Geum.ru

Стрельников

Вид материалаИсследование

Содержание


Atmin, iqsec2)
Список опубликованных работ по теме диссертации
Стрельников В.В.
Стрельников В.В.
Стрельников В.В.
Стрельников В.В.
Стрельников B.B.
Стрельников В.В.
Стрельников В.В.
Список сокращений.
Подобный материал:
1   2   3

ВЫВОДЫ.


1. Разработанные в настоящем исследовании алгоритмы, протоколы и компьютерные программы для проведения метилчувствительного фингерпринтинга и анализа, ориентированного на длину амплифицируемых фрагментов (AFLOAT), эффективно решают основную проблему непредвзятого скрининга дифференциального метилирования геномов – определение геномной принадлежности дифференциально метилированных локусов, поскольку исключают многоэтапный блок лабораторного анализа - выделение фрагментов ДНК из гелей, их реамплификацию, клонирование, экстракцию плазмидной ДНК и секвенирование. Предложенные методы скрининга обеспечивают высокую воспроизводимость результатов, снижение себестоимости и трудоемкости исследований, расширение возможностей визуального контроля на каждом этапе эксперимента.

2. Методами анализа in vitro и in silico охарактеризован состав репрезентаций генома, генерируемых методами метилчувствительного фингерпринтинга и AFLOAT. Предложенные схемы экспериментов обеспечивают высокое содержание CpG-островков в составе репрезентаций дифференциально метилированных участков, что создает базу для эффективного выявления новых генов и локусов, вовлеченных в канцерогенез и подверженных аномальной эпигенетической регуляции при раке.

3. Разработанные методы непредвзятого скрининга позволяют идентифицировать дифференциально метилированные локусы геномов независимо от их расположения относительно кодирующих областей, промоторов и сайтов инициации транскрипции. Среди выявленных в работе 26 новых локусов, аномально метилированных при раке молочной железы, 4 являются межгенными (области хромосом 1p33, 5p15.33, 12q13.13 и 13q32.1), 5 – интронными (гены BIN1, RAI1, GPC2, PPP2R5C, PHF1), 2 расположены в первых экзонах (гены ATMIN, IQSEC2). Лишь около половины (гены LAMB1, KCNH8, DOCK6, SH3KBP1, C2CD2, KIAA1324L, AX746725/AK127124, TMEM176A/TMEM176B, FOXM1/HKMT1188, LAMC3, SEMA6B, VCIP135, KCNH2, CACNG4 и PSMF1) полученных фрагментов имеют локализацию, каноническую для дифференциального метилирования при канцерогенезе, что подтверждает непредвзятый характер скрининга. Дифференциальное метилирование указанных локусов подтверждено методами метилспецифического секвенирования, метилчувствительной ПЦР и метилспецифического анализа конформационного полиморфизма однонитевых фрагментов ДНК.

4. Анализ молекулярной патологии гена SEMA6B, аномальное метилирование которого при раке молочной железы впервые показано в настоящем исследовании, продемонстрировал наличие повреждений гена (метилирование, потеря гетерозиготности) в 75% образцов рака молочной железы. Впервые выявлена герминальная мутация SEMA6B у пациентки с раком молочной железы. Полученные результаты свидетельствуют о том, что SEMA6B – один из наиболее реальных генов-кандидатов на роль супрессора опухолевого роста в области хромосомы 19р13.3.

5. Скрининг метилирования ДНК из образцов рака молочной железы, светлоклеточного рака почки, рака мочевого пузыря, прилежащих условно нормальных тканей, аутопсийного материала молочной железы, лимфоцитов периферической крови и буккального эпителия здоровых доноров выявил константно метилированные участки генома человека, принадлежащие CpG-островку гена CUX1 в составе альтернативного 3’-концевого экзона, первым экзонам генов LAMA3A, LAMB3, LAMC3, интронным областям генов MAD1L1, FLNA и 3'-CpG-островку гена ZBTB4. Полученные результаты впервые предоставили базу для обоснованного дизайна контролей эффективности метилчувствительной ПЦР.

6. Анализ состояния метилирования участков ДНК в норме и при канцерогенезе в зависимости от локальных характеристик хроматина показал совместное расположение константно метилированных участков с плотной упаковкой нуклеосом при закрытом хроматине, константно неметилированных участков – с низкой плотностью упаковки нуклеосом при закрытом хроматине, и дифференциально метилированных участков – с областями открытого хроматина при любой плотности нуклеосомной упаковки. Это позволило разработать синтетический подход к отбору для анализа дифференциального метилирования кандидатных участков генов, вовлеченных в канцерогенез.

7. Использование разработанной в ходе исследования методологии локус-специфического анализа метилирования для изучения эпигенетической патологии семейства генов ламининов подтвердило предсказанное дифференциальное метилирование 70% промоторных областей этих генов при раке молочной железы. Шесть промоторных областей демонстрируют неметилированное состояние в нормальных тканях и аномальное метилирование при раке молочной железы, с частотами, составившими для генов LAMA1 – 36%, LAMA2 – 38%, LAMA3B – 6%, LAMA4 – 2%, LAMB1 – 16%, LAMC3 – 8%. Промотор гена LAMC2 показал дифференциальное метилирование в зависимости от тканевого происхождения образцов: в буккальном эпителии и лимфоцитах периферической крови метилирование отсутствует, в то время как образцы ДНК из нормальных и опухолевых тканей молочной железы метилированы в 100% случаев. Константное метилирование предсказано и подтверждено для промоторных областей генов субъединиц ламининов LAMA3A и LAMB3. Полученные результаты говорят о высоком предиктивном потенциале разработанного синтетического подхода к отбору для анализа дифференциального метилирования кандидатных участков генов, вовлеченных в канцерогенез.

8. Разработана новая универсальная стратегия и оригинальная методическая база анализа метиломов в норме и при патологии для поиска и характеристики функциональных нарушений, вызывающих различные заболевания у человека. На значительном экспериментальном материале (более 1000 образцов операционного материала рака молочной железы, рака мочевого пузыря, светлоклеточного рака почки и прилежащих тканей, немелкоклеточного рака легких, острого лимфобластного лейкоза, аутопсийного материала молочной железы, буккального эпителия и лимфоцитов периферической крови здоровых доноров) показана эффективность разработанных подходов, охарактеризованы новые гены и районы, вовлеченные в процесс канцерогенеза.


СПИСОК ОПУБЛИКОВАННЫХ РАБОТ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ

  1. Strelnikov V., Nemtsova M., Chesnokova G., Kuleshov N., Zaletayev D. A simple multiplex FRAXA, FRAXE, and FRAXF PCR assay convenient for wide screening programs // Human Mutation, 1999. V. 13. № 2. P. 166-169
  2. Немцова М.В., Стрельников В.В., Бабенко О.В., Васильев Е.В., Залетаев Д.В. Методические аспекты анализа метилирования при генетических и онкологических заболеваниях // Сборник трудов ГНТП "Геном человека", 2000. С. 167 168
  3. Бабенко О.В., Саакян С.В., Бровкина А.Ф., Козлова В.М., Стрельников В.В., Залетаев Д.В., Немцова М.В. Спектр и частота структурной патологии гена RB1 при ретинобластоме // Молекулярная биология, 2002. Т. 36. № 4. С. 623-629
  4. Бабенко О.В., Землякова В.В., Саакян С.В., Бровкина А.Ф., Стрельников В.В., Залетаев Д.В., Немцова М.В. Функциональная патология генов RB1 и CDKN2A, приводящая к развитию ретинобластомы // Молекулярная биология, 2002. Т.36 № 5, С. 777 783
  5. Немцова М.В., Землякова В.В., Жевлова А.И., Бабенко О.В., Стрельников В.В., Васильев Е.В., Дрозд О.В., Бочков Н.П., Залетаев Д.В.. Профиль метилирования генов-су­прессров опухолевого роста при различных формах рака. // Вестник НИИ Молекулярной медицины ММА им. Сеченова, 2002. № 2, С. 65 84
  6. Zemlyakova V., Lubchenko L., Zborovskaya I., Strelnikov V., Artamonov V., Nemtsova M. P16INK4a, p15INK4b, p14ARF, Rb1 and ECAD Genes Aberrant Methylation in Various Cancers.// European Journal of Human Genetics, 2002. V.10 Suppl. 1, P. 99
  7. Дрозд О.В., Стрельников В.В., Немцова М.В., Залетаев Д.В. Метилчувствительный фингерпринтинг как метод выявления структурных и функциональных изменений в геноме опухолевых клеток // Материалы научно-практического симпозиума "Технологии генодиагностики в практическом здравоохранении", 2002. С. 130 134
  8. Землякова В.В., Жевлова А.И., Зборовская И.Б., Стрельников В.В., Залетаев Д.В., Немцова М.В.. Аномальное метилирование некоторых генов-супрессоров при немелкоклеточном раке легкого // Молекулярная биология, 2003. Т.37 № 6, С. 983 988
  9. Землякова В.В., Жевлова А.И., Стрельников В.В., Любченко Л.Н., Вишневская Я.В., Третьякова В.А., Залетаев Д.В., Немцова М.В. Аномальное метилирование некоторых генов-супрессоров при спорадическом раке молочной железы // Молекулярная биология, 2003. Т.37 № 4, С. 696 703
  10. Залетаев Д.В., Немцова М.В., Стрельников В.В., Бабенко О.В., Васильев Е.В., Землякова В.В., Жевлова А.И., Дрозд О.В. Диагностика эпигенетической патологии при наследственных и онкологических заболеваниях // Молекулярная биология, 2004. Т.38 № 2, С. 213 223
  11. Землякова В.В., Стрельников В.В., Зборовская И.Б., Балукова О.В., Майорова О.А., Васильев Е.В., Залетаев Д.В., Немцова М.В. Сравнительный анализ аномального метилирования CpG-островков, расположенных в промоторных областях генов p16/CDKN2А и р14/ARF при немелкоклеточном раке легкого и остром лимфобластном лейкозе // Молекулярная биология, 2004. Т.38 № 6, С. 966 972
  12. Кузнецова Е.Б., Дрозд О.В., Бабенко О.В., Землякова В.В., Немцова М.В., Залетаев Д.В., Стрельников В.В. Идентификация генов, вовлеченных в канцерогенез, методом метилчувствительного ПЦР-фингерпринтинга // Медицинская генетика, 2004. Т.3 № 12, С. 563 568
  13. Kuznetsova E., Mikhaylenko D., Liubchenko L., Zborovskaya I., Strelnikov V. Differential methylation of LAMC3 and TGFBR1 CpG islands in non-small cell lung and breast cancer identified by methylation-sensitive restriction fingerprinting (MSRF) // European Journal of Human Genetics, 2004. V.12 Suppl. 1, P. 190
  14. Zemlyakova V., Babenko O., Zborovskaya I., Yakubovskaya M., Lyubchenko L., Maiorova O., Strelnikov V., Nemtsova M. Methylation of a number of tumor suppressor genes in various cancers // European Journal of Human Genetics, 2004. V.12 Suppl. 1, P. 191
  15. Klinkov A.A., Strelnikov V.V., Babenko O.V., Zemlyakova V.V., Zaletayev D.V., Ivanov M.A., Kuznetsova E.B., Nikitin E.A., Maiorova O.V.
    TNR/11q#1 Trinucleotide (GCC)n Repeat Alleles and Predisposition to Acute and Chronic Leukemia // Annals of Human Genetics, 2004. Т. 68. № 4. С. 362-366.
  16. Кузнецова Е.Б., Стрельников В.В., Дрозд О.В., Бабенко О.В., Землякова В.В., Кекеева О.В., Немцова М.В., Залетаев Д.В. Поиск и характеристика новых маркеров метилирования и генов, вовлеченных в канцерогенез, методом метилчувствительного фингерпринтинга // Вестник НИИ молекулярной медицины ММА им. И.М.Сеченова, 2005. № 5, C. 73 88
  17. Михайленко Д.С., Любченко Л.Н., Зборовская И.Б., Стрельников В.В., Залетаев Д.В. Анализ полиморфных вариантов CGG-повтора гена GIPC1 в норме, при раке молочной железы и немелкоклеточном раке легкого // Генетика, 2005. Т.41 №9, С. 1289 1295
  18. Немцова М.В., Стрельников В.В., Бабенко О.В., Землякова В.В., Залетаев Д.В. Молекулярная диагностика эпигенетических нарушений при синдроме Видеманна-Беквита // Медицинская генетика, 2005. № 1, С. 33 38
  19. Kuznetsova E., Lubchenko L., Zborovskaya I., Strelnikov V, Zaletayev D. Differential methylation of LAMC3, SEMA6B, VCIP135 and BIN1 CpG islands in breast cancer identified by methylation-sensitive restriction fingerprinting (MSRF) // European Journal of Human Genetics, 2005. V. 13 Suppl. 1, P. 192
  20. Nemtsova M, Zemlyakova V, Kusnetsova E, Strelnikov V, Lyubchenko L, Zaletayev D. Methylation profiling of carcinogenesis-associated genes in sporadic breast cancer // Breast Cancer Research, 2005. № 7 Suppl. 2, P. 4.17
  21. Кузнецова Е.Б., Стрельников В.В., Дрозд О.В., Немцова М.В., Залетаев Д.В. Поиск и характеристика новых маркеров метилирования и генов, вовлеченных в канцерогенез, методом метилчувствительного ПЦР-фингерпринтинга // Тезисы второй международной конференции «Молекулярная медицина и биобезопасность», Москва, 2005. С. 168
  22. Кузнецова Е.Б., Дрозд О.В., Немцова М.В., Стрельников В.В. Идентификация генов, вовлеченных в канцерогенез, методом метилчувствительного ПЦР-фингерпринтинга // V съезд российского общества медицинских генетиков, Уфа, Россия, Медицинская генетика, 2005. № 5, С. 214
  23. Strelnikov V.V., Kuznetsova E.B., Nemtsova M.V., Zaletayev D.V. Identification of methylation and expression abnormalities associated with breast cancer // European Journal of Human Genetics, 2006. V.14 Suppl. 1, P. 87
  24. Кузнецова Е.Б., Стрельников В.В. Методы анализа метилирования ДНК // Медицинская генетика, 2006. № 11. С. 3 11
  25. Залетаев Д.В., Немцова М.В., Стрельников В.В., Кузнецова Е.Б. Диагностика эпигенетических нарушений при наследственных заболеваниях // Медицинская генетика, 2006. Т. 5. Прил. 1. С. 54
  26. Strelnikov V.V., Kuznetsova E.B., Larin S.S., Nemtsova M.V., Zaletayev D.V. Novel cancer related genes and methylation/expression markers associated with breast cancer. // AACR Meeting Abstracts, 2006. B129
  27. Strelnikov V.V., Kuznetsova E.B., Larin S.S., Nemtsova M.V., Zaletayev D.V. Identification of novel methylation/expression markers and genes associated with breast cancer // AACR Meeting Abstracts, 2006. A96
  28. Kuznetsova E.B., Kekeeva T.V., Larin S.S., Zemlyakova V.V., Khomyakova A.V. Babenko O.V., Nemtsova M.V., Zaletayev D.V., Strelnikov V.V. Methylation of the BIN1 gene promoter CpG island associated with breast and prostate cancer // Journal of Carcinogenesis, 2007. 6: 9.
  29. Кузнецова Е.Б., Кекеева Т.В., Ларин С.С., Землякова В.В., Бабенко О.В., Немцова М.В., Залетаев Д.В., Стрельников В.В. Новые маркеры метилирования и экспрессии генов при раке молочной железы // Молекулярная биология, 2007. Т.41 №4, С. 624 633
  30. Kuznetsova E.B., Mikhaylenko D. S., Pudova E.A., Larin S.S., Nemtsova M.V., Zaletayev D.V., Strelnikov V.V. Inactivation of the laminin gamma 3 chain (LAMC3) gene in various cancers // European Journal of Human Genetics, 2007. V.15 Suppl. 1, P. 160.
  31. Strelnikov V.V., Kuznetsova E.B., Pudova E.A., Larin S.S., Nemtsova M.V., Zaletayev D.V. SEMA6B is a candidate tumor suppressor gene on 19p13.3 // European Journal of Human Genetics, 2007. V.15 Suppl. 1, P. 170
  32. Залетаев Д.В., Немцова М.В., Стрельников В.В., Бабенко О.В., Пальцева Е.М., Землякова В.В., Кузнецова, Кекеева Т.В., Михайленко Д.С., Манохина И.К. Эпигенетическая регуляция экспрессии генов в процессах канцерогенеза // Молекулярная медицина, 2008. № 4, С. 46 51
  33. Shkarupo V.V., Tanas A.S., Kuznetsova E.B., Zavalishina L.E., Frank G.A., Zaletaev D.V., Strelnikov V.V. A semi-automated unbiased differential methylation screening assay for applications in cancer epigenetic research // European Journal of Human Genetics, 2008. V.16 Suppl. 2, P. 223
  34. Pudova E.A., Kuznetsova E.B., Zavalishina L.E., Frank G.A., Zaletaev D.V., Strelnikov V.V. Dissection of allelic molecular pathology of the SEMA6B gene frequently altered in breast cancer // European Journal of Human Genetics, 2008. V.16 Suppl. 2, P. 206
  35. Пудова Е.А., Кузнецова Е.Б., Стрельников В.В., Залетаев Д.В. Механизмы инактивации предполагаемого гена – супрессора опухолевого роста SEMA6B при раке молочной железы // Тезисы V Конференции молодых ученых России с международным участием «Фундаментальные науки и прогресс клинической медицины» Москва, 2008. C. 349
  36. Шкарупо В.В., Танас А.С., Кузнецова Е.Б., Стрельников В.В.,Залетаев Д.В. Метод анализа структурно-функциональной организации эпигеномов клеток рака молочной железы // Тезисы V Конференции молодых ученых России с международным участием «Фундаментальные науки и прогресс клинической медицины» Москва, 2008. C. 489
  37. Strelnikov V.V., Tanas A.S., Shkarupo V.V., Kuznetsova E.B., Zaletaev D.V. Unbiased differential methylation screening assay for applications in cancer epigenetic research // Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology, 2008. P. 59 60
  38. Танас А.С., Стрельников В.В., Шкарупо В.В., Кузнецова Е.Б., Залетаев Д.В. Современный высокотехнологичный метод диагностики маркеров метилирования в онкологии // Онкогематология, 2008. №4, С. 73 74
  39. Стрельников В.В., Танас А.С., Шкарупо В.В., Кузнецова Е.Б., Залетаев Д.В. Современные высокотехнологичные методы диагностики маркеров метилирования ДНК в онкологии // Пятый московский международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития», Москва, 16-20 марта 2009. С. 90 91
  40. Strelnikov V. A State-of-the-Art Differential Methylation Screening Technique Based on the Amplification of Intermethylated Sites // Epigenetics World Congress – Event Proceedings, 2009. P. 27
  41. Залетаев Д.В., Немцова М.В., Стрельников В.В. Эпигенетическая регуляция экспрессии генов на ранних стадиях и в эмбриональных стволовых клетках // Учебник под ред. М.А.Пальцева «Биология стволовых клеток и клеточные технологии» для студентов медицинских вузов. М.: ОАО «Идательство «Медицина», 2009. Т. 1. С. 107 – 140
  42. Стрельников В.В., Танас А.С., Шкарупо В.В., Кузнецова Е.Б., Кекеева Т.В., Завалишина Л.Э., Франк Г.А., Залетаев Д.В. Современный высокотехнологичный метод скрининга дифференциального метилирования геномов на основе амплификации интерметилированных сайтов // Молекулярная медицина, 2009. № 4, С. 18 26
  43. Стрельников В.В., Кузнецова Е.Б., Залетаев Д.В. Поиск и характеристика новых маркеров метилирования и генов, вовлеченных в канцерогенез // Учебник под ред. М.А.Пальцева и Д.В.Залетаева «Системы генетических и эпигенетических маркеров в диагностике онкологических новообразований» для студентов медицинских вузов. М.: ОАО «Идательство «Медицина», 2009. С. 76-113
  44. Стрельников В.В., Танас А.С., Залетаев Д.В. Разработка новых методов диагностики метилирования ДНК в онкологии // Учебник под ред. М.А.Пальцева и Д.В.Залетаева «Системы генетических и эпигенетических маркеров в диагностике онкологических новообразований» для студентов медицинских вузов. М.: ОАО «Идательство «Медицина», 2009. С. 349-384
  45. Танас А.С., Шкарупо В.В., Стрельников В.В. Программное обеспечение для скринига дифференциального метилирования геномов на основе амплификации интерметилированных сайтов// Медицинская генетика, 2009, Т.8 №12 (90), С. 33
  46. Tanas A.S., Shkarupo V.V., Kuznetsova E.B., Zaletaev D.V., Strelnikov V.V. Amplification of intermethylated sites, Bioinformatics and Capillary electrophoresis: the ABC of the cancer methylomes // European Journal of Human Genetics, 2009. V.17 Suppl. 2, P. 284
  47. Tanas A.S., Shkarupo V.V, Kuznetsova E.B., Zaletayev D.V., Strelnikov V.V. Novel tools for unbiased DNA differential methylation screening // Epigenomics, 2010. V.2 No. 2, P. 325 333
  48. Залетаев Д.В., Стрельников В.В., Немцова М.В., Бабенко О.В., Кузнецова Е.Б., Землякова В.В., Кекеева Т.В., Михайленко Д.С., Шкарупо В.В., Танас А.С. Маркеры метилирования в диагностике онкологических заболеваний // Медицинская генетика, 2010. Т. 9 №1, С. 15 21
  49. Танас А.С., Шкарупо В.В., Кузнецова Е.Б., Залетаев Д.В., Стрельников В.В. Дизайн эксперимента и анализ результатов амплификации интерметилированных сайтов с использованием компьютерной программы AIMS in silico // Молекулярная биология, 2010. Т.44 № 2, С. 355 365
  50. Strelnikov V., Tanas A., Shkarupo V., Kuznetsova E., Gorban N., Zaletaev D. Non-microarray DNA differential methylation screening in breast cancer // Cancer Genetics and Cytogenetics, 2010. Vol.203 No 1, P. 93
  51. Tanas A., Shkarupo V., Kuznetsova E., Zaletaev D., Strelnikov V. AIMS in silico & PeakPick: a software package supporting unbiased screening of DNA differential methylation in cancer // Cancer Genetics and Cytogenetics, 2010. Vol.203 No 1, P. 94
  52. Алексеева E.A., Шубина M.B., Землякова В.B., Кузнецова Е.Б., Смолин A.B., Прозоренко Е.B., Залетаев Д.B., Стрельников B.B. Молекулярно-генетическая диагностика опухолей головного мозга. Сборник научных работ по материалам I Международного российско-американского симпозиума «Инновационные технологии в генетике и детской эпилептологии». Москва, 27-28 июня 2011. С. 72 84
  53. Стрельников В.В., Малышева А.С., Землякова В.В., Кузнецова Е.Б., Алексеева Е.А., Смолин А.В., Прозоренко Е.В., Залетаев Д.В. Делеции области расположения гена MGMT на хромосоме 10q26.3 в глиомах // Молекулярная медицина, 2011. № 2, С. 28 31
  54. Танас А.С., Руденко В.В., Стрельников В.В., Залетаев Д.В. Алгоритмы и программное обеспечение скрининга эпигенетических нарушений при раке. // Шестой московский международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития». Москва, 21-25 марта 2011. C. 139 140
  55. Бабенко О.В., Стрельников В.В., Залетаев Д.В. Классификация, номенклатура и классические методы детекции мутаций // Учебник под ред. М.А.Пальцева и Д.В.Залетаева «Введение в молекулярную диагностику» для студентов медицинских вузов. ОАО «Издательство «Медицина», 2011. Т. 2. С. 11-36
  56. Стрельников В.В., Кузнецова Е.Б., Танас А.А. Методы анализа метилирования ДНК // Учебник под ред. М.А.Пальцева и Д.В.Залетаева «Введение в молекулярную диагностику» для студентов медицинских вузов. М.: ОАО «Издательство «Медицина», 2011. Т. 2. С. 80-99
  57. Стрельников В.В., В.В.Землякова, И.П.Белецкий. ДНК-диагностика с использованием биологических микрочипов // Учебник под ред. М.А.Пальцева и Д.В.Залетаева «Введение в молекулярную диагностику» для студентов медицинских вузов. М.: ОАО «Издательство «Медицина», 2011. Т. 2. С. 148-165
  58. Залетаев Д.В., В.В.Стрельников, О.В.Бабенко, Землякова В.В., Немцова М.В. Общие подходы к молекулярно-генетической диагностике в онкологии // Учебник под ред. М.А.Пальцева и Д.В.Залетаева «Введение в молекулярную диагностику» для студентов медицинских вузов. М.: ОАО «Издательство «Медицина», 2011. Т. 2. С. 402-448
  59. Стрельников В.В., В.В.Землякова, М.В.Шубина. Молекулярно-генетическая диагностика опухолей головного мозга // Учебник под ред. М.А.Пальцева и Д.В.Залетаева «Введение в молекулярную диагностику» для студентов медицинских вузов. М.: ОАО «Идательство «Медицина», 2011. Т. 2. С. 486-503
  60. Залетаев Д.В., Стрельников В.В., Кекеева Т.В., Землякова В.В., Кузнецова Е.Б., Михайленко Д.С. Аномалии метилирования в процессах канцерогенеза: поиск новых генов, разработка методов и систем ДНК-маркеров для диагностики // Экологическая генетика, 2011. Т.IX. № 3. С. 27 32.

Зарегистрированные новые медицинские технологии, алгоритмы и компьютерные программы, заявки на патент:

1. Руденко В.В., Танас А.С., Стрельников В.В., Кузнецова Е.Б., Залетаев Д.В. Скрининг аномального метилирования ДНК на основе метода амплификации интерметилированных сайтов для диагностики злокачественного опухолевого процесса // Медицинская ДНК-технология. Разрешение ФС № 2011/132 от 27.05.2011г.

2. Немцова М.В., Залетаев Д.В., Стрельников В.В. Молекулярная диагностика нарушений метилирования импринтированных районов IGF2, H19, KCNQ1OT1 у пациентов с синдромом Видеманна-Беквита // Медицинская ДНК-технология. Разрешение ФС № 2011/131 от 27.05.2011 г.

3. Танас А.С., Шкарупо В.В., Стрельников В.В. Компьютерная программа AIMS in silico // Рекламно-техническое описание, описание программы, описание применения. Регистрационный номер ВНТИЦ 50201050017. Москва, 2010 г.

4. Танас А.С., Руденко В.В., Стрельников В.В. Компьютерная программа PeakPick // Рекламно-техническое описание, описание программы, описание применения. Регистрационный номер ВНТИЦ 50201050040. Москва, 2010 г.

5. Танас А.С., Руденко В.В., Стрельников В.В. Программа для ЭВМ "AIMS in silico 2". Рекламно-техническое описание, описание применения. Регистрационный номер ВНТИЦ 50201151514, Москва, 2011 г.

6. Руденко В.В., Танас А.С., Кузнецова Е.Б., Стрельников В.В., Залетаев Д.В. Способ формирования панелей маркеров метилирования ДНК // Заявка на получение патента, регистрационный номер 2011119871, Роспатент, Москва, 2011 г.


Список сокращений.

АИМС - амплификация интерметилированных сайтов

ДНК – дезоксирибонуклеиновая кислота

ИБГ – Институт биологии гена

КЭФ – капиллярный электрофорез

МРНЦ – Медико-радиологический научный центр

МЧ-ПЦР – метилчувствительная полимеразная цепная реакция

МЧФП – метилчувствительный фингерпринтинг

НМРЛ - немелкоклеточный рак легких

п.н. – пара нуклеотидов

ПААГ – полиакриламидный гель

ПЦР – полимеразная цепная реакция

РМЖ – рак молочной железы

РМП - рак мочевого пузыря

РОНЦ – Российский онкологический научный центр

РП - рак почки

РПЖ – рак предстательной железы

РФФИ – Российский фонд фундаментальных исследований

AFLOAT - Amplified Fragment Length Oriented Analysis (анализ, ориентированный на длину амплифицируемых фрагментов)

В-ОЛЛ - В-клеточный острый лимфобластный лейкоз

MLPA - мультиплексная лигазная проба-зависимая амплификация