Г. А. Агаева Институт физических проблем, Бакинский Государственный Университет

Вид материала

Документы

Подобный материал:

• Проблемы кибернетики и информатики” (pci’2010), 57.04kb.
• Человечество переживает эпоху глобальной демографической революции, 441.1kb.
• Московский Государственный Институт Электроники и Математики (Технический Университет), 10.69kb.
• Министерство Образования Азербайджанской Республики Бакинский Государственный Университет, 256.92kb.
• Кубанский государственный аграрный университет кубанский государственный технологический, 51.16kb.
• Московский Государственный Институт Международных Отношений (Университет) мид россии,, 39.44kb.
• Экспериментальные исследования деформирования резин и слоистых сред с помощью лазерного, 62.83kb.
• Московский Государственный Институт Электроники и Математики (Технический Университет), 763.07kb.
• А. В. Кузовкин московский инженерно-физический институт (государственный университет), 31.8kb.
• Отчет государственного образовательного учреждения высшего профессионального образования, 2810.92kb.

Конформационное поведение тахикининового нейропептида кассинина и его монозамещенных аналогов

Г. А. Агаева

Институт физических проблем, Бакинский Государственный Университет


Кассинин впервые был обнаружен в центральной нервной системе амфибии Kassina senegalensis. Молекула кассинина состоит из 12 аминокислотных остатков H-Asp¹-Val²-Pro³-Lys⁴-Ser⁵-Asp⁶-Gln⁷-Phe⁸-Phe⁹-Gly¹⁰-Leu¹¹Met¹²NH₂. По своей первичной структуре и ряду функциональных свойств кассинин относят к тахикининовым нейропептидам. Нейропептиды этой группы, характеризуются одинаковой С-концевой последовательностью Phe-Xaa-Gly-Leu-Met NH₂, и проявляют похожие фармакологические свойства. Кассинин особенно эффективен в проявлении таких свойств как понижение артериального давления, стимулирование сокращения гладкой мускулатуры и стимулирование рефлекса мочеиспускания. Определение конформационного поведения нейропептидов как потенциальных лекарственных препаратов является необходимым этапом для молекулярного моделирования и создания новых более эффективных их аналогов. В настоящей работе методами молекулярной механики и молекулярной динамики был проведен поиск энергетически предпочтительных конформационных состояний нативной молекулы кассинина и его 12 монозамещенных L-аланином аналогов. Результаты исследования показали, что начальный пентапептидный фрагмент молекулы является конформационно подвижным, а последующий пептидный участок предпочтительно формирует альфа-спиральную структуру, что может быть важным для биологической активности. Исследование конформационных возможностей 12 аналогов кассинина с монозамещениями на L-аланин позволили определить ключевые остатки кассинина, замещение которых изменяют отдельные энергетические и геометрические параметры предпочтительных конформаций кассинина. Полученные пространственные структуры молекулы кассинина и его аналогов могут служить как исходные для моделирования и синтеза новых избирательно действующих аналогов молекулы кассинина..