуклеофозмина в мозге, в первичных культурах клеток глии и нейронах.
Анализ нуклеофозмина в культурах клеток глиом и нейробластом человека.
Выявление белковых партнеров SURF-6 человека в живых клетках. Завершение изучения влияния сверхэкспресии SURF-6 в соматических клетках млекопитающих.
Продолжение изучения уровня экспрессии SURF-6 у больных лимфолейкозами.
Определение роли белка ядрышка фибрилларина в ответе клеток человека на окислительный стресс.
Сравнительный анализ поведения рРНК и белковых факторов процессинга рРНК при делении клеток млекопитающих.
Изучение локализация и стабильность рРНК на разных стадиях созревания ооцитов мыши.
Изучение биохимического состава ядрышковых телец в ооцитах млекопитающих с помощью витальных красителей.
Изучение способность аутоантител к ядрышковым антигенам проникать внутрь живых клеток и их возможная цитотоксичность эффекты на органном уровне.
Изучение реакции аутбредных мышей на регулярные инъекции сублетальных доз HgCl2.
Лаборатория структурной биохимии
46
23
(1)
Изучение структурно-функциональной организации и инженерия рекомбинантных белков для медицины и биотехнологии.
Номер государственной
регистрации 01201054508.
Руководитель темы – акад. М.П.Кирпичников
Базовое
бюджетное финансирование,
Программа Президиума РАН по молекулярной и клеточной биологии.
Программа Президиума РАН "Основы фундаментальных исследованй нанотехнологий и наноматериалов".
Грант РФФИ 11-04-01864-а.
Гос. Контракт № 16.740.11.0497.
Гос. Контракт № П-408.
Гос. Контракт № П-916 .
Разработка бесклеточных систем продукции фрагментов бета-адренергического рецептора человека.
Получение эффективного бактериального штамм-продуцента делеционного варианта интегрального мембранного белка BNIP3 и разработка метода выделения и очистки этого белка в количествах, достаточных для проведения структурных исследований методом ЯМР.
Разработка методов получения и очистки рекомбинантного трансформирующего фактора роста человека (TGFβ1).
Разработка и оптимизация системы экспрессии терапевтических антител против фактора некроза опухолей-альфа и интерферона-гамма в клеточных линиях СНО.
Исследование свойств ФНО-связывающих белков, полученных из библиотек ДНК на основе 10 домена фибронектина.
Проведение исследований мутантных вариантов цитохрома с, сконструированных на основе анализа информационной структуры белка с целью уменьшения конформационной подвижности участка 76-83 а.о., с помощью КД и Раман-спектроскопии.
Исследование активации CD4+ Т-клеток при нормальных и патологических значениях концентрации ионов кальция в периферической крови здоровых доноров.
Разработка флуоресцентного метода детекции взаимодействий эфринового рецептора EphA2 и рекомбинантного эфрина А1 на клеточной линии.
Разработка методов направленного поиска новых лигандов калиевых каналов семейства Kv1 на основе бактериальной клеточной тест-системы.
Отдел биоинженерии
2010-2012
46.
24
(5, 6)
Разработка фундаментальных принципов конструирования неприродных антител с заданными свойствами и нанокомплексов на их основе.
Номер государственной
регистрации 01201053929,
Руководитель: С.М. Деев
Базовое
бюджетное финансирование,
Программы Президиума РАН «МКБ», «Нанобио»,
гранты РФФИ
12-04-00757-а,
11-04-12091-офи-м-2011
7 000
1. Разработка универсальной технологии создания магнитоуправляемых мультифункциональных наночастиц с заранее заданными свойствами на основе белкового модуля барназа-барстар (продолжение исследования).
2. Разработка принципов конструирования гибридных биосовместимых наноконструкций для биоимиджинга - визуализации опухолевых клеток человека in vitro и in vivo на основе мини-антител и флуоресцентных наночастиц различной природы (наноалмазы, нанозолото и др.) (продолжение исследования).
3. Разработка принципов конструирования высокоэффективных иммунотоксинов на основе противораковых миниантител и действующих агентов различной природы (рибонуклеазы, бактериальные токсины, радионуклиды) (продолжение исследования).
4.Разработка принципов получения аналогов полноразмерных антител человека на основе моногенных рекомбинантных конструкций (продолжение исследования).
Лаборатория молекулярной иммунологии
2010-2012
46.
25
(1)
Протеомный анализ мха Physcomitrella patens.
Номер государственной регистрации – 01200957169
Д.б.н. Говорун В.М.
Базовое бюджетное финансирование
Анализ пептидома протонемы и
гаметофоров мха Physcomitrella
patens при тепловом стрессе.
Изучение протеомного профиля
митохондрий мха Physcomitrella
patens.
Лаборатория протеомики
2009-2012
46
(7).
Поиск пептидных маркеров рака яичника в сыворотке крови человека при помощи протеомных технологий.
Номер государственной
регистрации 01201054507
к.х.н. Р.Х.Зиганшин
Базовое бюджетное финансирование
Грант РФФИ № 09-04-12085-офи_м
1700
Идентификация пептидов сыворотки крови практически здоровых доноров и пациентов с различными, социально-значимыми заболеваниями человека
Выявление пептидных маркеров
рака яичников в сыворотке крови
человека.
Лаборатория протеомики
2009-12
46
26
( 1).
Структурно-функциональные исследования протеиназ, осуществляющих процессинг белков и регуляцию клеточных функций. Протеиназы социально опасных заболеваний.
Номер государственной регистрации - 01200957165
Румш Л.Д.
Базовое
бюджетное финансирование
грант РФФИ 11-04-00895
Госконтракт № 16.512.11.2110 от 25 февраля 2011
Грант РФФИ
10-04-01381-а
340
2 500
400
Продолжение структурно-функциональных исследований АТР-зависимых Lon-протеиназ – ключевых ферментов внутриклеточной селективной деградации белков на примере фермента из Escherichia coli (EcLon).
Продолжение работы по получению и исследованию укороченной формы фермента -психрофильной протеиназы из микроорганизма Serratia Proteamaculans (PSP). Изучение свойств фермента в комплексе с шаперонином.
Получение рекомбинантной цистеиновой протеиназы L и изучение ее свойств. IgA1 протеаза из Nesseria meningitidis (термостабильные протеиназы из кишечника личинок жука-кожееда Dermestes maculates).
Получение иммуноглобулина А1 человека в высокоочищенном состоянии. Наработка компонентов для окончательного варианта тест-системы для идентификации IgA1 антител на основе рекомбинантной IgA1 протеазы менингококка.
Продолжение работы по изучению протективной активности полученных образцов рекомбинантной IgA1 протеазы в опытах по заражению мышей культурой менингококков различных серогрупп. Изучение механизмов защиты от менингококковой инфекции животных, иммунизированных полученными препаратами.
Разработка подходов к идентификация дуоденазоподобных протеаз в тканях человека.
Теоретические исследования в области механизма действия протеиназ.
Лаборатория протеолитических ферментов
2010-2012
пункт 46
27
А (3)
Синтез и биологическая активность индолсодержащих липидов
Номер государственной
регистрации 01200957162
В.В. Безуглов
Базовое
бюджетное финансирование
1. Синтез индолсодержащих амидов простагландинов типов E и F как аналогов природных простамидов.
2. Определение возможного нейрозащитного действия синтезированных веществ в моделях, имитирующих нейродегенеративные процессы.
3. Определение цитотоксического действия синтезированных веществ на культуре клеток глиомы С6.
4. Изучение гидролитической стабильности наиболее активных синтезированных соединений в биологических системах.
Лаборатория оксилипинов
2009-2012
46
28
(3,7)
Синтез новых противоопухолевых веществ липидной природы, создание и исследование форм их адресной доставки в опухоли.
Номер государственной
регистрации 01201053924