
Как известно, большинство микроорганизмов, распространенных в природе, к которым относятся ме-тилотрофы, не могут служить хорошими продуцентами ароматических аминокислот, вследствие наличия эффективных механизмов регуляции биосинтеза этих соединений в микробной клетке, хотя эта способность появляется у ряда их мутантных форм [15 — 17]. Активными микробными продуцентами L-фснилаланина являются, как правило, мутанты, у которых снят негативный контроль со стороны таких ключевых ферментов биосинтеза этой аминокислоты, как префенатдегидратаза (ПД) и дезоксиара-биногептулозофосфатсинтстаза (ДАГФ-синтетаза) [18, 19]. Определенный интерес в связи с этим представляет исследование способности продуцировать L-фенилаланин лейцинзависимым метилотроф-ным мутантом В. methylicum, достаточно удобным, хотя и малоизученным объектом для биотехнологического применения. Поэтому начальный этап биохимических исследований В, methylicum был связан с получением ауксотрофных мутантов, для которых в большинстве случаях характерны ограниченный спектр мутантных фенотипов и кроме того довольно высокий уровень реверсий [20 — 23]. Исходный лейцин-зависимый штамм В. methylicum, продуцент L-фенилаланина, был отобран в лаборатории генетики ме-тилотрофов НИИ генетики и селекции промышленных микроорганизмов на предыдущем этапе работы после обработки В. methylicum нитрозогуанидином по устойчивости к аналогу фенилаланина мета-фторфенилаланину (50мкг/мл.). Выделенные таким образом аналогорезистентные мутанты конвертировали метанол и накапливали при этом фенилаланин
в ферментационной среде. Сравнительные анализы аминокислоты методом тонкослойной хроматографии и масс-спектрометрии показали, что фенилаланин, секретиру-емый В. mcthylicum, полностью идентичен коммерческому L-фенилаланину.
Мы изучали влияние степени замещенности дейтерием низкомолекулярных субстратов воды и метанола в составе питательных сред на рост полученного ауксотрофа, величину лаг-фазы и времени клеточной генерации (см. таблицу), а также секрецию дейтериймеченного фенилаланина. Продолжительность лаг-фазы, время генерации и максимальная секреция фенилаланина В. melhylicum в условиях изотопных экспериментов (см. таблицу, опыт 2, 4, 6, 8, 10) представлены на гистограмме (рис. 1).
Секреция
, г/л
Рис. 1. Характеристики бактериального роста В. methylicutn {выход биомассы, время генерации и максимальная секреция фенилаланина) на средах с изотопным составом, соответствующим номерам экспериментов 2, 4, 6, 8, 10 в таблице
Как видно из представленных данных, в отсутствие дейтериймеченных субстратов при росте исходной бактерии на протонированной среде продолжительность лаг-фазы не превышала 24 ч (см. таблицу, опыт 1). С увеличением содержания тяжёлой воды в среде продолжительность лаг-фазы увеличивалась до 64 ч на средах с 98 % D2O и 2 % CD3OD по объему (см. таблицу, опыт 10). Если замена метанола на его дейтерированный аналог не вызывала существенного ингибирования роста бактерий и не сказывалась на выходе микробной биомассы, то на средах с высоким содержанием оксида дейтерия микробный рост был заметно подавлен. Вследствие этого в экспериментах, где оксид дейтерия преобладал в среде (см. таблицу, опыт 9, 10), выход биомассы был значительно ниже, чем в контрольных экспериментах и в тех случаях, когда использовали простую воду и дейтеро-метанол (см. таблицу, опыт 2).
Как видно, длительность времени генерации бактериальной культуры с увеличением изотопного насыщения среды дейтерием увеличивается. Из данных таблицы видно, что продолжительность лаг-фазы и время клеточной генерации бактерии при переходе со стандартной на дейтерированные среды находятся в определенной корреляции. Так например, в условиях эксперимента 10 продолжительность лаг-фазы увеличивается в 2,6 раза, а время генерации возрастает в 2,2 раза.
С целью увеличения эффективности изотопного мечения клеточных БАС и аминокислот и интенсификации роста метилотрофа на полностью дейтерированных средах мы адаптировали полученный мутант В. methylicum к максимальному содержанию дейтерия в среде культивирования. Для этого были проведены пять серий адаптационных пассажей на агаризованных средах (с 2 % СD3ОО по объему) при ступенчатом увеличении концентрации оксида дейтерия в них (см. таблицу). Последовательно отбирали наиболее продуктивные по уровню накопления дейтерированной биомассы клоны В. methylicum и пересевали их на среды с большей степенью дейтерирования, вплоть до полной замены воды и метанола на их дейтерированные аналоги (выживаемость на полностью дейтерированных средах не более 40 %). Полученный в результате ступенчатого отбора штамм В. methylicum, адаптированный к дейтерию, переносили затем с максимально насыщенных дейтерием агаризованных сред на жидкие среды М9, приготовленные исключительно из 98 % D2O (99,9 % D) и содержащие 2 % СОзОD, и культивировали, как описано в эксперименте.
Динамика роста бактерии В. mеthylicum, адаптированного к высокому содержанию дейтерия в среде, и способность секретировать L-фенилаланин в условиях максимально насыщенных дейтерием сред представлены на рис. 2.
дО время, ч
Секреция
Рис. 2. Динамика роста В. methylicum (la, 10'а, 10d) и секреция фенилаланина (16, 10'б, 10б) на средах с изотопным составом, соответствующим номерам эксперимента в таблице: I а,б — исходный метилотроф на стандартной среде М9; 10'а,б — адаптированный к высокому содержанию дейтерия В. melhylicum на полностью дейтерированной среде; 10 а,б — неадаптированный метилотроф на полностью дейтерированной среде
Выход биомассы, время генерации и максимальная секреции фенилаланина исходным мутантом (10) и мутантом, адаптированным к высокому содержанию дейтерия в среде (10'), на средах, максимально насыщенных дейтерием, приведены в гистограмме на рис. 3 относительно контрольного (У). Сравнивали ростовые данные адаптированного к дейтерию метилотрофа и секрецию фенилаланина (опыт 10') с исходным В. methylicum на стандартной среде М9 (опыт I) и на полностью (98 % D2О) дейтерированных средах с 2 % CD3OD (опыт 10).
Как видно из графиков на рис. 2, степень замещенности дейтерием воды и метанола не оказывает
м •
и биомассы, % 0тк0нтролн<го L-Ptic, г/л
Время
Рис. 3. Выход биомассы, время генерации и максимальная секреция фенилаланина на средах с изотопным составом, соответствующим номеру эксперимента в таблице: 10 — исходный метилотроф; 10' — адаптированный к высокому содержанию дейтерия В. methylicum; 1 — исходный метилотроф на стандартной недейтери-рованной среде
значительного влияния на секрецию фенилаланина, в то время как выход микробной биомассы на дей-терированной среде значительно уменьшается. Незначительное снижение уровня секреции фенилаланина (до 0,5 г/л) наблюдалось лишь в изотопных экспериментах (см. рис. 2, 10 б), когда использовали исходный метилотроф на средах с максимальным насыщением дейтерием. Уровень накопления микробной биомассы адаптированным метилотрофом на полностью дейтерированной среде выше, чем для исходного В. methylicum (см. рис. 2, 10 а), несмотря на двухкратное увеличение продолжительности лаг-фазы (рис. 2, опыт 10' а), в то время как секреция фенилаланина у адаптированного метилотрофа существенным образом не отличалась от таковой на недейтерированной среде. В отличие от адаптированного к дейтерию В. methylicum, рост исходного мутанта на полностью дейтерированной среде с 98%-ной тяжёлой водой сильно ингибируется дейтерием (см. рис. 2, 10 и).
Как видно из рис. 3, время клеточной генерации для адаптированного метилотрофа (2,5 ч) близко к исходному на стандартной среде. Несложный селекционный подход позволил получить штамм В. methylicum, способный конвертировать дейтеро-метанол на максимально насыщенных дейтерием средах в клеточные БАС и секретирусмый L-фенилаланин. При этом выход фенилаланина у адаптированного мутанта не сократился (см. рис. 2). Таким образом, было показано, что некоторые виды метилотрофных бактерий, например, факультативный метилотроф В. methylicum, в принципе могут быть адаптированы к высокому содержанию дейтерия в среде без потери ростовых и биосинтетических способностей бактериальной культуры.
Механизм биосинтеза L-фенилаланина В. methylicum и роль лейцина в этом процессе не объяснены окончательно.
Что же касается самого фенилаланина, то он, как известно, синтезируется в клетках микроорганизмов и, в частности, в коринебактериях из своего предшественника — префеновой кислоты, которая через стадию образования фенилпирувата превращается в фенилаланин под действием клеточных трансаминаз [24 — 26].
Продолжая обсуждать механизм секреции фенилаланина этим метилотрофом следует отмстить, что общей особенностью сскретируемой целевой аминокислоты было значительное увеличение ее продукции на ранней фазе экспоненциального роста В. mehtylicum, когда выход микробной биомассы был незначителен (см. рис. 2). Затем во многих экспериментах наблюдалось, как правило, ингибирование биосинтеза фенилаланина на поздней фазе экспоненциального роста и снижение его концентрации в среде. Как показали микроскопические наблюдения за растущей популяцией микроорганизмов, подобный характер динамики секреции фенилаланина не коррелирует с качественными изменениями ростовых характеристик культуры на различных стадиях роста, что служит подтверждением морфологической однородности микробной популяции. По-видимому, накопленный в процессе роста фенилаланин ингиби-ровал ферменты собственного пути биосинтеза. Кроме того, как показано еще на других микробных продуцентах L-фенилаланина! при культивировании микроорганизмов без рН-статирования не исключено обратное превращение экзогенного фенилаланина в интермедиаторные соединения его биосинтеза [25, 26]. Кроме основной сскретируемой аминокислоты в среде, как правило, присутствуют следовые количества других аминокислот (аланин, ва-лин, а также тирозин и триптофан) и других метаболитов, четко детектируемых масс-спектрометри-чсским анализом [3].
Степень биосинтетического обогащения секрети-руемого L-фенилаланина была определена масс-спектрометрическим анализом метиловых эфиров N-дансильных производных аминокислот методом электронного удара. Согласно сравнительным данным масс-спектрометрического анализа производных на-тивного и дейтерироваиного фенилаланина со сред разного уровня дейтерирования (см. таблицу), степень биосинтетического включения дейтерия в молекулу фенилаланина коррелирует с концентрацией дейтерия в среде. Так например, в масс-спектре дейтерированного производного фенилаланина (молекулярная масса недейтерированного соединения 412), полученного из В. methylicum в условиях максимального насыщения среды дейтерием (см. таблицу, опыт 10), четко детектируется высокоинтенсивный пик молекулярного иона с m/z 420 (М+ + 8) и менее интенсивный пик с примесью m/z 419 (М.++ 7). Предварительные данные свидетельствуют о высокой степени включения дейтерия в молекулу фенилаланина в условиях полной замены воды и метанола на D2О и СDзOD, что составляет (с учетом точности метода) 7-8 атомов из 8 детектируемых по скелету молекулы. При этом сгкообмсниваемые атомы D(H) амино- и карбоксильной групп не рассматриваются.
Основными преимуществами В. methylicum, адаптированного к максимальному содержанию дейтерия в среде и способного конвертировать дейтеро-метанол для получения униформно дсйтерированных аминокислот и белка (в отличие от некоторых традиционных способов с использованием других микробных продуцентов [27, 28] и микроводорослей [29]) являются хорошие ростовые и биосинтетические способности этого метилотрофа на максимально дейтерированных средах.
При помощи адаптированного штамма В. methylicum можно достаточно быстро наработать в ла-
бораторных условиях граммовые количества униформно меченного дейтерием L-фенилаланина. Таким образом, использование в прикладных целях полученного в настоящей работе мутанта В. methylicum, адаптированного к полностью дейтериро-ванным средам, содержащим тяжёлую воду и дейтеро-метанол и, в частности, для биосинтетического получения фенилаланина разной степени обогащенности дейтерием {вплоть до полной замены всех атомов водорода на дейтерий) является весьма эффективным,
В заключение следует отметить, что более высокая эффективность изотопного мечения клеточных БАС может быть обеспечена путем полной замены протонированных компонентов среды на их дейтери-рованные аналоги, а также используя лейцин, униформно меченный дейтерием, который в принципе можно получать из гидролизатов тотального белка биомассы этого метилотрофа. Анализ биосинтетического включения дейтерия в аминокислоты тотального белка биомассы будет опубликован отдельно.
Авторы выражают благодарность ст. н. с. ВНИЦ молекулярной диагностики О. С. РешетовоЙ за участие в получении масс-спектров изучаемых образцов производных аминокислот.
ИТЕРАТУРА
- Романовская В. А.,
- Мохамед эль Сайд II Микробиология. —
1986. — Т. 48. — № 2. — С. 97 — 107.
Pages: | 1 | 2 | 3 |