Распределение антигенов системы HLA у больных туберкулезом и здоровых представителей русской этнической группы Челябинской области
Дипломная работа - Медицина, физкультура, здравоохранение
Другие дипломы по предмету Медицина, физкультура, здравоохранение
?м и здоровых людей русской национальности, проживающих в Челябинской области, рассчитывается согласно критерию Пирсона:
,
где N - это число обследованных в двух сравниваемых группах;
а - число индивидуумов несущих исследуемый антиген среди больных туберкулезом;
в - число индивидуумов не несущих исследуемый антиген среди больных туберкулезом;
с - число индивидуумов несущих исследуемый антиген среди здоровых русских;
d - число индивидуумов, не несущих исследуемый антиген среди здоровых русских.
Важным элементом популяционного анализа являются гаметные ассоциации, которые учитывают разницу в теоретически определенной ассоциации между 2-я антигенами разных локусов и истинной ассоциацией, встречающейся в популяции. К необходимости введения данного показателя приводит рассуждение: если бы аллели исследуемых локусов встречались независимо друг от друга, часть их ассоциаций на хромосоме (гаплотип) определялась бы произведением Р1Р2, где Р1 и Р2 - частота соответствующих генов. Однако в популяции частота отдельных аллелей встречаются более часто или наоборот, более редко, чем это следует из теоретического расчета, то есть данные гены находятся в состоянии неравновесного iепления (linkage disequilibrium), которое измеряется величиной ?, отражающее превышение или дефицит гаплотипа в популяции по сравнению с произведением частот двух генов.
Величина ? подсчитывается из сетки 22 по формуле (P. Mattiusi 1970г)
n - число обследованных в выборке
b - число индивидуумов несущих X и не несущих Y
с - число индивидуумов несущих Y, но не несущих X
d - число индивидуумов не несущих ни X ни Y.
Приведенная формула входит составной частью в формулу, используемую для определения частоты гаплотипа в панмиктической популяции
H XY = (PX PY) + ? X,Y,
где РX и РY - равны частоте соответствующих генов
?X,Y - гаметная ассоциация между генами соответствующими генами.
Для определения частоты трехлокусных гаплотипов методом максимального правдоподобия (maximum-liekelihood) использовалась компьютерная программа "Арлекин", версия 3.1
2.2 Результаты собственных исследований
2.2.1 Анализ распределения частот генов и антигенов HLA II класса у больных туберкулезом представителей русской национальности, проживающих в Челябинской области
В результате проведенного исследования были выявлены основные черты иммуногенетического профиля HLA локусов DR, DQB, DQA у больных туберкулезом русской национальности (рисунок 6, приложения). Анализ распределения аллелей данных локусов представлен в таблице 5.
Таблица 5. Распределение частот генов и антигенов HLA II класса
у больных туберкулезом
HLAБольные туберкулезомN = 51Ax%Рx%DR 11427,450,15DR 3815,690,08DR 41223,530,13DR 71529,410,16DR 835,880,03DR 923,920,02DR 10000,00DR 11917,650,09DR 1211,960,01DR 131121,570,11DR 1423,920,02DR 151223,530,13DR 16713,730,07DQA 1011631,380,17DQA 1021937,250,21DQA 103815,670,08DQA 2011529,410,16DQA 3011427,450,15DQA 40135,880,03DQA 5012039,210,22DQA 601000,00DQB 2012039,220,22DQB 3011529,410,16DQB 302917,650,09DQB 30347,840,04DQB 401/235,880,03DQB 5011325,490,14DQB 502/4713,730,07DQB 50323,920,02DQB 602/81937,250,21DQB 60111,960,01
Как видно из таблицы, для больных туберкулезом характерна относительно высокая частота антигенов DR 1 (27,45%), DR 7 (29,41%). С низкой частотой встречались DR 8 (5,88%), DR 9 (3,92%), DR 12 (1,96%), DR 14 (3,92%). Антиген DR 10 у больных туберкулезом обнаружен не был.
Самыми распространенными аллелями локуса HLA DQA у больных туберкулезом являются DQA 101 (31,37%), DQA 102 (37,25%), DQA 501 (39,22%). Наиболее низкие частоты имеет DQA 401 (5,88%).
Среди аллелей локуса HLA DQB у больных туберкулезом Челябинской области преобладающими являются DQB 201 (39,21%), DQB 602/8 (37,25%), DQB 501 (25,49%). Редкими являются аллели DQB 303 (7,84%), DQB 401/2 (5,88%), DQB 503 (3,92%), DQB 601 (1,96%). В целом такое распределение типично для большинства популяций европеоидной расы.
2.2.2 Анализ распределения частот генов и антигенов HLA II класса в популяции русских Челябинской области
В результате проведенного исследования были выявлены основные черты иммуногенетического профиля HLA локусов DR, DQB, DQA у здоровых доноров областной станции переливания крови русской национальности, проживающих в Челябинской области. Анализ распределения аллелей данных локусов представлен в таблице 6.
Таблица 6. Распределение частот генов и антигенов HLA II класса
у здоровых русских, проживающих в Челябинской области
HLAЗдоровые русскиеN = 202Ax%Рx%DR 15527,220,15DR 33718,310,1DR 43818,810,1DR 74823,760,13DR 8178,420,04DR 994,460,02DR 1073,470,02DR 113818,810,1DR 1273,470,02DR 135627,720,15DR 1473,470,02DR 155426,730,14DR 16115,450,03DQA 1016532,180,18DQA 1026230,690,17DQA 1034120,300,11DQA 2014823,760,13DQA 3014823,760,13DQA 401146,930,04DQA 5016934,160, 19DQA 60110,500,002DQB 2017135,150, 19DQB 3017235,640, 20DQB 3022914,360,07DQB 303209,900,05DQB 401/2136,440,03DQB 5016331, 190,17DQB 502/4136,430,03DQB 50362,970,01DQB 602/88140,100,23DQB 601104,950,03
Как видно из таблицы, для популяции русских, проживающих в Челябинской области, характерна относительно высокая частота антигенов DR 1 (27,22%), DR 13 (27,22%) и DR 15 (26,73%). С низкой частотой встречались DR 9 (4,46%), DR 10 (3,47%), DR 12 (3,47%), DR 14 (3,47%). Такое распределение аллелей характерно для большинства европеоидных популяций.
Среди аллелей локуса DQA у доноров русской национальности из Челябинской области наиболее частыми являются DQA 101 (32,18%), DQA 102 (30,69%), DQA 501 (34,16%), что типично для большинства популяций европеоидной расы. Редко встречаются аллели DQA 401 (6,93%), DQA 601 (0,50%).
Среди аллелей локуса HLA DQB русских Челябинской области преобладающими являются DQB 201 (35,15%), DQB 301 (35,64%), DQB 501 (31,19%), DQB 602/8 (40,10%), что также характерно для европеоидов. Редкими являются аллели DQB 503 (2,97%), DQB 601 (4,95%).
2.2.3 Сравнительный анализ частот встречаемости антигенов HLA II класса у больных туберкулезом и здоровых пред