Тезисы докладов

Вид материала

Содержание

Реакция здоровья человека на внешние воздействия со стороны трех окружающих сред. сопоставительный анализ
Возрастные изменения альтернативного сплайсинга в мозге приматов

Подобный материал:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 ... 96

РЕАКЦИЯ ЗДОРОВЬЯ ЧЕЛОВЕКА НА ВНЕШНИЕ ВОЗДЕЙСТВИЯ СО СТОРОНЫ ТРЕХ ОКРУЖАЮЩИХ СРЕД. СОПОСТАВИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ

А.Г.Гамбурцев¹⁾, О.И.Аптикаева¹⁾, А.В.Сигачев²⁾

¹⁾ УРАН Институт физики Земли РАН,

²⁾ Станция скорой медицинской помощи г. Москвы

Фундаментальная научная цель проекта: понять закономерности динамики различных процессов в разных сферах, продвинуться по пути решения проблемы прогнозирования будущих явлений и процессов. Практическая цель: способствовать выживанию, оздоровлению, безопасности и социальному благополучию населения России, ее устойчивому развитию. Одна из важнейших задач в рамках взятого направления является задача развития системного медико-экологического мониторинга. Для того чтобы продвинуться во взятом направлении, необходимо изучить и проанализировать особенности фонового и аномального протекания природных процессов без участия и с участием антропогенных воздействий, установить причинно-следственные связи между процессами. Мы пытаемся изучить закономерности динамики процессов в трех окружающих нас средах, особенно влияющие на здоровье и качество жизни людей, и свойства динамики медицинских временных рядов. Нами сформулированы основные закономерности динамики процессов. Они являются общими для природных социальных и других гуманитарных процессов, в том числе для динамики медицинских показателей. В то же время имеют место особенные черты динамики гуманитарных процессов, в частности для динамики медицинских показателей. Они связаны с человеческим фактором – со стороны медиков, самих больных и их окружения. Наши подходы к решению поставленных задач заключаются в анализе фактических данных о временных и пространственно-временных процессах в природе и обществе. Остановимся на некоторых результатах.

Рождественские каникулы (РК). Сопоставление вызовов скорой помощи (ВСП) в течение 3-10 января до и после введения РК для работающих людей показало существенную разницу в числе суточных ВСП. Обострение гипертонической болезни в дни РК заметно возрастает по сравнению с теми же календарными днями в годы до введения РК.

Аномально жаркое лето 2010 г. Динамическая картина ВСП в Москве сильно изменилась по сравнению с летними периодами других лет. Это вызвано, по мнению медиков, небывало продолжительной и сильной жарой в июле-августе. Получены и уже обрабатываются интересные фактические данные. В частности, в отдельные дни июля-августа значительно увеличилось число ВСП по случаям инсульта, гипотензии, ангины, пневмонии – до 50–100 % и более. Эта картина подтверждается данными о смертных случаях во Франции аномально жарким летом 2003 г. Но многие заболевания на эту аномалию не прореагировали. Детальный анализ данных по ВСП планируем провести в 2012 г.

ВСП летом и зимой. В некоторых работах предполагается, что увеличение числа вызовов скорой помощи в зимнее время связано с тем, что в это время увеличивается солнечная и геомагнитная активность. По-видимому, это не так, потому что сопоставление данных о смертности в северном и южном полушарии показывает, что в зимнее время как в одном, так и в другом полушарии смертность увеличивается.

Предложение. Продолжаем считать, что необходимо начать проводить широкомасштабные междисциплинарные исследования с целью создания обоснованного системного комплексного эколого-медицинского мониторинга, в котором участвовали бы РАН, Минздравсоцразвития, Росгидромет, Минприроды, МЧС, Минобороны и ряд других ведомств. Наши предложения были озвучены еще в 1997 г. на совместном заседании двух Межведомственных комиссий СБ РФ; было принято положительное решение, носившее, однако, рекомендательный характер.

ВОЗРАСТНЫЕ ИЗМЕНЕНИЯ АЛЬТЕРНАТИВНОГО СПЛАЙСИНГА В МОЗГЕ ПРИМАТОВ

М.С.Гельфанд^1,2), П.В.Мазин^2,3), P.Khaitovich³⁾

¹⁾Институт проблем передачи информации им. А.А.Харкевича РАН, Москва

²⁾Факультет биоинженерии и биоинформатики МГУ, Москва

³⁾ Partner Institute for Computational Biology, Shanghai Institutes for Biological Sciences, Chinese Academy of Sciences, Шанхай, Китай

Исследованы данные высокопроизводительного секвенирования транскриптома двух областей мозга (префронтальная кора и мозжечок) трех приматов (человек, шимпанзе, макака-резус). В первом наборе данных были секвенированы парные риды длиной 75 нуклеотидов. Для каждого сочетания ткань/вид было исследовано два образца (новорожденные, взрослые), каждый из которых содержал смесь материала из пяти индивидуумов. Во втором наборе (только кора) были секвенированы одиночные риды с известной цепи для 13-14 индивидуальных образцов возрастов от нескольких дней до десятков лет.

Картирование на геномы проводили программой Tophat без использования аннотации, разрешали не более 3 несовпадений. Уникально картировалось 60-69 % ридов, причем множественные совпадения были, где возможно, разрешены при помощи второго рида из пары. Сборку генов проводили с учетом ограничений на минимальное покрытие и его непрерывность. Аннотация экзон-интронной структуры генов шимпанзе и макаки была проведена путем проекции на эти геномы известных генов человека. В результате было получено 26594 гена, содержавших 59105 конститутивных экзона, 21134 альтернативных сегментов и 23528 удержанных интронов. Было показано хорошее согласование с генами, описанными в базе данных Ensemble.

Значимые различия в уровнях включения сегментов определяли при помощи биномиальной модели. Оказалось, что, хотя наиболее существенные различия, как и ожидалось, наблюдались между видами, для 20 % генов было показано изменение альтернативного сплайсинга с возрастом. Для нескольких генов была проведена количественная ПЦР, которая подтвердила сделанные наблюдения.

Паттерны возрастных изменений альтернативного сплайсинга в трех приматах заметно различались. Однако после коррекции на физиологический возраст путем привязки к маркерам возраста (прорезывание зубов, появление коренных зубов, половое созревание и т.п.) паттерны существенно сблизились.

Blog