Утверждаю

Вид материалаРабочая программа

Содержание


1. Цели освоения дисциплины
2.Место дисциплины в структуре ООП бакалавриата
Молекулярная спектроскопия в биофизике
Молекулярная спектроскопия в биофизике
4. Структура и содержание дисциплины «Молекулярная спектроскопия в биофизике»
4.1. Структура дисциплины
Формы текущего контроля успеваемости (по неделям семестра)
4.2. Содержание дисциплины
5. Образовательные технологии
6.1 Учебно-методическое обеспечение самостоятельной работы студентов
Порядок выполнения и контроля самостоятельной работы студентов
6.2 Контрольные вопросы и задания для проведения текущего контроля
6.4 Контрольные вопросы и задания для проведения промежуточной аттестации по итогам освоения дисциплины «Молекулярная спектроско
7. Учебно-методическое и информационное обеспечение дисциплины «Молекулярная спектроскопия в биофизике»
8. Материально-техническое обеспечение дисциплины «Молекулярная спектроскопия в биофизике»
Подобный материал:
Приложение


МИНИСТЕРСТВО ОБРАЗОВАНИЯ И НАУКИ

РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ

Саратовский государственный университет имени Н.Г. Чернышевского


Физический факультет


УТВЕРЖДАЮ

___________________________

"__" __________________2011 г.


Рабочая программа дисциплины


Молекулярная спектроскопия в биофизике


Направление подготовки

011200 Физика


Профиль подготовки

Биофизика


Квалификация (степень) выпускника

Бакалавр


Форма обучения

очная


Саратов,

2011


1. Цели освоения дисциплины

Цель освоения дисциплины «Молекулярная спектроскопия в биофизике» заключается в обеспечении студентов базовыми знаниями в области спектроскопии молекул, составляющих биологические объекты, на основе общефизической и общетеоретической подготовки бакалавров-физиков. Одна из основных целей состоит в обеспечении студентов знаниями и навыками в исследовании энергетической и пространственной структуры свободных и связанных молекул, связанных с общими вопросами спектроскопии, закономерностями формирования уровней энергии, соответствующих внутренним движениям (электронному, колебательному, вращательному) атомов или молекул и их оптических спектров. Знание данной дисциплины необходимо для исследования многих явлений в области атомной и молекулярной физики, физики твердого тела, химии, биологии..


2.Место дисциплины в структуре ООП бакалавриата

Дисциплина «Молекулярная спектроскопия в биофизике» относится к профессиональному циклу (Б.3), вариативной части дисциплин (В.8).

В рамках учебного плана дисциплина «Молекулярная спектроскопия в биофизике» базируется на теоретических представлениях и математико-аналитическом аппарате таких дисциплин математического и естественнонаучного цикла как «Физические методы регистрации биологических параметров», профессионального цикла: «Оптика». Также требуются практические навыки, полученные в рамках дисциплины профессионального цикла «Спецпрактикум 1»

Для успешного усвоения дисциплины необходимы знания основ и методов оптики и физики атомов и атомных явлений, основных представлений о классической и квантовой теории излучения света атомами, молекулярной физики, теории точечных и пространственных групп.

При освоении дисциплины «Молекулярная спектроскопия в биофизике» студенты должны иметь навыки самостоятельной работы с учебными пособиями и монографической литературой, в том числе на иностранном языке, уметь осуществлять поиск в базах данных научной литературы, формулировать поисковые запросы и фильтрацию результатов поиска. Студенты должны иметь навыки работы с персональным компьютером достаточные для самостоятельного освоения пользовательского интерфейса и функциональных возможностей пакетов программ для научных и инженерных расчетов и обработки экспериментальных данных (Matlab, Mathcad, Originlab Origin и др.).

Знания, полученные при освоении дисциплины «Молекулярная спектроскопия в биофизике», необходимы при выполнении студентом квалификационных работ в течение всего курса обучения по профилю «Биофизика».


3 Компетенции обучающегося, формируемые в результате освоения дисциплины «Молекулярная спектроскопия в биофизике».

В результате освоения дисциплины « Молекулярная спектроскопия в биофизике» должны формироваться в определенной части следующие компетенции:

общекультурные:

ОК-16 - способность использовать в познавательной и профессиональной деятельности навыки работы с информацией из различных источников

общепрофессиональные:

ПК-3 - способность эксплуатировать современную физическую аппаратуру и оборудование;

ПК-5 - способность применять на практике базовые общепрофессиональные знания теории и методов физических исследований (в соответствии с профилем подготовки)

В результате освоения дисциплины « Молекулярная спектроскопия в биофизике» обучающийся должен:

•Знать:

- классические модели излучения разреженных сред, теплового излучения конденсированных сред;

- основные представления о классической и квантовой теории излучения света атомами и молекулами;

- основы молекулярной физики;

- теории точечных и пространственных групп.

•Уметь:

- излагать и критически анализировать основные положения теории формирования спектров, а также их практических возможностей;

- пользоваться теоретическими основами обработки спектров и практическими навыками, полученными в ходе освоения дисциплины, для обработки и анализа спектров с целью получения информации о структуре и составе вещества;

- пользоваться экспериментальным оборудованием, настраивать и эксплуатировать спектральные приборы;

•Владеть:

- методами математической обработки спектров;

- практическими навыками регистрации спектров;

- практическими навыками экспериментальной работы со спектральными приборами.


4. Структура и содержание дисциплины «Молекулярная спектроскопия в биофизике»

Общая трудоемкость дисциплины составляет 4 зачетных единицы, 90 часов (32 часа лекций, 58 часов самостоятельной работы)


4.1. Структура дисциплины




п/п

Раздел дисциплины

Семестр

Неделя семестра

Виды учебной работы, включая самостоятельную работу студентов и трудоемкость (в часах)

Формы текущего контроля успеваемости (по неделям семестра)

Формы промежуточной аттестации (по семестрам)

1

Общие вопросы спектроскопии.

6

1

Л 2

СР 2










2

Молекулярная спектроскопия. Вращательная спектроскопия

6

2

Л 2

СР 2










3

Колебательная спектроскопия

6

3

Л 2

СР 2










4

Электронная спектроскопия молекул

6

4

Л 2

СР 2










5

Электронная спектроскопия связанных молекул

6

5

Л 2

СР 2










6

Спектроскопия твердого тела

6

6

Л 2

СР 2










7

Люминесцен-ция

6

7

Л 2

СР 2










8

Экспериментальные методы молекулярной спектроскопии.

6

8

Л 2

СР 2










9

Применение спектроскопии в биологии и медицине

6

9

Л 2

СР 2










10

Итог







Л 32

СР 58







Экзамен


4.2. Содержание дисциплины

1. Основы теории взаимодействия излучения с атомами и молекулами. Вероятности переходов. Полуклассическая теория взаимодействия излучения с веществом на основе теории возмущений, зависящих от времени. Дипольное приближение. Константы скорости переходов для различных атомно-молекулярных движений. Спонтанные и вынужденные переходы. Коэффициенты Эйнштейна, время жизни в возбужденном состоянии. Сила осцилляторов. Сила перехода.

2. Спектроскопия свободных молекул. Описание движения свободных молекул. Система коллективных координат. Двухатомные молекулы. Модели жесткого и нежесткого ротаторов.

8. Многоатомные молекулы. Моменты инерции и вращательные состояния. Вращательные модели нелинейных молекул: сферический, симметричный и асимметричный волчки. Информативность вращательных спектров.

9. Двухатомные молекулы. Модель колеблющегося ротатора в гармоническом и ангармоническом приближении. Колебательно-вращательные спектры инфракрасного поглощения и комбинационного рассеяния света. Интенсивности и поляризации в спектрах.

10. Многоатомные молекулы. Выбор колебательных координат. Нормальные колебания. Формы колебаний. Характеристичность. Симметрия колебаний. Симметрия нормальных смещений и нормальных координат. Классификация нормальных колебаний по симметрии. Теоретико-групповой анализ колебаний.

11. Ангармонизм. Симметрия колебательных состояний. Правила отбора по симметрии. Информативность колебательных спектров. Колебание кристаллических решеток. Колебательные спектры кристаллов

12. Электронные состояния и химическая связь в молекулах. Построение молекулярных орбиталей из атомных. Связывающие, разрыхляющие, несвязывающие орбитали. Особенности образования электронных орбиталей многоатомных молекул. Гибридизация.

13. Электронно-колебательно-вращательные спектры двухатомных молекул. Правила отбора. Колебательная структура электронных переходов. Вращательная структура электронно-колебательных переходов. Парабола Фортра. Образование кантов. Принцип Франка-Кондона. Распределение интенсивности в спектрах электронно-колебательных переходов.

14. Классификация молекулярных взаимодействий. Потенциалы парных, и коллективных взаимодействий. Универсальные взаимодействия, их влияние на положение, интенсивность и форму электронных полос. Специфические взаимодействия. Примеры специфических взаимодействий и их спектральных проявлений: водородная связь, комплексы с переносом заряда.

15. Обзор методов регистрации и анализа вращательных, колебательно-вращательных, электронно-колебательных спектров. Спектры поглощения, испускания, рассеяния. Извлечение информации о строении и энергетической структуре свободных и связанных молекул.

Применение спектроскопических методов в экологии, биологии и медицине. 16. Методы мониторинга атмосферного воздуха. Методы мониторинга водных сред. Спектроскопия в биолого-медицинских исследованиях. Диагностические и лечебные физические методы в медицине.


5. Образовательные технологии

При реализации дисциплины «Молекулярная спектроскопия в биофизике» используются следующие виды учебных занятий: лекции, консультации, самостоятельные работы.

В рамках лекционных занятий предусмотрены активные формы учебного процесса: разбор конкретных ситуаций, натурные демонстрации, компьютерные демонстрации с использованием интерактивных и мультимедийных технологий.


6. Учебно-методическое обеспечение самостоятельной работы студентов. Оценочные средства для текущего контроля успеваемости, промежуточной аттестации по итогам освоения дисциплины.


6.1 Учебно-методическое обеспечение самостоятельной работы студентов


Виды самостоятельной работы студента:

- изучение теоретического материала по конспектам лекций и рекомендованным учебным пособиям, монографической учебной литературе;

- самостоятельное изучение некоторых теоретических вопросов, выделенных в программе дисциплины, нерассмотренных на лекциях;

- выполнение комплекса заданий теоретического характера, расчетных и графических по всем разделам дисциплины;

- выполнение практических заданий по обработке полученных спектров;


Порядок выполнения и контроля самостоятельной работы студентов:

- самостоятельная работа обучающихся по изучению теоретического лекционного материала предусмотрена один раз в неделю; контроль выполнения этой работы предусмотрен на лекциях по данной дисциплине;

- самостоятельное изучение некоторых теоретических вопросов, выделенных в программе дисциплины и нерассмотренных на лекциях, предусматривается по мере изучения соответствующих разделов, в которых выделены эти вопросы для самостоятельного изучения; контроль выполнения этой самостоятельной работы предусмотрен в рамках промежуточного контроля – экзамена по данной дисциплине;


При выполнении самостоятельной работы студенты должны использовать информационное обеспечение, указанное в п.7 данной рабочей программы.


6.2 Контрольные вопросы и задания для проведения текущего контроля:

1. От каких условий эксперимента зависит разрешение спектральных полос?

2. В каких случаях происходит нарушение закона Бугера-Бера?

3. Каким образом растворители влияют на характеристики спектров?

4. Какие характеристики вещества можно получить из спектров?

5. В чем заключается влияние стенок кюветы на регистрируемую оптическую плотность образца?

6. Каким образом рассчитывают свойства молекул по колебательно-вращательным спектрам? Рассчитать параметры молекулы соляной кислоты.

7. Как изменяются спектры люминесценции молекул при добавлении в раствор тяжелых атомов?

8. В чем заключается метод МОЛКАО? Как изменяются спектры органических молекул при увеличении количества идентичных компонент?

9. В чем заключаются преимущества использования поляризационных фильтров при регистрации спектров люминесценции порошков?

10. Временные зависимости люминесценции.

11. Основные типы спектральных приборов и принципы их функционирования.

12. Основные принципы определения концентрации веществ при помощи спектрофотометрии.

13. Пространственная конфигурация молекулы. Типы колебаний, колебательные энергетические уровни.

14. Закономерности формирования колебательно-вращательных спектров, правила отбора.

15. Спектр возбуждения молекул. Спектр люминесценции. Однородное и неоднородное уширение спектров люминесценции и поглощения.

16. Влияние реабсорбции на спектр люминесценции.


6.4 Контрольные вопросы и задания для проведения промежуточной аттестации по итогам освоения дисциплины «Молекулярная спектроскопия в биофизике»


1. Основы теории взаимодействия излучения с атомами и молекулами.

2. Тонкая структура термов. Правила отбора для излучательных переходов.

3. Спектроскопия свободных молекул.

7. Многоатомные молекулы.

8. Двухатомные молекулы.

9. Классификация нормальных колебаний по симметрии. Теоретико-групповой анализ колебаний.

10. Колебательные спектры кристаллов.

11. Электронные состояния и химическая связь в молекулах.

12. Электронно-колебательно-вращательные спектры двухатомных молекул.

13. Классификация молекулярных взаимодействий.

14. Методы регистрации спектров.


7. Учебно-методическое и информационное обеспечение дисциплины «Молекулярная спектроскопия в биофизике»


а) основная литература:
  1. Заказнов, Н. П. Кирюшин, С. И., Кузичев, В. И. Теория оптических систем : учеб. пособие . -4-е изд., стер. СПб.; М.; Краснодар: Лань, 2008 – 446 с.
  2. Курс физики: учеб. пособие : в 3 т./ И. В. Савельев. - (Учебники для вузов. Специальная литература). - (Классическая учебная литература по физике). - (Лучшие классические учебники). - 3-е изд., стер. Т. 3: Квантовая оптика. Атомная физика. Физика твёрдого тела. Физика атомного ядра и элементарных частиц СПб.; М.; Краснодар: Лань, 2007 301 с
  3. Пентин Ю.А, Курамшина Г.М. Основы молекулярной спектроскопии : учеб. пособие М.: Мир: БИНОМ. Лаб. Знаний, 2008, 398 с
  4. Ландсберг Г.С. Оптика : учеб. пособие . -6-е изд., стер. М.: ФИЗМАТЛИТ, 2010, 848 с.

б) дополнительная литература:
  1. В.Шмидт Оптическая спектроскопия для химиков и биологов. М.:Техносфера, 2007, 368 с.
  2. Зайдель А.Н., Островская Г.В., Островский И.Ю. Техника и практика спектроскопии. М.:Наука, 1972, 375 с.
  3. Оптическая биомедицинская диагностика = Optical Biomedical Diagnostics: учеб. пособие : в 2 т. : пер. с англ./ под ред. В. В. Тучина. М.: ФИЗМАТЛИТ, 2007
  4. Баличева Т. Г., Белорукова Л. П., Звинчук Р. А., Кондратьев Ю. В. Физические методы исследования неорганических веществ : учеб. пособие М.: Академия, 2006, 442 с.



в) программное обеспечение и Интернет-ресурсы:

Учебно-методические материалы практикума, размещенные на сайте кафедры оптики и биофотоники Саратовского государственного университета им. Н.Г. Чернышевского ссылка скрыта


8. Материально-техническое обеспечение дисциплины
«Молекулярная спектроскопия в биофизике»


- спектрофлуориметр;

- спектрофотометр CARY2415;

- спектрофотометр двухлучевой двухволновой для биологических исследований;

- интегрирующая сфера.

- лабораторное оборудование и материалы практикума.


Программа составлена в соответствии с требованиями ФГОС ВПО с учетом рекомендаций и Примерной ООП ВПО по направлению 011200 Физика и профилю подготовки Биофизика.


Автор:

профессор кафедры оптики и биофотоники,

д.ф.-м.н., профессор В.И. Кочубей


Программа одобрена на заседании кафедры оптики и биофотоники

от 14 января 2011 года, протокол № 1/11.


Подписи:


Зав. кафедрой В.В. Тучин


Декан физического факультета

(факультет, где разработана программа) В.М. Аникин


Декан физического факультета

(факультет, где реализуется программа) В.М. Аникин