На правах рукописи
ЦИВИЛЕВА ОЛЬГА МИХАЙЛОВНА
ВНЕКЛЕТОЧНЫЕ ЛЕКТИНЫ Lentinus edodes:
ХАРАКТЕРИСТИКА, СВОЙСТВА
И ПРЕДПОЛАГАЕМЫЕ ФУНКЦИИ
03.00.04 - Биохимия
03.00.07 - Микробиология
Автореферат диссертации на соискание ученой степени
доктора биологических наук
Саратов - 2008
Работа выполнена в Институте биохимии и физиологии растений и микроорганизмов Российской Академии наук (ИБФРМ РАН, г. Саратов)
Научный консультант: доктор биологических наук
Никитина Валентина Евгеньевна
Официальные оппоненты: доктор химических наук, профессор
Щеголев Сергей Юрьевич
доктор биологических наук, профессор
Терешина Вера Михайловна
доктор медицинских наук, профессор
Бородулин Владимир Борисович
Ведущая организация: ГУ НИИ по изысканию новых антибиотиков им. Г.Ф. Гаузе РАМН
Защита диссертации состоится л 21 мая 2008 года в 10.00 на заседании диссертационного совета Д 002.146.01 при Институте биохимии
и физиологии растений и микроорганизмов РАН
по адресу: 410049, г. Саратов, проспект Энтузиастов, 13.
С диссертацией можно ознакомиться в научной библиотеке Института биохимии и физиологии растений и микроорганизмов РАН.
Автореферат диссертации размещен на сайте ВАК
Автореферат разослан л21 февраля 2008 года.
Ученый секретарь
диссертационного совета Д 002.146.01,
доктор биологических наук В.Е. Никитина
ВВЕДЕНИЕ
Актуальность темы данной работы определяется прежде всего ее направленностью на разрешение проблемы явного несоответствия между весьма ограниченным к настоящему времени уровнем информации о важных биологически активных соединениях, лектинах ксилотрофных базидиомицетов, и заинтересованностью исследователей в углубленном изучении этих углеводсвязывающих белков самого разного биологического происхождения. Грибы являются очень интересной в теоретическом и практическом плане группой живых организмов, в то же время внеклеточные грибные лектины практически не описаны.
Вопрос о возможности искусственного выращивания грибов уже свыше двух тысячелетий занимает человечество. Объектом научных исследований во всем мире являются более 100 тыс. видов. Промышленное производство высших грибов во многих странах мира выделилось в самостоятельную, интенсивно развивающуюся высокопроизводительную отрасль.
Общеизвестно функциональное значение грибов в различных биогеоценозах, где они благодаря широкому набору ферментов принимают активное участие в процессах деструкции и минерализации органического вещества. В настоящее время известно большое количество видов базидиальных грибов, которые представляют интерес в качестве продуцентов биологически активных веществ. К числу перспективных микологических объектов для поверхностного и глубинного культивирования с целью получения дополнительного источника белка, биологически активных соединений безусловно относится ксилотрофный базидиомицет Lentinus edodes.
Глубокие исследования физиологии высших грибов начались в последние три-четыре десятилетия. Происходящие при росте и развитии грибного организма сложные физиологические и биохимические процессы, их интенсивность, определяющиеся наследственными качествами самого организма и факторами внешней среды, требуют дальнейшего изучения. При этом кроме факторов, определяемых самим организмом, т.е. вид и штамм гриба, возраст культуры, способность к вегетативному размножению и образованию биологически активных веществ, интенсивность дыхания и др., необходимо учитывать и регулировать факторы внешней среды, влияющие на физиологические и биохимические процессы, как важнейшие факторы, определяющие активность гетеротрофных организмов [Дворнина, 1990].
Исследования роста базидиомицетов, в том числе L. edodes, на жидких средах направлены на изучение питательных потребностей и физиологии вида в чистой культуре, разработку технологии погруженного культивирования мицелия с целью получения биомассы кормового и пищевого назначения, препаратов, обладающих онкостатическим действием [Соломко и Митропольская, 1994]. Глубинное культивирование также предлагается как быстрый и эффективный метод производства посевного материала для грибоводства [Yang and Jong, 1989]. Значительно меньшее число работ посвящено биохимии глубинного культивирования, ее связи с физиологией роста и развития грибного организма в глубинной культуре. В частности, лектиновая активность высших грибов изучена явно недостаточно, лишь отдельные работы касаются изучения лектинов в связи с физиологическими аспектами, проблемами морфогенеза грибов. На стадиях, предшествующих плодоношению и характеризующихся у отдельных видов формированием специализированных вегетативных структур, таких как коричневая мицелиальная пленка шиитаке, исследование лектиновой активности приобретает особую актуальность, поскольку биохимические условия возникновения подобных особенностей морфогенеза и способов дальнейшего развития (перехода либо к нормальному плодоношению, либо к образованию недифференцированных базидиом) давно интересовали исследователей, оставаясь неопределенными.
Не обсуждалась роль лектинов при неблагоприятных условиях роста культур базидиомицетов, взаимодействие лектинов с важнейшими биологически активными соединениями (как антиоксидантной природы, так и вызывающими окислительный стресс; с соединениями фитогормональной природы, принимающими участие в цитодифференцировке у высших грибов). Не были выявлены регуляторы внеклеточной лектиновой активности, поэтому представляло интерес изучить не только эффекторы - компоненты синтетических сред культивирования, но и обнаружить какие-либо эндогенные низкомолекулярные регуляторы указанной активности, внешние условия их биосинтеза и проявления, что удалось реализовать в рамках настоящей работы.
Следовательно, ко времени начала наших исследований в этой области налицо был недостаток сведений по вопросам выявления лектиновой активности грибных культур, получения очищенных препаратов внеклеточных грибных лектинов, изучения их свойств и предполагаемых функций. Актуальным представляется наш посильный вклад в описание новой группы гликопротеинов ксилотрофных базидиомицетов, внеклеточных лектинов, физико-химические свойства которых важны для понимания их физиологической роли, морфогенетических функций в грибном организме как объекте микробиологических исследований. Учитывая вышеизложенные обстоятельства, нами было предпринято настоящее исследование.
Цель работы - характеристика внеклеточных лектинов культивируемого ксилотрофного базидиомицета Lentinus edodes и условий проявления их биологической активности.
Задачи исследования:
1. Провести скрининг штаммов Lentinus edodes на присутствие лектинов.
2. Выделить внеклеточные лектины L. edodes, изучить их химический состав, физико-химические свойства, углеводную специфичность.
3. Изучить зависимость лектиновой активности культуры L. edodes от условий выращивания. Выявить оптимальный состав жидкой среды выращивания с целью получения максимальной лектиновой активности. Разработать способ получения экзолектинов L. edodes F-249 с целью повышения выхода препаратов.
4. Исследовать влияние катионов металлов(II) на активность внеклеточных лектинов шиитаке с привлечением расчетных методов квантовой химии и QSAR.
5. Изучить влияние неблагоприятных внешних условий на лектиновую активность L. edodes во взаимосвязи с ростовыми характеристиками культуры.
6. Исследовать взаимосвязь активности внеклеточных лектинов L. edodes и морфогенеза (формирования коричневой мицелиальной пленки) в глубинной культуре.
7. Выявить взаимосвязь углеводного и жирнокислотного состава мицелия шиитаке на разных стадиях морфогенетического развития с лектиновой активностью и углеводной специфичностью лектинов культуры.
8. Исследовать влияние некоторых элементоорганических соединений (Se-, серу-, азотсодержащих) на активность внеклеточных лектинов шиитаке с привлечением теоретических представлений (пространственная и электронная структура молекул, QSAR свойства реактантов).
9. Исследовать биологические свойства лектинов: их способность к взаимодействию с веществами фитогормональной природы, с разными типами эритроцитов; антигенные свойства.
10. Изучить возможности использования глубинной культуры L. edodes при модифицированном способе ее выращивания в качестве технологически перспективного посевного материала.
Научная новизна работы
Впервые в культуральной жидкости и на поверхности мицелия ряда штаммов базидиомицета L. edodes обнаружены лектины, имеющие в зависимости от штамма различную специфичность к углеводам.
Выделены чистые препараты лектинов из культуральной жидкости L. edodes, изучены их физико-химические свойства, охарактеризована реакционная способность лектиновых препаратов.
Впервые показано, что максимальное повышение внеклеточной лектиновой активности базидиомицета наблюдается при условиях, отличных от оптимальных для выращивания культуры.
Впервые установлено участие лектинов в морфогенетических процессах и инициации плодообразования шиитаке. Выявлена взаимосвязь активности лектинов с формированием коричневой мицелиальной пленки в глубинной культуре; с процессами роста и развития грибного мицелия при твердофазном культивировании; с биосинтезом соединений, относящихся к важнейшим компонентам химического состава мицелия - липидам и углеводам.
Впервые обнаружен и выделен необычный для макробазидиомицетов гликолипид моносахаридной природы, способный модифицировать активность внеклеточных лектинов шиитаке.
Впервые выявлено взаимодействие лектинов ксилотрофного базидиомицета с фитогормоном ИУК, сопровождающееся значительным увеличением лектиновой активности в системе Улектин-ИУКФ.
Научные положения работы расширяют и углубляют современные представления о разнообразии лектинов базидиомицетов и о физиолого-биохимических механизмах регуляции их биосинтеза и активности; позволяют с новых позиций подойти к изучению их функциональной роли в жизнедеятельности грибных культур, в адаптационных и морфогенетических процессах.
Практическая значимость исследования
Работа вносит вклад в развитие направления лектинологии, связанного с изучением лектинов высших грибов, в рамках которого положено начало новой области исследования препаратов внеклеточных лектинов ксилотрофных базидиомицетов.
Показана принципиальная осуществимость выделения и очистки внеклеточных лектинов из жидких синтетических сред культивирования ксилотрофных базидиомицетов. Разработана методика эффективной дифференциации хроматографических свойств двух внеклеточных лектинов, способствующей их более эффективному разделению. Выявлены низкомолекулярные вещества - эффекторы проявления внеклеточными лектинами их биологической активности, изучено взаимодействие лектинов с соединениями - антиоксидантами и индукторами окислительного стресса, с разными типами эритроцитов в реакции гемагглютинации; некоторые антигенные свойства. Подобная характеристика внеклеточных лектинов способствует перспективному использованию выделенных белков при проведении научных и прикладных исследований в области биохимии, энзимологии и иммунологии.
На основании результатов проведенного исследования выявлен ряд особенностей, проявляющихся при формировании неполноценных плодовых тел шиитаке в отсутствие характерной для данного вида коричневой мицелиальной пленки. Совокупность отличных от нормального плодоношения характеристик, в том числе по лектиновой активности, составу жирнокислотного и углеводного пула мицелия, могла бы служить дополнительным параметром биохимической оценки мицелия в процессе плодообразования. Полученные данные, свидетельствующие о существенных изменениях в направленности реакций синтеза, десатурации и элонгации жирных кислот у неполноценных плодовых тел, могут быть полезны и при обсуждении роли липидов в процессе морфогенеза.
Наше предположение и дальнейшее обоснование роли лектинов как потенциальных морфообразующих белков позволило внести определенный вклад в создание эффективного способа получения посевного мицелия шиитаке.
Материалы работы и препараты лектинов используются в учебном процессе и научно-исследовательской работе химического факультета СГУ, СВИРХБЗ, лаборатории микробиологии Института микробиологии НАН Беларуси.
По результатам работы получен патент РФ, а также положительное решение формальной экспертизы. Подана заявка на предполагаемое изобретение (приоритет от 23.06.2006).
Внедрение результатов диссертационной работы подтверждено соответствующими актами, представленными в Приложении к диссертации.
Основные положения, выносимые на защиту
1. В культуральной жидкости и на поверхности мицелия культур ряда штаммов Lentinus edodes присутствуют внеклеточные лектины, имеющие в зависимости от штамма различную специфичность к углеводам.
2. Культура L. edodes F-249 синтезирует два внеклеточных лектина, различающихся по своим физико-химическим свойствам, составу, углеводной специфичности, антигенным свойствам, агглютинации разных типов эритроцитов, реакционной способности в отношении низкомолекулярных биологически значимых соединений.
3. Активность и динамика образования внеклеточных лектинов L. edodes зависят от физико-химических условий культивирования. Наиболее значимыми факторами, влияющими на лектиновую активность глубинной культуры L. edodes, являются присутствие в среде культивирования аминокислотных источников азота, катионов металлов(II), селена в органической форме.
4. При воздействии неблагоприятных для роста мицелия грибной культуры условий (температурного и питательного стресса) наблюдается значительное увеличение лектиновой активности, что можно связать со стабилизирующей, адаптогенной ролью лектинов L. edodes.
5. Лектины L. edodes принимают участие в морфогенетических процессах культуры. Установлена взаимосвязь внеклеточной лектиновой активности шиитаке с формированием коричневой мицелиальной пленки в глубинной культуре, с процессами роста и развития грибного мицелия при твердофазном культивировании, с синтезом соединений, относящихся к важнейшим компонентам химического состава мицелия - липидам и углеводам.
6. Одним из эндогенных регуляторов активности лектинов L. edodes является необычный для ксилотрофных базидиомицетов галактолипид S3, впервые выделенный из внеклеточных метаболитов L. edodes.
7. Экзогенными регуляторами внеклеточной лектиновой активности L. edodes могут служить низкомолекулярные соединения - индукторы окислительного стресса, а также антиоксиданты, в частности, селенорганические соединения, при взаимодействии с которыми сильно влияние электрофильных свойств реагента и гидрофобных взаимодействий.
8. Лектины L. edodes взаимодействуют с фитогормоном ИУК, при этом значительно увеличивается лектиновая активность в системе Улектин-ИУКФ. Продукты взаимодействия с ИУК для двух лектинов имеют, вероятно, одинаковую химическую природу.
9. Эффективным способом разделения двух внеклеточных лектинов шиитаке на основе дифференциации хроматографических характеристик и усиления биосинтеза одного из лектинов является воздействие Cu(II).
Работа выполнена в лаборатории микробиологии и микологии Института биохимии и физиологии растений и микроорганизмов РАН в соответствии с плановой тематикой УСъедобные культивируемые грибы: физиология и биохимияФ (№ гос. регистрации 01970008158, научный руководитель темы: доктор биологических наук, старший научный сотрудник, зав. лабораторией В.Е. Никитина), УРоль углеводсвязывающих гликопротеинов в процессах жизнедеятельности бактерий и грибов Ф (№ гос. регистрации 01200606184, научный руководитель темы: доктор биологических наук, старший научный сотрудник, зав. лабораторией В.Е. Никитина).
Физико-химические задачи работы выполнены совместно с лабораторией структурных методов исследования ИБФРМ РАН (зав. лабораторией - к.х.н. Е.Е Федоров), с лабораторией биохимии (зав. лабораторией в период выполнения исследований - д.б.н. В.В. Игнатов), а также на кафедре аналитической химии и химической экологии Саратовского государственного университета им. Н.Г. Чернышевского (СГУ), при непосредственном участии д.х.н., профессора А.Н. Панкратова; на кафедре органической и биоорганической химии СГУ (зав. кафедрой - д.х.н., профессор А.П. Кривенько).
Частично данная работа получила финансовую поддержку Российского фонда фундаментальных исследований (№№ проектов 03-04-48129, 06-04-81042-Бел_а), Федерального агентства по науке и инновациям в рамках федеральной целевой научно-технической программы УИсследования и разработки по приоритетным направлениям развития науки и техникиФ на 2002-2006 годы (государственный контракт № 02.444.11.7331), программы Президиума РАН УФундаментальные науки - медицинеФ в рамках совместного проекта ИБФРМ РАН и ИРЭ РАН, 2007 г.
Апробация работы
Основные результаты работы были представлены на: 37th IUPAC Congr. Frontiers in Chemistry: Molecular Basis of the Life Sciences, 27th GDCh General Meeting (Berlin, Germany, Aug. 14-19, 1999); науч. конфер. УФундаментальные и прикладные исследования саратовских ученых для процветания России и Саратовской губернииФ (Саратов, 1999); 5th World Congr. of Theoretically Oriented Chemists - WATOCТ99 (Imperial College, London, 1-6 Aug., 1999); 1-й регион. конфер. мол. ученых (Саратов, 26-27 марта 2002); Первом съезде микологов России УСовременная микология в РоссииФ (Москва, 18-20 апреля 2002); межд. науч. конфер. УФизиология и биохимия культивируемых грибовФ (6-8 июня 2002, Саратов); IV Всерос. конфер. мол. ученых (Саратов, 23-25 июня, 2003); Int. Symp. УBiochemical Interactions of Microorganisms and Plants with Technogenic Environmental PollutantsФ (Saratov, 28-30 July, 2003); VIII Int. Conf. УThe Biology of Plant Cells In Vitro and BiotechnologyФ (Saratov, September 9-13, 2003); 8-й Межд. Пущинской школе-конфер. мол. ученых "Биология - наука XXI векаФ (Пущино, 17-21 мая 2004); III Всерос. школе-конфер. УХимия и биохимия углеводовФ (9-11 сентября 2004, Саратов); II Российской школе-конфер. УМолекулярное моделирование в химии, биологии и медицинеФ (Саратов, 13-16 октября 2004); Втором съезде Общества биотехнологов России (Москва, 13-15 октября 2004); Всерос. научно-практич. конфер. УВавиловские чтения - 2004Ф (Саратов, 24-26 ноября 2004); II Всерос. симп. УТест-методы химического анализаФ (Саратов, 2004); 3-м Всерос. Конгрессе по Медицинской микологии (Москва, март 2005); 9-й Межд. Пущинской школе-конфер. мол. ученых "Биология - наука XXI векаФ (Пущино, 18-22 апреля 2005); Межд. конфер. ФПроблемы биодеструкции техногенных загрязнителей окружающей средыФ (Саратов, 14-16 сентября 2005); Всерос. конфер. УМолекулярные механизмы взаимодействия микроорганизмов и растений: фундаментальные и прикладные аспектыФ (Саратов, 15-17 июня 2005); V Всерос. конфер. мол. ученых УСовременные проблемы теоретической и экспериментальной химииФ (Саратов, 22-24 июня 2005); Int. Conf. УBiocatalysis-2005: Fundamentals&ApplicationsФ (St. Petersburg, 19-23 June, 2005); II Межд. симп. "Разделение и концентрирование в аналитической химии и радиохимии" (Краснодар, 25-30 сентября 2005); 10-й Пущинской школе-конфер. мол. ученых "Биология - наука XXI векаФ (Пущино, 17-21 апреля 2006); 4-м Всерос. Конгрессе по Медицинской микологии (Москва, 29-31 марта 2006); Межд. науч. конфер. УФизиология микроорганизмов в природных и экспериментальных системах (памяти профессора М.В. Гусева)Ф (Москва, МГУ им. М.В. Ломоносова, биологический факультет, 16-19 мая 2006); III межрегион. конфер. мол. ученых УСтратегия взаимодействия микроорганизмов и растений с окружающей средойФ (Саратов, 10-12 октября 2006); Межд. науч. конфер. УСовременное состояние и перспективы развития микробиологии и биотехнологииФ (Минск, 1-2 июня 2006); Втором Саратовском салоне изобретений, инноваций и инвестиций (Саратов, 2006); 5-м Всерос. Конгрессе по Медицинской микологии (Москва, март 2007); 4-й Росс. конфер. УАктуальные проблемы инноваций с нетрадиционными природными ресурсами и создания функциональных продуктовФ (Москва, 4-5 июня 2007); VI Всерос. интерактивной конфер. мол. ученых "Современные проблемы теоретической и экспериментальной химии" (Саратов, июнь 2007); XV Congress of European Mycologists (St. Petersburg, 16-22 September 2007), а также на научных конференциях и семинарах ИБФРМ.
ичный вклад соискателя
Автору принадлежит идея, разработка путей экспериментального выполнения и теоретическое обоснование всех основополагающих задач, поставленных в диссертационной работе, ключевая роль на всех этапах исследования, интерпретации и теоретической обработки полученных результатов.
Благодарности
Следует отметить вклад в выполнение данной работы д.б.н., зав. лабораторией В.Е. Никитиной, явившейся вдохновителем самого факта проведения исследований с такими объектами, как Lentinus edodes и лектины этой культуры, а также организатором углубленных исследований важной морфогенетической структуры шиитаке - коричневой мицелиальной пленки и эффекта неблагоприятных условий внешней среды. Интересное и полезное обсуждение результатов было обеспечено со стороны В.Е. Никитиной на всем протяжении периода выполнения работы.
Правильная интерпретация полученных результатов в терминах физико-химических, спектроскопических, аналитической химии была бы крайне обеднена, а квантовохимическая интерпретация - невозможна, без сотрудничества с д.х.н., профессором кафедры аналитической химии и химической экологии СГУ им. Н.Г. Чернышевского А.Н. Панкратовым.
Публикации
По теме диссертации опубликовано 78 научных работ, в том числе 38 статей, список которых приведен в конце автореферата (включая 19 статей в рецензируемых иностранных изданиях и российских журналах, входящих в УПеречень периодических научных изданий, рекомендуемых ВАК ЕФ, 19 статей в сборниках научных трудов), 1 патент РФ, 1 положительное решение формальной экспертизы. Подана заявка на предполагаемое изобретение (приоритет от 23.06.2006).
Структура и объем работы
Диссертация состоит из введения, 3 основных глав и ряда подглав, включающих обзор литературы, описание материалов и методов исследования, изложение полученных результатов и их обсуждение, заключения, выводов, списка использованных источников литературы и приложения. Приложение содержит документальное подтверждение внедрения материалов диссертации в учебный процесс и практику научных исследований.
Работа изложена на 353 страницах машинописного текста. Иллюстративный материал представлен 55 рисунками и 54 таблицами. Список цитируемой литературы включает 519 источников (отечественных и зарубежных).
СОДЕРЖАНИЕ ДИССЕРТАЦИИ
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
В обзоре литературы (глава 1), представленном 3 разделами, 12 подразделами, изложены современные представления о свойствах и функциях лектинов грибов (общее понятие о лектинах, предполагаемая роль, биологические свойства, применение грибных лектинов). Во второй части обзора охарактеризованы морфолого-культуральные и физиолого-биохимические особенности Lentinus edodes (дана краткая характеристика этого вида как гриба УбелойФ гнили, оценены питательные свойства и медицинское значение шиитаке). В третьей части обзора литературы рассмотрено значение экзогенных низкомолекулярных соединений в жизнедеятельности мицелиальных культур. Значительное внимание уделено соединениям селена в процессах жизнедеятельности биотехнологически значимых грибных культур (селен описан как составляющая часть минерального питания грибов, представлена общая информация по химии селена в живой клетке, данные о влиянии искусственных добавок селенсодержащих веществ на развитие грибных культур). Далее подчеркнуты важнейшие функции, выполняемые соединениями меди в жизнедеятельности микроорганизмов, в основном в связи с биохимией микологических объектов. В следующем подразделе описаны имеющиеся в литературе немногочисленные исследования фитогормона -индолил-3-уксусной кислоты во взаимосвязи с искусственной культурой базидиомицетов.
На основании каждого из разделов представленного обзора сформулированы аспекты исследования для достижения цели настоящей работы и определен круг решаемых для этого задач.
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
Объекты исследования, условия культивирования
Данное исследование выполнено на материале коллекции штаммов высших базидиальных грибов кафедры микологии и альгологии Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова. В работе использованы 4 штамма L. edodes: NY, F-249, 2T, 0779. Культуры грибов поддерживали на сусло-агаре при 4оС.
В процессе исследования лектиновой активности L. edodes на разных стадиях морфогенеза промежуточную культуру для получения плодовых тел выращивали на среде следующего состава ([Song et al., 1987], г/л): D-Glc - 10; L-Asn - 1; KH2PO4 - 5; MgSO4.7H2O - 2.5; FeSO4.7H2O - 0.03; тиамин - 5.10-4; H2O до общего объема 1 л
При изучении влияния состава среды культивирования на активность внеклеточных лектинов L. edodes использовали следующие источники углерода (300 мM по углероду): D-Glc, Suc, L-Ara, L-Rha, D-Man, D-Mal, D-Fru, D-Gal, D-Lac, CH3COONa.3H2O. В качестве источника азота в среду вносили в различных концентрациях L-Asn, NaNO3, NH4Cl. Рассчитывали оптимальное соотношение C:N. В состав сред входили только указанные компоненты. Кислотность исходной среды культивирования устанавливали добавлением HCl или NaOH (0,05 M) в стерильных условиях после раздельной стерилизации компонентов.
Для исследования взаимосвязи молекулярной структуры источника азота и активности внеклеточных лектинов при глубинном культивировании L. edodes использовали синтетические среды на основе D-Glc (50 мM) с источниками азота: NH4Cl или NaNO3 (соотношение C:N в среде составляло от 7,5:1 до 150:1); эссенциальные аминокислоты (20 мM по азоту). В качестве компонентов - добавок к среде выращивания использовали катионы Ca2+ или Mn2+ в виде хлоридов.
С целью изучения стимуляторов лектиновой активности на агаризованных средах при культивировании L. edodes использовали синтетические среды с источником углерода (концентрация 300 мM по углероду): D-Glc, Suc, L-Ara, L-Rha, D-Man, D-Mal, D-Fru, D-Gal, D-Lac; источником азота (концентрация 20 мM по азоту): Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Cys, Met, Asp, Glu, Asn, Phe, Trp, NH4Cl, а также среду с PBS (рН 7,2) и композиции указанных компонентов. Среды Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Cys, Met, Asp, Glu, Asn, Phe, Trp содержали также 0,4500 г/л Glc. Среда PBS содержала также, г/л: Glc - 0,4500, NH4Cl - 0,2140. Среда Glc-NH4Cl содержала, г/л: Glc - 0,4500, NH4Cl - 0,2140.
Исследование влияния селенсодержащего препарата ДАФС-25 на рост и лектиновую активность L. edodes проводили на жидких и агаризованных средах. При глубинном культивировании L. edodes использовали среды: с Glc и Asn, соотношение C:N 15:1 (среда I); пивное сусло, 2o по Баллингу (среда II); среда на основе пшеничной муки (20 г/л) (среда III); среда на основе экстракта дубовых опилок (среда IV). В состав плотных сред того же состава (Ia, IIIa, IVa) и 4o-го агаризованного пивного сусла (IIa) входил дополнительно агар (18 г/л). ДАФС-25 синтезирован, описан и любезно предоставлен Б.И. Древко [Древко и др., 2001]. Концентрация в пересчете на селен в средах культивирования составляла 0,1 мг/л.
Изучая влияние Me2+ на активность внеклеточных лектинов шиитаке, использовали синтетические жидкие среды с источником углерода (концентрация 300 мМ по углероду): D-Glc, L-Ara, Suc; источником азота служил Asn (10 мМ). В качестве компонентов - добавок к среде выращивания использовали соли металлов (концентрации 0 - 10 мM): MgSO4.7H2O, CaCl2.2H2O, MnCl2.4H2O, FeSO4.7H2O, CuSO4.5H2O, ZnSO4.7H2O, CoCl2.6H2O, NiSO4.6H2O, SnCl2.2H2O.
Синтетическая среда для изучения процессов хелатообразования в рамках проблемы влияния Fe(II), Co(II), Ni(II) на активность внеклеточных лектинов L. edodes состояла из Glc (50 мМ), Asn (10 мМ), включала добавки Fe(II), Co(II), Ni(II) (4 мМ) и EG (2 мМ или 4 мМ).
Методы исследования
При посеве грибной культуры в качестве инокулята использовали 14-сут культуру L. edodes F-249, выращенную на агаризованном пивном сусле при 26oС. Cпособ дозирования посевной культуры состоял в засеве жидких сред дисками сусло-агара диаметром 5 мм с культурой гриба, взятыми из одной зоны растущего мицелия, обычно 3 диска на 50 мл среды или 1 диск на чашку Петри.
Растворы органических Se-, S-, N-содержащих соединений, используемых в качестве добавок к среде выращивания, после стерилизации в тонком слое УФ облучением добавляли непосредственно перед посевом.
Получение плодовых тел L. edodes осуществляли как на органической плотной среде из смеси дубовых опилок и пшеничного зерна (4:1, v/v), так и на чашках Петри со средой сусло-агар, по модифицированной методике [Stamets, 1993] с применением холодового шока и суточных температурных колебаний. Время от засева субстрата до начала плодоношения составляло от 38 до 70 сут в зависимости от штамма.
Ростовой коэффициент (РК) вычисляли по формуле: РК = dhg/t, где d - диаметр колонии, мм; h - высота колонии, мм; g - плотность колонии, балл; t - возраст колонии, сут. Величину g оценивают по трехбалльной шкале [Бухало, 1988]. Скорость роста при глубинном культивировании определяли по накоплению сухой биомассы в единицу времени в зависимости от продолжительности выращивания.
ектиновую активность в жидких пробах определяли реакцией ГА с самопроизвольным оседанием эритроцитов, используя 2%-ную суспензию трипсинизированных кроличьих эритроцитов в серии последовательных разведений лектина [Луцик и др., 1981]. ТГА выражали как наибольшее разведение раствора, вызывающее агглютинацию эритроцитов.
Углеводную специфичность определяли в серии последовательных разведений углевода (от 0,3 М) при использовании раствора испытуемого гемагглютинина с титром 4 в реакции ГА. В работе использовали 21 препарат углеводов (Serva). Углеводную специфичность оценивали по минимальной концентрации углевода, ингибирующующей реакцию ГА лектина в данных условиях. При отсутствии ингибирования в интервале концентраций углевода от 0 до 100 мM считали, что специфичность исследуемого лектина к данному углеводу отсутствует.
Изучение зависимости лектиновой активности от температуры культивирования мицелия проводили: при 26оС как оптимальной температуре роста мицелия для данного вида, 16оС - температуре замедленного роста, 32оС и 37оС - верхних предельных значениях температурного интервала развития этой культуры на плотных и жидких средах соответственно.
Относительную молекулярную массу белковых образцов определяли с помощью электрофореза в 15%-ном полиакриламидном геле с додецилсульфатом натрия (SDS-PAGE) по методу Лэммли. В качестве стандарта использовали набор белков маркеров фирмы Amresco (США) Визуализация белковых полос осуществлялась методом окраски геля при помощи 0,2%-ного раствора CoomassieТ Brilliant Blue G-250 или 0,1% (m/v) раствора AgNO3.
Аминокислотный состав белков определяли на аминокислотном анализаторе 339 (ЧССР). Подготовку образца проводили по общепринятому методу (при 105оС 24 ч в 6М HСl).
Состав углеводной фракции исследовали методом капиллярной газовой хроматографии на неподвижной жидкой фазе SE-54 в режиме программирования температуры, с предварительным получением силильных производных сахаров.
Хроматографию проводили на приборе Chrom 5 (ЧССР) с пламенно-ионизационным детектором, используя кварцевую капиллярную колонку длиной 25 м, при программировании температуры от 150 до 280оС со скоростью нагрева термостата колонок 8 град/мин. Объем пробы 1 мкл. Газ-носитель - гелий.
Триметилсилиловые эфиры исследуемых проб и соединений-стандартов получали с использованием 1,1,1,3,3,3-гексаметилдисилазана и триметилхлорсилана в качестве катализатора [Пецев и Коцев, 1987].
ипиды экстрагировали модифицированным методом С. Song с соавторами (1989), включающим обработку сухого мицелия смесями метанол-вода-хлороформ в объемном соотношении (1:2:3), высушивание в токе азота или аргона и экстракцию сухого остатка гексаном. Жирные кислоты анализировали в виде метиловых эфиров методом газожидкостной хроматографии. Метиловые эфиры ЖК разделяли на газожидкостном хроматографе УБиохром-1Ф на кварцевой капиллярной колонке (длина 25 м, внутренний диаметр 0.2 мм) с неподвижной фазой SE-54. Использовали режим программирования температуры термостата колонки от 130 до 270оС со скоростью нагрева 4оС/мин. Температура испарителя 150оС, детектора 270оС. Газ-носитель - гелий, скорость потока 1.6 мл/мин.
Жирные кислоты идентифицировали по временам удерживания их метиловых эфиров. В качестве стандартов метиловых эфиров ЖК использовали набор Bacterial Acid Methyl Esters CP Mix (Supelco): 11:0, 2-OH 10:0, 12:0, 13:0, 2-OH 12:0, 3-OH 12:0, 14:0, i-15:0, a-15:0, 15:0, 2-OH 14:0, 3-OH 14:0, i-16:0, 16:19, 16:0, i-17:0, 17:0, 2-OH 16:0, 18:29,12, 18:19, 18:0, 19:0, 20:0, а также в дополнение другие метиловые эфиры ЖК (Sigma): 7:0, 8:0, 9:0, 10:0, 18:1, 20:2, 21:0, 22:1, 22:0, 23:0, 24:1, 24:0.
Поликлональные кроличьи антитела получали на хроматографически очищенный препарат внеклеточного лектина L1. Иммунизацию проводили 3 раза с интервалом 2 недели, последовательно вводя в подколенные лимфатические узлы кролика 50, 100 и 150 мкг лектина. Антиген растворяли в физрастворе, забуференном фосфатами (рН 7.2) до концентрации 100 мкг/мл и смешивали с полным адъювантом Фрейнда в соотношении 1:1. Кровь отбирали через неделю после третьей иммунизации. Фракцию иммуноглобулинов G получали из антисыворотки осаждением сульфатом аммония.
Твердофазный иммуноферментный анализ (ИФА) выполняли в полистироловых 96-луночных планшетах. В качестве ферментативной метки использовали пероксидазу хрена, конъюгированную с анти-кроличьими козлиными антителами. В качестве субстратного реагента использовали орто-фенилендиамин с перекисью водорода. Измерения оптической плотности исследуемых проб проводили при длине волны 490 нм на иммуноферментном анализаторе АИФ-Ц-01С (ЗАО ИЛИП, г. Санкт-Петербург). Результаты твердофазного ИФА продемонстрировали наличие общих антигенных детерминант в составе двух внеклеточных лектинов.
Съемку рентгенограмм проводили на рентгеновском дифрактометре ДРОН-3 на Cu-K излучении в следующем режиме: сила анодного тока 75-150 А, катодное напряжение 75-150 В. Скорость сканирования 2 град/мин.
Спектры ЯМР получали на спектрометре Varian FT 80A (США), частота 80 МГц, для 2 - 3% растворов образцов в 99.96 % D2O при 303К (внутренний стандарт - ацетон, н 2.225 м.д., с 31.45 м.д., и внешний стандарт - 85% водная Н3РО4, р 0 м.д.). Для калибровки спектров использовали Na-соль 3-(триметилсилил)-пропионовой-2,2,3,3-d4 кислоты (внутренний стандарт, н0).
Инфракрасные спектры регистрировали на приборе ИК-Фурье спектрометр ФСМ 1201 в тонком слое вазелинового масла и гексахлорбутадиена.
QSAR-свойства вычисляли с помощью программы комплекса HyperChem по атомно-аддитивным схемам [Hasel et al., 1988; Still et al., 1990; Bodor et al., 1989; Gavezotti, 1983; Ghose and Crippen, 1986, 1987; Viswanadhan et al., 1989; Miller, 1990; Ghose et al., 1988].
При изучении влияния Fe(II), Co(II), Ni(II) на активность внеклеточных лектинов L. edodes квантовохимические ab initio расчеты проводили неограниченным методом Хартри - Фока (UHF) в базисе 3-21G(d,p) (UHF/3-21G(d,p)) [Hehre et al., 1986; Кларк, 1990] с использованием программ из пакета HyperChem [HyperChem (TM), Hypercube, Inc., 1115 NW 4th Street, Gainesville, Florida 32601, U. S. A.]. Полную оптимизацию геометрии проводили посредством алгоритма Полака - Рибера (Polak - Ribiere conjugate gradient algorithm) [Дэннис и Шнабель, 1988]. Предварительную оптимизацию геометрии осуществляли методом PM3 [Stewart, 1989a; 1989b] посредством программы из того же пакета. При квантовохимических расчетах задавали условие, чтобы норма градиента не превышала 0.02 ккал/(моль.). Корреляционные поправки к хартри-фоковским энергиям рассчитывали для оптимизированной геометрии (Single Point) в рамках теории возмущений Меллера - Плессе второго порядка (MP2) [Hehre et al., 1986; Кларк, 1990] в том же базисе (подход MP2/3-21G(d,p)//UHF/3-21G(d,p)).
При оценке полученных результатов пользовались методом расчета стандартного отклонения среднего арифметического; данные, представленные в настоящей работе, имеют соответствующие доверительные интервалы при уровне доверительной вероятности 0,95.
РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
Обнаружение, выделение, определение специфичности
агглютининов Lentinus edodes
Обнаружение лектинов Lentinus edodes
О наличии лектинов L. edodes информация крайне ограничена и представлена двумя работами [Jeune et al., 1990; Wang et al., 1999], касающимися выделения лектина из плодовых тел L. edodes. В литературе отсутствуют данные о внеклеточных лектинах шиитаке. Поэтому, учитывая важность и разнообразие функций лектинов в живых организмах, а также разностороннее значение базидиомицета L. edodes, мы предприняли исследования по обнаружению внеклеточных лектинов, находящихся в культуральной жидкости гриба, а также в пассивных смывах с поверхности мицелия в условиях твердофазного культивирования.
В результате экспериментов по поискам гемагглютининов культуральной жидкости была обнаружена ГА активность в КЖ у всех взятых в эксперимент штаммов L. edodes F-249, 2T, 0779, NY, выращенных на минеральной среде при 26оС. Анализ КЖ показал значительные вариации ГА активности в зависимости от штамма шиитаке. Возникает вопрос, не объясняются ли эти штаммовые различия по продукции внеклеточных гемагглютининов разной способностью культур к накоплению биомассы? Для корректности сравнения ГА активности у разных штаммов L. edodes, культивируемых одно и то же время, проведены эксперименты по определению скорости роста используемых штаммов на минеральной среде, позволившие заключить, что различия в отношении ГА активности заметно превосходят различия в скорости роста культур штаммов.
Полученные данные позволили говорить о большом количестве внеклеточных агглютининов, выделяющихся в среду выращивания. Для доказательства принадлежности выявленных гемагглютининов к классу лектинов были получены результаты определения углеводной специфичности агглютининов КЖ методом ингибирования агглютинации эритроцитов углеводами. Агглютинины всех штаммов высокоспецифичны к D-Gal (кроме NY), D-Lac, в меньшей степени - D-Mal. Ингибирующая концентрация углевода минимальна в случае Lac и штамма F-249. При этом аминопроизводные Gal и Glc малоэффективны в отношении ингибирования реакции ГА лектинов КЖ всех штаммов, а GalNAc и GlcNAc ингибируют только ГАА лектинов штамма NY (4,17 и 16,7 мМ соответственно).
К L-Rha особенно специфичны лектины штамма F-249: реакцию ГА ингибирует концентрация этого углевода 11,1 мМ. Исключительно в отношении лектинов штамма F-249 наблюдается явно выраженная углеводная специфичность к D-ManOH и D-Cel (8,33 и 33,3 мМ соответственно в сравнении с величинами, превышающими 100 мМ, для других штаммов). Мы осознаем, что преждевременно было бы говорить об углеводной специфичности грибных лектинов как о систематическом штаммоспецифичном признаке, однако из полученных нами данных довольно четко видны различия этого параметра у разных культур штаммов.
Предположив, что гемагглютинины присутствуют и на поверхности грибных гиф при выращивании на плотных средах, и что ГА активность будет проявляться в пассивных смывах с мицелия, мы провели эксперименты по обнаружению внеклеточных гемагглютининов при твердофазном культивировании. Была выявлена ГА активность в пассивных смывах с мицелия у всех взятых в эксперимент штаммов L. edodes, выращенных на агаризованных средах разного состава. Различия в отношении ГА активности заметно превосходят различия ростовых характеристик культур штаммов, и корреляций ГА активности со скоростью накопления биомассы не выявляется (как и при жидкофазном культивировании). Определение углеводных гаптенов для агглютининов вегетативного мицелия культур 4-х штаммов шиитаке показано присутствие во всех без исключения случаях лектинов с высокой специфичностью только к D-Lac. Специфичность к D-Gal и D-GalN, несомненно, ниже, но также обнаружена для всех штаммов. Лектины с аналогичной высокой специфичностью к Lac были обнаружены нами и в КЖ.
Таким образом, данные, полученные из экспериментов по обнаружению гемагглютининов шиитаке, позволяют утверждать, что агглютинины L. edodes присутствуют в КЖ и в пассивных смывах с мицелия у всех взятых в эксперимент штаммов L. edodes, выращенных в условиях жидкофазного и твердофазного культивирования. Определение углеводных гаптенов позволяет отнести выявленные гемагглютинины к классу лектинов. Различия в отношении лектиновой активности заметно превосходят различия ростовых характеристик культур штаммов.
Выделение и очистка, определение углеводной специфичности лектинов
Для дальнейших исследований по выделению и очистке внеклеточных лектинов шиитаке мы использовали штамм L. edodes F-249. Выбор был основан на следующем: высокая лектиновая активность в условиях эксперимента; быстрый рост вегетативного мицелия на агаризованных средах; именно для штамма F-249 нам удалось получить плодовые тела на чашках Петри в течение не более чем 60 суток.
При выделении внеклеточных лектинов L. edodes F-249 в качестве грубого белкового экстракта использовали КЖ. В состав синтетической среды входили Glc (50 мМ) и Asn (10 мМ). Сконцентрированный фильтрат КЖ осаждали ацетоном, выпавший при 4оС осадок отделяли от супернатанта. Осадок растворяли в воде, получая неочищенный раствор лектина 1 (L1). Супернатант освобождали от ацетона, высушивали при 30-32оС, остаток растворяли в воде, получая неочищенный раствор лектина 2 (L2). Полученные водные растворы лектинов пропускали через колонку с Sephadex G-25, элюент вода. Выход белковых фракций регистрировали на приборе Uvicord S-II (LKB) при 280 нм.
Далее очистку лектинов L1 и L2 проводили с использованием гель-фильтрации и ионообменной хроматографии. При нанесении активных по ГА фракций, сошедших с колонки после гель-эксклюзионной хроматографии, на колонку с катионообменником Toyopearl СМ-650M большинство примесей связалось с носителем, тогда как очищенные лектины выходили со свободным объемом. После гель-фильтрации на колонке с Toyopearl HW-55S (рис. 1) удалось выделить и разделить две активные по ГА фракции целевых белков. Анионообменная хроматография указанных фракций, содержавших преимущественно L1 или L2, на колонке с Toyopearl DEAE-650M привела к удалению большинства примесей и полному разделению двух лектинов, выходивших с колонки при существенно различной ионной силе элюента (L1 при концентрации NaCl 0,3 моль/л; L2 элюировался PBS с концентрацией NaCl 0,14 моль/л). Окончательную очистку проводили на колонке с Sephadex G-75. Обессоленные водные растворы L1 и L2 концентрировали.
Рис. 1. Профиль элюции лектинов
L1 и L2 Lentinus edodes F-249
на колонке с Toyopearl HW-55S.
1 - L1; 2 - L2
SDS-PAGE показал, что оба белка мономерны, характеризуются молекулярными массами 43 и 37 кДа соответственно. Дополнительное подтверждение указанных величин получили при использовании калиброванной по молекулярной массе колонке с Sephadex G-75. Установлено, что внеклеточные лектины L. edodes F-249 являются гликопротеинами, однако содержание углеводов в L2 значительно выше, чем в L1.
Определение углеводной специфичности показало, что оба лектина проявляют специфичность к D-Gal и D-Lac. И для L1, и для L2 минимальные ингибирующие концентрации этих углеводов 2,08 мМ Gal и 8,33 мМ Lac. Другие углеводы, к которым лектины проявляют более или менее высокое сродство: для L1 это Rha (4,16 мМ); для L2 - Ara (4,16 мМ) и ManOH (8,33 мМ).
Интересна специфичность одного из лектинов (L2) и гемагглютиннов КЖ к ManOH. Известно, что метаболизм ManOH играет важную роль в развитии плодовых тел гриба. У L. edodes содержание этого полиола может достигать 30-50 % от общих углеводов. По нашим данным ManOH накапливается в белом мицелии L. edodes перед нормальным плодоношением на коричневой мицелиальной пленке.
ектины обнаруживают высокую специфичность к гликопроизводным, в составе молекул которых есть прежде всего D-галактозид или, в меньшей степени, к производным 4-О-D-глюкопиранозы, предпочтительнее 4-О--D-Glc- по сравнению с 4-О--D-Glc-. Никакие иные D-глюкозидные производные, как и сама Glc, не проявляют сродства к исследуемым лектинам.
Внеклеточный гликопротеин L. edodes Ц лектин L1
Внеклеточный лектин L1 из L. edodes F-249 - гликопротеин с моносубъединичной структурой, молекулярной массой 43 кДа. L1 имеет в своем составе (10,5 1,0)% (m/m)углеводов, представленных Glc.
По результатам определения аминокислотного состава L1 обращает на себя внимание достаточно высокий уровень полярных аминокислот (Asх, Glх, Lys, Arg). Так, содержание Lys и Arg составляет 10,4 и 16,5 мол.% соответственно. Много и кислот, занимающих промежуточное положение между гидрофильными и гидрофобными, особенно Hys, Ser и Gly. Для L1 индекс полярности равен 54,6%. Такая высокая полярность характерна для большинства водорастворимых белков, для которых величина указанного индекса находится обычно в рамках интервала 47 6 %.
На хроматографически очищенный препарат внеклеточного лектина L1 получали поликлональные кроличьи антитела. Результаты твердофазного ИФА продемонстрировали наличие общих антигенных детерминант в составе двух внеклеточных лектинов.
Агглютинирующие свойства лектинов L. edodes на разных стадиях очистки препаратов этих белков изучали в зависимости от типа эритроцитов (разных животных и 4 групп крови человека) и их предварительной обработки (нативных и трипсинизированных). Очищенные лектины демонстрировали высокую избирательность при узнавании определенных структур на поверхности трипсинизированных эритроцитов кролика, не реагировали с эритроцитами других животных и человека. Обработка эритроцитов трипсином значительно повышала чувствительность реакции.
Внеклеточный протеогликан L. edodes Ц лектин L2
Внеклеточный лектин 2 из L. edodes F-249 - протеогликан с моносубъединичной структурой, молекулярной массой 37 кДа. L2 содержит в своем составе (90,3 1,0)% (m/m) углеводов, предсталенных Glc (73% общей массы углеводной части молекулы лектина) и Gal (27% общей массы углеводной части молекулы лектина).
В L2 высоко содержание полярных аминокислот, прежде всего Asх - около 42% от суммы аминокислот. Элементный анализ (на содержание азота) показал, что Asх присутствует в виде Asn. Менее 10% в L2 других полярных аминокислот: Glх, Lys, Arg. Для L2 индекс полярности равен 56,7%.
Содержание углеводов в L2 значительно выше, чем в L1. Высокое содержание Asn в составе L2 согласуется с нашими данными о положительном эффекте Asn в отношении формирования коричневой мицелиальной пленки L. edodes в глубинной культуре. Кроме того, высокий уровень Asn в L2 наряду с составом углеводной части молекулы (Glc и Gal) позволяют отнести этот лектин к N-аспарагинсвязанным, имеющим N-гликозидную связь в молекуле протеогликана. Белковая часть связывается с углеводной через Asn [Э.А. Коваленко, 1997].
Более детальная структурная характеристика L2 была получена с помощью спектроскопии ЯМР. Спектр ЯМР 1H образца L2 содержит две группы сигналов (табл. 1). Химический сдвиг протона воды (H2O), содержащейся в растворителе (D2O), равен 4.632 млн-1. Поэтому с высокой степенью достоверности пики при 4.380, 4.884, 5.047 и 5.087 млн-1 могут быть отнесены к протонам гидроксильных групп.
Кроме того, пики при 5.047 и 5.087 млн-1 могут относиться к алкиламинным (AlkNH2, AlkNHAlkТ) или алкиламидным протонам (AlkCONH2, AlkCONHAlkТ), для резонанса которых характерны химические сдвиги 5.0-8.0 и 5.0-8.5 млн-1 соответственно [Панкратов и Остроумов, 1995].
Отметим, что сигналы метиленовых и метиновых протонов групп CH2OH и CHOH обычно проявляются в области 3.6 и 3.8 млн-1 соответственно. Это согласуется с предположением о наличии в составе образца названных групп.
Таблица 1. Данные спектра ЯМР 1H внеклеточного лектина L2 из L. edodes F-249
Химический сдвиг (δ,млн-1) | Возможное отнесение |
3.268; 3.317; 3.380; 3.420; 3.466; 3.631 | 1. Алкильные протоны в фрагментах CH2OH, CHOH, CH2NCOR, CH2NSO2R, CH2N+, CHN+, CH2N=C=S, CH2+N≡C-, CH2SO2F, CH2Cl, CH2Br, CH2I 2. Алкильные протоны разнообразных фрагментов XCH2Y и XCHY, включая R2NCH2COOR, R2NCHCOOR (R = H, Alk, Ar) 3. Протоны при гетероатомах O, N, S в соединениях AlkOH, ArNH2, ArNHR, ArSH |
4.380; 4.884; 5.047; 5.087 | 1. Протоны при гетероатомах O, N в соединениях AlkOH, ArOH, ArNH2, ArNHR 2. Винильные протоны фрагментов C=CH2, ROC=CH (R = H, Alk, Ar) |
В пользу отнесения пиков к OH- или NH-протонам свидетельствует то, что все сигналы в той или иной степени уширены. Причиной уширения сигналов протонов при гетероатомах обычно является их участие в обменных взаимодействиях, а в случае протонов при атоме азота - также наличием у ядра 14N электрического квадрупольного момента [Панкратов и Остроумов, 1995].
Спектр не содержит сигналов алкильных и циклоалкильных протонов, не связанных с электроноакцепторными атомными группами, а также протонов ароматических, хиноидных, пиридиновых, пиррольных, фурановых, тиофеновых циклов, альдегидных протонов (RCHO), подвижных атомов водорода карбоновых кислот (RCOOH), сульфокислот (RSO3H), оксимов (R2C=NOH), алкилтиолов (AlkSH).
Учитывая характер образца, можно исключить возможность присутствия фрагментов CH2NCOR, CH2NSO2R, CH2N=C=S, CH2+N≡C-, CH2SO2F, CH2Cl, CH2Br, CH2I, структурных элементов XCH2Y и XCHY, кроме приведенных в табл. 1 α-аминокислотных, а также C=CH2, ROC=CH, AlkNH2, AlkNHAlkТ, ArNH2, ArNHR, ArSH.
Следовательно, спектр ЯМР 1H образца не противоречит возможности наличия в его составе углеводных и α-аминокислотных звеньев, то есть протеогликановой природе L2.
Выделение и характеристика внеклеточного гликолипида L. edodes
Используя экстракцию смесями метанол-вода-хлороформ, из L2 на промежуточной стадии его очистки мы получили препарат, содержащий Gal (выход 0,19%) и жирные кислоты (выход 0,17%) С8:0 и С9:0 (в соотношении 28% и 72% (m/m) от суммы двух ЖК соответственно). Путем простых вычислений из экспериментально найденного соотношения масс Gal и алкановых кислот получаем, что в выделенном препарате (обозначенном нами S3) на одну молекулу Gal приходится 1 молекула ЖК. Это в пределах погрешности эксперимента подтверждается теоретическими подсчетами (приведены в тексте диссертации). Согласно результатам элементного анализа, 15% молекул галактолипида сульфатировано. То есть главными компонентами S3 являются Gal (1-сульфат-Gal), ацилированная остатками октадекановой или нонадекановой кислот. Указанные методы исследования дополнены ИК-спектроскопическими.
В ИК-спектре галактолипида S3 наблюдались случаи, когда полосы можно относить к сульфатной группе. Имелись типичные алифатические полосы, свидетельствовавшие о присутствии углеводородной цепи ацильного заместителя, а также признаки полиметиленовой цепи. Отнесения частот для колебания с участием связей C-O в карбоновых кислотах, сложных эфирах (1155 и 1111 см-1) могут говорить о сложноэфирном характере присоединения жирнокислотного заместителя Gal. В целом отнесения частот не противоречат возможности наличия в составе соединения S3 углеводных звеньев и ЖК остатков.
Накопление входящих в состав S3 короткоцепочечных ЖК происходит в мицелии шиитаке на стадии формирования коричневой мицелиальной пленки и коррелирует с резким повышением внеклеточной лектиновой активности в смывах с мицелия именно на этой морфогенетической стадии. Никакого повышения содержания в мицелии ЖК С8:0 или С9:0 не наблюдается при образовании недифференцированных плодовых тел на белом мицелии, когда и увеличения лектиновой активности не происходит. Более подробному описанию изменений жирнокислотного состава мицелия во взаимосвязи с лектиновой активностью культуры в процессе морфогенеза посвящен один из разделов настоящей работы.
Можно высказать предположение о возможной роли S3 как одного из регуляторов активности внеклеточных лектинов. Кроме корреляции накопления компонентов S3 с увеличением лектиновой активности, о возможном вкладе гликолипида в регуляцию этой активности говорят результаты других наших наблюдений. В смесях препаратов S3 + L1 и S3 + L2 при одинаковой массовой концентрации компонентов титр гемагглютинации возрастает в 8 и 16 раз соответственно (собственной ГА активности S3 не проявляет). Кроме того, в ходе процедуры очистки препарата L2 удельная активность его проходит через максимум на промежуточной стадии, на которой L2 связан с S3, а затем заметно снижается по мере дальнейшей очистки L2.
Длительное время в литературе обсуждаются вопросы, связанные с неспецифичностью реакции клеток микроорганизмов в ответ на самые различные внешние воздействия. В общем механизме приспособления к неблагоприятным условиям или стрессу значимую роль играют регуляторные соединения, экскретируемые во внеклеточную среду (факторы стресса) [Андреев и др., 1988]. Среди компонентов фактора были выявлены урацил, фосфаты, жирные кислоты (С9:0 и С10:0), олигосахариды. (Примечание: среди компонентов S3 72 масс% жирнокислотного пула приходится на С9:0). Подобное соединение синтезируется одним из первых на фоне затухания метаболических процессов, работающих в состоянии нормы [Феофилова, 1994].
Мы полагаем, что в дополнение к комплексу вторичных метаболитов, экскретируемых культурой L. edodes, под воздействием изменившихся в отрицательную сторону условий внешней среды (питательный стресс, переход к цитодифференцировке вследствие истощения питательных ресурсов) присоединяются вещества - регуляторы лектиновой активности, одним из которых является S3.
С учетом разнообразия биологического происхождения продуцентов гликолипидов с признаками как явного сходства, так и немаловажного в функциональном плане различия молекулярного строения обсуждаемых соединений, выявляемых современными исследованиями [Cheng et al., 2003; Голубев и др., 2004; Воробьева и др., 2006; Плужников и др., 2006; Кулаковская и др., 2007], не представляется особенно удивительным тот факт, что L. edodes и, вероятно, другие макробазидиомицеты способны самостоятельно синтезировать подобные соединения, однако пока в отношении данной систематической группы такой информации в литературе мы не встречали.
Зависимость лектиновой активности от условий культивирования
Имеется ряд признанных важными физико-химических и биологических факторов внешней среды, которые могут служить триггерами процессов сложного пути развития мицелиальных грибов [Феофилова и др, 1988]. От таких параметров внешних условий, как температура культивирования, количество посевного материала, возраст культуры, состав питательной среды (природа веществ - источников углеродного и азотного питания, соотношение УC:NФ, кислотность), мы изучали зависимость активности лектинов L. edodes для успешного решения в дальнейшем проблемы получения этих биологически активных соединений методом глубинного культивирования.
Влияние количества посевного мицелия, температуры,
возраста культуры на лектиновую активность L. edodes
Для изучения влияния количества посевного мицелия на активность внеклеточных лектинов гриба мы выбрали способ дозирования посевной культуры - дисками сусло-агара, покрытыми мицелием (d=5 мм). Зависимость лектиновой активности КЖ от дозы посевного мицелия изучали в процессе роста культуры на синтетической Glc-Asn среде. Оказалось, что зависимость лектиновой активности КЖ от количества посевного материала характеризуется непропорционально быстрым увеличением этой активности, имеющим предельное значение при определенном количестве инокулята.
Изучение зависимости лектиновой активности от температуры культивирования показало, что титры ГА имеют более высокие значения как при повышении температуры, так и при ее понижении по сравнению с оптимумом роста (26оС). Для корректности сравнения лектиновой активности у разных штаммов L. edodes, культивируемых одно и то же время, проведены эксперименты по определению скорости роста используемых штаммов при данных температурных условиях выращивания. Оказалось, что таких резких изменений, как это имеет место в плане лектиновой активности, скорость роста не претерпевает ни в зависимости от штамма, ни тем более от температуры выращивания. Штаммовые различия скоростей роста относительно невелики: не более чем в 1,1 раза при 37оС, в 1,2 раза при 26оС, в 1,3 раза при 16оС, а штаммовые различия по лектиновой активности достигают 5,1103 раз (при 37оС). Изучали влияние выбранных температур на лектиновую активность КЖ в процессе роста культуры, а также зависимость скорости роста всех исследуемых штаммов L. edodes от времени культивирования (рис. 2).
Рис. 2. Зависимость лектиновой активности КЖ (а, б, в) и скорости роста (г)
L. edodes от времени культивирования при различных температурах выращивания
(26oС (a, г), 16oС (б), 37oС (в)). Штаммы: 1 - NY, 2 - F-249, 3 - 2T, 4 - 0779
Видно, что штаммовые различия в отношении ГА активности КЖ, сравнительно небольшие при 16oС, увеличиваются при 26oС с одновременным изменением вида соответствующей кривой. При 37oС штаммовые различия продолжают углубляться, резко отличается от других штамм NY. Сопоставление характера зависимостей на рис. 2 (а, б, в) с рис. 2 (г) позволяет сделать вывод, что изменения лектиновой активности в нашем эксперименте не определяются только скоростью роста. Аналогичный вывод был сделан нами и ранее для случая температурного оптимума 26оС: лектиновая активность - биохимическая характеристика, производная не только от способности грибной культуры к накоплению биомассы.
Активность внеклеточных лектинов L. edodes в зависимости
от источников углерода и азота
Исследования, связанные с образованием внеклеточных лектинов шиитаке в зависимости от условий глубинного культивирования, позволяют представить характеристику внешних условий биосинтеза лектинов культуры, выявить оптимальную в этом отношении химически детерминированную среду выращивания и усовершенствовать процедуру выделения и очистки экзолектинов. С этой целью первоначально мы изучали жидкие среды разнообразного химического состава, а именно с различными источниками углерода и азота, низкомолекулярными компонентами-добавками, значениями рН среды, в динамике роста культуры.
Анализ КЖ показал значительное увеличение титров ГА для всех сред с моносахаридами в качестве источника углерода по сравнению с лектиновой активностью сред на основе других углеводов или ацетата натрия. В этой связи особенно выделяется Ara, титр ГА при использовании которой в КЖ возрос не менее чем в 8 раз по сравнению с другими изученными веществами. Обнаружено, что наибольшей лектиновой активностью характеризуется среда выращивания УAra - AsnФ при соотношении С:N (9,5-12):1 на 15-18-е сут культивирования (титр ГА 8192), а также УGlc - AsnФ при возрасте культуры 3-7 сут и C:N 17:1 (титр ГА 4096). Отмечено значительное увеличение лектиновой активности при рН 8-9 и отсутствие положительного эффекта рН-статирования растущей культуры.
Эффект некоторых низкомолекулярных компонентов среды:
эксперимент и квантовохимическое рассмотрение
Катионы двухвалентных металлов
Известно стимулирующее влияние некоторых микроэлементов, в том числе катионов металлов, на синтез вторичных метаболитов различными грибами [Scott and Gaucher, 1984; Козловский и Соловьева, 1986; Hughes and Poole, 1989; Ловкова и др, 1995; Козловский и др., 2000]. О механизмах их действия на процесс в целом или на его отдельные этапы известно крайне мало. Исследование лектиновой активности L. edodes во взаимосвязи с химическим составом среды культивирования мы продолжили с использованием введения в состав синтетических сред катионов металлов (II) в виде солей. Девять металлов(II) выбрали по принципу биологической значимости их катионов для минерального питания грибов. Соли выбранных металлов входят в микроколичествах в состав оптимизированных питательных сред ксилотрофных базидиомицетов [напр., Бухало, 1988; Дворнина, 1990; Дудка и др., 1992].
Изучая зависимость лектиновой активности глубинной культуры L. edodes от концентрации солей металлов(II) в синтетической среде выращивания, мы установили, что одним из факторов, влияющих на эту активность, несомненно является присутствие в среде культивирования солей металлов в степени окисления +2. В случае меди имеет место зависимость Улектиновая активность - концентрация катионаФ, противоположная наблюдаемой для других металлов в настоящей работе: наибольшая активность внеклеточных лектинов проявлялась на среде с максимальным содержанием меди.
В отношении величин титров гемагглютинации и периодов проявления наибольшей лектиновой активности имеет значение не только концентрация катиона Me2+, но и источник углеродного питания грибной культуры. Так, среды выращивания с Ca2+ и Glc (рис. 3а), Suc (рис. 3б), Ara (рис. 3в) различаются как величинами титров ГА (максимальные значения составляют 1024 для Glc и Ara, 256 для Suc), так и периодами проявления наибольшей лектиновой активности. Так, титр 1024 наблюдается при содержании Са2+ 1 мM на 9-е сут и в период 16-28 сут культивирования в случае Glc, но только в интервале 21-28 сут в случае Ara. Максимальная лектиновая активность (титр 256) для среды с Suc наблюдается лишь на 3-и и 5-е сут, причем при той же 1 мM концентрации Са2+.
Полученные данные для металлов, образующих обсуждаемые выше катионы, позволяют составить последовательность в порядке уменьшения положительного эффекта Ме2+ на активность внеклеточных лектинов шиитаке:
Mg > Ca > Cu > Fe > Mn > Zn ~ Sn > Co > Ni.
а б в
Рис. 3. Зависимость летиновой активности (lgT) КЖ L. edodes F-249 с добавкой Са2+
при использовании в качестве источника углерода: D-Glc (а), Suc (б), L-Ara (в) от времени культивирования. [Ca2+], мM: (61,68,75) - 0; (62,69,76) - 1; (63,70,77) - 2; (64,71,78) - 4;
(65,72,79) - 6; (66,73,80) - 8; (67,74,81) - 10
Катионы металлов триады железа
Интерес представляет объяснение влияния катионов металлов на лектиновую активность с позиций квантовой химии. Металлы, рассмотренные в настоящей работе, очень различны по положению в Периодической системе элементов и по свойствам. Поэтому для столь многофакторного свойства, как лектиновая активность, корректные сопоставления можно делать только в ряду близких по важнейшим характеристикам катионов металлов. Поэтому нами в этом плане рассмотрена триада железа, кобальта, никеля.
Вероятный механизм положительного влияния катионов металлов на лектиновую активность состоит в том, что они образуют смешаннолигандные комплексы с гидроксильными группами лектинов и гликоконъюгатов, способствуя обратимому связыванию гликоконъюгатов лектинами. Из-за сходства электронной конфигурации и электростатических предпосылок комплексообразования изучаемых катионов с кислородсодержащими лигандами есть основания полагать, что различия определяются термодинамикой реакций комплексообразования, прочностью связи металл - кислород. Для проверки этого предположения мы провели квантовохимическое ab initio исследование термодинамики реакций гексааквокомплексов Fe(II), Co(II) и Ni(II) с модельной системой - EG, типичным хелатообразующим реагентом и простым аналогом углеводов. Оценивали тенденцию изменения значений полной энергии молекулярных систем в ряду металлов, а именно ΔE как аналог свободной энергии (ΔG) реакции без учета энтропии (корректность использования величины ΔE вместо ΔG показана в тексте диссертации).
Ряд уменьшения склонности катионов к комплексообразованию с этиленгликолем Fe2+ > Co2+ >> Ni2+, полученный из квантовохимических расчетов, согласуется с рядом уменьшения влияния этих катионов на лектиновую активность: Fe2+ > Co2+ > Ni2+. При этом все величины ΔE положительны, что свидетельствует о несамопроизвольности, обратимости возможных процессов комплексообразования. Катион металла не должен быть связан в прочный комплекс, и связывание лектина с гликоконъюгатом обратимо, что отражает важнейшую особенность взаимодействия лектинов с гликоконъюгатами.
Наряду с описанным выше квантовохимическим ab initio исследованием термодинамики реакций гексааквокомплексов Fe(II), Co(II) и Ni(II) с EG, мы провели экспериментальное исследование поведения моделируемой системы, определяли в динамике лектиновую активность КЖ L. edodes в разных вариантах опыта.
В качестве обобщения данной части работы следует сказать, что мы исследовали эффекты двухзарядных катионов металлов триады железа в составе жидкой синтетической среды культивирования, проявляющиеся в изменении активности внеклеточных лектинов L. edodes, и попытались объяснить влияние катионов металлов на лектиновую активность с позиций квантовой химии. Показано, что активность внеклеточных лектинов зависит от присутствия в среде культивирования двухзарядных катионов металлов триады железа. Влияние Fe2+, Co2+, Ni2+ на лектиновую активность изменяется симбатно с рассчитанными на уровнях теории UHF/3-21G(d,p), MP2/3-21G(d,p)//UHF/3-21G(d,p) энергиями реакций хелатообразования гексааквокомплексов металлов с модельным лигандом EG. Гипотеза об обратимом связывании катионов металлов в непрочные смешаннолигандные комплексы с лектинами и гликоконъюгатами, разумно объясняющая различное влияние катионов металлов на лектиновую активность, получила квантовохимическое обоснование на примере трех металлов (Fe, Co, Ni).
Селен в органической форме
Актуальность изучения влияния Se на физиолого-биохимические характеристики грибных культур и отсутствие соответствующей информации в отношении шиитаке (об этом можно судить при рассмотрении обзора литературы) дало нам основания к проведению описанных ниже исследований. Мы использовали новое органическое соединение Se, обладающее преимуществами перед селенатами и селенитами натрия. 1,5-Дифенил-3-селенпентандион-1,5 (препарат ДАФС-25) является одним из немногочисленных селеноорганических соединений, внедренных в практику [Древко и др., 2001].
Исследована зависимость лектиновой активности и ростовых характеристик L. edodes от присутствия в жидких и агаризованных средах селенсодержащего компонента ДАФС-25. Наблюдается стимуляция процесса накопления биомассы при глубинном культивировании в присутствии селеновых добавок; относительно быстрорастущий мицелий более подвержен позитивному влиянию препарата. Выявлено положительное воздействие ДАФС-25 на ростовые показатели L. edodes на агаризованных средах, при этом максимальный эффект достигается в случае среды с наиболее низкой скоростью роста мицелия. Под воздействием ДАФС-25 лектиновая активность как культуральной жидкости, так и мицелиальных смывов L. edodes в наибольшей степени возрастает в случае синтетической среды, характеризующейся высокой активностью внеклеточных лектинов изучаемой культуры и сравнительно низкой лектиновой активностью смывов с мицелия в отсутствие ДАФС-25.
Результаты проведенных исследований позволяют сделать вывод, что селенсодержащий препарат ДАФС-25 в концентрации 10-4 г/л в пересчете на селен оказывает заметное действие на процессы жизнедеятельности L. edodes, выраженное в изменении ростовых параметров и лектиновой активности культуры как на жидких, так и на агаризованных средах. Селеновая добавка в наибольшей степени стимулирует рост и лектиновую активность шиитаке на синтетической агаризованной среде, характеризующейся низкими значениями как ростовых показателей, так и лектиновой активности смывов с мицелия, в отсутствие ДАФС-25. Кроме того, под воздействием препарата возрастает лектиновая активность и на жидкой синтетической среде, характеризующейся максимальными в нашем эксперименте титрами гемагглютинации. Сравнительно низкая при отсутствии ДАФС-25 лектиновая активность или смывов с мицелия (как это имеет место в случае синтетической среды), или культуральной жидкости (среда с дубовыми опилками) может, по-видимому, служить отчасти предпосылкой более выраженного стимулирующего эффекта ДАФС-25 в отношении активности внеклеточных лектинов культуры.
Воздействие неблагоприятных факторов на лектиновую активность L. edodes
Одним из достаточно важных вопросов, который возникает при исследовании эффектов добавок различных компонентов к среде культивирования, является вопрос о том, как повлияют условия Упитательного стрессаФ (терминология в соответствии с работой Е.П. Феофиловой (1994)) на изучаемую биологическую активность. В зависимости от того, будет ли наблюдаться повышение активности внеклеточных лектинов при выращивании на неполноценных синтетических питательных средах, можно было бы сделать предположение об участии лектинов в адаптации культуры к неблагоприятным факторам внешней среды.
Идентифицированные внеклеточные соединения, участвующие в адаптации микроорганизмов к неблагоприятным условиям среды, по химической природе относятся к разным типам. Они представлены белками, углеводородами, органическими кислотами, нуклеотидами, аминокислотами, липопептидами, летучими соединениями [Николаев, 2004]. Однако большая часть таких соединений в настоящее время не идентифицирована. Снижение уровня энергетического и конструктивного метаболизма и выход из неповрежденных клеток компонентов внутриклеточного пула являются характерными для защитных метаболических реакций (напр., [Андреев и др., 1988]). Модуляции в лектиновой компоненте внеклеточных белков культуры L. edodes, возможно, являются одним из механизмов, регулирующих метаболизм грибных клеток под влиянием внешних факторов. Начальный подход к доказательству данного предположения осуществлен в настоящем разделе работы. Нам не удалось найти сведений об изучении в подобном аспекте микологических культур.
В качестве показателя УнеблагоприятностиФ условий культивирования гриба мы использовали ростовые характеристики (замедление роста мицелия на агаризованных средах) и изучали, будет ли наблюдаться повышение активности внеклеточных лектинов при выращивании на таких средах. Представляло интерес исследовать культуральную жидкость L. edodes F-249 с тем же, как у агаризованных, составом исходных жидких сред на присутствие внеклеточных лектинов. Получены также данные по лектиновой активности культуральной жидкости L. edodes F-249 при выращивании на жидкой среде с Glc. В этом случае в качестве посевного материала служил мицелий, полученный на всех указанных выше агаризованных синтетических средах.
В пользу высказанных выше предположений о стимулирующей роли неблагоприятных условий выращивания на лектиновую активность шиитаке свидетельствуют медленно растущие колонии на агаризованных средах разных составов, характеризующихся одновременно высокими титрами ГА, а также примеры обратной ситуации, то есть Убыстрый рост - низкая лектиновая активностьФ.
Следовательно, результаты проведенных исследований позволяют сделать вывод, что компоненты питательных сред, неблагоприятные для роста культуры, при определенных условиях стимулируют повышение лектиновой активности шиитаке. Вполне вероятно, что постоянное присутствие внеклеточных лектинов Lentinus edodes, обнаруженное нами, - не препятствие для предварительного (требуется дальнейшее углубленное изучение) отнесения их к описанным протекторным белкам. Здесь, опираясь на данные литературы по бактериальным внеклеточным факторам адаптации [Николаев, 2004], необходимо также учитывать, что факторы адаптации протекторного типа могут быть и, как правило, являются долгоживущими. А сигнальные молекулы, молекулы-зонды, для которых изучена динамика их появления и исчезновения из культуральной жидкости, относительно короткоживущие, они быстро накапливаются в среде до активной концентрации и быстро элиминируются.
ектины шиитаке в процессах морфогенеза
Исследования, представленные в данном разделе, затрагивают такой малоизученный вопрос, как взаимосвязь процессов роста и развития грибного мицелия с синтезом соединений, способных регулировать включение той или иной морфогенетической программы. К числу таких соединений безусловно относят и важнейшие компоненты химического состава мицелия - липиды и углеводы [Феофилова и др., 1994, 2000; Терешина и др., 2002]. Предположение о том, что к числу таких соединений принадлежат грибные лектины, мы постараемся доказать далее. Поэтому наряду с активностью лектинов шиитаке мы исследовали углеводный состав мицелия L. edodes и жирнокислотный состав общих липидов на разных стадиях морфогенеза.
ектиновая активность L. edodes на разных стадиях
формирования плодовых тел
Особый интерес представляет обнаружение и изучение лектиновой активности культуры L. edodes в процессе развития, проследив за изменениями этой активности на стадиях образования различных вегетативных структур, в том числе пигментированной мицелиальной пленки (МП). Исследования показали, что это образование представляет собой плотное сплетение толстостенных пигментированных гиф. У L. edodes МП обычно предшествуют образованию примордиев и далее плодовых тел [Гарибова и др., 1997].
Учитывая время появления МП и титры ГА мицелиальных смывов для этой вегетативной структуры, мы сделали вывод о том, что чем выше ТГА в смывах с мицелия, тем быстрее формируется МП, с более высокой при этом лектиновой активностью. В экспериментах по получению плодовых тел на чашках Петри мы наблюдали, что в дальнейшем процессе морфогенеза и плодовые тела образуются лишь в случае МП с максимальной лектиновой активностью.
При проведении экспериментов по определению лектиновой активности на различных стадиях морфогенеза (непигментированный мицелий; пигментированный мицелий; коричневая мицелиальная пленка; мицелиальная корка; примордии; незрелое плодовое тело; зрелое плодовое тело) нами было показано, что лектиновая активность различна на всех стадиях развития гриба. ГА активность смывов с мицелия, примордиев, ножки плодового тела существенно ниже, чем в случае МП. Важно отметить тот факт, что появление пигментированного мицелия, предшествующего образованию МП, не приводит к увеличению ГА активности. Лишь формирование плотной коричневой МП дает резкое повышение титра ГА. Можно предположить определенное значение лектинов на каждом этапе морфогенетического развития гриба, особенно на стадии образования МП. Согласно имеющейся информации [Botton and Guillot, 1987; Richard, 1995], образование специализированных вегетативных структур в процессе роста грибов требует мицелиальной агрегации, и внеклеточные лектины могут участвовать в обеспечении сцепления между гифами [Kaneko et al., 1993].
Определение углеводных гаптенов для агглютининов различных вегетативных структур шиитаке позволило представить последовательность по возрастанию ингибирующей концентрации углевода: D-Lac>D-Gal>D-GalN>D-GlcN>L-Rha, которая нарушается в единственном случае (плодовое тело, штамм F-249), когда Gal и Lac в приведенном ряду меняются местами.
Формирование пигментированной мицелиальной пленки
в глубинной культуре шиитаке в зависимости
от активности внеклеточных лектинов
Итак, участие лектинов в формировании пигментированной мицелиальной пленки L. edodes подтверждается рядом экспериментов, описанных выше. Эти эксперименты были проведены в условиях твердофазного культивирования. Возникает вопрос о существовании взаимосвязи лектиновой активности L. edodes и морфогенетических процессов в условиях жидких питательных сред. Каковы условия формирования МП в глубинной культуре, зависит ли образование этой морфогенетической структуры от активности внеклеточных лектинов? Для выяснения этих вопросов впервые предприняты попытки получения МП на жидких синтетических средах, характеризующихся высокой лектиновой активностью.
Суммируя результаты оптимизации состава среды выращивания в отношении лектиновой активности, описанные выше, можно заключить, что активность внеклеточных лектинов L. edodes F-249 высока для сред с аминокислотным азотом (ТГА достигает значения 4096 при соотношении C:N, равном 17:1). Однако появление МП наблюдалось только после 55-60 суток культивирования.
Мы попытались получить МП L. edodes F-249 с использованием ряда добавок к синтетической среде, в частности, солей Ca, Mn(II): CaCl2.2H2O, MnCl2.4H2O. Обнаружен положительный эффект катионов Са2+ (2 - 10 ммоль/л) или Mn2+ (0,5 - 2 мM). В отсутствие аминокислотного источника азота не обнаружено влияния этих катионов на появление МП. Среди изученных нами эссенциальных аминокислот выражен эффект Asn на процесс образования МП в жидкой среде культивирования. То есть имеет место явный эффект одновременного присутствия двухзарядных катионов Ca или Mn и Asn на процесс формирования МП в глубинной культуре.
Естественно предположить, что Asn участвует в определенных биохимических процессах, медиированных ионами Ca2+ и Mn2+. Но ограничено ли отличие Asn как компонента жидкой питательной среды только участием в химическом связывании в растворе? Если это так, то по электронному строению молекулы Asn должен выделяться даже среди структурно близких аминокислот. Известно, что углеводы взаимодействуют с лектинами в том числе посредством образования множественных водородных связей, при этом амидный водород и карбонильный кислород Asn в структуре сайтов связывания часто включены в это белок-углеводное взаимодействие ["The Lectins...", 1986; Elgavish and Shaanan, 1997]. К рассмотрению данной проблемы нами привлечены методы квантовой химии.
Возникает предположение, что реакционным фрагментом аспарагина служит амидная группировка, однако вследствие сопряжения в амидной группе нуклеофильные свойства азота существенно понижены. Наиболее вероятным центром связывания катиона металла является атом кислорода. Это вытекает также из принципа жестких и мягких кислот и оснований [Pearson, 1990]: предпочтительно взаимодействие жесткой кислоты Льюиса - катиона Ca или Mn(II) с жестким реакционным центром - кислородным атомом. Если реакционным фрагментом является COOH-группа, то связывание металла по кислородному атому не имеет альтернативы.
Gln - ближайший структурный аналог Asn и единственная из исследованных нами аминокислот, помимо Asn, имеющая в своем составе группу CONH2. Хотя молекула Gln отличается от Asn только одним метиленовым звеном, тем не менее Gln, в отличие от Asn, как компонент питательной среды не оказывает заметного влияния на формирование МП шиитаке. Важно объяснить разное химическое поведение этих двух структурно аналогичных соединений. Основываясь на вышесказанном, можно предположить, что различия в реакционной способности обусловлены различными зарядами на вероятных реакционных центрах.
Ограниченным методом Хартри-Фока (RHF) [Кларк, 1990] нами произведены ab initio расчеты электронной структуры цвиттер-ионов Asn и Gln. Заряды на атомах в изученных молекулярных системах служат квантовохимическим индексом, описывающим реакционную способность веществ в реакциях, управляемых электростатическими силами. Жестко-жесткое взаимодействие аминокислота - катион Ca2+ или Mn2+ как раз относится к такого рода процессам. Получили, что зарядовые характеристики возможных реакционных центров обеих аминокислот очень близки между собой. По-видимому, дифференциальный характер взаимодействия изученных аминокислот с катионами металлов не связан с различиями в электронном строении цвиттер-ионов.
Для выявления других возможных факторов, влияющих на химическое поведение двух аминокислот при взаимодействии с катионами металлов, нами с помощью программного пакета HyperChem рассчитаны QSAR-свойства цвиттер-ионов Asn и Gln. Результаты расчетов позволили сделать вывод, что, возможно, различие в реакционной способности двух цвиттер-ионов в некоторой степени связано с их дифференциальной гидрофобностью. Asn как менее гидрофобный реактант имеет более прочную гидратную оболочку и поэтому связывает катион металла менее прочно, то есть обратимо. Одной из причин высокой селективности к Asn по сравнению с Gln может являться пространственный фактор. На основе таких критериев, как ван-дер-ваальсова поверхность и особенно объем молекулы, можно направленно искать подходящие по топологии фрагменты в структуре белка, основываясь на возможных будущих данных рентгеноструктурного анализа.
Необычно высокое содержание Asn, обнаруженное нами при изучении аминокислотного состава лектина L2 (cм. выше), по меньшей мере не противоречит предположению о важности этой аминокислоты для лектинового биосинтеза. На наш взгляд, несомненна активизация процессов формирования МП в глубинной культуре шиитаке с повышенной лектиновой активностью, и Asn способствует этой активизации.
Cледовательно, в данном разделе показана зависимость внеклеточной лектиновой активности L. edodes F-249 от одновременного присутствия в синтетической жидкой среде культивирования Asn и двухзарядных катионов Ca или Mn. При этом наблюдается формирование МП в глубинной культуре в течение нескольких суток. Результаты произведенных методом RHF/6-31G* ab initio расчетов электронной структуры цвиттер-ионов Asn и Gln не позволяют связывать дифференциальный характер взаимодействия изученных аминокислот с катионами металлов с различиями в электронном строении цвиттер-ионов. Рассчитаные QSAR-свойства этих цвиттер-ионов свидетельствуют в пользу того, что различие в реакционной способности Asn и Gln в некоторой степени связано с их разной гидрофобностью. Кроме того, полученные в настоящей работе данные не позволяют и ограничивать роль аспарагина на изучаемой стадии морфогенеза L. edodes только участием в химическом связывании в жидкой среде выращивания. По нашему мнению, аспарагин включен, возможно опосредованно, в биосинтетические процессы, одним из результатов которых является формирование МП культуры.
Взаимосвязь углеводной специфичности лектинов
и углеводного состава мицелия L. edodes
на разных стадиях морфогенеза
Высказываются предположения об участии углеводов в индукции процесса плодообразования у грибов. Смена стадий цитодифференцировки происходит под воздействием стрессовых факторов, что сопровождается изменением химического состава, структуры и функции клеток. Для базидиальных грибов таким регулирующим фактором часто является температура, например, холодовой стресс индуцирует образование базидиом у L. edodes [Терешина и др., 2002]. Одна из важнейших ответных реакций клетки гриба на стресс - изменение углеводного состава; это может регулировать активность ферментов и влиять на развитие гриба.
Известно в то же время, что морфогенетическая стадия коричневой мицелиальной пленки, предшествующая нормальному плодоношению шиитаке, обладает по результатам наших экспериментов высокой лектиновой активностью. Процесс формирования неполноценных плодовых тел на непигментированном мицелии, минуя стадию образования МП, практически не изучен, в частности, ничего не известно о лектиновых комплексах и изменениях углеводного состава неполноценных базидиом. Использованный в настоящем исследовании подход позволяет судить об особенностях углеводного состава и лектиновой активности, проявляющихся в условиях формирования обычных и неполноценных плодовых тел, о корреляциях состава углеводного компонента мицелия и углеводной специфичности лектинов. Кроме того, он дает возможность выявить характерные признаки, сопутствующие образованию плодовых тел, вне зависимости от их морфологии, условий формирования и стадии жизненного цикла культуры.
В данной части наших исследований мы поставили задачу выявления взаимосвязи углеводного состава мицелия шиитаке на разных стадиях морфогенетического развития с лектиновой активностью и углеводной специфичностью лектинов культуры. Для этого состав углеводной фракции L. edodes изучали на разных этапах развития культуры: белый мицелий, слабопигментированный мицелий, МП, плодовое тело. Обнаружили изменения углеводного состава L. edodes на разных стадиях морфогенеза.
Углеводный состав МП отличается от такового не только плодовых тел и белого мицелия, но и слабопигментированного мицелия - стадии, предшествующей формированию собственно мицелиальной пленки. Для сравнения изучен также состав углеводной фракции на разных стадиях развития мицелия двух других штаммов культуры - 2Т и NY. Выбор указанных штаммов в качестве объектов исследования обусловлен существованием разделенных во времени явлений плодоношения и формирования коричневой пленки, при этом на белом мицелии появляются немногочисленные деформированные, неполноценные плодовые тела, а затем, после формирования пленки, происходит обычное, с точки зрения геометрических характеристик плодовых тел и урожайности, плодоношение.
Изучено относительное содержание углеводов, к которым специфичны лектины L. edodes. Содержание Lac у штамма F-249 максимально в МП и не обнаруживается в базидиомах. Соотношение относительных величин содержания Lac в МП и слабопигментированном мицелии составило 44: 1 соответственно. В случае двух других штаммов культуры - 2Т и NY оказалось, что на стадии белого мицелия штамма 2Т, приводящей к формированию неполноценных плодовых тел, повышено содержание Gal, не обнаруживаемой настоящим методом на других стадиях. Состав деформированных базидиом, образующихся первоначально на белом мицелии штамма NY, характеризуется относительно высоким содержанием Lac, также не найденной в наших экспериментах в непигментированном мицелии. Для обоих углеводов соотношение примерно 40:1 в сравнении с другими стадиями каждого штамма.
Определено содержание углевода, к которому специфичны лектины только плодовых тел всех изученных штаммов - D-Mal. Минимальные ингибирующие концентрации ее достаточно невысоки и составляют 8,33 - 16,7 мМ. В случае штамма F-249 этот дисахарид присутствует в белом мицелии, в значительных количествах накапливается в пигментированном мицелии, расходуется на стадии МП и вновь появляется в базидиомах в соотношении на указанных стадиях 1.4:5.5:1, соответственно. В случаях формирования плодовых тел без коричневой пленки (штаммы 2T и NY) Mal не обнаруживается ни в составе неполноценных плодовых тел, ни на стадиях, предшествующих плодоношению.
Количество Rha, к которой углеводная специфичность лектинов относительно низка, при плодоношении без МП возрастает одновременно с Lac и Gal, углеводная специфичность к которым проявляется в гораздо большей степени. При формировании базидиом L. edodes F-249 Rha обнаруживается лишь на стадиях, когда содержание Lac наименьшее или она отсутствует. Таким образом, в коричневой пленке накапливается только углевод, характеризующийся наибольшим сродством к лектинам культуры.
При рассмотрении особенностей углеводного состава мицелия шиитаке в случае плодоношения на МП обращают на себя внимание выраженные количественные изменения D-ManOH и D-Ino в зависимости от стадии морфогенеза. Cодержание ManOH в белом мицелии, пигментированном мицелии, МП и плодовом теле соотносится как 714 : 55 : 1 : 56 соответственно. Содержание же Ino наиболее низко в белом мицелии и резко возрастает в пигментированном в соотношении примерно 1 : 39. То есть ManOH накапливается, а Ino, наоборот, присутствует в минимальных количествах в белом мицелии перед плодоношением. Интересно, что те же изменения в химическом составе мицелия происходят под влиянием низкотемпературного стресса [Феофилова и др., 1994].
Таким образом, углеводная специфичность лектинов L. edodes при твердофазном культивировании в наибольшей степени проявляется к углеводам, обнаруживаемым на стадии коричневой пленки. Наблюдаются различия углеводного состава (количества Mal, Rha, ManOH и Ino) при нормальном плодоношении культуры и при образовании деформированных базидиом на непигментированном мицелии. Такие данные, как увеличение лектиновой активности и содержания углеводов, к которым специфичны лектины культуры, на фоне роста количества ManOH и снижения уровня Ino перед плодоношением, представляются нам еще одним свидетельством в пользу предположения об участии лектинов в индукции процесса плодообразования.
Изменение жирнокислотного состава общих липидов
и лектиновой активности L. edodes в процессе морфогенеза
Во введении к предыдущему разделу уже упоминалось о крайне малой изученности процесса формирования неполноценных плодовых тел на непигментированном мицелии, минуя стадию образования МП. В частности, ничего не известно о лектиновых комплексах и липидах неполноценных базидиом. При выборе объектов исследования в обсуждаемой части работы мы использовали штамм L. edodes, характеризующийся классическим развитием плодовых тел на пигментированной мицелиальной пленке, а также штаммы, образующие деформированные плодовые тела на стадии белого мицелия, а затем, после формирования МП, приступающие к обычному для данного вида плодоношению. Подобный подход позволяет судить об особенностях жирнокислотного состава и лектиновой активности, проявляющихся в условиях формирования обычных и неполноценных плодовых тел.
Широким набором сведений о функциональной и метаболической взаимосвязи лектинов и липидов мы пока не располагаем. Однако хорошо известно, что гидрофобные участки молекул лектинов и гидрофобные взаимодействия чрезвычайно важны для функционирования этих белков. То есть усиление гидрофобности посредством образования более или менее устойчивых ассоциатов лектинов с такими соединениями, как ЖК, образующиеся после гидролиза нейтральных липидов, может влиять на биосинтез и/или активность лектинов. Задача настоящей части работы - выявление изменений ЖК состава общих липидов и активности лектинов, происходящих по мере развития шиитаке.
Обнаружены изменения ЖК состава общих липидов мицелия L. edodes на разных стадиях морфогенеза. На примере штамма F-249 показано, что по мере развития вегетативного мицелия происходит постепенное снижение ненасыщенности (за счет C18:1 и C22:1 кислот, а также увеличение относительного содержания короткоцепочечных ЖК. На стадии образования плодовых тел отмечается заметное увеличение уровня ненасыщенных ЖК (в основном за счет С22:1 и С24:1) и исчезновение ЖК с короткими цепями. Резкие изменения относительного содержания короткоцепочечных ЖК могут быть связаны с температурой культивирования шиитаке (развитие белого мицелия происходило при 26оС, пигментация и образование МП при 4оС, развитие плодовых тел при 18оС). Ранее отмечалось, что у базидиальных грибов, выращенных при низких температурах, наблюдается укорачивание ацильных цепей ЖК липидов [Феофилова и др., 2000].
Достаточно высокая для базидиальных грибов концентрация пальмитиновой кислоты отличает L. edodes от других ксилотрофов [Феофилова и др., 1998]. Появление пигментации мицелия и затем МП у L. edodes F-249 коррелирует с заметным (в 1,7 раза) увеличением уровня С16:0. У штамма NY высокая концентрация пальмитиновой кислоты (около 40% от суммы ЖК) отмечается на стадии белого мицелия, у 2Т - на стадии образования плодовых тел.
Значительное содержание линолевой кислоты (С18:2) отмечается как общая закономерность при изучении ЖК состава общих липидов грибов разных трофических групп. В нашем эксперименте у штамма F-249 каких-либо колебаний относительного содержания линолевой кислоты при переходе от белого мицелия к стадии МП, а затем к базидиомам, отмечено не было. Другая картина наблюдалась у L. edodes NY: содержание С18:2 перед плодоношением в 3 раза превышало соответствующую величину для плодовых тел. При этом у штамма 2Т относительное содержание этой ЖК оставалось практически неизменным. Таким образом, изменения уровня линолевой кислоты в процессе морфогенеза изученных культур L. edodes нельзя однозначно связать с типом плодоношения и с наличием стадии МП.
Появление ненасыщенных длинноцепочечных ЖК в базидиомах Pleurotus ostreatus и Agaricus bisporus связывают с холодовым шоком, который является необходимым триггером образования плодовых тел [Феофилова и др., 2000]. В то же время отмечена корреляция между появлением МП на поверхности зрелого мицелия L. edodes и началом плодообразования [Александрова и др., 1998]. С этих позиций объяснимо возрастание относительного содержания длинноцепочечных моноеновых ЖК в плодовом теле по сравнению с белым мицелием в случае плодоношения L. edodes F-249 на МП. Однако эта закономерность не прослеживалась при формировании неполноценных плодовых тел у штаммов 2T и NY. Плодообразование у этих штаммов сопровождалось резким увеличением концентрации ЖК с нечетным количеством атомов углерода, в том числе С17:0 у NY и С15:0 у 2Т. Данный факт требует, на наш взгляд, дальнейшего изучения.
На основании результатов проведенного исследования выявлен ряд особенностей, проявляющихся при формировании неполноценных плодовых тел шиитаке в отсутствие МП. Лектиновая активность на стадии неполноценных плодовых тел остается относительно высокой, по величине ТГА соответствует примордиям при нормальном плодоношении и существенно превышает рассматриваемые показатели для зрелого плодового тела. В отличие от плодовых тел, развивающихся на МП, образование деформированных базидиом на белом мицелии не сопровождается увеличением степени ненасыщенности ЖК. Вместе с тем, их формирование коррелирует с увеличением процентного содержания ЖК с нечетным количеством атомов углерода; а также, вероятно, уменьшением активности реакций элонгации, что выразилось в снижении относительного содержания (штамм NY) или полной редукции (штамм 2Т) длинноцепочечных ЖК. По-видимому, совокупность указанных характеристик могла бы служить дополнительным параметром биохимической оценки мицелия в процессе плодообразования. Полученные данные, свидетельствующие о существенных изменениях в направленности реакций синтеза, десатурации и элонгации жирных кислот у неполноценных плодовых тел, могут быть полезны и при обсуждении роли липидов в процессе морфогенеза.
В целом по результатам, описанным в разделе, посвященном участию лектинов шиитаке в морфогенетических процессах, можно прийти к таким заключениям. Прослеживается взаимосвязь активности внеклеточных лектинов шиитаке с формированием коричневой мицелиальной пленки в глубинной культуре, с процессами роста и развития грибного мицелия при твердофазном культивировании, с синтезом соединений, относящихся к важнейшим компонентам химического состава мицелия - липидам и углеводам. Вероятно, лектины Lentinus edodes участвуют в процессе инициации плодообразования.
ектины шиитаке при взаимодействии с экзогенными соединениями
Взаимодействие лектинов с органическими селенсодержащими веществами
Влияние селенсодержащих соединений
на активность внеклеточных лектинов L. edodes
итературные данные свидетельствуют о непосредственном активном участии микроэлемента селена в биохимических и физиологических процессах. Однако отмечается отсутствие достаточно обоснованных сведений о биохимических механизмах действия селена, особенно селенорганических соединений [Whanger, 2002]. Отсутствует какая-либо информация о взаимодействиях селенорганических веществ, рассматриваемых в нашей работе или им структурно подобных, - не только с лектинами, но и с белками вообще. В связи с вышесказанным нами была поставлена задача изучения активности внеклеточных лектинов L. edodes при различных условиях взаимодействия препаратов лектинов с некоторыми соединениями Se. Получение данных по влиянию селеноорганического вещества ДАФС-25, представителя ряда 1,5-ди(4-R-фенил)-3-селенпентандионов-1,5, на лектиновую активность культуры (см. раздел выше) позволило нам перейти к следующему шагу работы, уже с препаратами внеклеточных лектинов культуры.
В ходе экспериментальных и теоретических исследований, описанных в настоящем разделе, помимо препарата ДАФС-25, рассмотрены и другие органические соединения селена (табл. 2).
Таблица 2. Селенсодержащие соединения, рассмотренные в настоящей работе
Номер | Название | R |
I | 1,5-Дифенил-3-селенпентандион-1,5 | H |
II | 1,5-Ди(4-метоксифенил)-3-селенпентандион-1,5 | OCH3 |
III | 1,5-Ди(4-этоксифенил)-3-селенпентандион-1,5 | OC2H5 |
IV | 1,5-Ди(4-н-октилоксифенил)-3-селенпентандион-1,5 | н-OC8H17 |
На основании экспериментов с ДАФС-25 предполагались интересные результаты определения изучаемой биологической активности в реакционных смесях с выделенными из КЖ и очищенными лектинами. При этом можно ожидать, что структура селенсодержащего компонента реакционных смесей, как и его концентрация, окажут значительное влияние на лектиновую активность препарата белка, и что активность продуктов взаимодействия лектина с селенорганическим соединением будет различной в зависимости и от стадии очистки белка после его первоначального выделения из синтетической среды выращивания гриба. Все вышесказанное привело нас к выбору соединений - производных изученного нами ранее 1,5-дифенил-3-селенпентандиона-1,5 (табл. 2) и препаратов двух лектинов (L1 и L2) на трех основных стадиях очистки каждого белка, описанных в соответствующем разделе. В результате Убелковых объектовФ получили шесть, условно обозначив их для целей настоящей работы следующим образом: в последовательности увеличения степени чистоты препарата белка 1, 3, 5 соответствовали L1, а 2, 4, 6 - лектину L2.
В качестве растворителя для соединений ряда 1,5-ди(4-R-фенил)-3-селенпентандионов-1,5 выбрали смешанный растворитель ДМСО : H2O (4 : 1, v/v). Растворы селенорганических соединений I, III, IV в ДМСО использовали в таких максимальных концентрациях (С1), при которых собственная ГА активность ни ДМСО, ни I, III, IV не проявлялась; это также дополнительно контролировалось реакцией гемагглютинации I, III, IV в выбранных концентрациях С1, С2, С3. Минимальная из трех величина С3 равна концентрации соединения I (ДАФС-25) в наших более ранних исследованиях лектиновой активности КЖ, а С2 занимала промежуточное положение.
Изменение характеристик взаимодействия лектинов
с селенорганическими соединениями в зависимости
от стадии очистки препарата лектина
Стадия очистки препарата лектина оказывает наибольшее (если сравнивать с такими характеристиками, как концентрация I, III, IV) влияние на дифференциальный характер взаимодействия внеклеточных лектинов с селеноорганическими соединениями.
Так, в случае вещества I при одной и той же концентрации С1 селенсодержащего соединения титр гемагглютинации меняется от 64 до 1024, возрастая по мере степени чистоты препарата лектина L2, и почти так же резко снижается (от 1024 до 128 при С3) по мере очистки L1. Препарат ДАФС-25, таким образом, в гораздо большей степени повышает лектиновую активность очищенного L2, чем L1, однако для этого требуются относительно высокие концентрации селенового соединения (50 мг/л Se).
Заметно выражено УсродствоФ препарата 1 (неочищенного L1) к соединению III, причем и при самой высокой, и при самой низкой концентрации указанного соединения титр гемагглютинации очень высок (512 и 2048 соответственно). Однако по мере очистки лектина 1 титр ГА в присутствии тех же концентраций этокси-производного (вещество III) становится равным 64. Наоборот, очищенный препарат лектина 2 значительно повышает свою ГА активность при взаимодействии с III (до величины ТГА, равной 512 - заметим, до того же значения, что и неочищенный L1). И снова для этого требуются высокие концентрации (С1) селенового производного III. Самая низкая концентрация и ДАФС-25 (как только что говорилось), и вещества III нисколько не эффективны в отношении стимулирования лектиновой активности очищенного L2: титры ГА 16 и 8 соответственно по сравнению с величиной 32 в отсутствие селенорганических соединений. Не оказывает ингибирующего действия только вещество IV: титр ГА минимум 32, достигает 512 для обоих лектинов после первой стадии очистки. В то же время для IV менее всего из селенорганических соединений выражена зависимость его влияния на лектиновую активность от стадии очистки препарата. Это вещество достаточно индифферентно в отношении наличия примесей в препаратах лектинов 1 - 6, зато наблюдается оптимальная в обсуждаемом аспекте концентрация IV, когда титр ГА равен 512 независимо от степени чистоты лектинов (рис. 4).
Рис. 4. Зависимость лектиновой активности от стадии очистки
препаратов лектинов
при концентрации селенорганических соединений
С2 = 6.33 .10-5 моль/л (5 мг/л Se).
1, 3, 5 - L1; 2, 4, 6 - L2
на трех стадиях очистки
Подобная неспецифичность взаимодействия н-октилокси-производного (вещество IV) c лектинами при наличии явно выраженной концентрационной зависимости реактанта привели нас к мысли о каком-то едином химизме этих процессов, возможно, гидрофобных взаимодействиях с октильным радикалом.
Изменение характеристик взаимодействия лектинов
с селенорганическими соединениями в зависимости
от концентрации селенсодержащих соединений
Зависимость лектиновой активности обоих исследуемых белков на всех трех стадиях их очистки от концентрации селенорганического соединений проходит через максимум лишь в единственном случае соединения IV (рис. 5). Признать возможность мицеллообразования в реакционной среде в данном случае вряд ли правомерно, поскольку после достижения критической концентрации мицеллообразования, ККМ, эффективность взаимодействия, отражаемая параметром ТГА в нашем эксперименте, должна оставаться на постоянном уровне при увеличении концентрации IV. Мы этого не наблюдаем, но тем не менее считаем очень вероятным, что вещество IV, содержащее н-октильный заместитель, более способно к мицеллообразованию по сравнению с I или III. Необходимы специальные исследования с определением ККМ. Наиболее очевиден тот факт, что явная гидрофобность соединения IV по сравнению с остальными изученными селеновыми веществами вносит существенный вклад во взаимодействие с лектинами L. edodes. Соединение IV положительно влияет на активность лектинов и L1, и L2, этот аспект мы обсуждаем также в следующем разделе.
Рис. 5. Зависимость лектиновой активности препаратов лектинов
(1, 3, 5 - L1; 2, 4, 6 - L2 на трех стадиях очистки) от концентрации соединения IV:
С1=6.33 10-4 моль/л (50 мг/л Se)
С2 = 6.33 10-5 моль/л (5 мг/л Se)
С3=6.33 10-6 моль/л (0.5 мг/л Se)
Квантовохимические и QSAR cвойства селенсодержащих соединений
ряда 1,5-ди(4-R-фенил)-3-селенпентандионов-1,5
Электронное и пространственное строение изучаемых селенорганических соединений, их QSAR свойства могут служить предпосылкой наблюдаемого нами химического поведения этих соединений в процессах их взаимодействия с лектинами L. edodes. По данным расчетов на уровне теории B3LYP/6-31G(d,p), позволивших судить о некоторых пространственных параметрах и зарядах на атомах молекул селенсодержащих соединений, электронные и топологические характеристики молекул I-III очень близки между собой. Следовательно, различие во влиянии веществ на ГА способность определяется не остовом молекул (включающим атом Se и фрагмент CH2COAr), а заместителем в положении 4 ароматического кольца (H, OCH3, OC2H5 и н-OC8H17 в случае соединений I, II, III и IV соответственно). При этом положительный заряд на атоме селена свидетельствует о том, что в процессах, в которых селен проявляет себя как антиоксидант, он является электрофильным центром и может взаимодействовать с электроноизбыточными частицами, например молекулами кислорода O2, пероксида водорода H2O2, супероксидным анион-радикалом O2•-, тиолами RSH и др. [Blessing et al., 2004, Jacob et al., 1999]. Примечательная особенность селена состоит в его способности окислять тиолы в восстанавливающих условиях [Turan et al., 1997; Ganther, 1999; Jacob et al., 2003; Blessing et al., 2004].
На окислении тиолов следует остановиться особо. К числу общих свойств лектинов относится в том числе стабилизация углеводсвязывающих участков дисульфидными мостиками. То есть дополнительное образование -S-S- в молекулах исследуемых лектинов вполне может способствовать усилению способности последних к взаимодействию с углеводными структурами эритроцитов, иными словами - увеличению титров ГА.
Для выявления других возможных факторов, влияющих на химическое поведение селенорганических соединений при взаимодействии с лектинами, нами рассчитаны QSAR-свойства [Hasel et al., 1988; Still et al., 1990; Bodor et al., 1989; Gavezotti, 1983; Ghose and Crippen, 1986, 1987; Viswanadhan et al., 1989; Miller, 1990; Ghose et al., 1988] молекул I-IV.
Возможно, различие в реакционной способности селенсодержащих молекул в некоторой степени связано с их дифференциальной гидрофобностью.
Из общих свойств лектинов разного происхождения следует, что углеводы взаимодействуют с лектинами посредством водородных связей, координирования металлов, ван-дер-ваальсовых, гидрофобных взаимодействий [Elagavish and Shaanan, 1997]. Несмотря на преобладающе гидрофильный характер углеводов, гидрофобные взаимодействия играют важную роль в их распознавании лектинами. Особенно примечательно взаимодействие между ароматическими фрагментами аминокислот и галактозой в углеводсвязывающих участках галактозоспецифических лектинов, что приписывается взаимодействию между частично заряженными алифатическими протонами на поверхности кольца гексозы и частичным отрицательным зарядом -электронов ароматической системы [Elagavish and Shaanan, 1997]. Отметим, что L1 и L2 галактозоспецифичны.
Участки гидрофобного связывания вообще очень характерны для лектинов. К ним относят и липидсвязывающие участки, хорошо изученные в случае бактериальных лектинов (адгезинов и токсинов) [Лахтин, 1989]. На примере некоторых бактериальных и вирусных лектинов показано, что липидсвязывающие участки характеризуются выраженными гидрофобными свойствами. Кроме того, можно предположить и особую роль ароматического кольца в структуре исследованных нами селенорганических соединений; наличие этого кольца могло бы оказать дополнительный положительный эффект в отношении углеводсвязывающих свойств лектинов L. edodes. Так, на примере лектинов бобовых показано, что гидрофобные пептиды в составе гидрофобной полости на поверхности лектиновых молекул участвуют во взаимодействии с фенильными и метильными производными сахаридов, поскольку такие пептиды располагаются в непосредственной близости от углеводсвязывающих участков [Лахтин, 1994; Луцик и др,. 1981].
Если согласно [Лахтин, 1994; Луцик и др,. 1981] принять ключевую роль ароматических фрагментов молекул I-IV в связывании с лектинами, то ясно, что остальная часть молекулы по-разному, из очевидных пространственных соображений, влияет на Уарил-лектиновоеФ взаимодействие с результирующим разным титром гемагглютинации реакционной смеси. Вероятно, значительное увеличение длины углеводородной цепи в н-октилпроизводном (IV) может отчасти экранировать участвующий во взаимодействии с гликоконъюгатами эритроцитов арильный участок молекулы IV. Этому способствует гидрофобное взаимодействие, стремящееся уменьшить поверхность контакта между гидрофобной частью молекулы (ароматическим фрагментом и углеводородной цепью) и водой. При этом алкильная цепь может стерически экранировать ароматическое кольцо, препятствуя тем самым взаимодействию с лектином.
Сравнительный анализ реакционной способности
L-цистеина и L-метионина: некоторые теоретические
предпосылки замещения атома серы на селен
Cys и Met - единственные аминокислоты в белках, которые претерпевают обратимое окисление/восстановление в биологических условиях. Окисление серусодержащих боковых цепей Cys и Met кислородными агентами может приводить к окислительным состояниям серы, не способным восстанавливаться в биологических условиях. То есть нужны такие механизмы окисления, которые защищают против переокисления эти кислотные остатки и предотвращают необратимую потерю активности белка. В работе [Jones et al., 2004] показано, что редокс-потенциал стационарного состояния цистеин/цистиновой пары позволяет обепечить мягкое окисление белков без прямого участия более сильных окислителей.
С биохимической точки зрения Se замещает S в определенных цистеиновых фрагментах селенопротеинов. Он отличается от серы редокс-потенциалами и стабильностью в разных степенях окисления, что приводит к множественным каталитическим процессам с его участием [Jacob et al., 1999; Blessing et al., 2004].
Анализ литературы позволяет прийти к выводу, что наиболее вероятный химизм взаимодействия соединений Se с белками (в том числе лектинами) состоит в образовании связей разной прочности с серусодержащими аминокислотами лектинов, вплоть до, возможно, полного замещения серы на селен. Оба лектина L1 и L2 имеют в своем составе заметные количества серусодержащих аминокислот, цистеина и метионина. Представляет интерес рассмотреть эту проблему химизма более подробно, проведя сравнительный анализ реакционной способности L-Cys и L-Met и обсудив некоторые теоретические предпосылки замещения атома серы на селен. Задача сравнительного исследования Met и Cys интересна и в следующем аспекте.
В живых организмах селен обнаружен в составе нескольких индивидуальных соединений, но одной из основных форм существования органического селена в растительных и грибных тканях является селенометионин (SeMet) [Whanger, 2002]. Так, SeMet - преобладающее селенсодержащее соединение обогащенных селеном дрожжей: при стандартизированных условиях выращивания дрожжевых культур около 85% селена содержится в них в виде SeMet [Ip et al., 2000]. Культура пекарских дрожжей Saccharomyces cerevisiae способна ассимилировать до 3 мг/г биомассы Se [Demirci, 1999], при этом более 90% общего Se находится в форме SeМet, а селеноцистеина (SeCys) лишь 0.5% [Schrauzer, 1998; Schrauzer, 2000]. Та же картина наблюдается у высших съедобных грибов - культивируемых базидиомицетов, в том числе наиболее интересующего нас объекта исследований L. edodes. Судя по результатам работ [Yoshida et al., 2005; Ogra et al., 2004], в культуре шиитаке, выращенной на обогащенном селенитом натрия субстрате, основное соединение - SeMet, связанный с белком.
Таким образом, налицо явное УпредпочтениеФ грибными культурами разных систематических групп именно органической формы селена в виде SeMet. Задача, поставленная в данном разделе работы - сравнительное квантовохимическое исследование электронного строения молекул и реакционной способности двух серусодержащих эссенциальных аминокислот - L-Cys и L-Met на начальном этапе взаимодействия с электрофильными реагентами для выяснения предпосылок замещения атома серы на селен именно в молекуле L-Met. Результативным оказался следующий подход:
i) использовали выявленные нами электрофильные свойства атома селена в селенорганических соединениях I-IV как исходное положение, позволяющее предположить возможность УоблегченнойФ димеризации аминокислот в составе белковой молекулы лектина L. еdodes. Это привело к постановке задачи по теоретическому рассмотрению влияния селенсодержащих соединений на формирование дополнительных дисульфидных связей в молекуле лектина. Тиольная группа аминокислоты служит реакционным центром биохимически важных процессов - окислительной димеризации с формированием дисульфидных мостиков [Jacob et al., 1999, 2004; Giles et al., 2003b; Jones et al., 2004], замещения атома серы на селен [Moroder, 2005] и др. Указанные процессы важны для проявления биологической активности определенных классов белков, в том числе лектинов. Как отмечалось в разделе 3.5.1-4, к числу общих свойств углеводсвязывающих белков относится стабилизация сайтов связывания углеводов дисульфидными мостиками;
ii) под влиянием селенсодержащих соединений происходит процесс не только димеризации серусодержащих аминокислот с формированием дополнительных дисульфидных мостиков в белковой молекуле, но и образования селенсодержащих аналогов, SeCys и SeMet, известны и смешанные аналоги. Однако подобные модификации аминокислот, судя по данным литературы, выражены в различной степени у Cys и Met. Для выявления некоторых возможных причин этого мы поставили задачу теоретического рассмотрения полной замены серы на селен с образованием селензамещенных аминокислот. В целом результаты настоящей части работы (электронное строение, поляризуемость, дипольные моменты, липофильность) косвенно подтверждают бльшую склонность Met замещать атом серы на селен в биохимических процессах усвоения последнего по сравнению с Cys.
Положительное влияние изученных селенорганических соединений на активность внеклеточных лектинов необходимо рассматривать в совокупности с таким аспектом, как функционирование системы антиоксидантной защиты (АОЗ) грибов. Об антиоксидантных свойствах селеновых соединений в связи с их влиянием на активность лектинов упоминалось выше (раздел 3.5.1.4). Влияние цистеиновых фрагментов белковой молекулы на биологическую активность и, в частности, на белок-углеводные взаимодействия, предполагающее возможность обратимого окисления-восстановления цистеина в биологических условиях, требует благоприятствующих условий химического окружения и состояния тиольной группы. Вероятно, первоначальный акт взаимодействия в системе Усоединение селена - α-аминокислотаФ, включающий взаимную ориентацию молекул реактантов и образование межмолекулярных водородных связей, служит предпосылкой того, что тиольная группа оказывается способной принимать участие в последующих стадиях (включающих более глубокие химические превращения) биологически значимых реакций.
Увеличение внутриклеточного уровня активных форм кислорода сопряжено с гипероксидантным состоянием клетки, предшествующим процессу клеточной цитодифференцировки [напр., Гесслер и др., 2006]. Неизбежно возникающие в клетке под действием внутренних и внешних факторов активные формы кислорода с одной стороны являются сигнальными молекулами, запускающими механизмы дифференцировки, а с другой стороны они создают необходимость присутствия в клетке системы АОЗ. Защита биологических молекул осуществляется не только ферментами, но и низкомолекулярными соединениями различной химической природы, вступающими в реакцию с активными формами кислорода. Существенную роль в защите клетки от окислительного стресса играют тиоловые соединения. Накапливаются данные о том, что многие тиолсодержащие белки, локализованные на клеточной поверхности и в экстраклеточной жидкости, могут подвергаться редокс-превращениям, откликаясь на изменение редокс-статуса клеточного окружения [Октябрьский и Смирнова, 2007].
Поддержание SH-групп в восстановленном состоянии и образование дисульфидных мостиков в молекуле белка - противоположно направленные реакции при взаимодействии препаратов внеклеточных лектинов с изученными селеноорганическими соединениями. Здесь играет роль соотношение процессов: с одной стороны - стабилизации структуры лектиновых молекул (S=S мостиками), активность которых при этом возрастает (в практическом плане это важно, как нами показано в разделе 3.4, на репродуктивных стадиях развития грибной культуры, особенно в коричневой мицелиальной пленке). С другой стороны - увеличение числа восстановленных тиоловых групп под влиянием антиоксидантных свойств соединений селена способно поддержать АОЗ, важную при окислительном стрессе, сопровождающем смену фаз развития мицелия [напр., Белозерская и Гесслер, 2006].
Ввиду такой неоднородности влияния селенсодержащих веществ неудивительно, что степень проявления эффекта изученных селенорганических соединений на активность лектинов L. edodes различна и зависит не только от природы селенового производного, но и от его концентрации, от содержания примесей в препаратах лектинов (т.е. от стадии их очистки). Тонкий баланс между окислительными и восстановительными молекулами, поддержание экстраклеточного тиол-дисульфидного статуса является важным инструментом регуляции биологической активности, передачи клеточных сигналов, дифференциации [цит. по Октябрьский и Смирнова, 2007].
Взаимодействие лектинов с катионами меди (II)
Хотя медь и является необходимым элементом питания (см. обзор литературы в диссертации), она вызывает окислительный стресс в результате образования свободных радикалов в реакциях Габера-Вайса и Фентона [Halliwell and Gutteridge, 1984; Деви и Прасад, 2005]. В условиях индуцированного металлом окислительного стресса время жизни образовавшихся активных форм кислорода и их токсическое действие контролируются системой актиоксидантной защиты клетки, т.е. соответствующими метаболитами [Mazhoudi et al., 1997; Noctor and Foyer, 1998].
В заключение предыдущего раздела мы уже говорили об известном явлении взаимозависимости окислительного стресса, цитодифференцировки и перехода к репродуктивной стадии развития грибного мицелия, необходимости при этом усиления АОЗ и предполагаемой нами вовлеченности в эти процессы лектинов в связи с их взаимодействием с селенорганическими соединениями. Последние проявляют себя как антиоксиданты и, по всей видимости, при участии лектинов L. edodes могли бы усиливать АОЗ. Интересно выявить результаты взаимодействия лектинов с эффектором противоположного свойства, то есть способствующим углублению окислительного стресса и активизации тех вторичных метаболитов гриба (мы полагаем, и лектинов: см. раздел 3.4 диссертации), которые принимают участие в развитии последствий этого стресса, в конечном итоге в формировании признаков генеративной стадии развития мицелия. Еще раз в ином аспекте подойти к рассмотрению описанной проблемы помогает, на наш взгляд, изучение взаимодействия меди (II) с лектинами шиитаке.
В ряду катионов, представленных выше как последовательность в порядке уменьшения положительного эффекта катионов металлов(II) на активность внеклеточных лектинов шиитаке (Mg>Ca>Cu>Fe>Mn>Zn~Sn>Co>Ni) нас прежде всего заинтересовала медь(II). Было обнаружено, что лишь в случае меди имеет место зависимость Улектиновая активностьЦконцентрация катионаФ, противоположная наблюдаемой для других металлов в настоящей работе: наибольшая активность внеклеточных лектинов проявлялась на среде с максимальным содержанием меди. Можно сформулировать несколько предположений о причинах и последствиях подобного эффекта меди(II):
- добавки ионов меди приводят к усилению биосинтеза внеклеточных лектинов L. edodes, при этом в неодинаковой степени для L1 и L2. Возможно также, что в присутствии Cu2+ имеет место накопление внеклеточных неактивных по гемагглютинации лектинов (например, связанных с металлом в комплекс или неактивных из-за токсического действия металла на грибную культуру). В этом случае удельная лектиновая активность (титр ГА/белок) не должна возрастать, она сохраняется или даже снижается из-за увеличения массы белка;
- значительно повышается активность экстрацеллюлярных лектинов, а прирост белковой массы УотстаетФ - происходит в гораздо меньшей степени. Тогда удельная лектиновая активность заметно возрастает. Сопровождаться такой эффект мог бы активным взаимодействием Cu(II) с внеклеточными лектинами в культуральной жидкости L. edodes. Если бы к тому же катионы меди проявляли УпредпочтениеФ в отношении одного из лектинов, продукция и/или увеличение активности которого стимулируется ионами меди, - это могло бы способствовать дифференциации белков КЖ и иметь положительные последствия для процесса предварительного разделения компонентов КЖ с целью дальнейшей очистки лектинов. Ниже приводим экспериментальное подтверждение своих предположений.
Более подробное исследование в динамике внеклеточной лектиновой активности шиитаке при выращивании на синтетических средах с разными концентрациями Cu2+ (в интервале концентраций катиона от 2.10-4 до 1.10-2 моль/л) проводили, определяя удельную лектиновую активность, достигаемую в КЖ при используемых концентрациях компонентов среды. Наилучший результат получался при концентрации ионов меди (II) в синтетической среде культивирования L. edodes - 1 мМ, D-глюкозы - 300 мМ по углероду, L-аспарагина - 20 мМ по азоту. При возрасте глубинной культуры 14 сут достигалось более чем 8-кратное увеличение удельной лектиновой активности при указанной концентрации Сu2+ по сравнению с более низкими концентрациями меди из приведенного выше интервала значений. Оптимальная концентрация ионов Cu(II) в среде культивирования L. edodes составляет 1.10-3 моль/л, при этом удельная лектиновая активность на 14-е сут культивирования более чем в 2 раза выше, чем в контрольном эксперименте.
Далее мы подтвердили, что ион меди образует с лектинами комплексы, отличающиеся по хроматографическим свойствам. К питательной среде (состоящей из Glc (5.10-2 M) и Asn (1.10-2 M), характеризующейся по нашим данным высокой активностью внеклеточных лектинов L. edodes, был добавлен CuSO45H2O до концентрации 10-2 - 10-4 M. Далее спустя 14 сут выращивания грибной культуры получали фильтрат КЖ и проводили осаждение ацетоном. Более полно произошло осаждение (осадка получилось больше), была обнаружена третья фаза примесных соединений меди, нерастворимая в смесях вода - ацетон. Гель-хроматограммы реакционных смесей были получены для разных концентраций Cu2+, возрастающих от 2.10-4 M до 1.10-2 M. Степень осаждения искомого белка оказалась значительно увеличенной (судя по поглощению при 280 нм, в 7,5 раз по сравнению с контролем в случае 1.10-2 M Cu2+).
Продукты разделения (на Sephadex G-25) фильтрата КЖ L. edodes (выращенного в присутствии сульфата меди указанных выше концентраций), осажденного ацетоном и растворенного в воде, анализировали методом электронной абсорбционной спектроскопии.
Меняется интенсивность и положение полосы 270 нм - ароматическое кольцо, находящееся в сопряжении (B-полоса). При переходе к концентрации Cu(II) от 0 к 1.10-2 М происходит возрастание интенсивности этой полосы. Вероятно, это обусловлено увеличением количества лектина при концентрации Cu(II) до 2.10-3 М. Смещение перегиба на кривой поглощения из области 270 нм в область 230 нм, имеющее место при дальнейшем повышении концентрации меди, слишком велико для неспецифических сольватохромных эффектов. Скорее всего, 230 нм - это уже не B-, а K-полоса ароматического кольца, то есть некие гетероатомы (N, O, S), неподеленные электронные пары которых находились в сопряжении с -системами ароматических колец, координируются с медью и тем самым выключаются из цепи сопряжения. Происходит химическое взаимодействие, вероятно, комплексообразование с медью. Поэтому предположительно при увеличении концентрации меди до 5.10-3 М возрастает количество комплекса меди с лектином. Наконец, концентрация меди(II) 1.10-2 М оказывается достаточно высокой для связывания значительного количества лектина, что приводит к скачкообразному увеличению содержания указанного комплекса. Полученные данные подтверждают приведенную выше информацию о том, что оптимальна в отношении удельной лектиновой активности именно миллимолярная концентрация Cu2+, стимулирующая, очевидно, биосинтез лектина без потери его гемагглютинирующих свойств. Избыточная медь(II) (выше 5.10-3 М) препятствует проявлению лектином этих свойств.
Проведенные эксперименты наводят на мысль, что взаимодействие иона меди (II) с лектинами действительно привело к дифференциации их хроматографических характеристик. Одновременно с параметрами разделения белков при использовании катионов меди в качестве добавки к синтетической питательной среде, изменяется и продукция грибной культурой одного из лектинов (L2), но из-за связывания лектинов медью(II) с увеличением ее концентрации удельная лектиновая активность (титр/белок) проходит через максимум.
Образование хелатов металла с внеклеточными соединениями, часто неидентифицированными, исследователи связывают с адаптацией микроорганизмов к высоким концентрациям металла. Причем предполагается, что клетки выделяют хелатирующие агенты именно при длительном культивировании в присутствии металла, когда последний добавлен в период лаг-фазы [Налимова и др., 2005]. Насколько дифференцировано взаимодействие L1 и L2 с Cu2+, насколько превалирует усиление биосинтеза одного из лектинов (L2, судя по гель-хроматографическим характеристикам)? Как меняется их массовое соотношение с изменением концентрации соли меди в питательной среде? В пределах возможностей метода ответить на эти вопросы помогло нам осуществление рентгенофазового анализа экзолектинов L. edodes. Был проанализирован ряд образцов; порядок перечисления отвечает последовательности стадий выделения и очистки. Образцы 1, 2, 3, 4, 5, 6 получены осаждением ацетоном из фильтрата КЖ. В образце 1 не было меди(II), в образцы 2, 3, 4, 5, 6 в питательную среду добавлялось 5..10-4, 1.10-3, 2.10-3, 5.10-3, 1.10-2 моль/л Cu2+. Образец L1+L2 - промежуточная стадия разделения белков L1 и L2, когда оба они присутствуют в смеси.
Рентгенограммы образцов 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, L1+L2 содержат две группы пиков. Интенсивность пиков первой группы уменьшается от образца 1 к образцу 6, а интенсивность пиков второй возрастает. Первая группа пиков соответствует лектину L1, а вторая - L2. Полученные данные иллюстрирует табл. 3.
Таблица 3.Соотношения (C2/C1) концентраций лектинов L1 и L2
Образец | 1 | 2 | 3 | 4 |
Отношение | 1.00 | 1.65 | 2.27 | 5.18 |
Образец | 5 | 6 | L1+L2 | |
Отношение | 18.4 | 14.8 | 1.33 |
Корректность развитого подхода подтверждается результатами независимого гель-хроматографического исследования со спектрофотометрическим детектированием.
Для образцов L1, L2 пиков, аналогичных остальным образцам, не получено, из чего следует, что лектины L1 и L2 взаимодействуют друг с другом. Отсутствуют также пики, соответствующие свободным углеводам (использованным в качестве стандартных веществ). Таким образом, Glc входит в состав кристаллических форм гликопротеинов.
Следовательно, в данном разделе показано, что:
- Ион меди (II) избирательно взаимодействует с одним из двух внеклеточных лектинов L. edodes. В результате двух возможных процессов - усиления биосинтеза лектинов в присутствии меди (II) и/или участия меди (II) в дифференциации белков КЖ на стадии получения ацетонового осадка белковой природы - в отделенной осаждением части КЖ значительно увеличивается количество только одного (L2) из лектинов.
- Оптимальная концентрация ионов меди (II) в синтетической среде культивирования L. edodes составляет 1.10-3 моль/л, при этом удельная лектиновая активность в 2 раза выше, чем в контрольном эксперименте, а количество не растворимого в ацетоне примесного осадка соединений меди достаточно мало. Более низкие концентрации меди малодейственны, а более высокие характеризуются значительным количеством указанного осадка.
- Предложена и реализована, на примере экзолектинов L. edodes, методология расчета отношения концентраций веществ в образце по данным рентгенофазового анализа с точностью до постоянной величины.
- На основании предложенного подхода можно судить о взаимодействии двух экзолектинов L. edodes между собой, а также о полноте разделения этих белков на разных стадиях их очистки.
Взаимодействие экзолектинов шиитаке с фитогормоном ИУК
Некоторые доказательства участия фитогормона ИУК в процессах морфогенетической дифференциации грибов рода Lentinus, полученные в ходе простых экспериментов, существуют достаточно давно, хотя и описаны в единичных работах [Rypacek and Sladky, 1972, 1973]. Результаты этих исследований подтвердили предположение, высказанное в еще более ранней публикации, посвященной изучению дрожжей [Kamisaka et al., 1967], о том, что гормонально контролируемый механизм регуляции роста имеет много общих особенностей у грибов и высших растений.
Известно, что не только растения и бактерии, но и некоторые микромицеты (Pisolithus tinclorius и Paxillus involutus) способны образовывать связанные формы ИУК [Цавкелова и др., 2006]. ИУК связывается с сахарами, аминокислотами и белками, образуя запасные (неактивные) формы, из которых фитогормон при необходимости высвобождается и восстанавливает свою физиологическую активность [Дерфлинг, 1985]. Имеющейся к настоящему времени информации об ИУК в культуре базидиомицетов посвящен раздел обзора литературы 1.3.3.
На примере Lentinus tigrinus исследователями Rypacek и Sladky еще в 1972-1973 гг. доказано предположение о том, что в дифференциации грибной культуры важное место принадлежит фитогормонам, и что процесс морфогенеза тесно связан с динамикой уровня эндогенных регуляторов роста, в том числе ауксина ИУК. О взаимодействии ИУК с лектинами базидиомицетов сведения в литературе отсутствуют. Для нас представляло интерес выяснить возможность взаимодействия in vitro внеклеточных лектинов и фитогормона, объединить которые можно по признаку участия в морфогенетических процессах грибной культуры.
Для изучения взаимодействия Улектин-ИУКФ использовали образцы лектинов и растворы ИУК в концентрациях 0,001; 0,01 и 0,1 г/л. Препараты двух внеклеточных лектинов (L1 и L2) L. edodes исследовали на трех основных стадиях очистки каждого белка. В результате Убелковых объектовФ - компонентов реакционных смесей получили шесть, условно обозначив их для целей настоящей работы следующим образом: в последовательности увеличения степени чистоты препарата белка 1, 3, 5 соответствовали L1, а 2, 4, 6 - лектину L2. Растворы исходных белковых компонентов (лектины 1 - 6) предполагаемых реакционных смесей готовили так, чтобы они характеризовались по возможности практически одинаковой лектиновой активностью. В качестве растворителя для ИУК выбрали этанол : H2O (1 : 1, v/v). При любой использованной (и даже более высокой) концентрации спиртового раствора ИУК собственная ГАА отсутствовала.
Полученные данные демонстрируют увеличение лектиновой активности в 8-64 раза в системе Улектин-ИУКФ по сравнению с исходными белковыми растворами. Не просматривается явной зависимости результатов взаимодействия ни от концентрации ИУК, ни от степени чистоты препарата лектина. Ясно только, что по мере очистки лектинов титр ГА не снижается (или возрастает). Что касается концентрации ИУК, то оптимальной (по параметру ГАА продуктов взаимодействия ее с лектинами) следует считать 0,01 г/л: для образцов лектинов 1 - 4 и 6 титр ГА в 2-4 раза выше при этой концентрации. Образец 5 (напомним, это очищенный L1) образует продукт взаимодействия с ИУК, характеризующийся титром ГА 1024 независимо от концентрации фитогормона.
Эти результаты наводят на мысль о коцентрационно-насыщаемом взаимодействии в системе Улектин-ИУКФ, приводящем к образованию химически однородных для двух лектинов продуктов взаимодействия. Для дополнительной характеристики указанных систем мы использовали спектрофотометрический метод анализа. Продукты взаимодействия препаратов лектинов и ИУК анализировали методом электронной абсорбционной спектроскопии.
Различия спектров практически не проявляются при разной степени очистки лектина 1. Кривые для лектина 2 в зависимости от стадии его очистки отличались только по интенсивности поглощения и геометрически могли бы быть получены одна из другой параллельным смещением вдоль оси ординат. Оказалось, что комплекс (L1 + ИУК) характеризуется тем же набором максимумов поглощения (200, 220 и 280 нм), однако при ином соотношении интенсивностей.
Меняется интенсивность полосы 280 нм. Она снижается почти в 2 раза при переходе от начальной к конечной стадии очистки лектина 2. При одинаковом, в пределах погрешности измерений, исходном титре ГА это может означать стимулирующее влияние примесных к L2 соединений на процесс взаимодействия лектина с фитогормоном. Вероятно, подобный эффект правомерно назвать положительным каталитическим, поскольку качественные характеристики спектра поглощения сохраняются, и лишь снижается количество продуктов взаимодействия УИУК-L2Ф при удалении примесных соединений. Максимум 220 нм - это, скорее всего, K-полоса ароматического кольца, то есть гетероатомы (N, O, S), азот ИУК, неподеленные электронные пары которых находились в сопряжении с -системами ароматических колец, координируются с лектинами и тем самым выключаются из цепи сопряжения. Происходит химическое взаимодействие, вероятно, комплексообразование с лектинами.
Итак, внеклеточные лектины L. edodes взаимодействуют с фитогормоном ИУК, при этом значительно (в 8 - 64 раза) увеличивается титр гемагглютинации в системе Улектин-ИУКФ. Продукты взаимодействия с ИУК для двух лектинов имеют, вероятно, одинаковую химическую природу.
ВЫВОДЫ
1. В культуральной жидкости и на поверхности мицелия ряда штаммов базидиомицета Lentinus edodes обнаружены лектины, имеющие в зависимости от штамма различную специфичность к углеводам.
2. Культура L. edodes F-249 синтезирует два внеклеточных лектина, различающихся по составу и физико-химическим свойствам. Внеклеточный лектин L1 из L. edodes - гликопротеин с моносубъединичной структурой, молекулярной массой 43 кДа. L1 имеет в своем составе (10,5 1,0) % (m/m) углеводов, представленных глюкозой. Внеклеточный лектин L2 - протеогликан с моносубъединичной структурой, молекулярной массой 37 кДа. L2 содержит в своем составе (90,3 1,0) % (m/m) углеводов, представленных глюкозой (73% (m/m) углеводной части молекулы лектина) и галактозой (27% (m/m) углеводной части молекулы лектина). В L2 высоко содержание Asn: 42% (m/m) от суммы аминокислот. Этот факт наряду с составом углеводной части молекулы (Glc+Gal) позволяет отнести L2 к N-аспарагинсвязанным белкам.
3. Два лектина L1 и L2 различаются по углеводной специфичности. Оба белка специфичны к D-галактозе и D-лактозе при одинаковой для L1 и L2 минимальной ингибирующей концентрации этих углеводов (2,08 мМ Gal; 8,33 мМ Lac). Другие углеводы, к которым лектины проявляют более или менее высокое сродство: для L1 это Rha (4,16 мМ); для L2 - Ara (4,16 мМ) и ManOH (8,33 мМ).
4. Два лектина L1 и L2 различаются по антигенным свойствам, имея при этом общие антигенные детерминанты. Очищенные внеклеточные лектины L. edodes высоко избирательны при узнавании определенных структур на поверхности трипсинизированных эритроцитов кролика, не реагируя с эритроцитами других животных и человека.
5. Установлено, что активность и динамика образования лектинов L. edodes зависят от условий культивирования, а именно: температуры, количества посевного мицелия, возраста культуры, а также от состава среды глубинного культивирования: соотношения количеств углерода и азота, природы компонентов - источников углерода и азота, кислотности среды. Оптимальный состав жидкой среды выращивания с целью получения максимальной лектиновой активности шиитаке включает в качестве источника углерода L-Ara или D-Glc, источника азота - L-Asn.
6. Одним из значимых факторов, влияющих на лектиновую активность глубинной культуры L. edodes, является присутствие в среде культивирования катионов металлов(II). В отношении величин титров гемагглютинации и периодов проявления наибольшей лектиновой активности имеет значение не только концентрация катиона M2+, но и источник углеродного питания грибной культуры. Полученные данные для металлов, образующих эти катионы, позволяют составить следующий ряд в порядке уменьшения положительного эффекта на активность внеклеточных лектинов шиитаке: Mg>Ca>Cu>Fe>Mn>Zn~Sn>Co>Ni. Влияние двухзарядных катионов металлов триады железа на активность внеклеточных лектинов L. edodes изменяется симбатно с энергиями реакций хелатообразования гексааквокомплексов металлов с модельным бидентатным лигандом этиленгликолем.
7. При воздействии неблагоприятных для роста мицелия грибной культуры условий (температурного и питательного стресса) наблюдается значительное увеличение лектиновой активности, что можно связать со стабилизирующей, адаптогенной ролью лектинов L. edodes.
8. Прослеживается взаимосвязь активности внеклеточных лектинов шиитаке с формированием коричневой мицелиальной пленки в глубинной культуре, с процессами роста и развития грибного мицелия при твердофазном культивировании, с синтезом соединений, относящихся к важнейшим компонентам химического состава мицелия - липидам и углеводам, что может свидетельствовать об участии лектинов L. edodes в морфогенетических процессах и инициации плодообразования.
9. Изменения активности внеклеточных лектинов L. edodes при различных условиях взаимодействия препаратов лектинов с соединениями - представителями ряда 1,5-ди(4-R-фенил)-3-селенпентандионов-1,5 в зависимости от структуры селенсодержащего компонента реакционных смесей, его концентрации, от стадии очистки белков, позволяют выявить влияние электрофильных свойств реагента и гидрофобных взаимодействий в химических процессах с участием лектинов. При этом результаты квантовохимических расчетов и QSAR свойства косвенно подтверждают бльшую склонность Met замещать атом серы на селен в биохимических процессах по сравнению с Cys.
10. Выявлено взаимодействие лектинов L. edodes с фитогормоном ИУК, при этом значительно (в 8 - 64 раза) увеличивается титр гемагглютинации в системе Улектин-ИУКФ. Продукты взаимодействия с ИУК для двух лектинов имеют, вероятно, одинаковую химическую природу. Возможность взаимодействия в указанной системе in vivo может основываться на участии обоих компонентов (и лектинов, по данным нашей работы, и ИУК, по литературным данным) в процессах морфогенетической дифференцировки мицелия высших грибов.
11. Впервые из внеклеточных метаболитов Lentinus edodes выделен галактолипид S3, являющийся одним из эндогенных регуляторов активности внеклеточных лектинов L. edodes. Галактолипид представляет собой D-галактопиранозу (15% (m/m) S3 содержат сульфат-Gal), ацилированную остатками октадекановой или нонадекановой кислот в соотношении 28% и 72% (m/m) от суммы двух ЖК соответственно.
12. Предложена методика эффективного разделения двух внеклеточных лектинов L. edodes, основанная на дифференциации их хроматографических свойств в присутствии Cu(II).
Основные работы, опубликованные по теме диссертации:
1. Pankratov A.N., Tsivileva O.M., Nikitina V.E. Laccase of Lentinus edodes catalyzed oxidation of amines and phenolic compounds: a quantum chemical consideration // J. Biochem. Mol. Biol. 2000. Vol. 33, № 1. P. 37-42.
2. Цивилева О.М., Никитина В.Е., Гарибова Л.В., Завьялова Л.А., Игнатов В.В. Гемагглютинирующая активность Lentinus edodes (Berk.) Sing [Lentinula edodes (Berk.) Pegler] // Микробиология. 2000. Т. 69, № 1. С. 38-44.
3. Tsivileva O.M., Nikitina V.E., Garibova L.V., Ignatov V.V. Lectin activity of Lentinus edodes // International Microbiology. 2001. Vol. 4, № 1. P. 41-45.
4. Никитина В.Е., Озерова Р.А., Цивилева О.М. Особенности роста мицелия Lentinus edodes на различных средах // Бюллетень Ботанического сада Саратовского государственного университета. Саратов: Научная книга, 2003. Вып. 2. С. 176-179.
5. Панкратов А.Н., Цивилева О.М., Никитина В.Е., Учаева И.М. Квантовохимическое рассмотрение возможной роли источника азота в связи с активностью внеклеточных лектинов при глубинном культивировании Lentinus edodes // Органические реагенты в организованных средах: Межвузовский сборник научных статей. Вып. 7. Саратов: Научная книга, 2003. C. 220-225.
6. Цивилева О.М., Панкратов А.Н., Никитина В.Е., Гарибова Л.В. Взаимосвязь молекулярной структуры источника азота и активности внеклеточных лектинов при глубинном культивировании Lentinus edodes (Berk.) Sing [Lentinula edodes (Berk.) Pegler] // Микробиология. 2004. Т. 73, № 4. С. 486-490.
7. Никитина В.Е., Цивилева О.М., Гарибова Л.В. Стимуляторы лектиновой активности Lentinus edodes на синтетических агаризованных средах // Биотехнология. 2004. № 3. С. 49-54.
8. Цивилева О.М., Панкратов А.Н., Древко Б.И., Никитина В.Е. Влияние 1,5-дифенил-3-селенпентандиона-1,5 на лектиновую активность глубинной культуры Lentinus edodes // Карбонильные соединения в синтезе гетероциклов: Сборник науч. трудов / Под ред. проф. А.П. Кривенько. Саратов: Научная книга, 2004. C. 301-303.
9. Лощинина Е.А., Цивилева О.М., Никитина В.Е., Панкратов А.Н., Древко Б.И. Влияние селенсодержащего препарата ДАФС-25 на морфолого-культуральные характеристики съедобного гриба шиитаке // Вавиловские чтения - 2004: Материалы Всероссийской научно-практической конф., посв. 117-й годовщине со дня рожд. акад. Н.И. Вавилова. Саратов, 24-26 ноября 2004. Секция физиологии и защиты растений. - Саратов: Изд-во СГАУ, 2004. - С. 36-39.
10. Цивилева О.М., Никитина В.Е., Гарибова Л.В. Влияние состава среды культивирования на активность внеклеточных лектинов Lentinus edodes // Прикл. биохимия и микробиология. 2005. Т. 41, № 2. С. 200-203.
11. Tsivileva O.M., Pankratov A.N., Nikitina V.E., Garibova L.V. Effect of media components on the mycelial film formation in submerged culture of Lentinus edodes (Shiitake) // Food Technol. Biotechnol. 2005. Vol. 43, № 3. P. 227-234.
12. Силина Ю.Е., Кучменко Т.А., Коренман Я.И., Цивилева О.М., Никитина В.Е. Применение полного факторного эксперимента для разработки газового сенсора на основе экстрактов мицелиального гриба Pleurotus ostreatus // Журн. аналит. химии. 2005. Т. 60, № 7. С. 759-764.
13. Цивилева О.М., Никитина В.Е., Панкратов А.Н., Древко Б.И., Лощинина Е.А., Гарибова Л.В. Влияние селенсодержащего препарата ДАФС-25 на рост и лектиновую активность Lentinus edodes // Биотехнология. 2005. № 2. С. 56-62.
14. Цивилева О.М., Никитина В.Е., Макаров О.Е., Гарибова Л.В. Взаимосвязь углеводной специфичности лектинов и углеводного состава мицелия Lentinus edodes (Berk.) Sing [Lentinula edodes (Berk.) Pegler] на разных стадиях морфогенеза // Микробиология. 2005. Т. 74, № 5. С. 714-716.
15. Никитина В.Е., Цивилева О.М., Степанова Л.В., Лощинина Е.А. Поиск группоспецифичных лектинов грибного происхождения // Успехи медицинской микологии. Том V / Под общей научной редакцией акад. РАЕН Ю.В. Сергеева. М.: Национальная академия микологии, 2005. С. 201-205.
16. Pankratov A.N., Tsivileva O.M., Nikitina V.E. A Brief Guide to Mycology Web Resources // Online Information Review. 2006. Vol. 30, № 1. P. 43-52.
17. Цивилева О.М., Никитина В.Е., Гарибова Л.В. Использование двухвалентного марганца при получении посевного мицелия Lentinus edodes // Микология и фитопатология. 2006. Т. 40, вып. 2. С. 142-145.
18. Цивилева О.М., Панкратов А.Н., Лощинина Е.А., Никитина В.Е. Экспериментальное и теоретическое исследование влияния катионов металлов триады железа на активность внеклеточных лектинов Lentinus edodes // Вестник Московского университета. Серия 2. Химия. 2006. Т. 47, № 2. С. 91-96.
19. Степанова Л.В., Цивилева О.М., Никитина В.Е., Лощинина Е.А., Гарибова Л.В., Тюрюкина Е.В. Гемагглютинирующая активность некоторых базидиальных ксилотрофов на стадии дикариотического мицелия // Микология и фитопатология. 2006. Т. 40, вып. 4. С. 307-313.
20. Лощинина Е.А., Никитина В.Е., Цивилева О.М., Степанова Л.В., Пономарева Е.Г., Шелудько А.В. Морфолого-культуральные характеристики базидиомицета Lentinus edodes при совместном культивировании с бактериями рода Azospirillum // Вестник СГАУ. 2006, № 6, вып. 2. С. 24-26.
21. Никитина В.Е., Цивилева О.М., Лощинина Е.А. Взаимоотношения ксилотрофных базидиомицетов и почвенных азотфиксирующих бактерий рода Azospirillum // Успехи медицинской микологии. Том VII / Под общей научной редакцией акад. РАЕН Ю.В. Сергеева. М.: Национальная академия микологии, 2006. С. 293-294.
22. Цивилева О.М., Макаров О.Е., Никитина В.Е., Гарибова Л.В. Изменение жирнокислотного состава общих липидов и лектиновой активности Lentinus edodes в процессе морфогенеза // Микология и фитопатология. 2007. Т. 41. № 5. С. 450-455.
23. Цивилева О.М., Панкратов А.Н., Никитина В.Е., Бычков Н.А., Лощинина Е.А. Влияние некоторых неорганических соединений на активность внеклеточных лектинов гриба Lentinus edodes // Известия Саратовского университета. Новая серия. 2007. Т. 7. Серия: Химия. Биология. Экология. Вып. 1. C. 21-27.
24. Nikitina V.E., Tsivileva O.M., Pankratov A.N., Bychkov N.A. Lentinula edodes Biotechnology - From Lentinan to Lectins // Food Technology and Biotechnology. 2007. Vol. 45, № 3. P. 230-237.
25. Никитина В.Е., Цивилева О.М., Лощинина Е.А., Макаров О.Е., Бабицкая В.Г., Щерба В.В., Пучкова Т.А. Биохимические особенности развития мицелия Lentunus edodes в совместной культуре с диазотрофными бактериями Azospirillum brasilense // Успехи медицинской микологии. Том IX / Под общей научной редакцией акад. РАЕН Ю.В. Сергеева. М.: Национальная академия микологии, 2007. С. 9-12.
26. Пучкова Т.А., Филимонова Т.В., Бабицкая В.Г., Никитина В.Е., Цивилева О.М., Щерба В.В., Иконникова Н.В. Меланиновые пигменты грибов Lentinus edodes и Ganoderma lucidum // Успехи медицинской микологии. Том IX / Под общей научной редакцией акад. РАЕН Ю.В. Сергеева. М.: Национальная академия микологии, 2007. С. 17-20.
27. Бабицкая В.Г., Щерба В.В., Пучкова Т.А., Никитина В.Е., Цивилева О.М., Иконникова Н.В., Смирнов Д.А., Осадчая О.В. Гликопротеины Lentinus edodes: факторы, влияющие на их образование // Успехи медицинской микологии. Том IX / Под общей научной редакцией акад. РАЕН Ю.В. Сергеева. М.: Национальная академия микологии, 2007. С. 142-144.
28. Смирнов Д.А., Щерба В.В., Никитина В.Е., Рожкова З.А., Бабицкая В.Г., Цивилева О.М., Пучкова Т.А., Осадчая О.В. Сравнительное изучение экзо- и эндополисахаридов, образуемых Lentinus edodes при различных способах культивирования // Успехи медицинской микологии. Том IX / Под общей научной редакцией акад. РАЕН Ю.В. Сергеева. М.: Национальная академия микологии, 2007. С. 181-183.
29. Никитина В.Е., Цивилева О.М., Бабицкая В.Г., Щерба В.В., Пучкова Т.А. Современные биотехнологические аспекты глубинного культивирования Lentunus edodes // Успехи медицинской микологии. Том IX / Под общей научной редакцией акад. РАЕН Ю.В. Сергеева. М.: Национальная академия микологии, 2007. С. 247-251.
30. Цивилева О.М., Никитина В.Е. Соединения селена в процессах жизнедеятельности биотехнологически значимых грибных культур // Нетрадиционные природные ресурсы, инновационные технологии и продукты. Cборник научных трудов. Выпуск 16. - М.: РАЕН, 2007. C. 47-58.
31. Лощинина Е.А., Цивилева О.М., Никитина В.Е.., Панкратов А.Н. Жирные кислоты мицелия на разных стадиях морфогенетического развития Lentinus edodes // Современные проблемы теоретической и экспериментальной химии: Сборник научных трудов. Саратов: Научная книга, 2007. C. 116-118.
32. Бычков Н.А., Цивилева О.М., Никитина В.Е., Панкратов А.Н. Способ выделения индивидуальных экзолектинов из жидких сред культивирования базидиомицета Lentinus edodes // Современные проблемы теоретической и экспериментальной химии: Сборник научных трудов. Саратов: Научная книга, 2007. C. 74-76.
33. Бычков Н.А., Панкратов А.Н., Цивилева О.М., Липатов И.А., Никитина В.Е., Древко Б.И. Взаимодействие соединений ряда 1,5-ди(4-R-фенил)-3-селенпентандионов-1,5 с лектинами базидиомицета Lentinus edodes // Современные проблемы теоретической и экспериментальной химии: Сборник научных трудов. Саратов: Научная книга, 2007. C. 331-333.
34. Бычков Н.А., Панкратов А.Н., Цивилева О.М. DFT-исследование взаимодействия L-цистеина с кислотами селена // Современные проблемы теоретической и экспериментальной химии: Сборник научных трудов. Саратов: Научная книга, 2007. C. 337-339.
35. Бычков Н.А., Панкратов А.Н., Цивилева О.М., Былинкина Н.Н., Никитина В.Е. Рентгенофазовый анализ экзолектинов базидиомицета Lentinus edodes // Современные проблемы теоретической и экспериментальной химии: Сборник научных трудов. Саратов: Научная книга, 2007. C. 71-74.
36. Бычков Н.А., Панкратов А.Н., Цивилева О.М. Сравнительный анализ реакционной способности L-цистеина и L-метионина: предпосылки замещения атома серы на селен в биохимических процессах // Современные проблемы теоретической и экспериментальной химии: Сборник научных трудов. Саратов: Научная книга, 2007. C. 328-330.
37. Лощинина Е.А., Цивилева О.М., Никитина В.Е., Макаров О.Е. Экспериментальные предпосылки отнесения пути биосинтеза фитогормона ИУК базидиомицетом Lentinus edodes к триптофанзависимому типу // Вавиловские чтения - 2007: Материалы межд. научно-практ. конф., посв. 120-й годовщине со дня рожд. акад. Н.И. Вавилова. Саратов, 27-30 ноября 2007. Т. 1. - Саратов: Научная книга, 2007. С. 37-38.
38. Ветчинкина Е.П., Никитина В.Е., Цивилева О.М., Гарибова Л.В. Активность внутриклеточных лектинов Lentinus edodes на разных стадиях развития гриба // Прикл. биохимия и микробиология. 2008. Т. 44, № 1. С. 76-83.
39. Никитина В.Е., Цивилева О.М. Способ выращивания съедобных грибов Lentinus edodes // Патент РФ № 2239983. Бюл. изобр. № 32 от 20.11.2004.
40. Цивилева О.М., Никитина В.Е., Кучменко Т.А., Силина Ю.Е., Панкратов А.Н. Биомодификатор для определения фенола и его производных / Положительное решение формальной экспертизы № 2005121083/13(023786). Приоритет от 13.12.2006.
Список сокращений, использованных в автореферате:
аанин - Ala; арабиноза - Ara; аргинин - Arg; аспарагин - Asn; аспарагиновая кислота - Asp; валин - Val; галактоза - Gal; гемагглютинация - ГА; гемагглютинирующая активность - ГАА; гистидин - Hys; гицин - Gly; гутамин - Gln; гутаминовая кислота - Glu; гюкоза - Glc; двухзарядный катион металла - Me2+; диметилсульфоксид - ДМСО; жирные кислоты - ЖК; изолейцин - Ile; иммуноферментный анализ - ИФА; инозит - Ino; культуральная жидкость - КЖ; актоза - Lac; ейцин - Leu; мальтоза - Mal; маннит - ManOH; манноза - Man; метионин - Met; пигментированная мицелиальная пленка - МП; рамноза - Rha; ростовой коэффициент - РК; сахароза - Suc; титр гемагглютинации - ТГА; триптофан - Trp; фенилаланин - Phe; фосфатно-солевой буфер - PBS; фруктоза - Fru; целлобиоза - Cel; цистеин - Cys; эектрофорез в полиакриламидном геле с додецилсульфатом натрия - SDS-PAGE; этиленгликоль - EG; Quantitative Structure - Activity Relationships (количественные соотношения структура - активность) - QSAR
Авторефераты по всем темам >> Авторефераты по биологии