Использование микросателлитного анализа ДНК для изучения популяций кумжи (Salmo Trutta L.) в реках Абхазии
Дипломная работа - Биология
Другие дипломы по предмету Биология
;210
Таблица 13 позволяет сравнить морфометрические показатели пятилеток из р. Том и р. Кодор. Сопоставляя параметры рыб одного возраста из разных рек видно, что особи, обитавшие в Кодор несколько крупнее, чем в реке Том. Однако малая выборка не позволяет нам на говорить о достоверных отличиях между особями из разных рек.
3.3 Результаты микросателлитного анализа ДНК
При исследовании локуса Str73INRA выявлено, что все изучаемые особи (17 особей) являются мономорфными по данному маркеру: они гетерозиготны (Рис.2). На электрофореграмме видно, что каждая исследованная особь в генотипе имеет два разных аллеля, так как тёмные полосы расположены на разных уровнях. Это свидетельствует о гетерозиготности всех исследуемых особей. Все 17 рыб имеют одинаковый генотип АВ, что указывает на их мономорфность по данному микросателлитному локусу. Аллель В длиннее аллелья А.
Рис.2. Электрофореграмма по микросателлитному локусу Str73INRA. Дорожки 2-18 - генотипы исследуемых форелей, дорожка 1- маркер молекулярной массы ДНК 20bp. А,В - аллели разной длины.
По локусу Str15INRA были исследованы 14 особей. На электрофореграмме видно, что на дорожке 2 имеется одна более жирная полоса, что говорит о гомозиготности данной особи. Все остальные рыбы оказались гетерозиготными по данному локусу. Но особи имеют разные генотипы, что указывает на полиморфизм изучаемых форелей по данному микросателлитному маркеру. Первая и шестая особь имеют одинаковый генотип АС, четвёртая и пятая особи имеют генотип ВЕ, а особи под номерами 7-10 и 14 характеризуются наличием генотипа АВ (Рис.3). Среди исследуемых рыб по данному локусу преобладают аллели А и В, реже встречаются аллели С и D. Самый длинный из всех аллелей данного локуса - Е, самый короткий - А.
Рис.3. Электрофореграмма по микросателлитному локусу Str15INRA. Дорожки 1-14 - генотипы исследуемых форелей (A,B,C,D,E - аллели разной длины).
По микросателлитному локусу Str60INRA нами исследовано 18 изучаемых форелей, которые также оказались полиморфными по данному молекулярному маркеру. Выявлено семь разных аллелей этого локуса (Рис.4). Электрофореграмма показывает, что только одна особь оказалась гомозиготной (АА), все остальные гетерозиготны. Не смотря на кривизну геля мы обнаруживаем, что все образцы с 8 по 18 идентичны по генотипу (DG). Большая часть особей имеют в генотипе аллели D и G, реже встречаются аллели Е и В. Самый длинный аллель данного локуса G, короткий - А.
Рис.4. Электрофореграмма по микросателлитному локусу Str60INRA (A,B,C,D,E,F,G - аллели разной длины). Дорожки 1-18 - генотипы исследуемых форелей
По локусу Str85INRA были исследованы 16 особей. Все исследуемые особи гетерозиготны по данному локусу. Особи оказались полиморфными, выявлено девять аллелей данного STR-локуса (Рис.5). В генотипе особей с большей частотой встречаются аллели H, G и D, реже встречаются аллели Е, I и А. Самый длинный аллель I, а самый короткий - А.
Рис.5. Электрофореграмма по микросателлитному локусу Str85INRA Дорожки 1-16 - генотипы исследуемых форелей (A,B,C,D,E,F,G,H,I - аллели разной длины).
По микросателлитному локусу Ssa197 нами исследовано 13 изучаемых форелей, которые также оказались полиморфными по данному молекулярному маркеру. Три особи оказались гомозиготными (DD, DD, BB), остальные исследуемые рыбы гетерозиготны по данному STR-локусу.
Выявлено шесть разных аллелей этого локуса (Рис.6). В генотипе особей преобладают аллели D,E и F, реже В, С и А.
Рис.6. Электрофореграмма по микросателлитному локусу Ssa197 (A,B,C,D,E,F - аллели разной длины). Дорожки 1-13 - генотипы исследуемых форелей.
Итоговые данные микросателлитного анализа ДНК исследуемых рыб по пяти стандартным STR-локусам представлены в таблице 8.
Таблица 8. Аллельное разнообразие исследованных форелей.
Название локусовКоличество аллелейЧисло исслед.особейStr15INRA514Str60INRA718Str73INRA217Str85INRA916Ssa197613
Итак, в результате данных исследований подобраны микросателлитные маркеры, которые в дальнейшем могут быть успешно использованы для исследования генетического разнообразия речных популяций черноморской кумжи. Локус Str73INRA , проявивший мономорфизм среди исследованных особей, позволяет предложить его для идентификации кумжи, обитающей в реках Абхазии.
Выводы
. Среди изученных нами особей кумжи обнаружены рыбы в возрасте от 1+ до 4+. Преобладающей возрастной группой явились трёхлетки -52%. Представлены были четырёхлетки (25%) и пятилетки (19%). Такой возрастной состав указывает на то, что исследованные рыбы являются представителями жилой расы (форели).
. Морфометрические данные свидетельствуют об относительной однородности особей по большинству измеренных параметров в рамках каждой возрастной группы.
. Подобраны пять микросателлитных локусов (Str15INRA, Str60INRA, Str73INRA, Str85INRA и Ssa197) для изучения генетической структуры популяций кумжи в реках Абхазии.
. Большая часть исследованных особей являлись гетерозиготными по всем изученным локусам.
. По четырём локусам Str15INRA, Str60INRA, Str85INRA и Ssa197 выявлен полиморфизм, т. е. установлено наличие 5, 7, 9 и 6 аллелей соответственно.
. Локус Str73INRA проявил мономорфизм среди исследованных нами особей. Это позволяет предложить этот локус для идентификации кумжи, обитающей в реках Абхазии.
Литература
1. Алтухов Ю. П. Динамика популяционных генофондов при антропогенных воздействиях. М.: Наука, 2004. С. 86-92, 111-112, 151-156, 183-190.
. Барач Г. П. Внутренние водоёмы Абхазской АССР, их промысловая ихтиофа