Внутренние воды Африки размещены очень неравномерно, что связано с климатом материка. Больше всего водоемов находится в Центральной Африке, меньше всего — в пустынях Сахара (на севере), Намиб и Калахари (на юге).
Реки Африки относятся к бассейнам Атлантического и Индийского океанов и бассейну внутреннего стока. Самыми длинными реками являются Нил, Конго, Нигер и Замбези.
Озера Африки многочисленны и различаются по происхождению котловин. Самые большие озера имеют тектоническое происхождение, то есть лежат в прогибах земной коры (Виктория) или расположены в Восточно-Африканской зоне разломов (Танганьика, Ньяса). Озеро Чад — реликтового происхождения.
В пустынных районах имеются значительные запасы подземных вод.