Примерная программа наименование дисциплины почвенная микробиология рекомендуется для направления подготовки

Вид материалаПримерная программа

Содержание


2. Место дисциплины в структуре ООП
3. Требования к результатам освоения дисциплины
4. Объем дисциплины и виды учебной работы
Самостоятельная работа (всего)
Вид промежуточной аттестации
5. Содержание дисциплины
1. Общая микробиология
2. Почвенная микробиология
3. Сельскохозяйственная микробиология
5.2 Разделы дисциплины и междисциплинарные связи с обеспечиваемыми (последующими) дисциплинам
5.3. Разделы дисциплин и виды занятий, час
6. Лабораторный практикум
Выявление включений. Окраска спор. Окраска по Граму.
Коллоквиум «Морфология и систематика микроорганизмов».
Количественный учет микроорганизмов в различных субстратах. Выделение чистой культуры.
Учет результатов опытов по молочнокислому брожению. Контрольная тестовая работа «Микробиологическая трасформация соединений угле
Коллоквиум «Метаболизм микроорганизмов». Постановка опытов по выявлению микробных комплексов почвы (по Холодному).
Результаты опыта по брожению клетчатки. Постановка опытов по моделированию процессов цикла азота в природе.
7. Примерная тематика курсовых работ.
8. Учебно-методическое и информационное обеспечение дисциплины
...
Полное содержание
Подобный материал:

ПРИМЕРНАЯ ПРОГРАММА


Наименование дисциплины - ПОЧВЕННАЯ МИКРОБИОЛОГИЯ


Рекомендуется для направления подготовки


110100 «Агрохимия и агропочвоведение»


Квалификация (степень) выпускника - бакалавр


1.Цели дисциплины: формирование знаний, умений и навыков по общей, почвенной и сельскохозяйственной микробиологии, понимание роли почвенных микроорганизмов в агроэкологических процессах.

Задачи дисциплины: изучение основ общей микробиологии; в области почвенной микробиологии - изучение почвенных микробных комплексов как факторов почвенного плодородия, овладение методами определения почвенных микроорганизмов, в области сельскохозяйственной микробиологии - изучение эпифитных микроорганизмов поверхности растений, микробиологических продуктов и биопрепаратов сельскохозяйственного назначения.


2. Место дисциплины в структуре ООП

Курс входит в базовую часть профессионального цикла дисциплин, включенных в учебный план согласно ФГОС ВПО и учебному плану направления 110100 «Агрохимия и агропочвоведение».

Для изучения дисциплины необходимы знания в области: общей биологии, органической химии, почвоведения, физиологии растений, биохимии.

Дисциплина «Почвенная микробиология» является предшествующей для следующих профессиональных дисциплин: агрохимия, земледелие и дисциплин профиля - агроэкология, растениеводство, защита растений.


3. Требования к результатам освоения дисциплины

В результате изучения дисциплины «Почвенная микробиология» выпускник по направлению подготовки 110100 «Агрохимия и агропочвоведение» с квалификацией (степенью) «бакалавр» должен обладать следующими компетенциями:
  • способности к использованию основных законов естественнонаучных дисциплин в профессиональной деятельности, применению методов математического анализа и моделирования, теоретического и экспериментального исследования;
  • готовности проводить физический, физико-химический, химический и микробиологический анализ почв, химический анализ растений, удобрений и мелиорантов в соответствии с современными методиками;
  • готовности участвовать в проведении почвенных, агрохимических и агроэкологических обследований земель сельскохозяйственного назначения;
  • способности к проведению растительной и почвенной диагностики, принятию мер по агроэкологической оптимизации минерального питания растений и микробиологической активности почв;
  • способности к проведению экологической экспертизы, проектов сельскохозяйственного землепользования;
  • готовности изучать современную информацию, отечественный и зарубежный опыт по тематике исследований;
  • способности к проведению почвенных, агрохимических и агроэкологических научных исследований согласно утвержденным методикам;
  • способности к лабораторному анализу почв, удобрений и растений;
  • способности к обобщению и статистической обработке результатов опытов, формулированию выводов.


В результате изучения дисциплины студент должен

знать: морфологию, систематику, физиологию и экологию микроорганизмов, роль микроорганизмов в превращениях различных соединений и химических элементов в почве;

уметь: определять биологическую активность почвы и предлагать способы ее регулирования, использовать биоиндикацию, биотесты.


4. Объем дисциплины и виды учебной работы:


Вид учебной работы

Всего

часов

Семестр

4

Аудиторные занятия (всего)

72

72

В том числе:







Лекции

28

28

Лабораторные работы

44

44

Самостоятельная работа (всего)

72

72

В том числе:







Курсовая работа

35

35

Самостоятельное изучение разделов дисциплины, самоподготовка к коллоквиумам, контрольным работам, лабораторным занятиям с помощью лекционного материала, учебников, практикума

37

37

Вид промежуточной аттестации

экзамен

экзамен

Общая трудоемкость: часы

зачетные единицы

144

4

144

4


5. Содержание дисциплины

5.1. Содержание разделов дисциплины




п/п

Наименование раздела дисциплины

Содержание раздела

1. Общая микробиология

1.1.

Объекты, история, задачи, направления и перспективы развития микробиологии.

Объекты и история микробиологии. Значение микроорганизмов в природе и жизнедеятельности человека. Задачи и основные направления в микробиологии.

1.2.

Морфология и систематика микроорганизмов

Основные группы микроорганизмов. Строение бактериальной клетки. Рост и размножение бактерий. Особенности строения клеток эукариот. Морфология и структура акариот, способы их репродукции. Методы микроскопии и приготовления препаратов.

Общие сведения по систематике и номенклатуре прокариот. Принципы фенотипической и филогенетической систематики. Основные таксономические группы бактерий.

1.3.

Отношение микроорганизмов к факторам внешней среды

Зависимость микроорганизмов от водного режима и кислотности среды, температуры, давления, химических веществ, радиации. Отношение микроорганизмов к кислороду. Различие реакции на внешние воздействия вегетативных клеток и эндоспор бактерий. Предотвращение развития микроорганизмов с помощью физических, химических и биологических факторов в быту, промышленности, сельском хозяйстве.

1.4.

Способы и типы питания микроорганизмов

Способы питания, поступление питательных веществ в клетку. Ферменты в жизнедеятельности микробной клетки. Пищевые потребности микроорганизмов и типы питания. Приготовление питательных сред для микроорганизмов и методы стерилизации.

1.5.

Распространение мик-

роорганизмов в различных субстратах: почве, навозе, зерне и др.

Методы количественного учета микроорганизмов. Определение качественного состава микрофлоры. Выделение чистых культур микроорганизмов.

1.6.

Метаболизм микроорганизмов. Превращение микроорганизмами соединений углерода.


Метаболические процессы: энергетический и конструктивный обмен (катаболизм и анаболизм). Получение и запасание энергии в клетке. Сходство и различие брожения, дыхания, анаэробного дыхания. Химизм и энергетика брожения, дыхания. Анаэробное дыхание с использованием кислорода нитратов и сульфатов.

1.7.

Виды брожений, осуществляемых микроорганизмами.

Окисление органических соединений микроорганизмами


Спиртовое брожение, химизм, возбудители. Эффект Пастера. Значение спиртового брожения в промышленности и сельском хозяйстве. Микробиологические основы виноделия. Типы молочнокислого брожения, возбудители. Роль молочнокислых и пропионовокислых бактерий в жизнедеятельности человека, здравоохранении, приготовлении кисломолочных продуктов, кормопроизводстве. Свойства возбудителей







этих процессов, распространение и значение их в природе и сельском хозяйстве.

Окисление клетчатки, жира и других органических соединений. Возбудители и ход процессов окисления, их значение в природе и сельском хозяйстве.

2. Почвенная микробиология

2.1

Микробиологические почвенные процессы превращения веществ и энергии

Маслянокислое, ацетонобутиловое брожения, брожение пектиновых веществ, брожение клетчатки, разложение гемицеллюлозы, лигнина, пектиновых веществ, окисление углеводородов в почве.

2.2.

Участие микроорганизмов в круговороте азота в природе


Процессы минерализации, иммобилизации, нитрификации и денитрификации. Регуляция денитрификации и иммобилизации агротехническими приемами. Меры борьбы с диссимиляторной денитрификацией в почве.

2.3.

Биологическая фиксация молекулярного азота атмосферы


Масштабы и значение биологической азотфиксации в природе. Энергоэффективность и «экологическая чистота» биологического азота. Свободноживущие, ассоциативные и симбиотические азотфиксаторы. Симбиотическая азотфиксация у бобовых и небобовых растений. Листовые клубеньки. Сочетание биологического и минерального азота в сельском хозяйстве.

2.4.

Превращения микроорганизмами соединений серы, фосфора, железа и др.


Круговорот серы в природе. Ассимиляторная сульфатредукция. Серобактерии и тионовые бактерии. Роль микроорганизмов в высвобождении кислоты из органических фосфорсодержащих соединений и в переводе нерастворимых фосфатов в растворимое состояние. Биологическое связывание фосфора. Роль микроорганизмов в фосфорном питании растений. Прямое и косвенное участие почвенных микроорганизмов в превращениях железа, марганца, алюминия, калия.

2.5.

Микробные комплексы почвы. Принципы и концепции почвенной микробиологии


Понятие о микробных комплексах почвы. Особенности почвы как среды обитания микроорганизмов. Эколого-географические закономерности распространения микроорганизмов в почвах. Стратегии жизнедеятельности микроорганизмов в почве. Разнообразие трофических взаимодействий микроорганизмов. Принципы и концепции, принятые в почвенной микробиологии.

2.6.

Агроэкологическая роль почвенных микроорганизмов


Значение почвенных микроорганизмов в плодородии почвы. Ассоциации микроорганизмов с корневой системой растений: ризосфера и ризоплана. Роль почвенных микроорганизмов в образовании и разрушении гумуса. Экологическая, биохимическая и микробиологическая концепции гумусообразования. Значение почвенной микрофлоры при рекультивации земель. Действие органических и минеральных удобрений, различных приемов обработки почвы и мелиорации на почвенные микроорганизмы. Деградация почвенными микроорганизмами пестицидов и других синтетических химических веществ.

2.7.

Биологическая активность разных типов почв, методы определения состава почвенных микроорганизмов (курс. работа).

Биогенность почв разных типов. Почвенные микроорганизмы как индикаторы типа и плодородия почв. Прямые и косвенные методы определения численности, состава и активности почвенных микроорганизмов. Учет численности отдельных физиологических групп.

3. Сельскохозяйственная микробиология

3.1.

Микробиология производства кормов, микробных биопрепаратов, значение эпифитных микроорганизмов в хранении урожая и другие аспекты использования микроорганизмов в сельскохозяйственном производстве.

Силосование кормов как метод анаэробной биоконверсии. Значение пробиотиков в сельском хозяйстве. Микробные землеудобрительные биопрепараты. Микоризация растений. Роль эпифитной микрофлоры при хранении зерна, семян, плодов и овощей. Применение микроорганизмов и микробных биопрепаратов для борьбы с болезнями и вредителями сельскохозяйственных растений. Микроорганизмы-продуценты биологически активных веществ, антибиотиков для защиты растений.


5.2 Разделы дисциплины и междисциплинарные связи с обеспечиваемыми (последующими) дисциплинам



п/п

Наименование обеспечиваемых (последующих) дисциплин

№№ разделов дисциплины, необходимых для изучения обеспечиваемых (последующих) дисциплин

1

2

3

1.

Агрохимия

+

+

+

2.

Земледелие

+

+

+

3.

Агроэкология

+

+

+

4.

Растениеводство

+

+

+

5.

Защита растений

+

+

+

5.3. Разделы дисциплин и виды занятий, час



п/п

Наименование раздела дисциплины

Лекции


ЛР

СРС

Всего

1.

Общая микробиология

12

24

30

66

2.

Почвенная микробиология

14

18

36

68

3.

Сельскохозяйственная микробиология

2

2

6

10


6. Лабораторный практикум



п/п

№ раздела

дисциплины

Наименование лабораторных работ

Трудоемкость, час.

1.

1

Ознакомление с иммерсионной системой микроскопа. Техника приготовления препаратов.

2

2.

1

Ознакомление с шаровидными и палочковидными формами бактерий.

2

3.

1

Ознакомление со спиралевидными, нитчатыми формами бактерий.

2

4.

1

Ознакомление с микромицетами, микроводорослями. Контрольная тестовая работа «Устройство микроскопа и техника микроскопирования бактериальных препаратов»


2

5.

1

Выявление включений. Окраска спор. Окраска по Граму.


2

6.

1

Постановка опыта по изучению значения питательных элементов для развития микроорганизмов.


2

7.

1

Учет результатов опыта по значению питательных элементов для развития микроорганизмов. Контрольная тестовая работа «Морфология и ультраструктура микроорганизмов».


2

8.

1

Коллоквиум «Морфология и систематика микроорганизмов».


2

9.

1

Определение численности микроорганизмов в различных субстратах. Контрольная работа «Питательные среды и методы стерилизации».


2

10.

1,2

Количественный учет микроорганизмов в различных субстратах. Выделение чистой культуры.


2

11.

1,2

Анализ чистой культуры и постановка опыта по определению ее чувствительности к антибиотикам. Постановка опытов по выявлению антагонистических взаимоотношений почвенных микроорганизмов.


2

12.

1,2

Оценка чувствительности чистой культуры к антибиотикам и антагонизма между почвенными микроорганизмами. Контрольная тестовая работа по питанию микроорганизмов.

2

13.


1,2

Коллоквиум «Питание микроорганизмов. Влияние факторов внешней среды на микроорганизмы». Моделирование спиртового, маслянокислого, брожений и брожения клетчатки.


2

14.

1,2,3

Результаты опытов по спиртовому, маслянокислому, молочнокислому брожениям. Постановка опытов по молочнокислому брожению.

2

15.

1,2

Учет результатов опытов по молочнокислому брожению. Контрольная тестовая работа «Микробиологическая трасформация соединений углерода».


2

16.

1,2

Коллоквиум «Метаболизм микроорганизмов». Постановка опытов по выявлению микробных комплексов почвы (по Холодному).


2

17.

2

Результаты опыта по брожению клетчатки. Постановка опытов по моделированию процессов цикла азота в природе.


2

18.

2

Результаты опытов по циклу азота. Просмотр клубеньковых бактерий в клубеньках бобовых растений.

2

19.

2

Контрольная тестовая работа «Роль микроорганизмов в круговороте азота в природе». Коллоквиум «Процессы круговорота азота в природе».

2

20.

2,3

Коллоквиум по почвенной и сельскохозяйственной микробиологии.

2

21.

2

Исследование биологической активности почв разных типов, освоение методов определения состава почвенных микроорганизмов. Постановка опытов для курсовой работы.

2

22.

2

Учет результатов посева на плотных и жидких средах. Обсуждение результатов.

2


7. Примерная тематика курсовых работ.
  1. Микробные ценозы почвы и методы их изучения.
  2. Влияние антропогенных факторов на микробиологические процессы в почве.
  3. Использование микроорганизмов в сельском хозяйстве как альтернатива химизации.
  4. Экология микроорганизмов.
  5. Микробные процессы в биотехнологии окружающей среды.



8. Учебно-методическое и информационное обеспечение дисциплины:


а) основная литература:
  1. Емцев В.Т., Мишустин Е.Н. Микробиология. М.: Дрофа, 2005.
  2. Шильникова В.К., Ванькова А.А, Годова Г.В. Микробиология М.: Дрофа, 2006.
  3. Звягинцев Д.Г., Бабьева И.П., Зенова Г.М. Биология почв. М.: МГУ, 2005.


б) дополнительная литература:
  1. Гусев М.В., Минеева Л.А. Микробиология. М.: МГУ, 2004.
  2. Заварзин Г.А., Колотилова Н.Н. Введение в природоведческую микробиологию. М.: Книжный дом «Университет», 2004.
  3. Шлегель Г. Общая микробиология, М.: Мир, 1987.
  4. Громов Б.В. Павленко Г.В. Экология бактерий. Л.: ЛГУ, 1989.
  5. Шильникова В.К., Серова Е.Я. Микроорганизмы-азотонакопители на службе растений. М.: Наука, 1983.
  6. Стейниер Р., Эдельберг Э., Ингрем Дж. Мир микробов. М.: Мир, 1987, Т.1…3.
  7. Современная микробиология. Прокариоты. /под ред. Ленгелера И., Древса Г., Шлегеля Г. М. Мир, 2005, т. 1,2.
  8. Шлегель Э.Г. История микробиологии. М. УРСС, 2005.
  9. Почвенная микробиология. Методические рекомендации к написанию курсовых работ для студентов факультета агрохимии и почвоведения. М.: РГАУ-МСХА, 2010.


в) базы данных, информационно-справочные и информационные системы:

Гарант, Консультант плюс, КОНСОР, полнотекстовая база данных иностранных журналов Doal, реферативная база данных Агрикола и ВИНИТИ, научная электронная библиотека e-library, Агропоиск; информационным справочным и поисковым системам: Rambler, Yandex, Google.


9.Материально-техническое обеспечение дисциплины

Для лекционного курса необходима компьютерная техника с мультимедийным обеспечением.

Для обеспечения лабораторных занятий необходимы: лаборатория, оснащенная газо- и водопроводом, УФ-лампы для стерилизации помещений, стерилизационная техника (автоклавы, стерилизационные шкафы), термостаты, анаэростаты, световые микроскопы с набором красителей и иммерсионных масел, электронный микроскоп, фотоэлектроколориметры, рН-метры, шейкеры, водяные бани, тест-системы для идентификации микроорганизмов, лабораторная посуда, компьютерная техника с мультимедийным обеспечением.


10. Методические рекомендации по организации изучения дисциплины

При преподавании курса необходимо ориентироваться на современные образовательные технологии путем использования модульности, индивидуализации с целью формирования и развития профессиональных навыков учащихся. Использовать активные методы, дифференцированное обучение, обеспечить профориентацию в процессе обучения.

Самостоятельная работа должна быть направлена на углубленное изучение актуальных проблем почвенной микробиологии, последних достижений науки и возможностей их использования для повышения почвенного плодородия, интенсификации сельскохозяйственного производства и охраны окружающей среды.

Желательный количественный состав студентов на лабораторном занятии не должен превышать 12 человек.


Разработчик:

РГАУ – МСХА

имени К.А.Тимирязева

доцент кафедры

микробиологии

Г.В.Годова



















Эксперт:







МГУ

имени М.В.Ломоносова

профессор

Д.Г.Звягинцев