Geum.ru
Авторефераты по всем темам  >>  Авторефераты по биологии  

На правах рукописи

Мостович Людмила Андреевна

РЕГУЛЯЦИЯ ЭКСПРЕССИИ ГЕНА D-ГЛЮКУРОНИЛ С5-ЭПИМЕРАЗЫ В ОПУХОЛЕВЫХ КЛЕТКАХ МОЛОЧНОЙ И ПРЕДСТАТЕЛЬНОЙ ЖЕЛЕЗЫ ЧЕЛОВЕКА

03.01.04 - биохимия

А В Т О Р Е Ф Е Р А Т

диссертации на соискание ученой степени

кандидата биологических наук

Новосибирск - 2012

Работа выполнена в ФГБУ НИИМББ СО РАМН (Новосибирск, Россия)

Научный руководитель

кандидат биологических наук  Григорьева Эльвира Витальевна

Официальные оппоненты:

Душкин Михаил Иванович  доктор медицинских наук, профессор,

ФГБУ НИИ терапии СО РАМН, заведующий лабораторией Молекулярно-клеточных механизмов терапевтических заболеваний

Макарова Светлана Ивановна  кандидат биологических наук, ФГБУ НИИМББ СО РАМН, старший научный сотрудник  аборатории Метаболизма лекарств и фармакокинетики 

Ведущая организация: ФГБУН ИМКБ СО РАН (Новосибирск)

Защита диссертации состоится л____________2012 г. в ____ часов на заседании диссертационного совета Д. 001.034.01 в ФГБУ НИИ биохимии СО РАМН по адресу: г. Новосибирск, ул. Тимакова, 2; тел. 8 (383) 333-54-81.

С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке ФГБУ НИИ биохимии СО РАМН.

Автореферат  разослан л___ _________2012 г.

Ученый секретарь диссертационного совета  Русских  Галина Сергеевна

Общая характеристика работы

Актуальность темы. D-глюкуронил С5-эпимераза является ключевым ферментом биосинтеза гепарансульфат протеогликанов (ГСПГ), которые представляют собой класс сложных биологических молекул, состоящих из корового белка и одной или нескольких полисахаридных  цепей гликозаминогликанов (ГАГ). Благодаря структурной сложности и разнообразию ГСПГ  выполняют множество различных функций в организме - во внеклеточном матриксе, помимо структурной функции, они участвуют в межклеточных взаимодействиях, во взаимодействиях клетки с внеклеточным матриксом, процессах адгезии и миграции; на поверхности клеток осуществляют сигнальные функции, выступая в качестве рецепторов и корецепторов для различных факторов роста и цитокинов. Функции протеогликанов во многом обусловлены модификациями углеводных цепей гликозаминогликанов, включающими N- и О-сульфатирование по разным положениям и эпимеризацию D-глюкуроновой кислоты (GlcA) в L-идуроновую кислоту (IdoA), которая повышает гибкость полисахаридных цепей гепарансульфат протеогликанов, обеспечивая их эффективное взаимодействие с лигандами. Изменение соотношения IdoA/GlcA наблюдается при злокачественной трансформации различных тканей и клеток (Mikami et al, 2001; Loussouarn et al, 2008).  За процесс эпимеризации уроновых кислот отвечает фермент D-глюкуронил С5 эпимераза (GLCE), играющий важную роль в процессах морфогенеза и жизнедеятельности живых организмов - мыши, нокаутные по гену GLCE, погибают сразу после рождения и имеют дефекты развития почек, легких и скелета (Li et al, 2003).

Ранее в нашей лаборатории было показано, что экспрессия GLCE значительно снижена в большинстве злокачественных опухолей молочной и предстательной железы человека и в клетках мелкоклеточного рака легкого (Grigorieva et al, 2008; Прудникова, 2009). Эктопическая экспрессия GLCE подавляла пролиферативную активность опухолевых клеток молочной (Prudnikova et al, 2010) и предстательной желез человека (Прудникова, 2009), мелкоклеточного рака легкого in vitro и рост экспериментальных опухолей  in vivo (Grigorieva et al, 2011). Полученные данные впервые позволили охарактеризовать GLCE  в качестве нового гена супрессора опухолевого роста, однако молекулярные механизмы антипролиферативного действия эпимеразы и причины снижения уровня экспрессии этого гена в опухолевых клетках оставались неизученными.

Известно несколько молекулярных механизмов, обеспечивающих эпигенетическую инактивацию генов супрессоров опухолевого роста. Одними из самых распространенных механизмов являются гиперметилирование промоторной области гена, приводящее к снижению уровня его экспрессии в клетке, и эпигенетическая регуляция экспрессии гена на уровне хроматина, которая  определяется степенью модификации гистонов (ацетилирование, фосфорилирование, метилирование, убиквинтинирование) и, как следствие, структурой нуклеосом (Veeck et al, 2010). Немаловажную функцию в регуляции экспрессии генов играет также активность различных факторов транскрипции. Кроме того, регуляция активности генов может осуществляться и на пост-транскрипционном уровне малыми РНК - наиболее древний и консервативный механизм,  называемый РНК-интерференцией (Bartels et al, 2009). 

Поскольку молекулярные механизмы регуляции экспрессии гена D-глюкуронил С5-эпимеразы на данный момент практически неизучены, особую актуальность имеет поиск причин инактивации D-глюкуронил С5-эпимеразы в опухолевых клетках, а также определение возможных молекулярных механизмов ее антипролиферативного действия.

Цель работы: оценить влияние D-глюкуронил С5-эпимеразы на экспрессию генов, участвующих в процессе канцерогенеза, и определить возможные молекулярные механизмы ее регуляции в опухолевых клетках и тканях.

Задачи исследования:

  1. Определить влияние D-глюкуронил С5-эпимеразы на экспрессию генов, участвующих в процессе канцерогенеза в опухолевых клетках молочной, предстательной желез и рака легкого человека.
  2. Определить статус метилирования промоторной области гена D-глюкуронил С5-эпимеразы в опухолях молочной и предстательной желез человека.
  3. Изучить влияние изменения структуры хроматина на экспрессию D-глюкуронил С5-эпимеразы в опухолевых клетках.
  4. Определить роль факторов транскрипции  TCF4 и -катенина в регуляции экспрессии D-глюкуронил С5-эпимеразы в опухолевых клетках.
  5. Оценить вклад микроРНК-218 в регуляцию экспрессии D-глюкуронил С5-эпимеразы в опухолевых клетках.

Научная новизна работы

В данной работе впервые было показано, что:

  1. Восстановление экспрессии D-глюкуронил С5-эпимеразы в клетках рака молочной и предстательной желез и мелкоклеточного рака легкого человека приводит к изменению экспрессии генов, участвующих в молекулярных механизмах ангиогенеза и инвазии/метастазирования,
  2. регуляция экспрессии  эпимеразы осуществляется как на транскрипционном, так и на пост-транскрипционном уровне через сложный комплекс эпигенетических механизмов регуляции экспрессии генов
  3. в отличие от других генов-супрессоров развития опухоли, метилирование не играет роли в регуляции экспрессии D-глюкуронил С5-эпимеразы в опухолевых тканях молочной и предстательной  желез человека
  4. степень модификации гистонов Н3К9Ас и Н3К4Ме3 влияет на  экспрессию D-глюкуронил С5-эпимеразы в опухолевых клетках молочной  железы человека
  5. экспрессия D-глюкуронил С5-эпимеразы в опухолевых клетках молочной железы  in vitro и опухолях in vivo коррелирует с уровнем экспрессии TCF4 и -катенина
  6. микроРНК-218 приводит к снижению экспрессию белка D-глюкуронил С5-эпимеразы в клеточных культурах рака молочной и предстательной желез in vitro

Практическая значимость

Данная работа носит преимущественно фундаментальный характер и представляет собой определение возможных молекулярных механизмов антипролиферативного эффекта и инактивации  D-глюкуронил С5-эпимеразы в опухолевых  клетках человека. Однако результаты исследования показали и возможность практического применения полученных данных для создания нового метода дифференциальной диагностики различных опухолей и выбора оптимальной стратегии лечения пациентов. Так, в ходе работы была показана активация экспрессии гена D-глюкуронил С5-эпимеразы ингибитором гистоновых деацетилаз трихостатином А, который в настоящее время активно применяется в клинической практике в качестве антиопухолевого препарата. Диагностическое определение уровня экспрессии D-глюкуронил С5-эпимеразы будет иметь важное значение для определения группы пациентов, для которых показано лечение этим препаратом.

Наряду с  возможным использованием D-глюкуронил С5-эпимеразы в качестве нового дифференциального диагностического маркера, интересные перспективы связаны со способностью эпимеразы регулировать процессы опухолевого ангиогенеза и инвазии/метастазирования, что позволит рассмотреть возможность создания на ее основе нового анти-ангиогенного и /или антиметастатического препарата для лечения злокачественных новообразований.

Положения, выносимые на защиту:

  1. Эктопическая экспрессия D-глюкуронил C5-эпимеразы в опухолевых клетках рака молочной и предстательной желез и мелкоклеточного рака легкого человека приводит к изменению активности генов канцерогенеза, продукты которых участвуют в молекулярных механизмах ангиогенеза и инвазии/метастазирования.
  2. Тканеспецифичное  действие эпимеразы заключается в регуляции экспрессии различных генов-супрессоров опухолевого роста (рак молочной железы) или факторов роста и их рецепторов (клетки мелкоклеточного рака легкого)
  3. В опухолевых тканях молочной и предстательной желез не обнаружено гиперметилирование промоторной области гена  D-глюкуронил С5-эпимеразы
  4. Степень ацетилирования и метилирования лизиновых остатков гистонов Н3 влияет на экспрессию D-глюкуронил С5-эпимеразы в опухолевых клетках молочной  железы человека зависит от.
  5. Экспрессия D-глюкуронил С5-эпимеразы в культуре опухолевых клеток in vitro и опухолях молочной железы in vivo положительно коррелирует с уровнем экспрессии TCF4/-катенин-транскрипционного комплекса
  6. МикроРНК-218  регулирует уровень белка  D-глюкуронил С5-эпимеразы в опухолевых клетках молочной и предстательной желез in vitro

Апробация работы

Результаты работы были представлены и обсуждены на V региональной конференции молодых ученых-онкологов им. академика РАМН Н.В.Васильева Актуальные вопросы экспериментальной и клинической онкологии (Томск, Россия, 2010); на 1 Британской Конференции по изучению рака молочной железы человека (1st British Breast Cancer Research Conference;  Ноттингем, Великобритания, 2010); на XXIII Международной зимней молодежной научной школе "Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии" (Москва, Россия, 2011); на 16 Всемирном Конгрессе по Современным Достижениям в Онкологии и 14 Международном Симпозиуме по Молекулярной Медицине (16th World Congress on Advances in Oncology and 14th International Symposium on Molecular Medicine; Родос, Греция, 2011); на 8 Европейской конференции по исследованию рака молочной железы (8th European Breast Cancer Conference, Вена, Австрия, 2012).

Публикации: По материалам диссертации опубликовано 7 печатных работ.

Структура работы: Диссертационная работа изложена на 105 страницах машинописного текста с полуторным интервалом, состоит из 6 разделов: введение, обзор литературы, материалов и методов, результатов, и обсуждения результатов, выводов, а так же списка цитируемой литературы, содержащего 2 отечественных и 131 зарубежных источника. Работа иллюстрирована 1 таблицей и 37 рисунками.

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

Для исследования механизмов регуляции D-глюкуронил С5-эпимеразы в опухолевых тканях человека было использовано по 19 образцов опухолей и наименее измененных удаленных участков молочной железы одного и того же пациента, и 20 образцов опухолей предстательной железы, удаленных в ходе хирургического вмешательства. Образцы замораживались жидким азотом и хранились при -70 C. Операционный материал получали в Городской Клинической Больнице N1 г. Новосибирска, забор образцов молочной железы проводили под контролем д.м.н., проф. С В.Сидорова, образцов рака предстательной железы - под контролем  к.м.н. И.С.Кунина, диагноз верифицирован гистологическим исследованием. Участки ткани для анализа отбирались таким образом, чтобы доля опухолевых клеток составляла более 70% ткани. Преобладающим гистологическим типом опухолей молочной железы являлся протоковый инфильтрующий рак, опухолей предстательной железы - карцинома предстательной железы. Большинство исследованных пациентов находились на второй стадии прогрессии злокачественного процесса в случае рака молочной железы и на второй  и третьей стадии прогрессии злокачественного процесса в случае рака предстательной железы. Забор материала проводился с согласия больных и протоколировался по стандартам этического комитета Российской Федерации. Эксперименты соответствовали этическим стандартам биоэтического комитета НИИ МББ СО РАМН, разработанными в соответствии с Хельсинской декларацией Всемирной ассоциации Этические принципы проведения научных медицинских исследований с участием человека с поправками 2000 г. и Правилами клинической практики в Российской Федерации, утвержденными Приказом Минздрава РФ № 266 от 19.06.2003 г. Все лица, участвующие в исследовании, дали письменное информированное согласие на участие в исследовании.

Для исследования действия D-глюкуронил С5-эпимеразы на экспрессию генов канцерогенеза in vitro были использованы клеточные культуры рака молочной железы (MCF7),  клеток мелкоклеточного рака легкого  (U2020), рака предстательной железы (PC3, Du-145 и LnCaP) человека, стабильно трансфецированные плазмидой без вставки гена (epi-pCEP4 или pETE) либо плазмидой, содержащей ген  GLCE (epi-pCEP4 или epi-pETE). Культуры клеток были получены в Каролинском институте (Стокгольм, Швеция). Клетки культивировали в среде IMDM, содержащей 2мМ L-глютамин, 100ед. пенициллина, 100 мкг/мл стрептомицина и 10% (v/v) фетальной бычьей сыворотки, в 5% CO2 атмосфере при 37С.  Для анализа клетки снимали с поверхности с использованием смеси трипсин/ЭДТА по стандартному протоколу, промывали трижды в фосфатно-солевом буфере, фиксировали в RNA-later и хранили при -20С.

Суммарную РНК выделяли с использованием RNAqueous Micro Kit (Applied Biosystems, США) либо PureLink Total RNA Purification System (Invitrogen, США) согласно инструкции производителя, концентрацию РНК оценивали с помощью набора реактивов Quant-iT Assay Kit для количественного определения РНК на приборе Qubit (Invitrogen, США), качество оценивали с помощью электрофореза. кДНК синтезировали из 1Ц2 мкг общей РНК с использованием набора реактивов First Strand cDNA Synthesis (Fermentas, Канада).

Для определения возможных механизмов противоопухолевого действия гена GLCE использовали набор реактивов Cancer PathFinder RT2 ProfilerЩ PCR Array (SABioscience, США). ПЦР в реальном времени проводили в соответствии с руководством пользователя RT2 Profiler PCR Array System, используя SYBR Green PCR Master Mix (Fermentas, Канада) в iCycler iQ5 Multicolor Detection System (Bio-Rad, США). Полученные результаты анализировали программой Excel-based PCR Array Data Analysis Software (SABioscience, США).

Анализ экспрессии генов GLCE, TCF4 и CTNN1 в опухолевых клетках и тканях молочной и предстательной желез проводили при помощи мультиплексной ПЦР на амплификаторе Терцик (Компания "ДНК Технологии", Россия). Объем реакционной смеси составлял 10 мкл, с добавлением ~100 нг кДНК, 1 мкл 10x ПЦР-буфера, 10 пмоль каждого праймера, 0,1 ммоль каждого дезоксинуклеозидтрифосфата и 1 ед. акт. Taq-ДНК-полимеразы. Амплификацию проводили в течение 10 циклов для генов эпимеразы и TCF4 и 7 циклов для гена CTNN1, после чего в реакционную смесь добавляли праймеры для GAPDH и проводили еще 22 цикла амплификации, при температуре отжига праймеров для GLCE  59оС и 55оС для TCF4 и CTNN1. Продукты ОТ-ПЦР анализировали электрофорезом в 1,5 % агарозном геле, который окрашивали бромистым этидием, сканировали с помощью видеосистемы DNA Analyzer (Россия). Денситометрию проводили с помощью программы Total Lab (Великобритания). Содержание мРНК GLCE, TCF4 и CTNN1 оценивали в относительных единицах как отношение интенсивности окрашивания специфической полосы исследуемых генов к интенсивности полосы гена домашнего хозяйства.

Количественную ПЦР в реальном времени проводили с использованием Custom GLCE TaqMan Assay (Applied Biosystems, США) на приборе  BioRad IQ5 Multicolor Real-Time PCR Detection System (BioRad, США). Реакционная смесь содержала ~100 нг кДНК, 1х TaqMan Universal PCR Master Mix (AppliedBiosystems, США), по 100нМ каждого праймера, 250нМ пробы. Реакцию проводили при следующих условиях: 95C - 3амин;  95C - 15 сек, 60C - 60 сек, - 40 циклов. Общий объем реакции составлял 25 мкл. Каждую реакцию проводили трижды, результат представлен в виде среднего значения + ошибка среднего.

Для определения статуса метилирования промоторной области  D-глюкуронил С5-эпимеразы были использованы методы метил-специфичной ПЦР и бисульфитного секвенирования. Для этого выделяли геномную ДНК с помощью  E.Z.N.А. DNA isolation kit (Zymo Research, USA), для бисульфитной обработки использовали E.Z.N.A. DNA methylation kit (Zymo Research, USA) в соответствии с инструкцией производителя. Геномную ДНК, обработанную бисульфитом, использовали для проведения метил-чувствительной амплификации ДНК фрагмента промоторной области с использованием двух различных пар праймеров Met и Unmet, специфичных к метилированоой или неметилированной последовательности промоторной ДНК, соответственно. Объем реакционной смеси составлял 30 мкл, она содержала ~ 75нг ДНК, 2x ПЦР-буфера для DreamTag-ДНК-полимеразы (Fermentas, Канада), 10 пкМ каждого праймера, 0,1 ммоль каждого дезоксинуклеозидтрифосфата, ДМСО 3 %и 1 ед. акт. Dream Taq-ДНК-полимеразы. Амплификация проводилась при следующих условиях: 40 циклов при температуре отжига праймеров при 65оС для праймеров unmet, 63оС для праймеров met. Продукты амплификации анализировали электрофорезом в 10% ПААГ или в 3% агарозном геле.

Амплификацию фрагмента ДНК  GLCE для бисульфитного секвенирования проводили с использованием праймеров, специфичных для последовательности CpG-островков гена  GLCE, в качестве матрицы использовалась геномная ДНК после бисульфитной обработки. ПЦР проводилась при следующих условиях: 94C  2 мин, 94C  30 с, 56C  30 с и 72C  1 мин, последний этап элонгации 72C  10 мин, 35 циклов. Общий объем реакции составлял 30мкл. Продукт ПЦР был очищен с помощью DNA Clean and Concentrator Kit (Zymo Research Corporation, США) и клонирован в  TOPO-вектор с использованием TOPO TA Cloning Kit for Sequencing (Invitrogen BV, Нидерланды) в соответствии с инструкциями производителя. Плазмидная ДНК была выделена с помощью Zyppy Plasmid Miniprep Kit (Zymo Research Corporation, США) в соответствии с инструкциями производителя. Для секвенирования был использован BigDye Terminator Cycle Sequencing Ready Reaction kit v1.1 и ABI Prism 3100 Genetic Analyzer (Applied Biosystems, США) в соответствии с инструкциями производителя. Для каждого образца было проанализировано 7-8 клонов.

Уровень экспрессии микроРНК-218 в образцах определяли методом ПЦР в реальном времени с использованием TaqMan microRNA assay (Invitrogen, США) согласно рекомендациям производителя. Выделение суммарной РНК проводили при помощи Trizol Reagent (Invitrogen, США). В обратную транскрипцию брали от 1 до 10 нг РНК, реакцию проводили в 15 мкл буфера для обратной транскрипции (50 мМ трис-HCl, pH 8,3, 3 мМ MgCl2, 75 мМ KCl, 10 мМ DTT), 0,5 ммоль каждого дезоксинуклеозидтрифосфата (включая dTTP), 50 ед. акт. обратной транскриптазы (MultiScribeЩ Reverse Transcriptase) и 10 пмоль праймеров 5xRT при следующих условиях: 30мин 16оС , 30 мин при 42оС, 5 мин при 85оС. Реакционная смесь для ПЦР содержала продукт обратной транскрипции, TaqMan Universal PCR Master Mix, TaqMan MicroRNA Assay, общий объем реакционной смеси составлял 20 мкл, амплификацию проводили при следующих условиях: 50C - 2амин;  95C - 10 мин, 95C - 15 сек, 60C - 60 сек, - 40 циклов.

Детекцию белка  D-глюкуронил С5- эпимеразы проводили при помощи метода Вестерн-блота. Белки разделяли электрофорезом по Лэммли (Mini-Protean II Cell-System, Bio-Rad, США), переносили на PVDF мембрану и инкубировали  с поликлональными антителами против  GLCE человека (GenScript Corp., США). Визуализацию проводили с использованием системы Opti-4CN Substrate Kit (Bio-Rad, США).

Для хроматиновой иммунопреципитации использовали набор реагентов MAGnify Chromatin Immunoprecipitation System (Invitrogen, США) и ChIP-grade моноклональные антитела к различным изоформам гистона Н3 - H3K9Ac,  H3K9Me3 или  H3K4Me3 (Abcam, UK). Для анализа использовали ~106 клеток на 10 ChIP-реакций. Анализ соосажденых ДНК фрагментов регуляторной последовательности гена эпимеразы после хроматиновой иммунопреципитации проводили при помощи ПЦР с праймерами GLCE ChIP C и GLCE ChIP 1 на амплификаторе Терцик (Компания "ДНК Технологии", Россия). Объем реакционной смеси составлял 10 мкл, ~100нг ДНК, 1 мкл 10x ПЦР-буфера,  0,1 ммоль каждого дезоксинуклеозидтрифосфата, 10 пмоль каждого праймера и 1 ед.акт. Taq-ДНК-полимеразы. Амплификацию проводили в течение 30 (для участка С) или 34 (для участка 1) циклов. Анализ продуктов ПЦР проводили методом вертикального гель-электрофореза в 8% ПААГ геле и анализировали при помощи видеосистемы DNA Analyzer (Москва) и программы Total Lab (Великобритания). Степень взаимодействия модифицированных гистоновых белков с участками промоторной области гена эпимеразы оценивали как отношение интенсивности окрашивания специфической полосы к интенсивности полосы контрольного нанесения.

Статистическую обработку результатов: среднее, ошибка среднего, оценка достоверности по критерию Манна-Уитни, коэффициент корреляции Спирмена рассчитывали при помощи компьютерной программы ORIGIN Pro 8.0.

РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ

Влияние эктопической экспрессии D-глюкуронил С5-эпимеразы на экспрессию генов, участвующих в процессе канцерогенеза

Ранее в нашей группе было показано снижение экспрессии гена D-глюкуронил С5-эпимеразы (GLCE)  в большинстве образцов опухолвых тканей молочной и предстательной железы человека. Также было показано. Что ген GLCE  проявляет свойства гена-супрессора опухолевого роста. Однако механизмы антиопухолевого эффекта и инактивации GLCE  в опухолевых клетках оставались неизученными

Для того чтобы определить возможные молекулярные механизмы антипролиферативного действия D-глюкуронил С5-эпимеразы, был проведен сравнительный анализ уровня экспрессии 84 генов, вовлеченных в процесс канцерогенеза, в исходных опухолевых клетках MCF7 (трансфецированных контрольной плазмидой) и в клетках GLCE-MCF7, экспрессирующих эпимеразу (стабильно трансфецированных плазмидой, содержащей ген  GLCE), для чего был использован набор реагентов Cancer PathFinder RT2 ProfilerЩ PCR Array (Рис.1).

Рисунок 1. Гены, экспрессия которых наиболее значительно изменена в клетках GLCE-MCF7, активно экспрессирующих D-глюкуронил С5-эпимеразу человека, по сравнению с исходными клетками  MCF7.

Наиболее значимые изменения уровня экспрессии генов канцерогенеза в клетках GLCE-MCF7 под действием эктопической экспрессии D-глюкуронил С5-эпимеразы можно приблизительно отнести к 3 основным механизмам:

1. усиление экспрессии генов супрессоров опухолевого роста -  р53 (+3.3 раза), BRCA1 (+3.5 раза), SYK (+8.1 раза) и транскрипционного фактора E2F1 (+3.00 раза);

2. изменение уровня экспрессии генов, отнесенных к молекулярным механизмам ангиогенеза -  IL8 (+4,6 раза), IFNB1 (+3,9 раза), TNF ( +4,6 раза) и TGFB1 (-5,7 раза);

3. усиление экспрессии генов-супрессоров метастазирования SYK (+8.1 раза) и NME1 (+3.96 раза) и снижение экспрессии метастаз-ассоциированного гена S100A4 (-4.6 раза).

Повышение экспрессии эпимеразы в клетках рака предстательной железы затрагивает в разной степени все рассмотренные молекулярные пути, однако наибольшие изменения экспрессии происходят среди генов, участвующих в процессах

ангиогенеза - VEGFA (-6,3 раз), THBS1 (+5,9 раз), TGFBR1 (+9,6 раз), IGF1 (+18,7 раз), FGFR2 (+12,3 раз), ANGPT (+17,4 раз);

инвазии и метастазирования - TIMP3 (+7,2 раз), TIMP1 (-2,4 раз), TWIST1 (+5,3 раз), MMP2 (+17,2 раз), MMP9 (+13,3 раз) и MMP1 (-3,5 раз).

В меньшей степени изменялась экспрессия генов, относящихся к процессам адгезии (ITGA4 (+9,2 раза), MCAM (+8,1 раз)) и регуляции клеточного цикла (CDC25A (+24,5 раз), CDK2 (+7,3 раза), E2F1 (+12,8 раз)).

Также анализ изменения экспрессии генов канцерогенеза в зависимости от экспрессии GLCE был проведен и для другой клеточной линии рака предстательной железы  LNCaP. Как и в случае с клетками PC3, в клетках LNCaP, стабильно экспрессирующих эпимеразу, наибольшие изменения экспрессии наблюдались среди генов, участвующих в процессах ангиогенеза и инвазии/метастазирования.

При эктопической экспрессии эпимеразы в клетках мелкоклеточного рака легкого  U2020 происходило изменение экспрессии 32 генов, относящихся главным образом к процессам

инвазии и метастазирования - MMP2 (-8.3 раза), MTA1 (-4.3 раза), PLAU (-4.3 раза), TIMP3 (-3 раза), S100A4 (-2.4 раза), SERPINE1 (-2.4раза) и TWIST1 (-3.7раза);

апоптоза - TERT (-4.5 раза), APAF1 (-2.4 раза), HTATIP2 (-3.5 раза),  TNFa и его рецепторы TNFRSF10B, TNFRSF1A и TNFRSF25 (в 3Ц4 раза);

и  ангиогенеза - VEGF-A (-6.2 раза), TGFB1 (- 3.1 раза), FGFR2 (-3.2 раза), PDGF-A и PDGF-B (-2.4 раза), коллаген XVIII (-2.4 раза).

Хотя наиболее значительные изменения относились к изменению экспрессии ряда факторов роста и их рецепторов (в первую очередь связанных с ангиогенезом), в клетках epi-U2020 изменялась также экспрессия некоторых генов, вовлеченных и в другие молекулярные механизмы канцерогенеза: снижалась экспрессия генов регуляции клеточного цикла E2F-1 (2.4-раза) и p21 (4.1-раза), генов, участвующих в процессах адгезии ITGA3 (2.7 раза) и MCAM (2.4 раза) и вовлеченных в сигнальную трансдукцию SNCG (6.2 раза), HER-2 (2.4-раза), Jun (3.2-раза), AKT1 (3.2-раза).

Также нами было исследовано влияние эпимеразы на изменение экспрессии генов канцерогенеза  в экспериментальной системе in vivo. Было проведено сравнение  относительных уровней экспрессии генов, участвующих в процессах канцерогенеза, в  неразвившихся опухолевых образованиях в месте инокуляции клеток (эпимераза экспрессируется) и в выросших экспериментальных опухолях U2020 (эпимераза инактивирована). Согласно полученным данным, эктопическая экспрессия GLCE в клетках U2020, приводящая к подавлению роста экспериментальных опухолей, сопровождалась изменением экспрессии 26 генов, относящихся в основном к молекулярным путям

ангиогенеза - IGF1 (+273 раза), IFNA1 (+3,4 раз), IFNB1  (+2,5 раз), TGFB1 и FGFR2 (+2,1 раза), PDGFA (-11,8 раз),  ANGPT1 (-3,6 раз) и THBS1 (-2,8 раз) и

апоптоза - HTATIP2 (+54 раза), BCL2 (+31 раз), TNF (+25,7 раз), TNFRSF6 (+8,4 раз), TNFRSF10B (-6,7 раз), BCL2L1 (+2,1 раз), CFLAR (+27,2  раза). 

Кроме того, в меньшей степени были изменены уровни экспрессии генов, участвующих в адгезии - ITGA1 (+3,2 раз), ITGA3 (+2,5 раз), ITGB5 (-7,9 раз), ITGB3 (-2,8 раз) и инвазии/метастазирования - SNCG (+2,7 раз), NME1 (+2,3 раз), MMP9 (-3,9 раз), MET (-2,6 раз), SERPINE1(+2,8 раз).

Полученные результаты показывают, что антипролиферативный эффект D-глюкуронил С5-эпимеразы in vivo осуществляется через более сложную регуляцию молекулярных путей канцерогенеза, чем in vitro.

Таким образом, было показано, что во всех типах исследованных опухолевых клеток (рака молочной и предстательной железы и мелкоклеточного рака легкого) эктопическая экспрессия D-глюкуронил С5-эпимеразы приводит к изменению экспрессии генов, относящихся к молекулярным механизмам опухолевого ангиогенеза и инвазии/метастазирования. Влияние экспрессии GLCE на процесс ангионгенеза может осуществляться через изменение структуры гепарансульфат протеогликанов (ГСПГ) клеточной поверхности и ВКМ. Известно, что многие ГСПГ вовлечены в регуляцию ангиогенеза, включая синдеканы (Alexopoulou et al, 2007), перлекан (Bix; Iozzo, 2005; Whitelock et al, 2008) и глипикан-1 (Aikawa et al, 2008). Например, перлекан модулирует взаимодействие VEGFЦVEGFR2 в процессе эмбрионального развития (Zoeller et al, 2009), а синдеканы важны для функций тирозин-киназного рецептора  FGFR. С одной стороны, синдеканы, связывающие как bFGF, так и его рецепторы, выступают в качестве активаторов сигнального механизма FGF; с другой стороны, синдеканы, взаимодействующие только с bFGF, действуют как ингибиторы сигнального каскада (Zhang et al, 2009). Таким образом, структура синдеканов (особенно их гепарансульфатной части) может определять свойства микроокружения клетки, модулируя про-онкогенные или анти-онкогенные функции FGFR.

Наряду с общими механизмами действия D-глюкуронил С5-эпимеразы в отношении различных типов опухолевых клеток, было показано также существование и тканеспецифичных механизмов антимитотического действия эпимеразы. Так, в клетках рака молочной железы  MCF7 восстановление экспрессии эпимеразы приводило к изменению экспрессии различных генов-супрессоров опухолевого роста, таких как  BRCA1 и SYK, известных как ингибиторы развития рака молочной железы и метастазирования (Gorski et al, 2009; Coopman et al, 2006), а также p53 и E2F1, являющихся важными регуляторами клеточного цикла (Polager et al, 2009). Восстановление экспрессии эпимеразы в клетках мелкоклеточного рака легкого и в клетках рака предстательной железы приводило к изменению экспрессии факторов роста и их рецепторов (VEGF-A, PDGF-A, PDGF-B, FGFR2, TGFB1 и TNF), которое объясняет показанные ранее антипролиферативные свойства  D-глюкуронил С5-эпимеразы в культурах клеток  in vitro, поскольку определяет характер межклеточных взаимодействий и передачу сигнальной информации от клетки к клетке. Возможно, что эктопическая экспрессия  эпимеразы в опухолевых клетках  приводит к восстановлению баланса между факторами роста и ингибиторами процесса ангиогенеза и инвазии/метастазирования, что могло бы приводить к подавлению этих процессов в системе in vivo.  Таким образом, полученные данные открывают перспективу для создания анти-ангиогенного или антиметастатического препарата на основе эпимеразы.

Молекулярные механизмы регуляции D-глюкуронил C5-эпимеразы в опухолевых клетках

Для определения причин инактивации D-глюкуронил С5-эпимеразы в опухолевых тканях, была изучена роль различных эпигенетических механизмов в регуляции экспрессии гена  GLCE в образцах опухолевых тканей молочной и предстательной железы с различным уровнем экспрессии  эпи меразы

Роль метилирования промоторной области в регуляции экспрессии D-глюкуронил С5-эпимеразы в опухолевых тканях человека

Одной из первых задач было определение роли метилирования промоторной области в регуляции экспрессии GLCE в клетках, поскольку метилирование является одним из наиболее вероятных механизмов инактивации генов-супрессоров развития опухоли в процессе канцерогенеза. Для определения статуса метилирования промоторной области гена GLCE в опухолях молочной и предстательной желез с различным уровнем экспрессии D-глюкуронил С5-эпимеразы были использованы методы метил-специфичной ПЦР и бисульфитного секвенирования (Рис. 2,3).

Рисунок 2. Метилирование CpG-островков регуляторной области гена GLCE в опухолевых тканях молочной железы человека. Метил-специфичная ПЦР (MSP) промоторной области  GLCE. 300-328 - опухоли молочной железы, C и T - контрольная и опухолевая ткани молочной железы, PC - положительный ПЦР контроль, NC - негативный ПЦР контроль, М - ДНК маркер, M и U - праймеры для метилированной или неметилированной ДНК последовательности, соответственно. Бисульфитное секвенирование (BS) промоторной области  GLCE опухолей молочной железы. 300 и 301 - № пациентов, пустые и черные круги - неметилированные и метилированные  CpG-динуклеотиды, соответственно.

Было показано, что промоторная область GLCE  неметилирована практически во всех проанализированных опухолях молочной железы человека. Согласно результатам бисульфитного секвенирования, уровень метилирования в исследуемых образцах не превышал  5-7%, и не было выявлено каких-либо специфических сайтов метилирования.

Рисунок 3. Метилирование CpG-островков регуляторной области гена GLCE в опухолевых тканях предстательной железы человека. Метил-специфичная ПЦР промоторной области  GLCE. 2-46 - опухоли предстательной железы, M и U - праймеры для метилированной или неметилированной ДНК последовательности, соответственно.

В опухолевых тканях предстательной железы также не было обнаружено метилирования промоторной области гена  GLCE. Бисульфитное секвенирование 9 образцов подтвердило полное отсутствие метилирования  CpG-островков во всех проанализированных опухолях.

Для дальнейшего изучения молекулярных механизмов регуляции экспрессии GLCE были проведены эксперименты на культурах клеток in vitro. Клетки рака молочной железы  (MCF7) и рака предстательной железы (Du-145, LNCaP, PC3)  были обработаны деметилирующим агентом 5-аза-дезоксицитидином (5-aza-dC) и/или ингибитором гистоновых деацетилаз трихостатином А (TSA) с последующим анализом статуса метилирования промоторной области GLCE и уровня ее экспрессии до и после обработки (Рис.4).

Рисунок 4. Активация экспрессии GLCE в клетках карциномы молочной железы  MCF7 после обработки  5-aza-dC или TSA. Интенсивность амплифицированного фрагмента ДНК гена нормализована на интенсивность фрагмента GAPDH (мультиплексная ОТ-ПЦР) и  -актина (TaqMan-ОТ ПЦР в реальном времени). Представлены средние значения SE трех экспериментов (OriginPro 8.1).

Методами метил-специфичной ПЦР и бисульфитного секвенирования было показано, что промотор GLCE в клетках рака молочной железы  MCF7 не метилирован, а обработка клеток деметилирующим агентом 5-аза-дезоксицитидином не оказывает значительного влияния на уровень экспрессии гена. Эти данные хорошо согласуются с отсутствием метилирования промоторной области эпимеразы в опухолевых тканях молочной железы in vivo.

Однако клеточные линии рака предстательной железы (Du-145, LNCaP, PC3) различались по степени метилирования промоторной области D-глюкуронил С5-эпимеразы - в клетках  Du-145 не было обнаружено метилирования промоторной области этого гена, в то время как клеточные линии LNCaP и PC3 показали значительную степень метилирования промоторной последовательности. Обработка этих клеток 5-аза-дезоксицитидином снижала степень метилирования промотора GLCE в клетках LNCaP и активировала экспрессию эпимеразы, в то время как в клетках  PC3 обработка 5-aza-dC не изменяла статус метилирования промотора (40-50%), но приводила к усилению экспрессии эпимеразы в обработанных клетках. Такое различие степени метилирования промоторной области GLCE в разных клеточных линиях рака предстательной железы человека in vitro и опухолях предстательной железы in vivo, по-видимому, может объяснятся гистологическим и морфологическим типом опухолей предстательной железы человека. 

Таким образом, промоторная область гена D-глюкуронил С5-эпимеразы, в принципе,  при определенных условиях, может быть метилирована в культивируемых опухолевых клетках in vitro, однако в ситуации  in vivo  в опухолях молочной и предстательной желез метилирование промоторной области гена  GLCE не обнаружено. 

Изучение влияния структуры хроматина на экспрессию гена  D-глюкуронил-С5-эпимеразы

Поскольку обработка клеток  MCF7 трихостатином А (TSA) приводила к повышению уровня мРНК GLCE, мы предположили, что структура хроматина играет определенную роль в регуляции экспрессии этого гена. Активация хроматина может оказывать прямое воздействие на экспрессию генов, приводя к повышению доступности промоторной области гена для транскрипционных комплексов.

Для того чтобы определить прямое взаимодействие регуляторной области гена GLCE  с активированными гистоновыми белками, был проведен анализ их взаимодействия методом хроматиновой иммунопреципитации (ChIP) с использованием антител против модифицированных лизиновых остатков H3K9Ac (ацетилированный лизиниовый остаток K9 гистона H3), H3K4Me3 (метелированный лизиниовый остаток K4 гистона H3) и H3K9Me3 (метелированный лизиниовый остаток K9 гистона H3) и двух пар праймеров, соответствующих участку промоторной области гена  GLCE (Рис. 5).

Рисунок 5. Взаимодействие промоторной области  гена GLCE с различными модификациями гистона  H3. А. Схема расположения праймеров для анализа связывания промоторной области с гистоновыми белками. Б. Пример электрофореграммы ПЦР после хроматиновой иммунопреципитации. В. Диаграмма изменения связывания промоторной области GLCE с модифицированными гистоновыми белками.

Согласно полученным результатам,  обработка клеток 5-aza-dC/TSA приводила к усилению взаимодействия промоторной области GLCE с маркерами активного хроматина  H3K9Ac  и  H3K4Me3, но практически не влияла на взаимодействие с маркером неактивного хроматина  H3K9Me3.  Такая активация транскрипционной активности эпимеразы, по-видимому, требует также дополнительного участия неидентифицированных пока регуляторных факторов, активируемых обработкой клеток 5-aza-dC. В целом, полученные данные подтверждают возможность прямого влияния структуры хроматина на транскрипционную активность промоторной области  GLCE.

Роль комплекса транскрипционных факторов TCF4/-катенин в регуляции  D-глюкуронил С5-эпимеразы.

Помимо прямого влияния на доступность промоторной зоны гена, активность структуры хроматина может оказывать и непрямое воздействие, связанное с активацией факторов, положительно регулирующих экспрессию GLCE в клетках. Одним из таких факторов может быть TCF4/-катенин- транскрипционный комплекс, участие которого в регуляции экспрессии эпимеразы было показано для клеток рака толстой кишки в системе in vitro (Ghiselli et al, 2005).

Для установления роли  -катенина (CTNN1) и  TCF4 в регуляции экспрессии GLCE в клетках рака молочной железы, была проведена оценка уровня экспрессии  CTNN1 и TCF4 в клетках MCF7 до и после обработки 5-аза-дезоксицитидином и трихостатином A (Рис. 6).

Рисунок 6. Экспрессия компонентов Wnt/-катенинового пути в клетках карциномы молочной железы человека MCF7 до и после обработки клеток 5-аза-дезоксицитидином и трихостатином A. Мультиплексная  ОТ-ПЦР и диаграмма изменения экспрессии генов GLCE,  TCF4 и CTNN1 в опухолевых образцах по сравнению с контрольной тканью. Представлены средние значения SE трех измерений (OriginPro 8.1).

Действительно, наряду с повышением экспрессии D-глюкуронил С5-эпимеразы, обработка клеток рака молочной железы  MCF7 трихостатином А и/или 5-аза-дезоксицитидином приводила к повышению уровня экспрессии компонентов Wnt-сигнального пути TCF4 и -катенина.

Статистический анализ данных по критерию Спирмена показал наличие корреляции средней силы для исследованных параметров.

Наряду с результатами, полученными для культуры клеток in vitro, уровень экспрессии TCF4, -катенина  и GLCE был определен также in vivo в 10 клинических образцах опухолей молочной  железы человека (Рис. 7).

Рисунок 7. Изменение экспрессии генов GLCE, TCF4 и CTNN1 в опухолевых тканях молочной железы. Диаграмма мультиплексной ОТ-ПЦР с геном  GAPDH в качестве внутреннего контроля. 300-326 - № пациентов.

Сравнительный анализ экспрессии GLCE, TCF4 и -катенина показал наличие прямой корреляции между  уровнями экспрессии этих генов в опухолевых тканях молочной железы in vivo. Согласно полученным данным, наблюдается корреляция между изменениями экспрессии  GLCE и TCF4 (Коэффициент корреляции Спирмена R=0,86, p0,05),  GLCE и -катенина (Коэффициент корреляции Спирмена R=0,68, p0,05), а также между TCF4 и -катенином (R=0,81; p0,05). Полученные результаты согласуются с опубликованными данными и говорят о том, что  транскрипционный комплекс TCF4/-катенин может регулировать экспрессию D-глюкуронил С5-эпимеразы также и в опухолевых клетках молочной железы человека.

Таким образом, регуляция экспрессии  D-глюкуронил С5-эпимеразы на транскрипционном уровне осуществляется через сложный молекулярный механизм, связанный в значительной мере со структурой хроматина, которая напрямую (усиление транскрипционной активности промоторной области  GLCE) и косвенно (активация TCF4/-катенин транскрипционного комплекса) влияет на уровень экспрессии этого гена.

Роль микроРНК-218 в регуляции  D-глюкуронил С5-эпимеразы в клетках рака молочной и предстательной железы

Помимо транскрипционного уровня, регуляция экспрессии D-глюкуронил С5-эпимеразы может регулироваться и на пост-транскрипционном уровне.

Ранее было показано, что регуляция эпимеразы в эндотелиальных клетках ретины мышей может осуществляться через микроРНК-218 (Small et al, 2010). Мы предположили, что микроРНК-218 может также играть роль в регуляции экспрессии GLCE в опухолевых клетках молочной и предстательной желез человека. Для проверки этой гипотезы, клетки карциномы молочной железы MCF7 и рака предстательной железы Du-145 были трансфецированы олигонуклеотидами микроРНК-218 и анти-микроРНК-218 с последующим анализом уровня экспрессии микроРНК-218 и D-глюкуронил С5-эпимеразы  в экспериментальных клетках (Рис. 8).

Рисунок 8. Экспрессия микроРНК-218 (А) и GLCE (Б) в клетках рака молочной (MCF7) и предстательной (Du-145) железы, трансфецированных микроРНК-218 и  анти-микроРНК-218. Анализ ПЦР в реальном времени. В - Вестерн-блот анализ уровня белка  GLCE в клетках MCF7 и Du-145, трансфецированных микроРНК-218 и  анти-микроРНК-218. Представлены средние значения SE трех измерений (OriginPro 8.1).

Значительное повышение (в 7-10 раз) уровня микроРНК-218, как и ожидалось, не приводило к изменению уровня мРНК GLCE, однако приводило к снижению уровня белка  GLCE в трансфецированных клетках, что подтверждает способность  микроРНК-218 регулировать уровень белковой молекулы D-глюкуронил С5-эпимеразы в клетках рака молочной и предстательной желез в системе in vitro.

Наряду с экспериментами in vitro на клеточных линиях, был проведен сравнительный анализ уровня экспрессии GLCE и микроРНК-218 в образцах опухолевых тканей молочной и предстательной железы человека in vivo. Результаты показали наличие прямой корреляции между уровнем мРНК GLCE  и микроРНК-218 (Коэффициент Спирмена R=0,68 для образцов рака молочной железы и R=0,96 p0,05 для опухолей предстательной железы), что может указывать на согласованную экспрессию микроРНК-218 и GLCE в изучаемых клетках. Однако уровень белка D-глюкуронил С5-эпимеразы слабо коррелировал с уровнем микроРНК-218 в опухолях молочной и предстательной желез (R=0,49 и R=0,53, соответственно; p0,05). По-видимому, хотя в культуре клеток микроРНК-218 и способна регулировать уровень белковой молекулы эпимеразы, но в опухолевой ткани in vivo свой вклад вносят также и другие регуляторные механизмы и влияние микроРНК становится не столь очевидным.

В целом, результаты исследования показали сложную регуляцию экспрессии GLCE в опухолевых тканях молочной и предстательной железы, осуществляемую как на транскрипционном (структура хроматина, активность TCF4/-катенин транскрипционного комплекса, другие не идентифицированные пока регуляторные факторы), так и на пост-транскрипционном уровне (микроРНК).

ВЫВОДЫ
  1. Эктопическая экспрессия D-глюкуронил С5-эпимеразы во всех типах исследованных опухолевых клеток (рака молочной и предстательной железы и мелкоклеточного рака легкого) приводит к изменению экспрессии генов, белковые продукты которых участвуют в процессах ангиогенеза (PDGF, TNF, IFNB1, ANGPT1, THBS1) и инвазии/метастазирования (TIMP1, TIMP3, TWIST1, S100A4)
  2. Восстановление экспрессии D-глюкуронил С5-эпимеразы в опухолевых клетках приводит к тканеспецифичному изменению экспрессии генов-супрессоров опухолевого роста BRCA1, E2F1, р53 в клетках рака молочной железы или факторов роста PDGF-A, аPDGF-B, VEGF-A , TGFB1 и их рецепторов в клетках мелкоклеточного рака легкого.
  3. Экспрессия D-глюкуронил С5-эпимеразы не связана с метелированием промоторного участка гена в опухолевых тканях молочной и предстательной  железы человека.
  4. Уровень экспрессииа D-глюкуронил С5-эпимеразы в опухолевых клетках молочнойа железы человека зависит от степени ацетилирования и метилирования лизиновых остатков в гистоне H3
  5. Экспрессия D-глюкуронил С5-эпимеразы в культуре опухолевых клеток in vitro и опухолях молочной железы in vivo положительно коррелирует с уровнем экспрессии TCF4/-катенин-транскрипционного комплекса
  6. МикроРНК-218 регулирует экспрессию белкаа D-глюкуронил С5-эпимеразы в опухолевых клетках молочной и предстательной железы in vitro.

СПИСОК РАБОТ, ОПУБЛИКОВАННЫХ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИ

  1. Мостович Л.А., Прудникова Т.Ю., Доманицкая Н.В., Вержбицкая Н.Е., Харченко О.В., Непомнящих Г.И., Айдагулова С.В., Рыкова В.И., Григорьева Э.В. Молекулярные механизмы противоопухолевого эффекта Д-глюкуронил С5-эпимеразы в экспериментальной модели рака легкого in vivo. // Сибирский онкологический журнал. - 2010. - Том 38. Ц№2. - C. 24 - 29.
  2. Prudnikova T.Y., Mostovich L.A., Domanitskaya N.V., Pavlova T.V., Kashuba V.I., Zabarovsky E.R., Grigorieva E.V. Antiproliferative effect of D-glucuronyl C5-epimerase in human breast cancer cells. // Cancer. Cell. Int. - 2010. - V. 10. - doi:  10.1186/1475-2867-10-27.
  3. Grigorieva E.V., Prudnikova T.Y., Domanitskaya N.V., Mostovich L.A., Pavlova T.V., Kashuba V.I., Zabarovsky E.R. D-glucuronyl C5-epimerase suppresses small-cell lung cancer cell proliferation in vitro and tumour growth in vivo. // Br. J. Cancer. - 2011. - V.105. - P.74-82.
  4. Мостович Л.А., Прудникова Т.Ю., Доманицкая Н.В., Вержбицкая Н.Е., Харченко О.В., Непомнящих Г.И., Айдагулова С.В., Рыкова В.И., Григорьева Э.В. D-глюкуронил С5-эпимераза человека подавляет развитие экспериментальных опухолей in vivo через молекулярный механизм ингибирования ангиогенеза. //  Сибирский Онкологический Журнал - 2010. - прил.1, стр.77-78
  5. Grigorieva E.V., Prudnikova T.Y., Mostovich L.A., Domanitskaya N.V., Zabarovsky E.R. D-glucuronyl C5-epimerase inhibits breast cancer cell proliferation through the tumour suppressor genes activation. // Europ. J. Cancer. Suppl. - 2010. - V.8. - № 6. ЦP. 24-25.
  6. Мостович Л.А., Прудникова Т.Ю., Доманицкая Н.В., Павлова Т.В., Рыкова В.И.,  Кашуба В.И., Забаровскиф Е.Р., Григорьева Э.В. Антиопухолевый эффект . D-глюкуронил С5-эпимеразы человека при мелкоклеточном раке легкого. // XXIII Международная зимняя школа Перспективные направления физико-химической биологии. - 2011. - Москва, Россия. - С.27-28.
  7. Prudnikova T.Y., Mostovich L.A., Kondratov A.V., Gubanova N.V., Kashuba V.I., Zabarovsky E.R., Grigorieva E.V. Molecular mechanisms of D-glucuronyl C5-epimerase  expression in breast cancer. // Int. J. Mol. Med. - 2011. - Vol. 28. - P. 46.

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ГАГ- гликозаминогликаны

ВКМ - внеклеточный матрикс

GAPDH - глицеральдегид-3-фосфат дегидрогеназа

GlcUA- глюкуроновая кислота

IdoUA- идуроновая кислота

ГСПГ- гепарансульфат протеогликан

ПЦР - полимеразная цепная реакция

мРНК - матричная рибонуклеиновая кислота

ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота

GLCE - D-глюкуронил С5-эпимераза

CTNN1 - -катенин

TCF4 - T-cell factor

TSA - трихостатин А

5-aza-dC - 5-аза-дезоксицитидин

H3K9Ac -ацетилированный лизиниовый остаток K9 гистона H3

H3K4Me3 - метелированный лизиниовый остаток K4 гистона H3

H3K9Me3 - метелированный лизиниовый остаток K9 гистона H3

ПААГ - полиакриламидный гель

ChIP Цхроматиновая иммунопреципитация

SE - ошибка среднего

R- коэффициент корреляции Спирмена

  Авторефераты по всем темам  >>  Авторефераты по биологии