.php> Содержание: "Основная образовательная программа высшего профессионального образования по направлению подготовки 020400 Биология"
Geum.ru

Основная образовательная программа высшего профессионального образования по направлению подготовки 020400 Биология



СодержаниеТребования к результатам освоения основной образовательной программы
Требования к результатам освоения ООП.
В соответствии с видами деятельности
2. Примерный учебный план
Базовая часть
Вариативная часть
Дисциплины по выбору студента
Базовая часть
Вариативная часть
Аннотированные Магистерские программы направления Биология
3. Примерные программы дисциплин базовой части общенаучного цикла
2. История и методология биологии
3. Компьютерные технологии в науке и образовании
4. Философские проблемы естествознания
5. Иностранный язык
6. Учение о биосфере и глобальные экологические проблемы
Список разработчиков ПООП, экспертов
Примерная программа
Цели и задачи дисциплины
Место дисциплины в структуре ООП
В начале курса
Объем дисциплины и виды учебной работы
Виды занятий
Формы текущего контроля (по неделям семестра) Форма промежуточной аттестации (по семестрам
Содержание дисциплины
Пространственные и временные масштабы.
Функциональный вид и физическая природа потенциалов молекулярного взаимодействия.
Алгоритмы вычисления невалентных взаимодействий.
Численное интегрирование уравнений движения.
Алгоритмы учета термодинамических характеристик среды
Вычисление давления в малых молекулярных системах. Баростат Берендсена.
Технологии постановки и проведения вычислительных экспериментов с различными биомолекулярными системами
Силовое разворачивание белковых глобул.
Постановка молекулярно-динамических расчетов с дендримерами.
Освоение программного обеспечения для молекулярного моделирования нано-био структур
Проведение НИР “Моделирование молекулярной динамики гидратированной макромолекулярной системы”
Ресурсное обеспечение
Методические рекомендации по организации изучения дисциплины: Рабочая программа
Рекомендуемые формы, методы и средства организации образовательного процесса
Примерный перечень вопросов проведения текущего контроля и промежуточной аттестации по итогам освоения дисциплины
К лекции 2 (Пространственные и временные масштабы)
К лекции 3 (Функциональный вид и физическая природа потенциалов молекулярного взаимодействия)
К лекции 4 (Алгоритмы вычисления невалентных взаимодействий)
К лекции 5 (Численное интегрирование уравнений движения)
К лекциям 6-7 (Учет влияния внешней среды. Термостаты)
К лекциям 8-9 (Вычисление давления в малых молекулярных системах)
К лекциям 10-11 (Моделирование биологических мембран)
К лекциям 12-13 (Силовое разворачивание белковых глобул)
К лекциям 14-15 (Постановка молекулярно-динамических расчетов с дендримерами)
Итоговый экзаменационный тест
Представление молекулярного объекта в виде системы взаимодействующих материальных частиц, движение которых описывается классичес
Задание координат и скоростей всех атомов; Задание таблицы параметров атомов (их типы, атомные массы, заряды); задание параметро
AMBER, GROMOS, GROMACS, CHARMM, ПУМА, PUMA, NAMD, Tinker, DL_POLY, LAMMPS, NWCHEM
Метод сканирования пространства
Главный: 2,0,7,0,1,4,0,5,0Присоединенный
1) Столкновительная динамика
Итоговая государственная аттестация
Требования к квалификационной работе магистра