М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова На правах рукописи буздин антон александрович полногеномное сравнение распределения ретроэлементов в ДНК человека и шимпанзе 03. 00. 03 Молекулярная биология диссертация

Вид материалаДиссертация

Содержание


Таблица 3.5.2. Данные поиска химерных ретроэлементов среди наиболее распространённых в геноме человека семейств псевдогенов.
Подобный материал:
1   ...   8   9   10   11   12   13   14   15   ...   19


a Номер ретроэлемента; b локализация в геноме человека, найдено с помощью Draft Human Genome Browser; c код доступа в GenBank; d дивергенция U6 частей химер от консенсуса U6, %; e семейство L1-части химер; f дивергенция L1 частей химер от консенсуса cоответствующего семейства L1, %.


Таблица 3.5.2. Данные поиска химерных ретроэлементов среди наиболее распространённых в геноме человека семейств псевдогенов.


Тип РНК

Всего

Химеры

Alu

L1

мРНК

5S rRNA

40

3 (7,5%)

2 (5%)

1 (2,5%)

-

4,5S rRNA

7

-

-

-

-

tRNA Asn

24

-

-

-

-

L7 r.p.

40

-

-

-

-

L7A r. p.

21

-

-

-

-

L23A r. p.

33

-

-

-

-

L10 r. p.

34

-

-

-

-

L31 r. p.

40

2 (5%)

2 (5%)

-

-

L28 r. p.

7

-

-

-

-

7SK

33

-

-

-

-

7SL (SRP)

43

1 (2,3%)

1 (2,3%)

-

-

E1 snlRNA

5

-

-

-

-

E2 snlRNA

5

-

-

-

-

E3 snlRNA

4

-

-

-

-

hY1

40

-

-

-

-

CYCLO

33

-

-

-

-

XBR (a-fet.)

2

-

-

-

-

XTR (a-fet)

2

-

-

-

-

U1 snRNA

40

-

-

-

-

U2 snRNA

40

-

-

-

-

U3 snRNA

40

8 (20%)

-

7 (17,5%)

1 (2,5%)

U4 snRNA

20

-

-

-

-

U5 snRNA

21

1 (4,8%)

-

1 (4,8%)

-

U6 snRNA

161

56 (34,8%)

?

56 (34,8%)

?

Суммарно

735

71 (9,6%)

5 (0,7%)

65 (8,8%)

1 (0,1%)